; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Pay0013575 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome

Gene IDPay0013575
OrganismCucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
Descriptionglycine-rich cell wall structural protein 1-like
Genome locationchr05:6935857..6942655
RNA-Seq ExpressionPay0013575
SyntenyPay0013575
Gene Ontology termsGO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0057340.1 glycine-rich cell wall structural protein 1.8-like [Cucumis melo var. makuwa]2.2e-4158.82Show/hide
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TYK13397.1 glycine-rich cell wall structural protein 1.8-like [Cucumis melo var. makuwa]6.3e-6869.23Show/hide
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        GEI GRG        GRGG+A+GEIFGRGG+A+GEI GRG   ++IG ++GRGGK +G I G GG       GRG+      G GG  GGIVIGGRRMGG
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XP_011658456.2 chromatin target of PRMT1 protein [Cucumis sativus]7.5e-3767.72Show/hide
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XP_016900727.1 PREDICTED: glycine-rich cell wall structural protein 1-like [Cucumis melo]2.1e-132100Show/hide
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XP_031742894.1 glycine-rich cell wall structural protein 1.8-like [Cucumis sativus]1.4e-5671.63Show/hide
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        MGEILGRGGE  GE +GRGG+A+GEI GRGG+AMGEILGRGGE +GE +GRGGK IGEIFGRGG AMGEI GRGGE +GE +GRGGKAIGEI GRGG A+
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        GEI GRG       +GRGGKAIGEIFGRGG+AIGEI GRGV +GAMLGRGGKVVG I GGGGG G G GGGGGR  GG   GGR +GG   GG    GG 
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          GGR +G
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KHS4 Pollen coat oleosin-glycine rich protein6.1e-5365.44Show/hide
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        MGE+LGRGGE  GE +GRGG+A+GEI GRGG+AMGEILGRGGE +GE +GRGGK IGEIFGRGG AMGEI GRGGE +GE +GRGGKAIGEI GRGG A+
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        GEI GRG       +GRGGKAIGEIFGRGG A+GEI GR G ++G  +GRGGK +      GG  GGGGGGGRG+GGGGG GG  +GG   GG  +GG G
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A0A1S4DXM4 glycine-rich cell wall structural protein 1-like1.0e-132100Show/hide
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A0A5A7UQF2 Glycine-rich cell wall structural protein 1.8-like1.1e-4158.82Show/hide
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A0A5D3BMR9 Glycine-rich cell wall structural protein 1-like4.7e-3794.79Show/hide
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A0A5D3CNE0 Glycine-rich cell wall structural protein 1.8-like3.0e-6869.23Show/hide
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        GEI GRG        GRGG+A+GEIFGRGG+A+GEI GRG   ++IG ++GRGGK +G I G GG       GRG+      G GG  GGIVIGGRRMGG
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G23450.1 unknown protein1.5e-0642.93Show/hide
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        G GG   G   G GG   G   G GG       G GG   G + G  G  +G  FG+GG   G I G+GG  +G  +G+GG  IG  +G+GG       G
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         G+G+GG  IG   G+GG  IG   G+G  IG  +G+GG + GGI      GGG G G G+GGG G+GG V GG   GG V GG G  GGI
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGCGAAATATTGGGACGAGGCGGTGAGGCTACTGGTGAGATAATTGGACGCGGAGGTGAAGCTATGGGTGAAATATTAGGACGAGGTGGTAAAGCTATGGGAGAAAT
ATTGGGTCGAGGTGGTGAAGCTATCGGTGAAATAGTGGGACGAGGGGGTAAAGATATTGGTGAGATATTTGGACGAGGTGGCGAAGCAATGGGTGAAATATTTGGGCGAG
GTGGTGAAGCTATGGGTGAAATATTAGGACGAGGTGGTAAAGCTATAGGTGAAATATTGGGACGAGGGGGTGAAGCTATTGGTGAAATATTTGGACGGGGTGTGGGACGA
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TATGCGTTCGAGCGAGATAAGTCCAGGGGTCGCTTTGTAGAGACGTTCGCCAACGTCGGGTCTAATGAGCCTGTCGGGTATGAGGAATTTGACGTGCCGGATGGAAACGA
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGCGAAATATTGGGACGAGGCGGTGAGGCTACTGGTGAGATAATTGGACGCGGAGGTGAAGCTATGGGTGAAATATTAGGACGAGGTGGTAAAGCTATGGGAGAAAT
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TATGGAGTTTCCATCCATGTACAACTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGEILGRGGEATGEIIGRGGEAMGEILGRGGKAMGEILGRGGEAIGEIVGRGGKDIGEIFGRGGEAMGEIFGRGGEAMGEILGRGGKAIGEILGRGGEAIGEIFGRGVGR
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YAFERDKSRGRFVETFANVGSNEPVGYEEFDVPDGNDMEFPSMYN