; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Pay0011646 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome

Gene IDPay0011646
OrganismCucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
DescriptionDNA polymerase zeta processivity subunit isoform X1
Genome locationchr11:23888133..23893235
RNA-Seq ExpressionPay0011646
SyntenyPay0011646
Gene Ontology termsGO:0006974 - cellular response to DNA damage stimulus (biological process)
GO:0010224 - response to UV-B (biological process)
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InterPro domainsIPR003511 - HORMA domain
IPR036570 - HORMA domain superfamily
IPR045091 - Mad2-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_011656987.1 DNA polymerase zeta processivity subunit isoform X2 [Cucumis sativus]4.9e-10097.45Show/hide
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XP_038900295.1 DNA polymerase zeta processivity subunit [Benincasa hispida]3.6e-10392.75Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KEI1 HORMA domain-containing protein2.6e-10797.12Show/hide
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A0A1S3C2K7 DNA polymerase zeta processivity subunit isoform X22.1e-104100Show/hide
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A0A1S3C494 DNA polymerase zeta processivity subunit isoform X13.5e-112100Show/hide
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A0A6J1G790 DNA polymerase zeta processivity subunit isoform X21.1e-9787.44Show/hide
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A0A6J1I0B4 DNA polymerase zeta processivity subunit isoform X23.5e-9686.47Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q4KWZ6 Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD2B4.2e-2232.63Show/hide
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          S +E  LRAF++K+SV + +    PP C + +  + +   + +  K        WI  D +      P + P+K+MTS  L +QLY+E
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Q568H3 Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD2B1.6e-2132.63Show/hide
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Q8QFR4 Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD2B7.2e-2233.68Show/hide
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Q94FL5 DNA polymerase zeta processivity subunit1.4e-7369.27Show/hide
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Q9D752 Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD2B1.6e-2132.11Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G16590.1 DNA-binding HORMA family protein9.8e-7569.27Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TACCCTTCTGGTGCTTTTGAAAGAAGGAGGTACATGAATGCGGTTGTGCAGAAAGCTCGAAATCCTGAGCTGCAGGATTACATCCACTCAACTGTTTCAGGGCTA
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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CCTAATTGACAATATAGATTCCTAAATACAATAATAAGAAAAACCACAAATACCCCATAATTAATACATACTATGCACTCCCTTCAATCTTCTAAGTTTCCCCCA
AAAAAAGAAATCATCTTCTCTAAAACATCATATCTTCGACATGGAACCATTCTACTTCTCCAAGAGAACCCTAATTTTTCCTTCCCTTTTTCTTCTTAAAATACT
ATCGCTTTCTCTTCCATTTTTTAAACGCTTTCCACCGTCGCTCCAGATACGCGCAGCCTTCCTTTTTTAATCGTTTTGCACCACCGATTGCTTTTCACCGGAACT
TTTAAAATCGCTCCTCACTTAATCGCTTTACACCACCAATTGCTTTTCATCAGAACCATTCTCAAATCTCTTTCCACCGATCTTCAACCTTCTAATCGTTTGTAC
CATTGTGTTCATTCTTCAACCTTTCGTTGGATTTCTGCGGTTAAAATTTCGAAAATAATATCCTTTGCTACATTCTTCGTTCAAATTTACGTTACTGCAGCCATG
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TCCAAAATTTCAAAAATGAAGATTTGAATATCTTTTTCGTTAATTTCTTATTTTTTTTTATGATAATAAATAATTATTGCATTATATAGTTTTGAATGTAAAATA
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TATTTGATTTTTCGATCTCATGAAATACATCTATTTGCATCTAGATAGTTCTCATACGTGAAGGGTAATTTTGGTCCAAAAAAATGGAAAATATGTAAGGTAGTT
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AATTTTTATAAAAAATTAAAAATAAATATAAAACTTCCAAACAAGAGTAAATGAAAAAAATAAATAATAATAAAGAAACAAATTGAAGGTTGGATACAATAATTA
GAAAAAAAAAATCAAAATAAAAGTTTAAGATAATGTTATCTTAATTGCTTTTCTTTAACATAAAATTTTGAAACAAACGGAAAGCAATTCAGTTTGATTACCTTT
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