; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Pay0013968 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome

Gene IDPay0013968
OrganismCucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
Descriptionzinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like
Genome locationchr02:18328869..18330121
RNA-Seq ExpressionPay0013968
SyntenyPay0013968
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR008906 - HAT, C-terminal dimerisation domain
IPR012337 - Ribonuclease H-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
ACX85638.1 putative transposase [Cucumis melo]1.1e-13073.26Show/hide
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ADN33674.1 transposase [Cucumis melo subsp. melo]1.1e-13073.26Show/hide
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KAA0058067.1 putative transposase [Cucumis melo var. makuwa]1.6e-12189.68Show/hide
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XP_016899473.1 PREDICTED: zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like isoform X2 [Cucumis melo]1.4e-10965.09Show/hide
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XP_016903394.1 PREDICTED: zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like [Cucumis melo]4.8e-12190.28Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S4DU07 zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like isoform X17.0e-11065.09Show/hide
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A0A1S4E592 zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like2.3e-12190.28Show/hide
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        STGGRVLDSFRSSLTPQ AE LIC+QN IQSKPLDDMTEEID   E+
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A0A5A7UTL3 Putative transposase8.0e-12289.68Show/hide
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D0UIX2 Putative transposase5.5e-13173.26Show/hide
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E5GB32 Transposase5.5e-13173.26Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B9FJG3 Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 11.5e-1625.48Show/hide
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        +DV T+WN+T+ ML  A+  ++ F  LE  D +Y   ++ P+ EDW   +    +LK                                         FS
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Query:  ------EEDYAKIWTN----------------------------KVEEA-FRRLCDDYYMRMSKEKYSQTQSCTPI---EGFGFQSQSEIPSISSSGSYK
               E + K W +                             VE A + ++ DD    +  E  +Q    TP    +G G  + +   S  ++    
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            V      S        K+E+ +YLDE+    +  +  D+L WWK+N+ ++  +S++ARDI +IP+S V S  S FS  TG R+LD +RSS  P+  
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        EAL+C+++W+Q  P
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P08770 Putative AC transposase6.7e-1724.92Show/hide
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        DV TRWNST+ ML  A+  +    RL+  DP     D I P  E+W  A    K LK F +                                       
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Query:  -------EDYAKIWTNK---------VEEAFRRLCDDYYMRMSKEKYSQTQSCTPIEGF--GFQSQSEIPSISSSGSYKARATVHDRFKQSNKTCLDD--
               E + K W            ++  ++++  ++YM+    K+        ++ F    +   +  S  S  + K + T +D    +     DD  
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Query:  -------------AKTEVTRYLDEARIDCMGDEYLDLLTWWKVNSSRFKIISQVARDIYSIPISTVPSESAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICSQNW
                        E+ +Y+ E  +   G    D+L+WW+   + + I++Q+ARD+ +I +STV SESAFS GGRV+D +R+ L  +  EALIC+++W
Subjt:  -------------AKTEVTRYLDEARIDCMGDEYLDLLTWWKVNSSRFKIISQVARDIYSIPISTVPSESAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICSQNW

Query:  I
        +
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Q6AVI0 Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 21.0e-1726.11Show/hide
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        +DV T+WN+T+ ML  A+  ++ F  LE  D +Y   ++ P+ EDW   +    +LK                                         FS
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Query:  ------EEDYAKIWTN----------------------------KVEEA-FRRLCDDYYMRMSKEKYSQTQSCTPI---EGFGFQSQSEIPSISSSGSYK
               E + K W +                             VE A + ++ DD    + KE  +Q    TP    +G G  + +      ++    
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            V      S        K+E+ +YLDE+    +  +  D+L WWK+N+ +F  +S++ARDI +IP+S V S  S FS  TG R+LD +RSSL P+  
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Query:  EALICSQNWIQSKP
        EAL+C+++W+Q  P
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Q75HY5 Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 34.3e-1625.66Show/hide
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        +DV T+WN+T+ ML  A+  Q+ F  LE  D  Y   ++ P+TEDW   +    +L                 S   + + W  + E +     +D   R
Subjt:  MDVPTRWNSTFTMLDGAIKCQKTFERLEEHDPSYLPKDDIPTTEDWDNAKVFVKFLKTF--------------SEEDYAKIWTNKVEEAFRRLCDDYYMR

Query:  ----MSKEKYSQ-TQSCTPIEGFGFQ------------SQSEIPSISSS-----------GSYKARATVHDRFKQSNKTCLDDAKT--------------
            +  E++ +  + C  +                  S S+I S+ ++             Y   AT  +  + ++ T    A T              
Subjt:  ----MSKEKYSQ-TQSCTPIEGFGFQ------------SQSEIPSISSS-----------GSYKARATVHDRFKQSNKTCLDDAKT--------------

Query:  -----------EVTRYLDEARIDCMGDEYLDLLTWWKVNSSRFKIISQVARDIYSIPISTVPSE----SAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICSQNWI
                   E+ +YL+EA +  + D   ++L WWK+N+ +F  +S++ARD+ +IP+S V S     SA +TG ++LD +RSSL P+T EAL C+++W+
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Query:  QSKP
        Q  P
Subjt:  QSKP

Q9M2N5 Zinc finger BED domain-containing protein DAYSLEEPER9.7e-1625.44Show/hide
Query:  MDVPTRWNSTFTMLDGAIKCQKTFERLEEHDPSYLPKDDIPTTEDWDNAKVFVKFLK------------------TFSEEDY------------------
        +D  T+WN+T+ ML  A + ++ F  L+  DP Y      P+ EDW + +    FLK                  TF  E +                  
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Query:  --AKIWTNKVEEAFR--------RLCDDYYMRMSKEKYSQTQSCTPIEGFG-----------FQSQSEIPSISSSGSYKARAT-VHDRFKQSNKTCLDDA
          AK    KV++ +R         +  D   +M   ++S ++      G             F     +PS  ++ S   +A  + D      +T   + 
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Query:  KTEVTRYLDEARIDCMGDEYLDLLTWWKVNSSRFKIISQVARDIYSIPISTVPSESAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALICSQNWI
        K+E+ +YLDE  +  +  +  D+L WWK N  ++  +S++ARDI SIP+S    +  F    R +D +++SL P+T EALIC++ W+
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G18560.1 BED zinc finger ;hAT family dimerisation domain1.5e-0829.89Show/hide
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        E+T+YL E+ +        D+L WWKVNS R+  +S +ARD  ++  ++   E  F   G  +D  +  +   + +++IC ++WI++
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AT3G42170.1 BED zinc finger ;hAT family dimerisation domain6.9e-1725.44Show/hide
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        +D  T+WN+T+ ML  A + ++ F  L+  DP Y      P+ EDW + +    FLK                  TF  E +                  
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Query:  --AKIWTNKVEEAFR--------RLCDDYYMRMSKEKYSQTQSCTPIEGFG-----------FQSQSEIPSISSSGSYKARAT-VHDRFKQSNKTCLDDA
          AK    KV++ +R         +  D   +M   ++S ++      G             F     +PS  ++ S   +A  + D      +T   + 
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        K+E+ +YLDE  +  +  +  D+L WWK N  ++  +S++ARDI SIP+S    +  F    R +D +++SL P+T EALIC++ W+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATGTTCCGACACGATGGAATTCTACTTTTACTATGTTGGATGGAGCAATTAAGTGTCAAAAGACTTTTGAAAGATTGGAGGAGCATGACCCTAGTTATTTGCCAAA
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AAGCATTTCGTCGATTGTGTGATGATTATTATATGAGAATGTCAAAAGAAAAATATTCACAAACACAATCATGTACACCTATCGAAGGATTTGGCTTTCAAAGTCAAAGT
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TCGTTATCTGGATGAGGCTCGTATAGATTGTATGGGCGATGAATATTTAGATTTGCTAACTTGGTGGAAGGTGAATTCCTCTCGATTTAAGATCATTAGCCAAGTAGCTA
GGGACATCTACAGTATTCCTATATCAACTGTGCCTTCTGAGTCCGCCTTTAGCACTGGAGGACGGGTGTTAGATTCTTTTCGAAGTTCTTTAACTCCTCAAACTGCAGAG
GCACTCATTTGTTCTCAGAATTGGATTCAGTCTAAACCTTTGGATGACATGACTGAAGAAATTGACGGGGCTGAAGAAATTGATGAAGGTAATATTCTTTTTGAAAGTCT
TGAAGCTCAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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EIPSISSSGSYKARATVHDRFKQSNKTCLDDAKTEVTRYLDEARIDCMGDEYLDLLTWWKVNSSRFKIISQVARDIYSIPISTVPSESAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAE
ALICSQNWIQSKPLDDMTEEIDGAEEIDEGNILFESLEAQ