; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Pay0013640 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome

Gene IDPay0013640
OrganismCucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
Descriptionprotein CHLOROPLAST IMPORT APPARATUS 2
Genome locationchr05:24836952..24841025
RNA-Seq ExpressionPay0013640
SyntenyPay0013640
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
TYK03087.1 protein CHLOROPLAST IMPORT APPARATUS 2 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]1.2e-16399.34Show/hide
Query:  MSSPCISGGGRAYNFDLEIVKSPSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSHDD
        MSSPCISGGGRAYNFDLEIVKSPSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSHDD
Subjt:  MSSPCISGGGRAYNFDLEIVKSPSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSHDD

Query:  SSSLFCESAELLLPFRVIDSSGFLLHQPLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIMGNLSVDNLEN
        SSSLFCESAELLLPFRVIDSSGFLLHQPLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIMGNLSVDNLEN
Subjt:  SSSLFCESAELLLPFRVIDSSGFLLHQPLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIMGNLSVDNLEN

Query:  GNSTQDSCVNANNHQRNWNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAPAPAPTPTPTPAAVSTKKKKKKLEK
        GNSTQDSCVNANNHQRNWNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAPAPAP PTPTPAAVSTKKKKKK+EK
Subjt:  GNSTQDSCVNANNHQRNWNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAPAPAPTPTPTPAAVSTKKKKKKLEK

Query:  L
        L
Subjt:  L

XP_004149511.2 protein CHLOROPLAST IMPORT APPARATUS 2 isoform X2 [Cucumis sativus]5.0e-16298.34Show/hide
Query:  MSSPCISGGGRAYNFDLEIVKSPSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSHDD
        MSSPCISGGGRAYNFDLEI+KSPSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSHDD
Subjt:  MSSPCISGGGRAYNFDLEIVKSPSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSHDD

Query:  SSSLFCESAELLLPFRVIDSSGFLLHQPLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIMGNLSVDNLEN
        SSSLFCESAELLLPFRVIDSSGFLLHQPLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIMGNLSVDNLE 
Subjt:  SSSLFCESAELLLPFRVIDSSGFLLHQPLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIMGNLSVDNLEN

Query:  GNSTQDSCVNANNHQRNWNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAPAPAPTPTPTPAAVSTKKKKKKLEK
        GNSTQDSCVNANNH RNWNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAPAP PTPTPTPAAVSTKKKKKK+EK
Subjt:  GNSTQDSCVNANNHQRNWNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAPAPAPTPTPTPAAVSTKKKKKKLEK

Query:  L
        L
Subjt:  L

XP_008451201.1 PREDICTED: protein CHLOROPLAST IMPORT APPARATUS 2 isoform X1 [Cucumis melo]3.1e-16499.67Show/hide
Query:  MSSPCISGGGRAYNFDLEIVKSPSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSHDD
        MSSPCISGGGRAYNFDLEIVKSPSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSHDD
Subjt:  MSSPCISGGGRAYNFDLEIVKSPSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSHDD

Query:  SSSLFCESAELLLPFRVIDSSGFLLHQPLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIMGNLSVDNLEN
        SSSLFCESAELLLPFRVIDSSGFLLHQPLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIMGNLSVDNLEN
Subjt:  SSSLFCESAELLLPFRVIDSSGFLLHQPLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIMGNLSVDNLEN

Query:  GNSTQDSCVNANNHQRNWNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAPAPAPTPTPTPAAVSTKKKKKKLEK
        GNSTQDSCVNANNHQRNWNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAPAPAPTPTPTPAAVSTKKKKKK+EK
Subjt:  GNSTQDSCVNANNHQRNWNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAPAPAPTPTPTPAAVSTKKKKKKLEK

Query:  L
        L
Subjt:  L

XP_008451210.1 PREDICTED: protein CHLOROPLAST IMPORT APPARATUS 2 isoform X2 [Cucumis melo]3.1e-16499.67Show/hide
Query:  MSSPCISGGGRAYNFDLEIVKSPSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSHDD
        MSSPCISGGGRAYNFDLEIVKSPSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSHDD
Subjt:  MSSPCISGGGRAYNFDLEIVKSPSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSHDD

Query:  SSSLFCESAELLLPFRVIDSSGFLLHQPLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIMGNLSVDNLEN
        SSSLFCESAELLLPFRVIDSSGFLLHQPLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIMGNLSVDNLEN
Subjt:  SSSLFCESAELLLPFRVIDSSGFLLHQPLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIMGNLSVDNLEN

Query:  GNSTQDSCVNANNHQRNWNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAPAPAPTPTPTPAAVSTKKKKKKLEK
        GNSTQDSCVNANNHQRNWNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAPAPAPTPTPTPAAVSTKKKKKK+EK
Subjt:  GNSTQDSCVNANNHQRNWNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAPAPAPTPTPTPAAVSTKKKKKKLEK

Query:  L
        L
Subjt:  L

XP_011648958.1 protein CHLOROPLAST IMPORT APPARATUS 2 isoform X1 [Cucumis sativus]5.0e-16298.34Show/hide
Query:  MSSPCISGGGRAYNFDLEIVKSPSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSHDD
        MSSPCISGGGRAYNFDLEI+KSPSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSHDD
Subjt:  MSSPCISGGGRAYNFDLEIVKSPSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSHDD

Query:  SSSLFCESAELLLPFRVIDSSGFLLHQPLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIMGNLSVDNLEN
        SSSLFCESAELLLPFRVIDSSGFLLHQPLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIMGNLSVDNLE 
Subjt:  SSSLFCESAELLLPFRVIDSSGFLLHQPLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIMGNLSVDNLEN

Query:  GNSTQDSCVNANNHQRNWNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAPAPAPTPTPTPAAVSTKKKKKKLEK
        GNSTQDSCVNANNH RNWNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAPAP PTPTPTPAAVSTKKKKKK+EK
Subjt:  GNSTQDSCVNANNHQRNWNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAPAPAPTPTPTPAAVSTKKKKKKLEK

Query:  L
        L
Subjt:  L

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LGV4 CCT domain-containing protein2.4e-16298.34Show/hide
Query:  MSSPCISGGGRAYNFDLEIVKSPSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSHDD
        MSSPCISGGGRAYNFDLEI+KSPSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSHDD
Subjt:  MSSPCISGGGRAYNFDLEIVKSPSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSHDD

Query:  SSSLFCESAELLLPFRVIDSSGFLLHQPLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIMGNLSVDNLEN
        SSSLFCESAELLLPFRVIDSSGFLLHQPLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIMGNLSVDNLE 
Subjt:  SSSLFCESAELLLPFRVIDSSGFLLHQPLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIMGNLSVDNLEN

Query:  GNSTQDSCVNANNHQRNWNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAPAPAPTPTPTPAAVSTKKKKKKLEK
        GNSTQDSCVNANNH RNWNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAPAP PTPTPTPAAVSTKKKKKK+EK
Subjt:  GNSTQDSCVNANNHQRNWNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAPAPAPTPTPTPAAVSTKKKKKKLEK

Query:  L
        L
Subjt:  L

A0A1S3BQD2 protein CHLOROPLAST IMPORT APPARATUS 2 isoform X21.5e-16499.67Show/hide
Query:  MSSPCISGGGRAYNFDLEIVKSPSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSHDD
        MSSPCISGGGRAYNFDLEIVKSPSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSHDD
Subjt:  MSSPCISGGGRAYNFDLEIVKSPSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSHDD

Query:  SSSLFCESAELLLPFRVIDSSGFLLHQPLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIMGNLSVDNLEN
        SSSLFCESAELLLPFRVIDSSGFLLHQPLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIMGNLSVDNLEN
Subjt:  SSSLFCESAELLLPFRVIDSSGFLLHQPLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIMGNLSVDNLEN

Query:  GNSTQDSCVNANNHQRNWNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAPAPAPTPTPTPAAVSTKKKKKKLEK
        GNSTQDSCVNANNHQRNWNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAPAPAPTPTPTPAAVSTKKKKKK+EK
Subjt:  GNSTQDSCVNANNHQRNWNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAPAPAPTPTPTPAAVSTKKKKKKLEK

Query:  L
        L
Subjt:  L

A0A1S3BQX8 protein CHLOROPLAST IMPORT APPARATUS 2 isoform X11.5e-16499.67Show/hide
Query:  MSSPCISGGGRAYNFDLEIVKSPSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSHDD
        MSSPCISGGGRAYNFDLEIVKSPSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSHDD
Subjt:  MSSPCISGGGRAYNFDLEIVKSPSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSHDD

Query:  SSSLFCESAELLLPFRVIDSSGFLLHQPLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIMGNLSVDNLEN
        SSSLFCESAELLLPFRVIDSSGFLLHQPLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIMGNLSVDNLEN
Subjt:  SSSLFCESAELLLPFRVIDSSGFLLHQPLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIMGNLSVDNLEN

Query:  GNSTQDSCVNANNHQRNWNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAPAPAPTPTPTPAAVSTKKKKKKLEK
        GNSTQDSCVNANNHQRNWNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAPAPAPTPTPTPAAVSTKKKKKK+EK
Subjt:  GNSTQDSCVNANNHQRNWNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAPAPAPTPTPTPAAVSTKKKKKKLEK

Query:  L
        L
Subjt:  L

A0A5D3BUC5 Protein CHLOROPLAST IMPORT APPARATUS 2 isoform X15.8e-16499.34Show/hide
Query:  MSSPCISGGGRAYNFDLEIVKSPSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSHDD
        MSSPCISGGGRAYNFDLEIVKSPSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSHDD
Subjt:  MSSPCISGGGRAYNFDLEIVKSPSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSHDD

Query:  SSSLFCESAELLLPFRVIDSSGFLLHQPLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIMGNLSVDNLEN
        SSSLFCESAELLLPFRVIDSSGFLLHQPLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIMGNLSVDNLEN
Subjt:  SSSLFCESAELLLPFRVIDSSGFLLHQPLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIMGNLSVDNLEN

Query:  GNSTQDSCVNANNHQRNWNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAPAPAPTPTPTPAAVSTKKKKKKLEK
        GNSTQDSCVNANNHQRNWNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAPAPAP PTPTPAAVSTKKKKKK+EK
Subjt:  GNSTQDSCVNANNHQRNWNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAPAPAPTPTPTPAAVSTKKKKKKLEK

Query:  L
        L
Subjt:  L

A0A6J1K6B9 protein CHLOROPLAST IMPORT APPARATUS 22.2e-12381.91Show/hide
Query:  MSSPCISGGGRAYNFDLEIVKSPSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSHDD
        MSSPCISGGGRAY+FDLEIVKSPSSSWTRTSQ+SSPSSTLSESSNN TQLAISTRK RTPRKRPNQTYNEAT+LLSTAYPNVFS KHLTNPRKFTKSHD 
Subjt:  MSSPCISGGGRAYNFDLEIVKSPSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSHDD

Query:  SSSLFCESAELLLPFRVIDSSGFLLHQPLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIMGNLSVDNLEN
          SLF +SAELLLPFR IDSS FL+HQPL  EKPNSQIHSKL NLWENRPCSSPGE+DFQP+SM   E+EDFDAESILDEEIEEGIDSI+GNL VDNLE 
Subjt:  SSSLFCESAELLLPFRVIDSSGFLLHQPLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIMGNLSVDNLEN

Query:  GNSTQDSCVNANNHQRNWN--WNPIGL-GFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAPAPAPTPTPTPAAVSTKKKKKK
        G+S QDSC  ANNH  NWN  WNPIGL GFNQKFESG+    GIERTAIR VDNGNWWRFPTVDV+EISPKLNPKPPA          P+AV+TKKKKKK
Subjt:  GNSTQDSCVNANNHQRNWN--WNPIGL-GFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAPAPAPTPTPTPAAVSTKKKKKK

Query:  LEKL
        +EKL
Subjt:  LEKL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9LU68 Protein CHLOROPLAST IMPORT APPARATUS 22.5e-3139.21Show/hide
Query:  SPCIS---GGGRAYNFDLEIVKS-PSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSH
        S C+S   GG  AY+F+LE VKS P SS T T++ +SPSST+SESSN  + LAISTRK RT RKRPNQTYNEA  LLSTAYPN+FS    +N     K+H
Subjt:  SPCIS---GGGRAYNFDLEIVKS-PSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSH

Query:  DDSSSLFC--------ESAELLLPFRVIDSSGFLLHQPLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIM
          S+S F         ++++LLLP+  I+   FL H P ++ K  ++  S    +     C   GEI+      + +  ++FDAESILDE+IEEGIDSIM
Subjt:  DDSSSLFC--------ESAELLLPFRVIDSSGFLLHQPLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIM

Query:  GNLSVDNLENG--NSTQDSCVNANNHQRN------------WNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAP
        G +   N  +G   S     +N      +             +WN    GFN  F  G G      R+A+R  D+   W+  TVD  +ISP++       
Subjt:  GNLSVDNLENG--NSTQDSCVNANNHQRN------------WNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAP

Query:  APAPT--------PTPTPAAVSTKKKKKK
        A +                  S KKKKKK
Subjt:  APAPT--------PTPTPAAVSTKKKKKK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G25990.1 CCT motif family protein6.8e-3237.25Show/hide
Query:  AYNFDLEIVKSPSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSHDDSSSLFCESAEL
        AY+F+LE++KSP S     + T SPSST+SE+  N+   +ISTR+ RTPRKRPNQTY+EA  LLSTAYP +FS+K      +   ++    S + E+++L
Subjt:  AYNFDLEIVKSPSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSHDDSSSLFCESAEL

Query:  LLPFRVIDSSGFLLHQPLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIMGNLSVDNLENGNSTQDSCVNA
        LLP+  I+ + FL          N  I +K  +  E +  S     D + N   +  ++DFDAESILDEEIEEGIDS MG     N+E+ +  +++C   
Subjt:  LLPFRVIDSSGFLLHQPLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIMGNLSVDNLENGNSTQDSCVNA

Query:  NNHQRNWNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAPA---------PAPTPTPTPAAVSTKKKKKKLEK
           +       +   +N +F  G G      R+++R  ++ NWW+FPTV+  +ISP++     A A          +   T   A    KKKKKK +K
Subjt:  NNHQRNWNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAPA---------PAPTPTPTPAAVSTKKKKKKLEK

AT4G25990.2 CCT motif family protein6.8e-3237.25Show/hide
Query:  AYNFDLEIVKSPSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSHDDSSSLFCESAEL
        AY+F+LE++KSP S     + T SPSST+SE+  N+   +ISTR+ RTPRKRPNQTY+EA  LLSTAYP +FS+K      +   ++    S + E+++L
Subjt:  AYNFDLEIVKSPSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSHDDSSSLFCESAEL

Query:  LLPFRVIDSSGFLLHQPLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIMGNLSVDNLENGNSTQDSCVNA
        LLP+  I+ + FL          N  I +K  +  E +  S     D + N   +  ++DFDAESILDEEIEEGIDS MG     N+E+ +  +++C   
Subjt:  LLPFRVIDSSGFLLHQPLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIMGNLSVDNLENGNSTQDSCVNA

Query:  NNHQRNWNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAPA---------PAPTPTPTPAAVSTKKKKKKLEK
           +       +   +N +F  G G      R+++R  ++ NWW+FPTV+  +ISP++     A A          +   T   A    KKKKKK +K
Subjt:  NNHQRNWNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAPA---------PAPTPTPTPAAVSTKKKKKKLEK

AT5G57180.1 chloroplast import apparatus 21.8e-3239.21Show/hide
Query:  SPCIS---GGGRAYNFDLEIVKS-PSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSH
        S C+S   GG  AY+F+LE VKS P SS T T++ +SPSST+SESSN  + LAISTRK RT RKRPNQTYNEA  LLSTAYPN+FS    +N     K+H
Subjt:  SPCIS---GGGRAYNFDLEIVKS-PSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSH

Query:  DDSSSLFC--------ESAELLLPFRVIDSSGFLLHQPLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIM
          S+S F         ++++LLLP+  I+   FL H P ++ K  ++  S    +     C   GEI+      + +  ++FDAESILDE+IEEGIDSIM
Subjt:  DDSSSLFC--------ESAELLLPFRVIDSSGFLLHQPLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIM

Query:  GNLSVDNLENG--NSTQDSCVNANNHQRN------------WNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAP
        G +   N  +G   S     +N      +             +WN    GFN  F  G G      R+A+R  D+   W+  TVD  +ISP++       
Subjt:  GNLSVDNLENG--NSTQDSCVNANNHQRN------------WNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAP

Query:  APAPT--------PTPTPAAVSTKKKKKK
        A +                  S KKKKKK
Subjt:  APAPT--------PTPTPAAVSTKKKKKK

AT5G57180.2 chloroplast import apparatus 21.8e-3239.21Show/hide
Query:  SPCIS---GGGRAYNFDLEIVKS-PSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSH
        S C+S   GG  AY+F+LE VKS P SS T T++ +SPSST+SESSN  + LAISTRK RT RKRPNQTYNEA  LLSTAYPN+FS    +N     K+H
Subjt:  SPCIS---GGGRAYNFDLEIVKS-PSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSH

Query:  DDSSSLFC--------ESAELLLPFRVIDSSGFLLHQPLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIM
          S+S F         ++++LLLP+  I+   FL H P ++ K  ++  S    +     C   GEI+      + +  ++FDAESILDE+IEEGIDSIM
Subjt:  DDSSSLFC--------ESAELLLPFRVIDSSGFLLHQPLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIM

Query:  GNLSVDNLENG--NSTQDSCVNANNHQRN------------WNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAP
        G +   N  +G   S     +N      +             +WN    GFN  F  G G      R+A+R  D+   W+  TVD  +ISP++       
Subjt:  GNLSVDNLENG--NSTQDSCVNANNHQRN------------WNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAP

Query:  APAPT--------PTPTPAAVSTKKKKKK
        A +                  S KKKKKK
Subjt:  APAPT--------PTPTPAAVSTKKKKKK

AT5G57180.3 chloroplast import apparatus 21.8e-3239.21Show/hide
Query:  SPCIS---GGGRAYNFDLEIVKS-PSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSH
        S C+S   GG  AY+F+LE VKS P SS T T++ +SPSST+SESSN  + LAISTRK RT RKRPNQTYNEA  LLSTAYPN+FS    +N     K+H
Subjt:  SPCIS---GGGRAYNFDLEIVKS-PSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSH

Query:  DDSSSLFC--------ESAELLLPFRVIDSSGFLLHQPLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIM
          S+S F         ++++LLLP+  I+   FL H P ++ K  ++  S    +     C   GEI+      + +  ++FDAESILDE+IEEGIDSIM
Subjt:  DDSSSLFC--------ESAELLLPFRVIDSSGFLLHQPLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIM

Query:  GNLSVDNLENG--NSTQDSCVNANNHQRN------------WNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAP
        G +   N  +G   S     +N      +             +WN    GFN  F  G G      R+A+R  D+   W+  TVD  +ISP++       
Subjt:  GNLSVDNLENG--NSTQDSCVNANNHQRN------------WNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAP

Query:  APAPT--------PTPTPAAVSTKKKKKK
        A +                  S KKKKKK
Subjt:  APAPT--------PTPTPAAVSTKKKKKK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCTTCTCCATGTATAAGTGGTGGTGGGAGGGCTTACAATTTCGATTTAGAGATTGTGAAATCTCCATCTTCTTCATGGACAAGAACTTCACAAACTTCATCG
CCATCTTCAACTTTATCAGAGTCAAGCAACAATACAACACAGTTAGCAATTTCAACTCGAAAATTAAGAACACCACGAAAACGCCCAAATCAAACCTACAACGAA
GCTACAGTTTTGCTTTCAACGGCCTACCCGAATGTTTTTTCAACCAAACATCTTACCAATCCGCGAAAATTCACCAAATCTCACGATGATTCTTCTTCTCTCTTC
TGTGAATCTGCTGAATTGCTTTTGCCTTTTCGAGTAATCGATAGTTCTGGATTTCTCCTTCACCAACCGCTGCTTGAAGAAAAGCCTAATTCCCAAATTCATTCC
AAATTGACCAATCTTTGGGAAAATCGACCGTGTTCTAGTCCTGGAGAGATCGATTTCCAACCGAATTCCATGGAGATTGAAGAGATTGAAGATTTCGATGCGGAA
TCGATTCTTGACGAGGAAATCGAAGAAGGAATCGATAGTATTATGGGGAATCTGAGTGTGGATAACCTAGAAAATGGTAATTCAACGCAAGATTCTTGTGTGAAT
GCGAATAATCATCAACGGAATTGGAATTGGAATCCAATCGGTTTAGGATTCAACCAGAAATTCGAATCTGGCTTCGGATTCCGTAAGGGAATCGAACGAACAGCA
ATTCGAGGAGTCGATAATGGAAACTGGTGGCGATTTCCGACTGTCGATGTAATCGAAATCTCTCCAAAACTAAATCCAAAACCACCAGCTCCGGCTCCGGCACCG
ACTCCAACTCCAACACCGGCGGCCGTCTCGACGAAGAAGAAGAAAAAGAAGTTGGAGAAGCTTTTACAGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AATGGAATTGGGTTTTTCTCAGTAACCAAACAGAGTTTAGAGGTTTTCTTGTTCTTGTTGTTGGTTGGAATTCAATGTCTTCTCCATGTATAAGTGGTGGTGGGA
GGGCTTACAATTTCGATTTAGAGATTGTGAAATCTCCATCTTCTTCATGGACAAGAACTTCACAAACTTCATCGCCATCTTCAACTTTATCAGAGTCAAGCAACA
ATACAACACAGTTAGCAATTTCAACTCGAAAATTAAGAACACCACGAAAACGCCCAAATCAAACCTACAACGAAGCTACAGTTTTGCTTTCAACGGCCTACCCGA
ATGTTTTTTCAACCAAACATCTTACCAATCCGCGAAAATTCACCAAATCTCACGATGATTCTTCTTCTCTCTTCTGTGAATCTGCTGAATTGCTTTTGCCTTTTC
GAGTAATCGATAGTTCTGGATTTCTCCTTCACCAACCGCTGCTTGAAGAAAAGCCTAATTCCCAAATTCATTCCAAATTGACCAATCTTTGGGAAAATCGACCGT
GTTCTAGTCCTGGAGAGATCGATTTCCAACCGAATTCCATGGAGATTGAAGAGATTGAAGATTTCGATGCGGAATCGATTCTTGACGAGGAAATCGAAGAAGGAA
TCGATAGTATTATGGGGAATCTGAGTGTGGATAACCTAGAAAATGGTAATTCAACGCAAGATTCTTGTGTGAATGCGAATAATCATCAACGGAATTGGAATTGGA
ATCCAATCGGTTTAGGATTCAACCAGAAATTCGAATCTGGCTTCGGATTCCGTAAGGGAATCGAACGAACAGCAATTCGAGGAGTCGATAATGGAAACTGGTGGC
GATTTCCGACTGTCGATGTAATCGAAATCTCTCCAAAACTAAATCCAAAACCACCAGCTCCGGCTCCGGCACCGACTCCAACTCCAACACCGGCGGCCGTCTCGA
CGAAGAAGAAGAAAAAGAAGTTGGAGAAGCTTTTACAGTGATTGAATCAAAGAAAGCCGCAATTCCATTACAAAAGGAGAAATCAGAGAAATCAGAGAAGCCAAT
CCCGAAATTGAAACCTGCTGGATTACTTCTGAAATTGAACTACGAAGCCGTGGCCGACGCTTGGTCTAGCAGGGGATCTCCATTTTCCGATGAGATTCCAAGTTC
CGATACGGCGGGAAGTGATGTAAATGCAAGGCTGGCGAATATAGATTTATTTACGGAGGGTGGAGGATTATTGAGAGAAGCCAGCGTGTTACGGTACAAAGAGAA
GAGGCGGACTCGGTTGTTCTCGAAGAAGATAAGATATCAAGTTAGGAAAGTCAATGCAGATGGACGGCCCAGAATGAAGGGGCGTTTTGTGAGGAGACCTAATTC
AAGCGGCCATAGAAAAGAGATTGACACTTCCCTTTAGGATTCCATTTTTGAGTTATCGGCTTCACTTTTTCTAGACCCACCTTTTTCTTTTTCACAATTAATTAT
TATCATCTTCTTTTCTTTTCTTTTTTCATTTTTACTTTGCATTATATTTTCCATGATTAGTTTTTTTTTTTTTTGCCTTTTTCCAATTCCAGAAAGCTCAATGAG
AGAATGGCCACTAAGTAGATGGTCAGAGATTCAATAAATCTAGGCTTTTTCTTTTTTCTTTTTAAATATATGTATCTTTCCTTTTTGGAGTTTTGTTTTATAGTG
TCTGAGAAGAGGCTCATATATGTTTTAATTTGAATTTCTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSSPCISGGGRAYNFDLEIVKSPSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSHDDSSSLF
CESAELLLPFRVIDSSGFLLHQPLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIMGNLSVDNLENGNSTQDSCVN
ANNHQRNWNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAPAPAPTPTPTPAAVSTKKKKKKLEKLLQ