CuGenDBv2

Gene ID	Pay0013651
Organism	Cucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
Description	Cytochrome c biogenesis protein CcsA
Genome location	chr05:12820843..12821872
RNA-Seq Expression	Pay0013651
Synteny	Pay0013651
Gene Ontology terms	GO:0017004 - cytochrome complex assembly (biological process) GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component) GO:0020037 - heme binding (molecular function)
InterPro domains	IPR002541 - Cytochrome c assembly protein IPR017562 - Cytochrome c-type biogenesis protein CcsA IPR045062 - Cytochrome c-type biogenesis protein CcsA/CcmC

Homology

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QHB76014.1 cytochrome c biogenesis protein [Cucumis melo subsp. melo]

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A0A249RXM9 Cytochrome c biogenesis protein CcsA

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A0A286NFV0 Cytochrome c biogenesis protein CcsA

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Q09FZ7 Cytochrome c biogenesis protein CcsA

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Q09WW9 Cytochrome c biogenesis protein CcsA

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Q0ZIW9 Cytochrome c biogenesis protein CcsA

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        MIF T EHILTHISFSV+SIVITI LITLL++E VGL  SSEKGMI TFFCITGLLVTRWIYL H PLSDLYESL+FLSW+  IIH+  Y KK+KNHL  
Subjt:  MIFLTFEHILTHISFSVISIVITIQLITLLINETVGLYVSSEKGMIVTFFCITGLLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWALFIIHLFAYLKKYKNHLSV

Query:  SAITAPSIIFTQGFATSGFLTKMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLCGSLFSVALI-------------------------------------
        SA+TAPS IFTQGFATSG LT+MHQS +LVPALQS WLMMHVSMMVLGYAALLCGSL SVAL+                                     
Subjt:  SAITAPSIIFTQGFATSGFLTKMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLCGSLFSVALI-------------------------------------

Query:  -------------SQLIQQLDHWSYRIISIGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYWNWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKDFEGVNSAIVASMGFLIIWI
                     +Q IQQLDHWSYR+IS+GF+FL+IGILSGAVWANE WGSYWNWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNK+ +  NSAIVASMGFLIIWI
Subjt:  -------------SQLIQQLDHWSYRIISIGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYWNWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKDFEGVNSAIVASMGFLIIWI

Query:  CYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN
        CYFGVNLLGIGLHSYGSFT +SN
Subjt:  CYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN

Q2QD41 Cytochrome c biogenesis protein CcsA

4.7e-138

81.42

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Query:  MIFLTFEHILTHISFSVISIVITIQLITLLINETVGLYVSSEKGMIVTFFCITGLLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWALFIIHLFAYLKKYKNHLSV
        MIF TFEHILTHISFSVISIVITIQLITLLINETVGLYVSSEKGMI TFFCITGLLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWA  IIHLF Y KKYKNHLSV
Subjt:  MIFLTFEHILTHISFSVISIVITIQLITLLINETVGLYVSSEKGMIVTFFCITGLLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWALFIIHLFAYLKKYKNHLSV

Query:  SAITAPSIIFTQGFATSGFLTKMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLCGSLFSVALI-------------------------------------
        SAITAPS IFTQGFATSGFLT+MHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLCGSLFSVALI                                     
Subjt:  SAITAPSIIFTQGFATSGFLTKMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLCGSLFSVALI-------------------------------------

Query:  -------------SQLIQQLDHWSYRIISIGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYWNWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKDFEGVNSAIVASMGFLIIWI
                     SQLIQQLDHWSYRIIS+GFIFLSIGILSGAVWANETWGSYWNWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNK+FEGVNSAIVASMGFLIIWI
Subjt:  -------------SQLIQQLDHWSYRIISIGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYWNWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKDFEGVNSAIVASMGFLIIWI

Query:  CYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN
        CYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN
Subjt:  CYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

ATCG01040.1 Cytochrome C assembly protein

3.9e-103

61.16

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Query:  MIFLTFEHILTHISFSVISIVITIQLITLLIN--ETVGLYVSSEKGMIVTFFCITGLLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWALFIIHLFAYLKKYKNHL
        MIF   EHILTHISFSV+SIV+TI  +TLL+N  E +G + SS+KG+I+TFF ITGLL+TRWIY  H PLS+LYESL+FLSWA  IIH+ +Y  K K   
Subjt:  MIFLTFEHILTHISFSVISIVITIQLITLLIN--ETVGLYVSSEKGMIVTFFCITGLLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWALFIIHLFAYLKKYKNHL

Query:  SVSAITAPSIIFTQGFATSGFLTKMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLCGSLFSVALI-----------------------------------
         ++ ITAPS+IF QGFATSG L KM QS +LVPALQS WLMMHVSMM+LGY ALLCGSL S+AL+                                   
Subjt:  SVSAITAPSIIFTQGFATSGFLTKMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLCGSLFSVALI-----------------------------------

Query:  ---------------------SQLIQQLDHWSYRIISIGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYWNWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKDFEGVNSAIVAS
                              QLIQQLD WS+RIIS+GFIFL++GILSGAVWANETWGSYWNWDPKETWAFITWTIFAIYLH +TN++  G+NSAIVA 
Subjt:  ---------------------SQLIQQLDHWSYRIISIGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYWNWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKDFEGVNSAIVAS

Query:  MGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFT
        +GF++IWICYFGVNLLGIGLHSYGSFT
Subjt:  MGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFT

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGATATTTTTAACTTTCGAGCATATATTAACTCATATATCTTTTTCGGTCATTTCAATTGTCATTACAATTCAGTTAATAACCTTATTAATCAATGAAACCGTAGGACT
CTATGTTTCGTCAGAAAAGGGCATGATAGTTACTTTTTTCTGTATAACAGGATTATTAGTTACTCGTTGGATTTATTTGAGGCATTTACCATTAAGTGATTTATATGAAT
CATTACTATTTCTTTCATGGGCTTTATTCATTATTCATCTATTTGCTTATTTAAAAAAATATAAAAACCATTTAAGTGTAAGCGCAATAACCGCGCCAAGTATTATTTTT
ACACAAGGTTTTGCTACTTCAGGTTTTTTAACTAAAATGCATCAATCCCCACTATTAGTTCCCGCTCTCCAATCTCATTGGTTAATGATGCACGTAAGTATGATGGTATT
AGGTTATGCAGCTCTTTTATGTGGATCATTATTTTCAGTAGCTCTTATATCTCAACTGATTCAACAATTAGATCATTGGAGTTATCGTATTATTAGTATAGGGTTTATCT
TTTTAAGCATAGGTATTCTTTCAGGGGCAGTATGGGCTAATGAGACATGGGGATCGTATTGGAATTGGGACCCAAAGGAAACTTGGGCATTTATTACTTGGACGATATTT
GCAATTTATTTACATACGCGAACAAATAAAGATTTTGAAGGTGTAAATTCCGCAATTGTGGCCTCTATGGGTTTTCTTATAATTTGGATATGCTATTTTGGGGTCAATCT
ATTAGGGATAGGGCTACATAGTTATGGTTCATTTACATTAACATCTAATTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

GTTCTATAATAGAATTAATAATTCAAGTCCCAGATATTAATTCAAATAATTGAATTGCGGGACCTTTAAATTTATTTTTTTATGATATTTTTAACTTTCGAGCATATATT
AACTCATATATCTTTTTCGGTCATTTCAATTGTCATTACAATTCAGTTAATAACCTTATTAATCAATGAAACCGTAGGACTCTATGTTTCGTCAGAAAAGGGCATGATAG
TTACTTTTTTCTGTATAACAGGATTATTAGTTACTCGTTGGATTTATTTGAGGCATTTACCATTAAGTGATTTATATGAATCATTACTATTTCTTTCATGGGCTTTATTC
ATTATTCATCTATTTGCTTATTTAAAAAAATATAAAAACCATTTAAGTGTAAGCGCAATAACCGCGCCAAGTATTATTTTTACACAAGGTTTTGCTACTTCAGGTTTTTT
AACTAAAATGCATCAATCCCCACTATTAGTTCCCGCTCTCCAATCTCATTGGTTAATGATGCACGTAAGTATGATGGTATTAGGTTATGCAGCTCTTTTATGTGGATCAT
TATTTTCAGTAGCTCTTATATCTCAACTGATTCAACAATTAGATCATTGGAGTTATCGTATTATTAGTATAGGGTTTATCTTTTTAAGCATAGGTATTCTTTCAGGGGCA
GTATGGGCTAATGAGACATGGGGATCGTATTGGAATTGGGACCCAAAGGAAACTTGGGCATTTATTACTTGGACGATATTTGCAATTTATTTACATACGCGAACAAATAA
AGATTTTGAAGGTGTAAATTCCGCAATTGTGGCCTCTATGGGTTTTCTTATAATTTGGATATGCTATTTTGGGGTCAATCTATTAGGGATAGGGCTACATAGTTATGGTT
CATTTACATTAACATCTAATTGA

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MIFLTFEHILTHISFSVISIVITIQLITLLINETVGLYVSSEKGMIVTFFCITGLLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWALFIIHLFAYLKKYKNHLSVSAITAPSIIF
TQGFATSGFLTKMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLCGSLFSVALISQLIQQLDHWSYRIISIGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYWNWDPKETWAFITWTIF
AIYLHTRTNKDFEGVNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN

Pay0013651 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome