; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Pay0013202 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome

Gene IDPay0013202
OrganismCucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
DescriptionRetrotransposon protein
Genome locationchr05:11933569..11934706
RNA-Seq ExpressionPay0013202
SyntenyPay0013202
Gene Ontology termsGO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0033290.1 putative nuclease HARBI1 [Cucumis melo var. makuwa]6.8e-10065.16Show/hide
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                                             AILRGKSYYPVDVQCRTIMVCCLLHNLINREMTNSEIIDDLDEGDSTYATTGGDEINYIEASN
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        GWSEWRDQLA
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KAA0062747.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]3.2e-9762.15Show/hide
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        MDRRCFAILCHLLRTTAGLV TEVIDVEEMVAMFLHILAH +KNRMIQREFVRSGETVSRHFN+VLLA  RLHDELLKKPQ VTNSCTDPRWKWFE   N
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        CL + +GTYIKVNVSATDRPRY TRKGEVATNVLG CDTK                                                            
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                                                AILRGKSYYPVDVQCRTIM CCLLHNLINREMTNSEIIDDLDEGDSTYATTGGDEINYIE
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        ASN WSEWRDQLA TMFS+W+L  Q
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TYK08389.1 putative nuclease HARBI1 [Cucumis melo var. makuwa]1.7e-9876.61Show/hide
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        IDDLDEGDSTYATTGGDEINYIEASN WSE RDQLA TMFS+W+L DQ
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XP_008441953.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103485952 [Cucumis melo]7.5e-9976.61Show/hide
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        ALDGTYIKVNVSA DRPR      S  +GE                    V     G+   +  ILRGKSYYPVDVQCRTIM CCLLHNLI REMTN+EI
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        IDDLDEGDSTYATTGGDEINYIEASN WSE RDQLA TMFS+W+L DQ
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XP_008456821.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103496660 [Cucumis melo]2.0e-9983.93Show/hide
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        ALD TYIKVNVSATDRPRY TRKGEVATNVLGVCDTK               ILRGKSYYPV+VQCRTIM CCLLHNLIN+EM NSEIIDDLDEGDSTYA
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        TT GDEINYIEASN  S+WRDQLA
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3B4J8 uncharacterized protein LOC1034859523.6e-9976.61Show/hide
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        ALDGTYIKVNVSA DRPR      S  +GE                    V     G+   +  ILRGKSYYPVDVQCRTIM CCLLHNLI REMTN+EI
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        IDDLDEGDSTYATTGGDEINYIEASN WSE RDQLA TMFS+W+L DQ
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A0A1S3C5E3 uncharacterized protein LOC1034966609.6e-10083.93Show/hide
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        ALD TYIKVNVSATDRPRY TRKGEVATNVLGVCDTK               ILRGKSYYPV+VQCRTIM CCLLHNLIN+EM NSEIIDDLDEGDSTYA
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        TT GDEINYIEASN  S+WRDQLA
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A0A5A7SQU2 Putative nuclease HARBI13.3e-10065.16Show/hide
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        ALD TYIKVNVSATDRPRYSTRKGEVA NVLGVCDTK                                                               
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Query:  -------------------------------------AILRGKSYYPVDVQCRTIMVCCLLHNLINREMTNSEIIDDLDEGDSTYATTGGDEINYIEASN
                                             AILRGKSYYPVDVQCRTIMVCCLLHNLINREMTNSEIIDDLDEGDSTYATTGGDEINYIEASN
Subjt:  -------------------------------------AILRGKSYYPVDVQCRTIMVCCLLHNLINREMTNSEIIDDLDEGDSTYATTGGDEINYIEASN

Query:  GWSEWRDQLA
        GWSEWRDQLA
Subjt:  GWSEWRDQLA

A0A5A7U0J9 Putative nuclease HARBI13.6e-9976.61Show/hide
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Query:  ALDGTYIKVNVSATDRPR-----YSTRKGE--------------------VATNVLGVCDTK-AILRGKSYYPVDVQCRTIMVCCLLHNLINREMTNSEI
        ALDGTYIKVNVSA DRPR      S  +GE                    V     G+   +  ILRGKSYYPVDVQCRTIM CCLLHNLI REMTN+EI
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A0A5D3CDG6 Putative nuclease HARBI18.1e-9976.61Show/hide
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Query:  ALDGTYIKVNVSATDRPR-----YSTRKGE--------------------VATNVLGVCDTK-AILRGKSYYPVDVQCRTIMVCCLLHNLINREMTNSEI
        ALDGTYIKVNVSA DRPR      S  +GE                    V     G+      ILRGKSYYPVDVQCRTIM CCLLHNLI REMTN+EI
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        IDDLDEGDSTYATTGGDEINYIEASN WSE RDQLA TMFS+W+L DQ
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G43722.1 unknown protein1.4e-1533.56Show/hide
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        M   CF  LC++L+T   L  T  I +EE VAMFL I  H+   R +   F R+ ETV R F  VL A   L  + ++ P      ++      D R W 
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Query:  WFENCLGALDGTYIKVNVSATDRPRYSTRKGEVATNVLGVCDTKAI
        +F   +GA+DGT++ V V    +  Y  R    + N++ +CD K +
Subjt:  WFENCLGALDGTYIKVNVSATDRPRYSTRKGEVATNVLGVCDTKAI

AT5G28950.1 unknown protein1.0e-0521.37Show/hide
Query:  WKWFENCLGALDGTYIKVNVSATDRPRYSTRKGEVATNVLGVCDTKA-ILRGKSYYPVDVQCRTIMVCCLLHN-----LINREMTNSEIIDDLDEGDSTY
        + +F++C+GA+D T+I   VS    P +  RKG+++ N+L  C+     +   S +        ++   L  N     +   + +  E+++++++ +   
Subjt:  WKWFENCLGALDGTYIKVNVSATDRPRYSTRKGEVATNVLGVCDTKA-ILRGKSYYPVDVQCRTIMVCCLLHN-----LINREMTNSEIIDDLDEGDSTY

Query:  ATTGGDEINYIEASNGWSEWRDQLARTMFSN
         TT   +  Y       ++WR+ +A  M++N
Subjt:  ATTGGDEINYIEASNGWSEWRDQLARTMFSN

AT5G41980.1 CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Putative harbinger transposase-derived nuclease (InterPro:IPR006912)4.2e-1536.3Show/hide
Query:  MDRRCFAILCHLLRTTAGLVGTEVIDVEEMVAMFLHILAHDMKNRMIQREFVRSGETVSRHFNLVLLAALRLHDELLKKPQLVTNSCT----DPRWKWFE
        MD+  F  LC LL+T   L  T  I +E  +A+FL I+ H+++ R +Q  F  SGET+SRHFN VL A + +  +     Q  +NS T    DP   +F+
Subjt:  MDRRCFAILCHLLRTTAGLVGTEVIDVEEMVAMFLHILAHDMKNRMIQREFVRSGETVSRHFNLVLLAALRLHDELLKKPQLVTNSCT----DPRWKWFE

Query:  NCLGALDGTYIKVNVSATDRPRYSTRKGEVATNVL
        +C+G +D  +I V V   ++  +    G +  NVL
Subjt:  NCLGALDGTYIKVNVSATDRPRYSTRKGEVATNVL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATAGAAGGTGTTTTGCCATTTTATGTCATTTACTAAGGACGACTGCTGGATTAGTCGGAACAGAAGTTATAGATGTAGAGGAGATGGTTGCCATGTTCCTGCATAT
ATTAGCTCATGATATGAAGAATCGAATGATACAAAGGGAATTTGTACGGTCTGGTGAGACTGTTTCTAGACATTTCAACCTTGTCTTGTTAGCAGCTTTGAGGTTACACG
ACGAGTTATTGAAAAAACCTCAGCTAGTAACAAACTCGTGCACGGATCCGAGATGGAAATGGTTTGAGAATTGTCTTGGTGCATTAGATGGCACATACATTAAGGTGAAT
GTCAGTGCAACTGATCGTCCAAGATACAGCACACGAAAGGGTGAAGTTGCGACAAATGTACTTGGTGTTTGCGATACAAAAGCAATTTTAAGAGGAAAGTCATACTACCC
AGTCGATGTCCAATGTCGAACAATCATGGTGTGTTGTCTGCTACACAATCTTATCAATAGAGAGATGACTAACAGTGAAATAATCGATGATTTGGATGAGGGTGATTCAA
CATACGCTACAACTGGAGGTGACGAGATTAATTACATTGAGGCTTCAAACGGGTGGAGTGAATGGAGGGATCAATTGGCTCGTACGATGTTCAGTAATTGGAAGTTACAT
GACCAGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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GACCAGTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDRRCFAILCHLLRTTAGLVGTEVIDVEEMVAMFLHILAHDMKNRMIQREFVRSGETVSRHFNLVLLAALRLHDELLKKPQLVTNSCTDPRWKWFENCLGALDGTYIKVN
VSATDRPRYSTRKGEVATNVLGVCDTKAILRGKSYYPVDVQCRTIMVCCLLHNLINREMTNSEIIDDLDEGDSTYATTGGDEINYIEASNGWSEWRDQLARTMFSNWKLH
DQ