; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Pay0012628 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome

Gene IDPay0012628
OrganismCucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
DescriptionRas-related protein like
Genome locationchr08:12470154..12474272
RNA-Seq ExpressionPay0012628
SyntenyPay0012628
Gene Ontology termsGO:0080092 - regulation of pollen tube growth (biological process)
GO:0045177 - apical part of cell (cellular component)
GO:0070382 - exocytic vesicle (cellular component)
GO:0090404 - pollen tube tip (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
GO:0019900 - kinase binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004150166.1 ras-related protein RABA4d [Cucumis sativus]1.1e-10685.43Show/hide
Query:  MSNLYGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVKELDGLVFLCFELHKNAVSRIALLFFLLPSIGTIHW
        MSNLYGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVK                         +  + G    
Subjt:  MSNLYGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVKELDGLVFLCFELHKNAVSRIALLFFLLPSIGTIHW

Query:  YRAVTSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFFTILTEI
        YRAVTSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFFTILTEI
Subjt:  YRAVTSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFFTILTEI

Query:  YRIISKKSLAAGEEIDIGSNPALFKGTNIVVPGQDQDSGTKGCCFAS
        YRIISKKSLAAGEEIDIGSNPALFKGT+IVVPGQDQDSG KGCCFAS
Subjt:  YRIISKKSLAAGEEIDIGSNPALFKGTNIVVPGQDQDSGTKGCCFAS

XP_008460801.1 PREDICTED: ras-related protein RABA4d [Cucumis melo]5.8e-10886.23Show/hide
Query:  MSNLYGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVKELDGLVFLCFELHKNAVSRIALLFFLLPSIGTIHW
        MSNLYGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVK                         +  + G    
Subjt:  MSNLYGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVKELDGLVFLCFELHKNAVSRIALLFFLLPSIGTIHW

Query:  YRAVTSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFFTILTEI
        YRAVTSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFFTILTEI
Subjt:  YRAVTSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFFTILTEI

Query:  YRIISKKSLAAGEEIDIGSNPALFKGTNIVVPGQDQDSGTKGCCFAS
        YRIISKKSLAAGEEIDIGSNPALFKGTNIVVPGQDQDSGTKGCCFAS
Subjt:  YRIISKKSLAAGEEIDIGSNPALFKGTNIVVPGQDQDSGTKGCCFAS

XP_022925137.1 ras-related protein RABA4d [Cucurbita moschata]1.5e-10383.4Show/hide
Query:  MSNLYGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVKELDGLVFLCFELHKNAVSRIALLFFLLPSIGTIHW
        MSNLYGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLL+RFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVK                         +  + G    
Subjt:  MSNLYGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVKELDGLVFLCFELHKNAVSRIALLFFLLPSIGTIHW

Query:  YRAVTSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFFTILTEI
        YRAVTSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFF ILTEI
Subjt:  YRAVTSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFFTILTEI

Query:  YRIISKKSLAAGEEIDIGSNPALFKGTNIVVPGQDQDSGTKGCCFAS
        YRIISKKSLAAGE IDIG NPALFKGTNIVVPGQDQ  G KGCCFAS
Subjt:  YRIISKKSLAAGEEIDIGSNPALFKGTNIVVPGQDQDSGTKGCCFAS

XP_022966454.1 ras-related protein RABA4d [Cucurbita maxima]4.3e-10383Show/hide
Query:  MSNLYGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVKELDGLVFLCFELHKNAVSRIALLFFLLPSIGTIHW
        MSNLYGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLL+RFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVK                         +  + G    
Subjt:  MSNLYGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVKELDGLVFLCFELHKNAVSRIALLFFLLPSIGTIHW

Query:  YRAVTSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFFTILTEI
        YRAVTSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFF ILTEI
Subjt:  YRAVTSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFFTILTEI

Query:  YRIISKKSLAAGEEIDIGSNPALFKGTNIVVPGQDQDSGTKGCCFAS
        YRIISKKSLAAGE IDIG NPALFKGTNIVVPGQ+Q  G KGCCFAS
Subjt:  YRIISKKSLAAGEEIDIGSNPALFKGTNIVVPGQDQDSGTKGCCFAS

XP_038881448.1 ras-related protein RABA4d [Benincasa hispida]8.3e-10785.43Show/hide
Query:  MSNLYGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVKELDGLVFLCFELHKNAVSRIALLFFLLPSIGTIHW
        MSNLYGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVK                         +  + G    
Subjt:  MSNLYGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVKELDGLVFLCFELHKNAVSRIALLFFLLPSIGTIHW

Query:  YRAVTSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFFTILTEI
        YRAVTSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFFTILTEI
Subjt:  YRAVTSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFFTILTEI

Query:  YRIISKKSLAAGEEIDIGSNPALFKGTNIVVPGQDQDSGTKGCCFAS
        YRIISKKSLAAGEEIDIGSNP LFKGTNIVVPGQDQDSG KGCCFAS
Subjt:  YRIISKKSLAAGEEIDIGSNPALFKGTNIVVPGQDQDSGTKGCCFAS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KW90 Uncharacterized protein5.3e-10785.43Show/hide
Query:  MSNLYGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVKELDGLVFLCFELHKNAVSRIALLFFLLPSIGTIHW
        MSNLYGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVK                         +  + G    
Subjt:  MSNLYGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVKELDGLVFLCFELHKNAVSRIALLFFLLPSIGTIHW

Query:  YRAVTSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFFTILTEI
        YRAVTSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFFTILTEI
Subjt:  YRAVTSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFFTILTEI

Query:  YRIISKKSLAAGEEIDIGSNPALFKGTNIVVPGQDQDSGTKGCCFAS
        YRIISKKSLAAGEEIDIGSNPALFKGT+IVVPGQDQDSG KGCCFAS
Subjt:  YRIISKKSLAAGEEIDIGSNPALFKGTNIVVPGQDQDSGTKGCCFAS

A0A1S3CDP9 ras-related protein RABA4d2.8e-10886.23Show/hide
Query:  MSNLYGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVKELDGLVFLCFELHKNAVSRIALLFFLLPSIGTIHW
        MSNLYGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVK                         +  + G    
Subjt:  MSNLYGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVKELDGLVFLCFELHKNAVSRIALLFFLLPSIGTIHW

Query:  YRAVTSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFFTILTEI
        YRAVTSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFFTILTEI
Subjt:  YRAVTSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFFTILTEI

Query:  YRIISKKSLAAGEEIDIGSNPALFKGTNIVVPGQDQDSGTKGCCFAS
        YRIISKKSLAAGEEIDIGSNPALFKGTNIVVPGQDQDSGTKGCCFAS
Subjt:  YRIISKKSLAAGEEIDIGSNPALFKGTNIVVPGQDQDSGTKGCCFAS

A0A5A7UD85 Ras-related protein RABA4d2.8e-10886.23Show/hide
Query:  MSNLYGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVKELDGLVFLCFELHKNAVSRIALLFFLLPSIGTIHW
        MSNLYGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVK                         +  + G    
Subjt:  MSNLYGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVKELDGLVFLCFELHKNAVSRIALLFFLLPSIGTIHW

Query:  YRAVTSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFFTILTEI
        YRAVTSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFFTILTEI
Subjt:  YRAVTSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFFTILTEI

Query:  YRIISKKSLAAGEEIDIGSNPALFKGTNIVVPGQDQDSGTKGCCFAS
        YRIISKKSLAAGEEIDIGSNPALFKGTNIVVPGQDQDSGTKGCCFAS
Subjt:  YRIISKKSLAAGEEIDIGSNPALFKGTNIVVPGQDQDSGTKGCCFAS

A0A6J1EAZ2 ras-related protein RABA4d7.1e-10483.4Show/hide
Query:  MSNLYGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVKELDGLVFLCFELHKNAVSRIALLFFLLPSIGTIHW
        MSNLYGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLL+RFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVK                         +  + G    
Subjt:  MSNLYGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVKELDGLVFLCFELHKNAVSRIALLFFLLPSIGTIHW

Query:  YRAVTSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFFTILTEI
        YRAVTSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFF ILTEI
Subjt:  YRAVTSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFFTILTEI

Query:  YRIISKKSLAAGEEIDIGSNPALFKGTNIVVPGQDQDSGTKGCCFAS
        YRIISKKSLAAGE IDIG NPALFKGTNIVVPGQDQ  G KGCCFAS
Subjt:  YRIISKKSLAAGEEIDIGSNPALFKGTNIVVPGQDQDSGTKGCCFAS

A0A6J1HTU8 ras-related protein RABA4d2.1e-10383Show/hide
Query:  MSNLYGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVKELDGLVFLCFELHKNAVSRIALLFFLLPSIGTIHW
        MSNLYGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLL+RFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVK                         +  + G    
Subjt:  MSNLYGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVKELDGLVFLCFELHKNAVSRIALLFFLLPSIGTIHW

Query:  YRAVTSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFFTILTEI
        YRAVTSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFF ILTEI
Subjt:  YRAVTSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFFTILTEI

Query:  YRIISKKSLAAGEEIDIGSNPALFKGTNIVVPGQDQDSGTKGCCFAS
        YRIISKKSLAAGE IDIG NPALFKGTNIVVPGQ+Q  G KGCCFAS
Subjt:  YRIISKKSLAAGEEIDIGSNPALFKGTNIVVPGQDQDSGTKGCCFAS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P25766 Ras-related protein RGP19.3e-8569.14Show/hide
Query:  YGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVKELDGLVFLCFELHKNAVSRIALLFFLLPSIGTIHWYRAV
        YG+  QKIDYVFKVVLIGDSAVGK+QLLARF+RNEF++DSKATIGVEFQT+TL ID +TVK                         +  + G    YRAV
Subjt:  YGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVKELDGLVFLCFELHKNAVSRIALLFFLLPSIGTIHWYRAV

Query:  TSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFFTILTEIYRII
        TSAYYRGAVGAMLVYD+TKRQSFDH+ARWLEELRGHADKNIVIMLIGNK DLG+LR VPTEDA+EFAERENLFFMETSALESTNVE AF T+LTEIYRI+
Subjt:  TSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFFTILTEIYRII

Query:  SKKSLAAGEEIDIGSNPALFKGTNIVVPGQDQDSGTKGCCFAS
        SKK+L A EE+D   N +L KGT IVVPGQ+    TK  C  S
Subjt:  SKKSLAAGEEIDIGSNPALFKGTNIVVPGQDQDSGTKGCCFAS

Q40191 Ras-related protein Rab11A1.3e-7564.08Show/hide
Query:  YGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVKELDGLVFLCFELHKNAVSRIALLFFLLPSIGTIHWYRAV
        YGD N KIDYVFKVVLIGDSAVGK+Q+LARF+RNEFS+DSK+TIGVEFQT+TLVID KTVK                         +  + G    YRAV
Subjt:  YGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVKELDGLVFLCFELHKNAVSRIALLFFLLPSIGTIHWYRAV

Query:  TSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFFTILTEIYRII
        TSAYYRGAVGAMLVYD+TKRQ+FDH+ RWLEELR HADKNIVI+LIGNKCDL + R VPTEDA+EFAE+E LFF+ETSALE+TNVE+AF T+LTEIY I+
Subjt:  TSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFFTILTEIYRII

Query:  SKKSLAAGEEIDIGSNPALFKGTNIVVPGQDQDSGTKG--CCFAS
        +KKSLAA E    G N A   G  I++PG  Q+   K   CC AS
Subjt:  SKKSLAAGEEIDIGSNPALFKGTNIVVPGQDQDSGTKG--CCFAS

Q40520 Ras-related protein Rab11C1.3e-7362.04Show/hide
Query:  MSNLYGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVKELDGLVFLCFELHKNAVSRIALLFFLLPSIGTIHW
        M++ YGD +QKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQ+LARF+RNEFS+DSKATIGVEFQT+TLVI  K+VK                         +  + G    
Subjt:  MSNLYGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVKELDGLVFLCFELHKNAVSRIALLFFLLPSIGTIHW

Query:  YRAVTSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFFTILTEI
        YRAVTSAYYRGAVGAMLVYD+TKRQ+FDH+ RWLEELR HAD+NIVIML GNK DL   RAVPTEDA+EFA++E LFF+ETSA+E+T +E AF T+LTEI
Subjt:  YRAVTSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFFTILTEI

Query:  YRIISKKSLAAGEEIDIGSNPALFKGTNIVVPGQDQ-DSGTKGCC
        + I++KK+LAA +E    SNPA   G  I+VPG  Q   G K CC
Subjt:  YRIISKKSLAAGEEIDIGSNPALFKGTNIVVPGQDQ-DSGTKGCC

Q9FE79 Ras-related protein RABA4c2.7e-8466.8Show/hide
Query:  MSNLYGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVKELDGLVFLCFELHKNAVSRIALLFFLLPSIGTIHW
        MS    ++NQKIDYVFKVVLIGDSAVGK+QLLARFSRNEFS++SKATIGVEFQT+TL ID+KT+K                         +  + G    
Subjt:  MSNLYGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVKELDGLVFLCFELHKNAVSRIALLFFLLPSIGTIHW

Query:  YRAVTSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFFTILTEI
        YRAVTSAYYRGAVGAMLVYD+TKRQSFDH+ARWLEELRGHADKNIVIMLIGNK DLG+LRAVPTEDA+EFA+RENLFFMETSAL+S NVE +F T+LTEI
Subjt:  YRAVTSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFFTILTEI

Query:  YRIISKKSLAAGEEIDIGSNPALFKGTNIVVPGQDQDSGTKGCCFAS
        YRI+SKK+L A EE + G + +L +GT IVV G++ +S  KGCC  S
Subjt:  YRIISKKSLAAGEEIDIGSNPALFKGTNIVVPGQDQDSGTKGCCFAS

Q9LH50 Ras-related protein RABA4d3.5e-9274.18Show/hide
Query:  MSNLYGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVKELDGLVFLCFELHKNAVSRIALLFFLLPSIGTIHW
        MSNLYGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARF+RNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVID KTVK                         +  + G    
Subjt:  MSNLYGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVKELDGLVFLCFELHKNAVSRIALLFFLLPSIGTIHW

Query:  YRAVTSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFFTILTEI
        YRAVTSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMA+WLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFA+RENLFFMETSALE+TNVETAF TILTEI
Subjt:  YRAVTSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFFTILTEI

Query:  YRIISKKSLAAGEEIDIGSNPALFKGTNIVVPGQDQDSGTKGCC
        YRIISKKSL A ++ D   N +L KGT I++P + +     GCC
Subjt:  YRIISKKSLAAGEEIDIGSNPALFKGTNIVVPGQDQDSGTKGCC

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G12160.1 RAB GTPase homolog A4D2.5e-9374.18Show/hide
Query:  MSNLYGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVKELDGLVFLCFELHKNAVSRIALLFFLLPSIGTIHW
        MSNLYGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARF+RNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVID KTVK                         +  + G    
Subjt:  MSNLYGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVKELDGLVFLCFELHKNAVSRIALLFFLLPSIGTIHW

Query:  YRAVTSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFFTILTEI
        YRAVTSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMA+WLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFA+RENLFFMETSALE+TNVETAF TILTEI
Subjt:  YRAVTSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFFTILTEI

Query:  YRIISKKSLAAGEEIDIGSNPALFKGTNIVVPGQDQDSGTKGCC
        YRIISKKSL A ++ D   N +L KGT I++P + +     GCC
Subjt:  YRIISKKSLAAGEEIDIGSNPALFKGTNIVVPGQDQDSGTKGCC

AT4G39990.1 RAB GTPase homolog A4B8.7e-7057.55Show/hide
Query:  YGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVKELDGLVFLCFELHKNAVSRIALLFFLLPSIGTIHWYRAV
        YG  + K+DYVFKVVLIGDSAVGK+QLLARF+R+EFS+DSKATIGVEFQT+TL I+QK++K                         +  + G    YRAV
Subjt:  YGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVKELDGLVFLCFELHKNAVSRIALLFFLLPSIGTIHWYRAV

Query:  TSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFFTILTEIYRII
        TSAYYRGAVGAMLVYDMTKR++F+H+ RWLEELR HADKNIVI+LIGNK DL   RAVPTEDA+EFAE+E LFF+ETSAL +TNVE +F T++T+IY  +
Subjt:  TSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFFTILTEIYRII

Query:  SKKSLAAGEEIDIGSNPALFKGTNIVVPGQDQD--SGTKGCCFAS
        +KK+LA+  +    +NP    G  I++PG  Q+  + T  CC +S
Subjt:  SKKSLAAGEEIDIGSNPALFKGTNIVVPGQDQD--SGTKGCCFAS

AT5G47960.1 RAB GTPase homolog A4C1.9e-8566.8Show/hide
Query:  MSNLYGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVKELDGLVFLCFELHKNAVSRIALLFFLLPSIGTIHW
        MS    ++NQKIDYVFKVVLIGDSAVGK+QLLARFSRNEFS++SKATIGVEFQT+TL ID+KT+K                         +  + G    
Subjt:  MSNLYGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVKELDGLVFLCFELHKNAVSRIALLFFLLPSIGTIHW

Query:  YRAVTSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFFTILTEI
        YRAVTSAYYRGAVGAMLVYD+TKRQSFDH+ARWLEELRGHADKNIVIMLIGNK DLG+LRAVPTEDA+EFA+RENLFFMETSAL+S NVE +F T+LTEI
Subjt:  YRAVTSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFFTILTEI

Query:  YRIISKKSLAAGEEIDIGSNPALFKGTNIVVPGQDQDSGTKGCCFAS
        YRI+SKK+L A EE + G + +L +GT IVV G++ +S  KGCC  S
Subjt:  YRIISKKSLAAGEEIDIGSNPALFKGTNIVVPGQDQDSGTKGCCFAS

AT5G60860.1 RAB GTPase homolog A1F4.0e-5953.14Show/hide
Query:  NQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVKELDGLVFLCFELHKNAVSRIALLFFLLPSIGTIHWYRAVTSAY
        + + DY+FKVVLIGDS VGK+ LL+RF+RNEFS++SK+TIGVEF T+++ +D K VK                         +  + G    YRA+TSAY
Subjt:  NQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVKELDGLVFLCFELHKNAVSRIALLFFLLPSIGTIHWYRAVTSAY

Query:  YRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFFTILTEIYRIISKKS
        YRGAVGA+LVYD+T+  +F+++ RWL+ELR H D NIVIM +GNK DL  LRAV TEDA+ FAEREN FFMETSALES NVE AF  +L++IYR++S+K+
Subjt:  YRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFFTILTEIYRIISKKS

Query:  LAAGEEIDIGSNP-ALFKGTNIVVPGQDQDSGTK--GCC
        L      DIG +P AL KG  I V  +D  S  K  GCC
Subjt:  LAAGEEIDIGSNP-ALFKGTNIVVPGQDQDSGTK--GCC

AT5G65270.1 RAB GTPase homolog A4A5.4e-7261.32Show/hide
Query:  YGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVKELDGLVFLCFELHKNAVSRIALLFFLLPSIGTIHWYRAV
        YGD +QKIDYVFKVVLIGDSAVGK+Q+LAR++R+EFS+DSKATIGVEFQT+TLVID K+VK                         +  + G    YRAV
Subjt:  YGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVKELDGLVFLCFELHKNAVSRIALLFFLLPSIGTIHWYRAV

Query:  TSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFFTILTEIYRII
        TSAYYRGAVGAMLVYD+T+RQ+FDH+ RWLEELR HADKNIVI+LIGNK DL   RA+PTEDA+EFAE+E LFF+ETSA  +TNVE+AF T+LTEI+ I+
Subjt:  TSAYYRGAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFFTILTEIYRII

Query:  SKKSLAAGEEIDIGSNPALFKGTNI-VVPGQDQDSGTKG--CC
        +KKSLAA E+ + G NP    G  I +VPG  Q    K   CC
Subjt:  SKKSLAAGEEIDIGSNPALFKGTNI-VVPGQDQDSGTKG--CC


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCGAATCTATATGGGGATTATAATCAGAAGATTGATTATGTTTTCAAAGTTGTGTTGATCGGAGATTCTGCTGTCGGCAAAACACAGCTCCTTGCTCGATTTTCCCG
GAATGAATTTAGCGTTGATTCCAAAGCTACTATTGGAGTCGAGTTTCAGACTAAAACTCTCGTCATTGATCAGAAAACAGTTAAAGAGCTCGATGGATTGGTATTCCTCT
GTTTCGAGCTGCACAAAAACGCGGTCTCTCGCATCGCCCTTCTTTTTTTCTTGCTTCCTTCGATCGGGACGATTCATTGGTACAGAGCAGTGACAAGTGCATACTACAGA
GGTGCAGTGGGAGCGATGCTAGTTTATGATATGACGAAGCGCCAGTCGTTCGACCACATGGCAAGGTGGCTGGAGGAACTAAGAGGGCATGCTGATAAGAACATCGTTAT
AATGCTCATCGGAAACAAATGCGATTTAGGAAGTCTCCGAGCGGTGCCAACAGAAGATGCACAAGAGTTTGCTGAAAGAGAAAACCTGTTCTTCATGGAGACTTCGGCTC
TGGAGTCGACGAATGTCGAAACTGCATTCTTCACAATTCTAACAGAGATTTATAGGATAATCAGCAAGAAAAGTCTTGCAGCTGGGGAAGAGATAGATATTGGTTCGAAT
CCAGCCCTGTTTAAAGGGACTAATATAGTTGTGCCTGGACAAGACCAGGATTCTGGGACAAAAGGTTGTTGCTTTGCGTCATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCGAATCTATATGGGGATTATAATCAGAAGATTGATTATGTTTTCAAAGTTGTGTTGATCGGAGATTCTGCTGTCGGCAAAACACAGCTCCTTGCTCGATTTTCCCG
GAATGAATTTAGCGTTGATTCCAAAGCTACTATTGGAGTCGAGTTTCAGACTAAAACTCTCGTCATTGATCAGAAAACAGTTAAAGAGCTCGATGGATTGGTATTCCTCT
GTTTCGAGCTGCACAAAAACGCGGTCTCTCGCATCGCCCTTCTTTTTTTCTTGCTTCCTTCGATCGGGACGATTCATTGGTACAGAGCAGTGACAAGTGCATACTACAGA
GGTGCAGTGGGAGCGATGCTAGTTTATGATATGACGAAGCGCCAGTCGTTCGACCACATGGCAAGGTGGCTGGAGGAACTAAGAGGGCATGCTGATAAGAACATCGTTAT
AATGCTCATCGGAAACAAATGCGATTTAGGAAGTCTCCGAGCGGTGCCAACAGAAGATGCACAAGAGTTTGCTGAAAGAGAAAACCTGTTCTTCATGGAGACTTCGGCTC
TGGAGTCGACGAATGTCGAAACTGCATTCTTCACAATTCTAACAGAGATTTATAGGATAATCAGCAAGAAAAGTCTTGCAGCTGGGGAAGAGATAGATATTGGTTCGAAT
CCAGCCCTGTTTAAAGGGACTAATATAGTTGTGCCTGGACAAGACCAGGATTCTGGGACAAAAGGTTGTTGCTTTGCGTCATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSNLYGDYNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKTQLLARFSRNEFSVDSKATIGVEFQTKTLVIDQKTVKELDGLVFLCFELHKNAVSRIALLFFLLPSIGTIHWYRAVTSAYYR
GAVGAMLVYDMTKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKCDLGSLRAVPTEDAQEFAERENLFFMETSALESTNVETAFFTILTEIYRIISKKSLAAGEEIDIGSN
PALFKGTNIVVPGQDQDSGTKGCCFAS