; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Pay0012634 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome

Gene IDPay0012634
OrganismCucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
DescriptionFra a 1-associated protein
Genome locationchr04:30267577..30271861
RNA-Seq ExpressionPay0012634
SyntenyPay0012634
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004136529.1 fra a 1-associated protein [Cucumis sativus]9.2e-9389.85Show/hide
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XP_008442953.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103486704 [Cucumis melo]2.9e-10799.48Show/hide
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XP_022151462.1 uncharacterized protein LOC111019393 [Momordica charantia]1.9e-7475.26Show/hide
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        S H+PF FPGLRSDI+AIE++LFGSMKGFFEAAEEIKNGFFG LRDP  F  +SSSP SMRRGIPIEDH+   FS P EPDSGHVDLSGLARDV
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XP_023539788.1 uncharacterized protein LOC111800367 [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.0e-6871.28Show/hide
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        MG VWR  +G+LDS A DG   +N +  SS DRCSTR VV+S CKTEEVEPGKFVRKCERTEEILRDCIGRP EVIQSN+EFTEEDVT+++V NRSF  G
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XP_038905970.1 fra a 1-associated protein [Benincasa hispida]9.8e-9590.21Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LGU7 Uncharacterized protein4.4e-9389.85Show/hide
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A0A1S3B6X7 uncharacterized protein LOC1034867041.4e-10799.48Show/hide
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A0A6J1DDK9 uncharacterized protein LOC1110193939.3e-7575.26Show/hide
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        S H+PF FPGLRSDI+AIE++LFGSMKGFFEAAEEIKNGFFG LRDP  F  +SSSP SMRRGIPIEDH+   FS P EPDSGHVDLSGLARDV
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A0A6J1FHK7 uncharacterized protein LOC1114458451.1e-6770.77Show/hide
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        SSE++PF+FPGLRSDI+AIE SLFGSMKGFF+AAEEI+NGFFGS RDPPLF+R+ SS  SMR+                EPDSGHVDLSGLARDV
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A0A6J1KVN4 uncharacterized protein LOC1114986068.4e-6870.77Show/hide
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        MG VWR  +G+LDS A DG   +N +  SS DRCSTR VV+S CKTEEVEPGKFVRKCERTEEILRDCIGRP EVIQSN+EFTEEDVT+++V NRSF  G
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        SSE++PF+FPGLRSDI+AIE SLFGSMKGFF+AAEEI+NGFFGS RDPP+FNR+ SS  SMR+                EPDSGHVDLSGLARDV
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
W5X2N3 Fra a 1-associated protein1.1e-5155Show/hide
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        MGWVW+DD    G ++ SA D   + D        DRCSTR VVR+ CKTEEVEPGKF+RKCE+TEE+LRDC+GRP EV+QSNKE+TE+DVTDQ++  S 
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          GS+++  F+FPGL+ DID IE +  G +  FFEAAE++KNGFF S   P +F+   S+S  S RR IPI+     E F       SG VDLSGLARDV
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G35900.1 unknown protein9.9e-4550.49Show/hide
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        MGW+W DD+    S++  GA   +     S   ++ CST  VVRS CKTEEVEPGKFVRKC++TEEILR C G+P+EV+QSN E TEEDVTDQMV RS  
Subjt:  MGWVWRDDTGDLDSSAVDGAKFDNSTYPSS---SDRCSTRNVVRSHCKTEEVEPGKFVRKCERTEEILRDCIGRPTEVIQSNKEFTEEDVTDQMVNRS-F

Query:  PLGSSEHRPFDFPGLRSDIDAIEQSLFGSMKGFFEAAEEIKNGFFGSLRDPPLFNRDSSSPGSMRRGIPIEDHDP-EFFSN----PKEP-DSGHVDLSGL
        P    +  P +FPGLR D+DAIE+     MK FF+AAEE+ +  F  + D          P + R GIPIE+H   E   N    P  P  SG +DLSGL
Subjt:  PLGSSEHRPFDFPGLRSDIDAIEQSLFGSMKGFFEAAEEIKNGFFGSLRDPPLFNRDSSSPGSMRRGIPIEDHDP-EFFSN----PKEP-DSGHVDLSGL

Query:  ARDV
        A+DV
Subjt:  ARDV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGATGGGTCTGGAGAGACGACACCGGCGATTTGGATTCATCTGCCGTTGATGGCGCCAAGTTCGACAATTCCACCTATCCATCCTCCAGCGATCGGTGTTCG
ACGAGAAATGTGGTGAGGTCGCACTGCAAGACCGAGGAGGTTGAGCCCGGAAAATTCGTCAGGAAGTGCGAGAGAACCGAGGAGATCCTCAGGGACTGCATTGGA
AGGCCAACCGAAGTGATACAGTCCAACAAGGAATTTACGGAAGAGGATGTAACAGATCAGATGGTCAATAGGTCATTCCCGTTGGGATCATCAGAACATCGACCC
TTTGATTTCCCTGGACTCCGTAGCGATATCGATGCCATTGAACAGAGTCTCTTTGGTAGCATGAAGGGGTTCTTTGAAGCAGCTGAAGAGATTAAGAATGGTTTC
TTTGGTTCTTTAAGAGATCCACCCCTATTCAATAGAGATTCTTCCTCTCCCGGATCGATGAGACGTGGTATACCGATTGAAGATCATGATCCAGAGTTCTTCTCC
AACCCAAAAGAGCCCGATTCTGGTCACGTTGACCTATCTGGATTGGCCAGGGATGTCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATAAAAACTCACATCTTTTATCTAATTCTCGTGTCTTCTCAAGCCGTGGCGCTCAAGAAAAACTCCACCGTAACAAAAGAGAATCTTGTGGCGTTCAAGAAGGTT
CGCGATATCCAGCTTCGAAAATGGGATGGGTCTGGAGAGACGACACCGGCGATTTGGATTCATCTGCCGTTGATGGCGCCAAGTTCGACAATTCCACCTATCCAT
CCTCCAGCGATCGGTGTTCGACGAGAAATGTGGTGAGGTCGCACTGCAAGACCGAGGAGGTTGAGCCCGGAAAATTCGTCAGGAAGTGCGAGAGAACCGAGGAGA
TCCTCAGGGACTGCATTGGAAGGCCAACCGAAGTGATACAGTCCAACAAGGAATTTACGGAAGAGGATGTAACAGATCAGATGGTCAATAGGTCATTCCCGTTGG
GATCATCAGAACATCGACCCTTTGATTTCCCTGGACTCCGTAGCGATATCGATGCCATTGAACAGAGTCTCTTTGGTAGCATGAAGGGGTTCTTTGAAGCAGCTG
AAGAGATTAAGAATGGTTTCTTTGGTTCTTTAAGAGATCCACCCCTATTCAATAGAGATTCTTCCTCTCCCGGATCGATGAGACGTGGTATACCGATTGAAGATC
ATGATCCAGAGTTCTTCTCCAACCCAAAAGAGCCCGATTCTGGTCACGTTGACCTATCTGGATTGGCCAGGGATGTCTAAATGCCCTTAATGAACCTGATCGCCC
CTTTCTTTTTCTGATTAGATACTACGGGTACACAGTATATTGTCTTTAATTTTGGTGACTGTACATTTGGTGATCAATAAAATACTCTTTAGTTTTCCTTCAGCT
AGTTTGTTTTTCCCTGGAAGAGGTCAAGTCTAAGCCATTATTGTTATATTTTCAACTTTTGCTTATAGACATATTGATTGATTATGTGCGGGAATCTTTCTTGAA
AGAGTGCAAAATTGTTGGTTTGAAAACAACCAAGTTTTCTAGTTTCAATTGGCTATACACTCCTTGAACATTCACACTTGTAAAGGTTAAAAAAATCAAATTCAA
CAATGGCAGTGGTGGAGGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGWVWRDDTGDLDSSAVDGAKFDNSTYPSSSDRCSTRNVVRSHCKTEEVEPGKFVRKCERTEEILRDCIGRPTEVIQSNKEFTEEDVTDQMVNRSFPLGSSEHRP
FDFPGLRSDIDAIEQSLFGSMKGFFEAAEEIKNGFFGSLRDPPLFNRDSSSPGSMRRGIPIEDHDPEFFSNPKEPDSGHVDLSGLARDV