; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Pay0013606 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome

Gene IDPay0013606
OrganismCucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
DescriptionGlycine-rich protein family
Genome locationchr07:6240678..6241991
RNA-Seq ExpressionPay0013606
SyntenyPay0013606
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008463760.1 PREDICTED: cold and drought-regulated protein CORA-like [Cucumis melo]4.4e-5691.24Show/hide
Query:  MTYPKTLIGLGLLLALLFISSQVSARLLEEDKVKADGLDYH------------GGHYGGGGHYGGGGHYGGGGHYGGGHGGHYGGGHYGGGHGLDADTKK
        MTYPKTLIGLGLLLALLFISSQVSARLLEEDKVKADGLDYH            GGHYGGGGHYGGGGHYGGGGHYGGGHGGHYGGGHYGGGHGLDADTKK
Subjt:  MTYPKTLIGLGLLLALLFISSQVSARLLEEDKVKADGLDYH------------GGHYGGGGHYGGGGHYGGGGHYGGGHGGHYGGGHYGGGHGLDADTKK

Query:  LNDQGLDSHGGHHGGGHGHGGGHHHCHHPHCPESVKN
        LNDQGLDSHGGHHGGGHGHGGGHHHCHHPHCPESVKN
Subjt:  LNDQGLDSHGGHHGGGHGHGGGHHHCHHPHCPESVKN

XP_010412618.1 PREDICTED: cold and drought-regulated protein CORA-like [Camelina sativa]2.9e-0754.69Show/hide
Query:  KTLIGLGLLLALLFISSQVSA-------RLLEEDKVKADGLDYHGGHYGGGGHY---GGGGHYGGGGHYGGGHGGHYGG----GHYGGGHGLDADTKKLN
        K LI LG L A+L + S+VSA       +   E+ V+ +G   HGGH  GGGHY   GGGGHYGGGGHYGGG GGHYGG    GH GGGHGLD       
Subjt:  KTLIGLGLLLALLFISSQVSA-------RLLEEDKVKADGLDYHGGHYGGGGHY---GGGGHYGGGGHYGGGHGGHYGG----GHYGGGHGLDADTKKLN

Query:  DQGLDSHGGHHG-GGHGHGGGHHHCHHP
          G   HGGH G GGHGHGGG H  + P
Subjt:  DQGLDSHGGHHG-GGHGHGGGHHHCHHP

XP_010488629.1 PREDICTED: glycine-rich cell wall structural protein-like [Camelina sativa]2.1e-0553.23Show/hide
Query:  KTLIGLGLLLALLFISSQVSA-------RLLEEDKVKADGLDYHGGHYGGGGHYGGGGHY---GGGGHYGGGHGGHY----GGGHYGGGHGLDADTKKLN
        K LI LG L A+L + S+VSA       +   E+KV+ +G   HGGH  GGGHYGGGGHY   GGGGHYGGG GGHY    GGGHYGGG G         
Subjt:  KTLIGLGLLLALLFISSQVSA-------RLLEEDKVKADGLDYHGGHYGGGGHYGGGGHY---GGGGHYGGGHGGHY----GGGHYGGGHGLDADTKKLN

Query:  DQGLDSHGGHH--GGGHGHGGGHH
               GGH+  GGGHGHGGG H
Subjt:  DQGLDSHGGHH--GGGHGHGGGHH

XP_011654035.2 cold and drought-regulated protein CORA [Cucumis sativus]8.1e-4268.02Show/hide
Query:  MTYPKTLIGLGLLLALLFISSQVSARLLEEDKVKADGLDYHGGHYGGGGHYG----------GGGHYGGGGHYGGGH--------GGHYGGGHYGGGHGL
        MTYPKTLIG GLLLALLFISSQVSARLLEEDKVK+DGLDY GG YGGGGHYG          GGGHYGGGGHYGGGH        GGHYGGGHYGGGHGL
Subjt:  MTYPKTLIGLGLLLALLFISSQVSARLLEEDKVKADGLDYHGGHYGGGGHYG----------GGGHYGGGGHYGGGH--------GGHYGGGHYGGGHGL

Query:  DADTKKLNDQGLD----SHGGHHGGGHG-------------------HGG------GHHHCHHPHCPESVKN
        DA+TK+ NDQGLD     HGGHHGGGHG                   HGG      GHHHCHHPHCPESVKN
Subjt:  DADTKKLNDQGLD----SHGGHHGGGHG-------------------HGG------GHHHCHHPHCPESVKN

XP_038900076.1 histidine-rich glycoprotein-like [Benincasa hispida]6.5e-0749.61Show/hide
Query:  MTYPKTLIGLGLLLALLFISSQVSARLLEEDKVKADGLDYHGGHYGGGGHYGGGGHYGGGGHYGGGHGGHYGGGHYGGGHGLDADTKKLNDQGLDSHGGH
        M Y KTL+ LGLLLALLF+SS VSARLLEEDK   +  D+HG H     H+  G H+   GH+   HG H        GH  DA     N  GLD H GH
Subjt:  MTYPKTLIGLGLLLALLFISSQVSARLLEEDKVKADGLDYHGGHYGGGGHYGGGGHYGGGGHYGGGHGGHYGGGHYGGGHGLDADTKKLNDQGLDSHGGH

Query:  HGGGHGHGGGHH-----------HCHHPH
        HGGGHGH GGHH           H HH H
Subjt:  HGGGHGHGGGHH-----------HCHHPH

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L4K0 Uncharacterized protein1.1e-3676.47Show/hide
Query:  MTYPKTLIGLGLLLALLFISSQVSARLLEEDKVKADGLDYHGGHYGGGGHYG----------GGGHYGGGGHYGGGH--------GGHYGGGHYGGGHGL
        MTYPKTLIG GLLLALLFISSQVSARLLEEDKVK+DGLDY GG YGGGGHYG          GGGHYGGGGHYGGGH        GGHYGGGHYGGGHGL
Subjt:  MTYPKTLIGLGLLLALLFISSQVSARLLEEDKVKADGLDYHGGHYGGGGHYG----------GGGHYGGGGHYGGGH--------GGHYGGGHYGGGHGL

Query:  DADTKKLNDQGLD----SHGGHHGGGHG--HGGGHH
        DA+TK+ NDQGLD     HGGHHGGGHG  HGGGHH
Subjt:  DADTKKLNDQGLD----SHGGHHGGGHG--HGGGHH

A0A178VR48 Uncharacterized protein1.9e-0450Show/hide
Query:  KTLIGLGLLLALLFISSQVSARLL------EEDKVKADGLDYHGGH--YGGGGHYGG-----GGHYGGGGH----YGGGHGGHY--GGGHYGGGHGLDAD
        K LI LGL   LL +S   +AR         E+ V+ +G  YHGGH  +GGGGHYGG     GGH GGGGH    YGGGHGGHY  GGGHYGGG G    
Subjt:  KTLIGLGLLLALLFISSQVSARLL------EEDKVKADGLDYHGGH--YGGGGHYGG-----GGHYGGGGH----YGGGHGGHY--GGGHYGGGHGLDAD

Query:  TKKLNDQGLDSHGGHHGGGHGHGGGHHHCHHP
               G    GGH+GGG  HGGG H  + P
Subjt:  TKKLNDQGLDSHGGHHGGGHGHGGGHHHCHHP

A0A1S3CJZ6 cold and drought-regulated protein CORA-like2.1e-5691.24Show/hide
Query:  MTYPKTLIGLGLLLALLFISSQVSARLLEEDKVKADGLDYH------------GGHYGGGGHYGGGGHYGGGGHYGGGHGGHYGGGHYGGGHGLDADTKK
        MTYPKTLIGLGLLLALLFISSQVSARLLEEDKVKADGLDYH            GGHYGGGGHYGGGGHYGGGGHYGGGHGGHYGGGHYGGGHGLDADTKK
Subjt:  MTYPKTLIGLGLLLALLFISSQVSARLLEEDKVKADGLDYH------------GGHYGGGGHYGGGGHYGGGGHYGGGHGGHYGGGHYGGGHGLDADTKK

Query:  LNDQGLDSHGGHHGGGHGHGGGHHHCHHPHCPESVKN
        LNDQGLDSHGGHHGGGHGHGGGHHHCHHPHCPESVKN
Subjt:  LNDQGLDSHGGHHGGGHGHGGGHHHCHHPHCPESVKN

A0A5D3DWK2 Cold and drought-regulated protein CORA-like2.1e-5691.24Show/hide
Query:  MTYPKTLIGLGLLLALLFISSQVSARLLEEDKVKADGLDYH------------GGHYGGGGHYGGGGHYGGGGHYGGGHGGHYGGGHYGGGHGLDADTKK
        MTYPKTLIGLGLLLALLFISSQVSARLLEEDKVKADGLDYH            GGHYGGGGHYGGGGHYGGGGHYGGGHGGHYGGGHYGGGHGLDADTKK
Subjt:  MTYPKTLIGLGLLLALLFISSQVSARLLEEDKVKADGLDYH------------GGHYGGGGHYGGGGHYGGGGHYGGGHGGHYGGGHYGGGHGLDADTKK

Query:  LNDQGLDSHGGHHGGGHGHGGGHHHCHHPHCPESVKN
        LNDQGLDSHGGHHGGGHGHGGGHHHCHHPHCPESVKN
Subjt:  LNDQGLDSHGGHHGGGHGHGGGHHHCHHPHCPESVKN

A0A5N6RVV5 Uncharacterized protein1.5e-0455.75Show/hide
Query:  MTYPKTLIGLGLLLA-LLFISSQVSARLLEEDKVKADGLDYHGGHYGGGGHYGGGGHYGGGGHYGGGHGGHYGGGHYGGGHGLDADTKKLNDQGLDSHGG
        M Y KTL+  GLL A +L ISS VSAR LEE+ VK D    HG  YGGG  YG GG YG GGH G GHGGH  GGH+  GHG  ++T+   +     HGG
Subjt:  MTYPKTLIGLGLLLA-LLFISSQVSARLLEEDKVKADGLDYHGGHYGGGGHYGGGGHYGGGGHYGGGHGGHYGGGHYGGGHGLDADTKKLNDQGLDSHGG

Query:  HHG-GGHGHGGGH
        H G GGHG  GGH
Subjt:  HHG-GGHGHGGGH

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G05440.2 GLYCINE RICH PROTEIN 92.5e-0445.99Show/hide
Query:  KTLIGLGLLLALLFISSQVSARLL------EEDKVKADGL---------------DYHGGHYGGGGH-----YGGGGHY-GGGGHYGGGHGGHY--GGGH
        K LI LGL   LL +S   +AR         E+ V+ +G                  HGGH GGGGH      GGGGHY GGGGHYGGG GGHY  GGGH
Subjt:  KTLIGLGLLLALLFISSQVSARLL------EEDKVKADGL---------------DYHGGHYGGGGH-----YGGGGHY-GGGGHYGGGHGGHY--GGGH

Query:  YGGGHGLDADTKKLNDQGLDSHGGHHGGGHGHGGGHH
        YGGG G           G   H G  GGG+G GGGHH
Subjt:  YGGGHGLDADTKKLNDQGLDSHGGHHGGGHGHGGGHH

AT2G05440.3 GLYCINE RICH PROTEIN 93.8e-0549.19Show/hide
Query:  KTLIGLGLLLALLFISSQVSARLL------EEDKVKADGL----DYHGGHYGGGGHYGGGGHYGGGGH----YGGGHGGHY--GGGHYGGGHGLDADTKK
        K LI LGL   LL +S   +AR         E+ V+ +G       HGGH GGGGH G GGH GGGGH    YGGG GGHY  GGGHYGGG G       
Subjt:  KTLIGLGLLLALLFISSQVSARLL------EEDKVKADGL----DYHGGHYGGGGHYGGGGHYGGGGH----YGGGHGGHY--GGGHYGGGHGLDADTKK

Query:  LNDQGLDSHGGHHGGGHGHGGGHH
                 GGH+GGG+G GGGHH
Subjt:  LNDQGLDSHGGHHGGGHGHGGGHH

AT2G05440.4 GLYCINE RICH PROTEIN 91.4e-0445.99Show/hide
Query:  KTLIGLGLLLALLFISSQVSARLL------EEDKVKADGL---------------DYHGGHYGGGGH-----YGGGGHY-GGGGHYGGGHGGHY--GGGH
        K LI LGL   LL +S   +AR         E+ V+ +G                  HGGH GGGGH      GGGGHY GGGGHYGGG GGHY  GGGH
Subjt:  KTLIGLGLLLALLFISSQVSARLL------EEDKVKADGL---------------DYHGGHYGGGGH-----YGGGGHY-GGGGHYGGGHGGHY--GGGH

Query:  YGGGHGLDADTKKLNDQGLDSHGGHHGGGHGHGGGHH
        YGGG G           G   H G  GGG+G GGGHH
Subjt:  YGGGHGLDADTKKLNDQGLDSHGGHHGGGHGHGGGHH

AT2G05440.7 GLYCINE RICH PROTEIN 97.6e-0646.56Show/hide
Query:  KTLIGLGLLLALLFISSQVSARLL------EEDKVKADGL---------------DYHGGHYGGGGH-----YGGGGHY-GGGGHYGGGHGGHYGGGHYG
        K LI LGL   LL +S   +AR         E+ V+ +G                  HGGH GGGGH      GGGGHY GGGGHYGGG GGH GGGHYG
Subjt:  KTLIGLGLLLALLFISSQVSARLL------EEDKVKADGL---------------DYHGGHYGGGGH-----YGGGGHY-GGGGHYGGGHGGHYGGGHYG

Query:  GGHGLDADTKKLNDQGLDSHGGHHGGGHGHG
        GG G           G    GGHHGGG GHG
Subjt:  GGHGLDADTKKLNDQGLDSHGGHHGGGHGHG

AT2G05510.1 Glycine-rich protein family1.8e-0748.46Show/hide
Query:  KTLIGLGLLLALLFISSQVSAR----LLEEDKVKADGLDYHGGH--YGGGGHYGG-----GGHYGGGGH----YGGGHGGHY--GGGHYGGGHGLDADTK
        K LI LGL   LL +S   +AR    +  E +       YHGGH  +GGGGHYGG     GGH GGGGH    YGGGHGGHY  GGGHYGGG G      
Subjt:  KTLIGLGLLLALLFISSQVSAR----LLEEDKVKADGLDYHGGH--YGGGGHYGG-----GGHYGGGGH----YGGGHGGHY--GGGHYGGGHGLDADTK

Query:  KLNDQGLDSHGGHHGGGHGHGGGHHHCHHP
                  GGH+GGG  HGGG H  + P
Subjt:  KLNDQGLDSHGGHHGGGHGHGGGHHHCHHP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACTTACCCTAAAACCCTTATCGGTCTCGGTCTCCTCCTCGCTCTTCTTTTCATCTCCTCCCAGGTCTCGGCTCGCCTACTCGAGGAAGACAAAGTTAAGGCC
GATGGCTTAGATTATCACGGTGGACACTACGGCGGAGGAGGTCACTACGGCGGAGGTGGACACTACGGGGGAGGAGGTCACTACGGTGGAGGACACGGGGGACAC
TATGGTGGAGGACACTACGGCGGAGGACATGGCCTTGATGCTGACACCAAAAAGTTGAACGATCAAGGTCTAGATAGTCACGGTGGACACCACGGCGGAGGGCAC
GGTCACGGCGGCGGCCACCACCACTGCCACCATCCCCACTGCCCTGAGAGTGTTAAGAATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ACCAAAAAATAGCCCAAGTTAATTAATTAGCAAAAGCACTTAGCTTTGTTAATTAACCAAAAATGACTTACCCTAAAACCCTTATCGGTCTCGGTCTCCTCCTCG
CTCTTCTTTTCATCTCCTCCCAGGTCTCGGCTCGCCTACTCGAGGAAGACAAAGTTAAGGCCGATGGCTTAGATTATCACGGTGGACACTACGGCGGAGGAGGTC
ACTACGGCGGAGGTGGACACTACGGGGGAGGAGGTCACTACGGTGGAGGACACGGGGGACACTATGGTGGAGGACACTACGGCGGAGGACATGGCCTTGATGCTG
ACACCAAAAAGTTGAACGATCAAGGTCTAGATAGTCACGGTGGACACCACGGCGGAGGGCACGGTCACGGCGGCGGCCACCACCACTGCCACCATCCCCACTGCC
CTGAGAGTGTTAAGAATTAGAACCCTAATACCTACACCCCATCTGCTACCATGTTTGGTTCAAAATAAAAGCATATTATTGTACCATGAAATAAAGTTTGTTTTA
TGTGTGTGTTGTGTTTTAAATTTAAATAAAAGCATAAGATATGTTGTATGAAGTGGAGATGATGCTAAATTATCATACTTTGGTAATTTATTACAACCTATGATC
TTTCTAGTTTTCATATTATATATGTAATGTCAAACTATATATAAACTTGATTTTGCTTTGTACATAACTTTAATTTTCCATAATATATGTTATTATTGGTTTTCT
AAGTCA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MTYPKTLIGLGLLLALLFISSQVSARLLEEDKVKADGLDYHGGHYGGGGHYGGGGHYGGGGHYGGGHGGHYGGGHYGGGHGLDADTKKLNDQGLDSHGGHHGGGH
GHGGGHHHCHHPHCPESVKN