; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Pay0013343 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome

Gene IDPay0013343
OrganismCucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
DescriptionGlutaredoxin-C5
Genome locationchr11:31925614..31929388
RNA-Seq ExpressionPay0013343
SyntenyPay0013343
Gene Ontology termsGO:0034599 - cellular response to oxidative stress (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0004499 - N,N-dimethylaniline monooxygenase activity (molecular function)
GO:0015038 - glutathione disulfide oxidoreductase activity (molecular function)
GO:0050660 - flavin adenine dinucleotide binding (molecular function)
GO:0050661 - NADP binding (molecular function)
GO:0097573 - glutathione oxidoreductase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002109 - Glutaredoxin
IPR011899 - Glutaredoxin, eukaryotic/virial
IPR014025 - Glutaredoxin subgroup
IPR036249 - Thioredoxin-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004140671.2 glutaredoxin-C5, chloroplastic [Cucumis sativus]2.4e-9395.34Show/hide
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XP_022954295.1 glutaredoxin-C5, chloroplastic-like [Cucurbita moschata]5.1e-7587.5Show/hide
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XP_023549357.1 glutaredoxin-C5, chloroplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.4e-7788.04Show/hide
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XP_038874858.1 glutaredoxin-C5, chloroplastic-like [Benincasa hispida]9.5e-8291.8Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KA52 Glutaredoxin domain-containing protein1.2e-9395.34Show/hide
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A0A1S3CB05 glutaredoxin-C5, chloroplastic2.4e-99100Show/hide
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A0A5D3DLT6 Glutaredoxin-C52.4e-99100Show/hide
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A0A6J1GS13 glutaredoxin-C5, chloroplastic-like2.5e-7587.5Show/hide
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A0A6J1JVU3 monothiol glutaredoxin-S10-like1.8e-7080.98Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O81187 Glutaredoxin2.2e-2053.76Show/hide
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P55142 Glutaredoxin-C61.7e-2052.48Show/hide
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        K T+   PVVVYSK++C +   VK LF++LG     IELD     G +LQ  L   TGQ TVPNVFI GKHIGGC DT+ L  +G+L P+L+EA A  S 
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        A
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Q0J3L4 Monothiol glutaredoxin-S102.5e-4578.63Show/hide
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        +S+++ +SSSS  SSFGSR+E+SVK T+  NPVV+YSK+WCSYS EVKALFKR+GVQP VIELD+LG QGPQLQKVLERLTGQ TVPNVFIGGKHIGGCT
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        DTVKL+RKGEL  MLSE
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Q8GWS0 Glutaredoxin-C5, chloroplastic2.9e-4968.42Show/hide
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        QKVLERLTGQHTVPNVF+ GKHIGGCTDTVKL RKG+LE ML+EAN K+ ++
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Q8LBS4 Monothiol glutaredoxin-S12, chloroplastic1.7e-4153.85Show/hide
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        YSS+VK+LFK L V+PLV+ELD+LG +G QLQ VLE++TGQ+TVPNVFIGGKHIGGC+DT++L+ KGELE +L+EAN K+ +
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G20270.1 Thioredoxin superfamily protein1.2e-4253.85Show/hide
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        +N T    NS   +SF   + + +   LPF        I I+    L      R  S++++SSSSSSS      GS LEE+VKTT+ +NPVVVYSKTWCS
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        YSS+VK+LFK L V+PLV+ELD+LG +G QLQ VLE++TGQ+TVPNVFIGGKHIGGC+DT++L+ KGELE +L+EAN K+ +
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AT2G20270.2 Thioredoxin superfamily protein3.1e-3846.89Show/hide
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        +N T    NS   +SF   + + +   LPF        I I+    L      R  S++++SSSSSSS      GS LEE+VKTT+ +NPVVVYSKTWCS
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Query:  YSSEVKALFKRLGVQPLVIELDEL---------------------------GPQGPQLQKVLERLTGQHTVPNVFIGGKHIGGCTDTVKLYRKGELEPML
        YSS+VK+LFK L V+PLV+ELD+L                           G +G QLQ VLE++TGQ+TVPNVFIGGKHIGGC+DT++L+ KGELE +L
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Query:  SEANAKHSE
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AT4G28730.1 Glutaredoxin family protein2.1e-5068.42Show/hide
Query:  SCTSKSISISKHNSLNGFTRTRSMSIQSV-SSSSSSSSSSSSFGSRLEESVKTTITQNPVVVYSKTWCSYSSEVKALFKRLGVQPLVIELDELGPQGPQL
        SC+S S S+    S       +S S++++ SSSS++SSSSSSFGSR+EES++ T+T+N VV+YSKTWCSY +EVK LFKRLGVQPLV+ELD+LGPQGPQL
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        QKVLERLTGQHTVPNVF+ GKHIGGCTDTVKL RKG+LE ML+EAN K+ ++
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AT5G40370.1 Glutaredoxin family protein2.5e-1947.47Show/hide
Query:  ESVKTTITQNPVVVYSKTWCSYSSEVKALFKRLGVQPLVIELDELGPQGPQLQKVLERLTGQHTVPNVFIGGKHIGGCTDTVKLYRKGELEPMLSEANA
        +  K  +    VVV+SKT+C Y   VK L ++LG +   +ELD     G Q+Q  L   TGQ TVPNVFIGG HIGGC  T  L++ G+L P+L+EA A
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AT5G63030.1 Thioredoxin superfamily protein2.5e-1947.92Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAGAATTGGAGCTTGAGCTTGAAATCAATGGCGGTTCCTTCCAATTTCACCTCCGTTCCTCCAAATTCTCCTCGCCCTCTTTCCTTCTTCTTCAAAGCTTCCGTTTT
TTCCCTCCCCTTTTACAATTCCTGCACTTCCAAATCCATTTCCATCTCAAAACACAATTCCCTCAATGGCTTTACGAGGACTAGATCCATGTCGATTCAATCCGTTTCTT
CTTCTTCCTCCTCCTCCTCCTCTTCTTCTTCTTTTGGTTCTAGGCTCGAGGAGAGTGTCAAAACTACAATTACACAGAACCCAGTTGTTGTTTACTCCAAGACATGGTGT
TCGTATTCTTCTGAGGTTAAGGCTTTGTTCAAGAGGCTTGGAGTGCAGCCATTGGTCATTGAATTGGATGAATTAGGTCCCCAAGGGCCACAATTGCAAAAGGTACTTGA
GAGGCTTACAGGACAACATACGGTACCAAACGTTTTCATTGGGGGCAAACATATAGGTGGTTGTACAGATACTGTGAAACTATACCGAAAAGGAGAACTCGAACCTATGC
TATCTGAAGCTAATGCTAAACATTCAGAGGCATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATAAAATAAAGTTTTCTTTTTGGTGCCCCTTCAAGGTTTATATATGGTTTGCTTTAGGAGGTCAAAAAGTAAAGTGAGAAAGTGAAACCTTTTGATAGGTTACAACAAAT
TGAGAAGATGAAGAATTGGAGCTTGAGCTTGAAATCAATGGCGGTTCCTTCCAATTTCACCTCCGTTCCTCCAAATTCTCCTCGCCCTCTTTCCTTCTTCTTCAAAGCTT
CCGTTTTTTCCCTCCCCTTTTACAATTCCTGCACTTCCAAATCCATTTCCATCTCAAAACACAATTCCCTCAATGGCTTTACGAGGACTAGATCCATGTCGATTCAATCC
GTTTCTTCTTCTTCCTCCTCCTCCTCCTCTTCTTCTTCTTTTGGTTCTAGGCTCGAGGAGAGTGTCAAAACTACAATTACACAGAACCCAGTTGTTGTTTACTCCAAGAC
ATGGTGTTCGTATTCTTCTGAGGTTAAGGCTTTGTTCAAGAGGCTTGGAGTGCAGCCATTGGTCATTGAATTGGATGAATTAGGTCCCCAAGGGCCACAATTGCAAAAGG
TACTTGAGAGGCTTACAGGACAACATACGGTACCAAACGTTTTCATTGGGGGCAAACATATAGGTGGTTGTACAGATACTGTGAAACTATACCGAAAAGGAGAACTCGAA
CCTATGCTATCTGAAGCTAATGCTAAACATTCAGAGGCATAAGCCTCAAGGCACATTTTGTTTTCTGAGCCATTTGGTGACTGACCTGTTGTTGATGTTTTCAATTCTAC
CTCAAGAGACACTTATGTTTTTAGTTAGGAAAATTATGTATGTTAAGCTATTTGTGGATGAATTTGTTACAAGGAACTCCAACTTGTGCCATGAATAAGAAAACATTTAT
TACCATTTGGAAAGTTCTTTTCTTGACATTTGTTTTTAATGAGATTTTTCTAAAGTAATAACATTTTCC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKNWSLSLKSMAVPSNFTSVPPNSPRPLSFFFKASVFSLPFYNSCTSKSISISKHNSLNGFTRTRSMSIQSVSSSSSSSSSSSSFGSRLEESVKTTITQNPVVVYSKTWC
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