; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Pay0013002 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome

Gene IDPay0013002
OrganismCucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
DescriptionSignaling peptide TAXIMIN 1
Genome locationchr05:7162431..7164260
RNA-Seq ExpressionPay0013002
SyntenyPay0013002
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004140113.1 signaling peptide TAXIMIN 1 [Cucumis sativus]3.5e-3598.7Show/hide
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A0A0A0KGH9 Uncharacterized protein1.7e-3598.7Show/hide
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A0A1S3BLY0 uncharacterized protein LOC1034912889.8e-36100Show/hide
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A0A6J1ER78 uncharacterized protein LOC1114370711.2e-3392.21Show/hide
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A0A6J1GJJ0 uncharacterized protein LOC1114548651.2e-3394.81Show/hide
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A0A6J1I283 uncharacterized protein LOC1114683582.7e-3392.21Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O82275 Signaling peptide TAXIMIN 16.0e-3083.12Show/hide
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Q1G309 Signaling peptide TAXIMIN 21.5e-2056.94Show/hide
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        GDCRPLGFL+GLPFA V+L+L+++G +IWI+G  L+C+CPCC C   +   A++LIK P  V+ WFT  IPC
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G20562.1 unknown protein1.0e-2156.94Show/hide
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AT2G31090.1 unknown protein4.2e-3183.12Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTGTTGTGGAGATGGCGATTGTAGGCCTCTCGGCTTCTTGCTTGGCTTGCCTTTTGCTTTCGTTTCTCTTCTCCTTTCCATTATCGGCGTAATTATATGGATTGTGGG
ATTGACGCTTACTTGCATATGTCCTTGTTGTTTGTGCTTAACGGTGATAGTGGAGCTTGCTTTGGAGCTGATCAAAGCCCCATTTCATGTCATGGAGTGGTTCACCTCTC
AGATTCCTTGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AGGAGATCCATGTGGTCTTGTATTTTTTCCATGAAAAAAAAGAGAGAATATTAGATAAATACAACATAAGTAAAAGGATAAATTCATTAGTAGATTTTATTTATTTATTT
CTATACAATTAACTCCAAGTTTTTAATTCTCAAAAAGAGTTTTATGTCCATGATTCAAGTTTCCAACCCCCTGTGTACTTAATTCTAAGTTCTAACCACTCTGTATTATT
GACATTGAGATGTTTGATTTGGGAAATACAAAACTTTTATTTTATAATGAAATTTTTATTGGAAAAGCAAACCTTTCCGTCGTCATCTAAGACTTACTTTGTTCAAAAGT
CAATTATACTCTGCTATCTCTACACTTTTTGGTCCAAACTCCAAAACCCATTCATTTAAAATATATATAAACAACACAAAGAATCGCATTCACAAAACAAAACCCATCTG
TTACACATTCTTCTTGATTTCTCAGCATCTTTTTTCTTCTTTCAGCAAAGGGATTCATTCATTCGATCAGGGCAAAACTCAGAAGATATGTGTTGTGGAGATGGCGATTG
TAGGCCTCTCGGCTTCTTGCTTGGCTTGCCTTTTGCTTTCGTTTCTCTTCTCCTTTCCATTATCGGCGTAATTATATGGATTGTGGGATTGACGCTTACTTGCATATGTC
CTTGTTGTTTGTGCTTAACGGTGATAGTGGAGCTTGCTTTGGAGCTGATCAAAGCCCCATTTCATGTCATGGAGTGGTTCACCTCTCAGATTCCTTGTTGATTGTTCATA
TTTATCAAAGAGGAAAGTCGGAGAAGCATTATATTGTGTAATTAGATTACCTTGTTTGTGTGAGATTTGCATTGGATATGAATATGGAGCTCTGTGTGTTCTTTGCTTCA
ATGAAATAGCCTTCCATTGATTGTTTATTTCATCAATAATCAATATAGAATTGAGGTTCACTTTTACAATATTTCTGGAATTCAAATTTTATTCTCTAGAAATTGTTTTA
TGATTTGTGAGGCTACTACGATAGAAATTCTATGTAAATTATTGTGCTTTTAAGGGTGAAAATGACAGGAGCAGTTCTTAAGGCTCTTCCTCTTCTGTCTCGTGATCATC
CAGCTTCCAAAAGCCATCAGCATCTTGTACCATTCCTTTGTTTTGAGCACACCACCATGAGCCAGGCACTAAATACTCTTCCTTGAGAGCATTCAAAGCTTTGTTCACAC
GTGCTATGTCTCTTTTCACTTCTAACATGAATCCACCTTCATTTCCCTGTGTTCCTGCTACCCCATGTAGATAAGCCTCCAAAGAATGCCAGCTCTTGAAACCTCCGGGA
CTCTTCAAGTATTCTGACTTTCGTGTGTCAATTATCAGCTCCTCTCCAACTTTCGCATAGCCCGTCAGTGGGTAATCCGGTACTATGTCGGCCTTGTTTCGTGTTCGCAG
CAGATGAAGCTCATTCATGGAGTTAAAAGTCTTTCTGAAGTTGCGATCTCCTACATGTGGACAGCCAAACAAGAAGGCTGTAACAGGGCAGGGTTTCTGAGGTTGCTTTT
TCCCCTTATTGATCCGATTTGCAATAATGTCTGTTGCATTCAAGGTTCCAAGGGCAGCACCTAAACTATGTCCTGTTATAGTTATGCTGATATCTTCATCTTGAAATTCT
TCTAGTAGCTTCTCAATTTCAGATAGAACCTGATCATTTAGATGATAGAATATAGTTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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