; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Pay0014377 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome

Gene IDPay0014377
OrganismCucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
Descriptiontranscription factor bHLH74 isoform X2
Genome locationchr03:29346783..29349259
RNA-Seq ExpressionPay0014377
SyntenyPay0014377
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR011598 - Myc-type, basic helix-loop-helix (bHLH) domain
IPR024097 - Basic helix-loop-helix leucine zipper transcription factor
IPR036638 - Helix-loop-helix DNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0060972.1 transcription factor bHLH49 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]2.1e-14099.63Show/hide
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XP_038885627.1 transcription factor bHLH74-like isoform X3 [Benincasa hispida]3.4e-9875.09Show/hide
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A0A0A0LNP9 BHLH domain-containing protein1.0e-12791.04Show/hide
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A0A1S3BA09 transcription factor bHLH49 isoform X12.1e-141100Show/hide
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A0A1S4DVD5 transcription factor bHLH74 isoform X22.1e-141100Show/hide
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A0A4V6A5Q3 Transcription factor bHLH74-like isoform X12.9e-4251.44Show/hide
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        QVEFLSMKLA V  E  ++ E+IL        S ++L  RG N
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A0A5A7UYJ9 Transcription factor bHLH49 isoform X11.0e-14099.63Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q69WS3 Transcription factor BHLH0943.4e-2456.14Show/hide
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Q6NKN9 Transcription factor bHLH743.8e-3151.45Show/hide
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        EFLSMKLA V  E +++ ++IL        + ++L  R     D  + T   +P   FQ  G  P +  TT+P
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Q9C670 Transcription factor bHLH761.8e-2555.97Show/hide
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        EFLSMKL+ V   L+ +LE+   LL  ++  SS+
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Q9CAA9 Transcription factor bHLH493.0e-2838.37Show/hide
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Q9SRT2 Transcription factor bHLH621.1e-2549.67Show/hide
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        +LDEIINYVQSLQ+QVEFLSMKL++V        +  LL+ + + SS+N++
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G10120.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein2.7e-3251.45Show/hide
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AT1G68920.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein2.1e-2938.37Show/hide
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AT1G68920.2 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein2.1e-2938.37Show/hide
Query:  MFGSGNFSDMVG-------SLGFLTEAD-------HSQIANIKCPFSYVQILDDEEMVSPKNDVKSQ---PDRVNEN--------QRKFVVGSNSSSPNK
        +F  GNFSDMV        ++G   +          S   N+  P + V +   E  V      K        V+E+        Q+     SN+    +
Subjt:  MFGSGNFSDMVG-------SLGFLTEAD-------HSQIANIKCPFSYVQILDDEEMVSPKNDVKSQ---PDRVNEN--------QRKFVVGSNSSSPNK

Query:  NAEDNLNVATTEILNKADK------TQKVEHRMSANFNTKSDSKQAKGGSQNVQSPKENYIRVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCH
        N + N   A +    ++++       +K     S N   K  +   + G Q+   PK+ YI V+ARRG+A N+HSLAERVRREKISERMK LQ LVPGC+
Subjt:  NAEDNLNVATTEILNKADK------TQKVEHRMSANFNTKSDSKQAKGGSQNVQSPKENYIRVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCH

Query:  QITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLANVGLESSLETEQIL
        ++TGK V+LDEIINYVQSLQ+QVEFLSMKLA V  +     E +L
Subjt:  QITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLANVGLESSLETEQIL

AT1G68920.3 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein4.0e-2838.52Show/hide
Query:  MFGSGNFSDMVG-------SLGFLTEAD-------HSQIANIKCPFSYVQILDDEEMVSPKNDVKSQ---PDRVNE-------NQRKFVVGSNSSSPNKN
        +F  GNFSDMV        ++G   +          S   N+  P + V +   E  V      K        V+E       N +K    S+++   K 
Subjt:  MFGSGNFSDMVG-------SLGFLTEAD-------HSQIANIKCPFSYVQILDDEEMVSPKNDVKSQ---PDRVNE-------NQRKFVVGSNSSSPNKN

Query:  AEDNLNVATTEILNKADK------TQKVEHRMSANFNTKSDSKQAKGGSQNVQSPKENYIRVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQ
           N   A +    ++++       +K     S N   K  +   + G Q+   PK+ YI V+ARRG+A N+HSLAERVRREKISERMK LQ LVPGC++
Subjt:  AEDNLNVATTEILNKADK------TQKVEHRMSANFNTKSDSKQAKGGSQNVQSPKENYIRVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQ

Query:  ITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLANVGLESSLETEQIL
        +TGK V+LDEIINYVQSLQ+QVEFLSMKLA V  +     E +L
Subjt:  ITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLANVGLESSLETEQIL

AT3G07340.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein7.6e-2749.67Show/hide
Query:  LNKADKTQKVEHRMSANFNTK-------SDSKQAKGGSQNVQ-----SPKENYIRVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTV
        L++  KT+  ++  SA  ++K       SD K+ K   +N        P ++YI V+ARRG+A ++HSLAERVRREKISERMKLLQ LVPGC+++TGK +
Subjt:  LNKADKTQKVEHRMSANFNTK-------SDSKQAKGGSQNVQ-----SPKENYIRVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTV

Query:  VLDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLANVGLESSLETEQILLTNNSYLSSSNVL
        +LDEIINYVQSLQ+QVEFLSMKL++V        +  LL+ + + SS+N++
Subjt:  VLDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLANVGLESSLETEQILLTNNSYLSSSNVL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTTGGAAGTGGGAACTTCTCTGATATGGTGGGTTCTTTAGGCTTTCTAACTGAAGCTGATCACAGTCAGATCGCCAATATTAAATGTCCATTTAGTTATGTGCAAAT
TCTGGATGACGAAGAAATGGTCTCACCAAAGAACGATGTAAAGTCTCAACCCGATCGCGTTAATGAAAATCAAAGAAAATTTGTTGTTGGTTCCAATTCTTCCAGCCCAA
ATAAGAATGCTGAAGATAACTTGAATGTGGCAACAACTGAGATCCTTAATAAAGCTGACAAAACACAGAAAGTGGAGCATAGAATGAGTGCAAATTTTAACACCAAATCA
GATAGTAAACAAGCCAAAGGAGGCTCTCAAAATGTACAATCCCCCAAGGAGAATTATATTCGTGTTCAAGCGCGACGGGGCCGAGCTGCTAATAACCATAGCCTCGCAGA
AAGGGTTAGAAGGGAAAAAATCAGCGAACGAATGAAGTTGCTGCAACAGCTTGTTCCTGGATGCCATCAGATTACCGGGAAAACCGTGGTGCTCGACGAAATTATCAACT
ATGTACAATCACTGCAACAACAGGTCGAGTTTTTATCGATGAAACTCGCAAATGTCGGACTAGAATCAAGCTTGGAGACAGAGCAGATTCTACTCACAAATAATTCATAC
CTTTCATCATCGAACGTTCTTTGTAAGAGAGGCGAAAACGTCAACGATCATAGATCAAGGACATTTCACACAAGTCCTCATGTGATGTTCCAACTTTATGGAACAAGGCC
AACCATGCCAAAAACTACATCTCCTTCAACTTTCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CCGTTTTGTTCTTTTTCATTTTAACTATGAATTTTGGCTTTGATTTTTAGGCTAAAGGAGACCAACCCGAACTTTACTGTCTATCAATCACAATGATGTTTGGATTCAAA
GGATTTGTCAAAATTACTTTCTTCTTCTTCCACACTCAAAAGTGAAAGTGAAGAAAATTCTCAGCCATTGATTGGAGTTGATACTTCTTTTTCATCTACTCTTGGATCTT
CTTCAACAACTCCTCTATGTGAATTATCCACAGCTTCTTTGGAGAATGAGGGAGTGAAAACCATTTCTAACCTTCTTCATGATCCTTCAACTTTGAGTTTTGATATGTTT
GGAAGTGGGAACTTCTCTGATATGGTGGGTTCTTTAGGCTTTCTAACTGAAGCTGATCACAGTCAGATCGCCAATATTAAATGTCCATTTAGTTATGTGCAAATTCTGGA
TGACGAAGAAATGGTCTCACCAAAGAACGATGTAAAGTCTCAACCCGATCGCGTTAATGAAAATCAAAGAAAATTTGTTGTTGGTTCCAATTCTTCCAGCCCAAATAAGA
ATGCTGAAGATAACTTGAATGTGGCAACAACTGAGATCCTTAATAAAGCTGACAAAACACAGAAAGTGGAGCATAGAATGAGTGCAAATTTTAACACCAAATCAGATAGT
AAACAAGCCAAAGGAGGCTCTCAAAATGTACAATCCCCCAAGGAGAATTATATTCGTGTTCAAGCGCGACGGGGCCGAGCTGCTAATAACCATAGCCTCGCAGAAAGGGT
TAGAAGGGAAAAAATCAGCGAACGAATGAAGTTGCTGCAACAGCTTGTTCCTGGATGCCATCAGATTACCGGGAAAACCGTGGTGCTCGACGAAATTATCAACTATGTAC
AATCACTGCAACAACAGGTCGAGTTTTTATCGATGAAACTCGCAAATGTCGGACTAGAATCAAGCTTGGAGACAGAGCAGATTCTACTCACAAATAATTCATACCTTTCA
TCATCGAACGTTCTTTGTAAGAGAGGCGAAAACGTCAACGATCATAGATCAAGGACATTTCACACAAGTCCTCATGTGATGTTCCAACTTTATGGAACAAGGCCAACCAT
GCCAAAAACTACATCTCCTTCAACTTTCTAACCTTTTCAAGATGAAAGGATAATCAGTAGATGATCAAAATTATGCAGCTGCAAAAACCAGAGATGGATGTCAGTATTTA
TCCTTTGATAGTCATTACATGTGGCGCAGCAAATTAATTAAAGACAGCAATGTAAAAACAGTACTCATTTGATTGAATTCAAATGTTGTTCTTAATCTTAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MFGSGNFSDMVGSLGFLTEADHSQIANIKCPFSYVQILDDEEMVSPKNDVKSQPDRVNENQRKFVVGSNSSSPNKNAEDNLNVATTEILNKADKTQKVEHRMSANFNTKS
DSKQAKGGSQNVQSPKENYIRVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLANVGLESSLETEQILLTNNSY
LSSSNVLCKRGENVNDHRSRTFHTSPHVMFQLYGTRPTMPKTTSPSTF