; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Pay0012680 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome

Gene IDPay0012680
OrganismCucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
Descriptionserine/arginine-rich splicing factor RSZ21
Genome locationchr10:3367280..3370055
RNA-Seq ExpressionPay0012680
SyntenyPay0012680
Gene Ontology termsGO:0003723 - RNA binding (molecular function)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000504 - RNA recognition motif domain
IPR001878 - Zinc finger, CCHC-type
IPR012677 - Nucleotide-binding alpha-beta plait domain superfamily
IPR035979 - RNA-binding domain superfamily
IPR036875 - Zinc finger, CCHC-type superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7012825.1 Serine/arginine-rich splicing factor RSZ21A [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.4e-9296.32Show/hide
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TYK15593.1 serine/arginine-rich splicing factor RSZ21 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]4.3e-9599.47Show/hide
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XP_008446226.1 PREDICTED: serine/arginine-rich splicing factor RSZ21 [Cucumis melo]8.6e-9699.47Show/hide
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XP_011655636.1 serine/arginine-rich splicing factor RSZ21 [Cucumis sativus]4.6e-9799.47Show/hide
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XP_023004543.1 serine/arginine-rich splicing factor RSZ21-like [Cucurbita maxima]3.4e-9297.35Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BEJ4 serine/arginine-rich splicing factor RSZ214.2e-9699.47Show/hide
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A0A5D3CUM7 Serine/arginine-rich splicing factor RSZ21 isoform X12.1e-9599.47Show/hide
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A0A6J1G1N9 serine/arginine-rich splicing factor RSZ21-like isoform X11.1e-9195.74Show/hide
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A0A6J1GX57 serine/arginine-rich splicing factor RSZ21-like1.4e-9196.3Show/hide
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A0A6J1KZV2 serine/arginine-rich splicing factor RSZ21-like1.6e-9297.35Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O81126 Serine/arginine-rich splicing factor RSZ223.9e-5969.7Show/hide
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O81127 Serine/arginine-rich splicing factor RSZ215.3e-6471.14Show/hide
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Q69KL9 Serine/arginine-rich splicing factor RSZ21A8.5e-5465.45Show/hide
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Q6K4N0 Serine/arginine-rich splicing factor RSZ214.6e-5264.21Show/hide
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Q9SJA6 Serine/arginine-rich splicing factor RSZ22A4.8e-5767.88Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G23860.1 RS-containing zinc finger protein 213.8e-6571.14Show/hide
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AT1G23860.2 RS-containing zinc finger protein 213.8e-6571.14Show/hide
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AT1G23860.4 RS-containing zinc finger protein 214.6e-6369.65Show/hide
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AT4G31580.1 serine/arginine-rich 222.8e-6069.7Show/hide
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AT4G31580.2 serine/arginine-rich 222.8e-6069.7Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACTAGAGTTTATATTGGTAATCTGGATCCACGCGTTACAGAGAGGGATCTCGAAGATGAATTTCGAATGTTCGGTGTTCTTAGGAGTGTTTGGGTTGCTAGAAGGCC
TCCAGGATATGCGTTTATTGAGTTTGATGATCGCAGGGATGCTCTAGATGCAATACAAGCTTTGGATGGAAAAAATGGTTGGCGTGTGGAGCTTTCTCACAACTCTAAAG
GTGGGGGAGGAGGTGGTGGTCGTCGTGGCCGTGGTGCTGGCGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGATGATTTGAAATGTTATGAATGTGGTGAGCCTGGACATTTTGCTCGT
GAATGCCGTTCACGTGGGGGCTCACGAGGTGTAGGAGGTGGTCTGCGTCGTAGTCCTTCTCCTCGGCGTCGTCGGAGTCCAAGCTATGAAAGATATGGCCGCAGGAGTAA
CAGTCCTCGTGGTAAAAGATCCCCACGACGTCGCAGCATTACACCTCCTAAGCGCGGTCGTAGCTACAGCAGATCTCCTCCATACCGTCATGCTCGTCGTGCTTCGCCTT
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ATGCTAATGGAGATTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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