; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Pay0014835 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome

Gene IDPay0014835
OrganismCucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
DescriptionProtein of unknown function, DUF584
Genome locationchr12:13019601..13024106
RNA-Seq ExpressionPay0014835
SyntenyPay0014835
Gene Ontology termsGO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR007608 - Senescence regulator S40


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KGN64943.1 hypothetical protein Csa_022813 [Cucumis sativus]2.1e-12198.73Show/hide
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XP_022967102.1 uncharacterized protein LOC111466606 [Cucurbita maxima]5.2e-10486.61Show/hide
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XP_038894579.1 uncharacterized protein LOC120083099 [Benincasa hispida]1.9e-11492.83Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LT40 Uncharacterized protein1.0e-12198.73Show/hide
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A0A1S4E4F1 uncharacterized protein LOC1034998841.7e-124100Show/hide
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A0A5A7SY45 Senescence regulator1.7e-124100Show/hide
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A0A6J1G2B0 uncharacterized protein LOC1114500338.6e-10586.67Show/hide
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A0A6J1HPU4 uncharacterized protein LOC1114666062.5e-10486.61Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G11700.1 Protein of unknown function, DUF5841.2e-1046.99Show/hide
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        SAPVNVP  SK      +E      +  +ED G M+PPHE +A+S  +    S    SV EG GRTLKGR+LR+VR+A+W +T
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AT3G15040.1 Protein of unknown function, DUF5843.8e-3648.98Show/hide
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        +P +  S+PSS   + D  D ELNEDD+F        ++  SH+ P +     SS +  +     LQ  K G    E  GILAALPE+  SSS   S  F
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        +HK          ++ SSSSSS       S SS+R IPT PKPP +RLP   S     KY QSAPV VP++S A++ R        +V  D  +E++GEM
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        LPPHEIVARSLAQS +LSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAV+RRT
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AT4G04630.1 Protein of unknown function, DUF5842.2e-1239.33Show/hide
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        + + L E E SS       SHF    S SSSSSSSP + R    +             + +K  SAP+NVP  SK     +      ++         ++
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        DDG M+PPHE VAR LA++ + S S+ EG GRTLKGRDL +VRNAV  +T
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AT4G21970.1 Protein of unknown function, DUF5843.8e-1239.58Show/hide
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        E E  S LR S     +  +S S    S+SS SS+R IP   +         +S   K  SAP+N+P  SK     +           +D  D+D+G M+
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        PPHE+VA+ LA++ + S S+ EG GRTLKGRDL + RNAV  RT
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AT5G60680.1 Protein of unknown function, DUF5849.7e-0836.17Show/hide
Query:  ENEASSSLRNSSHFYHKASVSSSSSSSPSSSRMIPTIPKPPLDRLPLPISTSLKYQSAPVNVPIMSKAV-------VQRQLE--VDVDYVDEDDGEMLPP
        E++  + + + S  + +   SS  S   SS+R             P   S++    S PVNVP  SK +        +R +E   D D  +ED G+ LPP
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        HE     LA++ M S SV EG GRTLKGRDL +VRNA++ +
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGACCTCAACCTTCATTCCTCCCGCTTCCGCCACCGCAATTCCCCTTCCTCCGAACGCTTTCTCGCATCCTTCCCTTCTCCCCCCGTTCGCACTTCAAACCCTAGTTC
CACCACCGCCCTCGACGACGATTCCGAGCTCAATGAGGACGACGTCTTCTGGACCGGCGATTTTGCTTCCGATTCCGTCCACCATAGCCACTCCACTCCCTCTTCCTCCT
CCTCTTCCACTCCTCGTCACCATATTCATCACCTCCAGCATCACAAGGGTTTTCCTCTGCCTGAAACCTTCGGAATTCTCGCTGCTCTTCCCGAGAATGAGGCCTCCTCC
AGTCTTAGAAACTCTTCTCATTTCTATCACAAGGCCTCTGTTTCGTCTTCTTCCTCCTCCTCCCCTTCGTCTTCTCGTATGATTCCCACGATCCCCAAACCTCCTCTGGA
CCGATTGCCTCTTCCCATTTCGACCTCGTTGAAGTACCAGTCTGCACCAGTGAATGTGCCAATAATGTCGAAGGCAGTTGTTCAAAGACAGCTGGAGGTTGATGTGGACT
ATGTTGATGAAGACGATGGGGAGATGTTGCCGCCGCATGAGATTGTGGCTAGAAGTTTGGCTCAGTCGCCGATGTTGTCGTGCTCTGTGCTTGAGGGAGCTGGAAGGACG
TTAAAAGGGAGGGATCTTCGTCAGGTTCGCAACGCGGTTTGGAGACGAACAGTGAAAATGGGGAAGGGAGGAATAATTGTAGAAGAGAGTGAAGGAACTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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