; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Pay0015210 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome

Gene IDPay0015210
OrganismCucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
DescriptionWW domain-containing protein
Genome locationchr04:1145880..1147136
RNA-Seq ExpressionPay0015210
SyntenyPay0015210
Gene Ontology termsGO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR036020 - WW domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6591744.1 hypothetical protein SDJN03_14090, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.2e-6367.12Show/hide
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KAG7024627.1 hypothetical protein SDJN02_13445 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]6.5e-6366.67Show/hide
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XP_004136212.1 uncharacterized protein LOC101215652 [Cucumis sativus]3.0e-11693.72Show/hide
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XP_008466035.2 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103503587 [Cucumis melo]6.2e-12299.08Show/hide
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        QTESLKSFFPNPIQNKV
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XP_038899250.1 uncharacterized protein LOC120086593 [Benincasa hispida]1.4e-8179.72Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LHX2 Uncharacterized protein1.4e-11693.72Show/hide
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A0A1S3CQA1 uncharacterized protein LOC1035035873.0e-12299.08Show/hide
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A0A6J1CC88 uncharacterized protein LOC1110093951.5e-4959.28Show/hide
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            QT+SLK  F N IQNKV
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A0A6J1F8N8 uncharacterized protein LOC1114431364.5e-6265.32Show/hide
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A0A6J1IME5 uncharacterized protein LOC1114765643.8e-6165.77Show/hide
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        MKRKWEDPQGE FNSPTD IEL LETPLPLEWQRCLDIQSG+I+F+NTKTQKRTSMDPRR K EG       S+    + LSLDLELNLNCQS  N    
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Query:  NNHHHQTESLKSFFPNPIQNKV
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G22250.1 unknown protein6.2e-1139.42Show/hide
Query:  DHQALSLDLELNLNCQSN------KKILSNNNDDTGGLM------KLQANNYGI--SCPWLRFE------REQQEMVARVCMQCHLLVMLLKSSPTCPNC
        DH+    DL+LNLN  S+      K I+  +    GG +      K+++ + G+  S  WL FE      +++QEM+  VCM+CH+LVML KS+  CPNC
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Query:  KFIH
        KF+H
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AT1G78170.1 unknown protein9.8e-1735.29Show/hide
Query:  EDPQGENFNSPTDNIELHLETPLPLEWQRCLDIQSGEIHFFNTKT-----QKRTSMDPRRNKLEGPTTTPSRSHVSDHQALSLDLELNLNCQSNK-KILS
        E P+ E+  S T + ELHL TPLP +WQ     ++ + H    K      Q + S+D   N    P+ +PSR+    +++ S+    N    S+K K+L+
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Query:  NNNDDTGGLMKLQANNYGISCPWLRFE--------REQQEMVARVCMQCHLLVMLLKSSPTCPNCKFIHP
        N +  +     +       S  WL FE         + QEMV  VCM+CH+LVML  S+P CPNCKF+HP
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AT2G33510.1 CONTAINS InterPro DOMAIN/s: WW/Rsp5/WWP (InterPro:IPR001202)7.8e-0624.09Show/hide
Query:  IELHLETPLPLEWQRCLDIQSGEIHFFNTKTQKRTSMDPRRNKLEGPTTTPSRSHVSDHQALSLDLELNLNCQSNKKILSNNNDDTGGLMKLQANNYGIS
        +EL+    LP  W++CLD+++GEI++ N K   R   DPR+     P +  S   V   +  S       + +S+     N+ ++     + +       
Subjt:  IELHLETPLPLEWQRCLDIQSGEIHFFNTKTQKRTSMDPRRNKLEGPTTTPSRSHVSDHQALSLDLELNLNCQSNKKILSNNNDDTGGLMKLQANNYGIS

Query:  CPWLRFEREQQEMVARVCMQCHLLVMLLKSSPTCPNC
              E E+  +V   C  C +  M+ K    CP C
Subjt:  CPWLRFEREQQEMVARVCMQCHLLVMLLKSSPTCPNC

AT4G08910.1 unknown protein2.3e-1068.42Show/hide
Query:  REQQEMVARVCMQCHLLVMLLKSSPTCPNCKFIHPMTD
        R ++EMVARVCM+CH+LVML K+SP CPNCKF+H   D
Subjt:  REQQEMVARVCMQCHLLVMLLKSSPTCPNCKFIHPMTD


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAGAGAAAATGGGAAGACCCACAAGGAGAAAACTTCAATTCTCCAACTGATAATATCGAGCTCCATCTCGAGACTCCATTACCTTTGGAGTGGCAAAGGTGTCTAGA
TATTCAGTCAGGAGAGATACATTTCTTCAACACAAAGACTCAAAAGAGAACCTCAATGGATCCAAGAAGAAATAAATTAGAGGGTCCTACTACTACTCCTAGTAGAAGCC
ATGTAAGTGATCATCAAGCCTTGAGCTTGGACCTGGAGCTCAATCTAAATTGTCAATCAAATAAGAAGATCTTAAGCAATAATAATGATGATACTGGAGGTTTGATGAAA
TTACAAGCAAATAATTATGGCATCAGTTGTCCATGGCTAAGATTTGAAAGAGAGCAACAAGAAATGGTTGCAAGAGTTTGCATGCAATGTCATTTATTAGTTATGCTTTT
GAAATCCTCACCTACATGCCCAAATTGCAAATTCATACACCCAATGACAGATCATCATCAGTACCTCCAAAATAACCCTCCAACTACTACTACAACAACAACAACAACCT
TCTTTTTACCTAATTCTCTCCCTACTGAGAATGATAATAATCATCATCATCAAACTGAGTCCTTAAAGAGTTTCTTCCCAAATCCTATTCAAAATAAAGTTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTTCAACCTCCAAAGCCTGTCCCCAACTAGATTCTTCCCTTGCAGTTATAGCTAACCCCATCGTCCATATTATATCTAAGCCTTTTTCACCCCTTCCTAACACACACATA
CACAAAGTAAATCAGAACTACAAAAGATATCTCTCTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCCTTTCGTTTTCTCTCTGCAAATCCAAAATGAAGAGAAAATGGGAAGACCCACA
AGGAGAAAACTTCAATTCTCCAACTGATAATATCGAGCTCCATCTCGAGACTCCATTACCTTTGGAGTGGCAAAGGTGTCTAGATATTCAGTCAGGAGAGATACATTTCT
TCAACACAAAGACTCAAAAGAGAACCTCAATGGATCCAAGAAGAAATAAATTAGAGGGTCCTACTACTACTCCTAGTAGAAGCCATGTAAGTGATCATCAAGCCTTGAGC
TTGGACCTGGAGCTCAATCTAAATTGTCAATCAAATAAGAAGATCTTAAGCAATAATAATGATGATACTGGAGGTTTGATGAAATTACAAGCAAATAATTATGGCATCAG
TTGTCCATGGCTAAGATTTGAAAGAGAGCAACAAGAAATGGTTGCAAGAGTTTGCATGCAATGTCATTTATTAGTTATGCTTTTGAAATCCTCACCTACATGCCCAAATT
GCAAATTCATACACCCAATGACAGATCATCATCAGTACCTCCAAAATAACCCTCCAACTACTACTACAACAACAACAACAACCTTCTTTTTACCTAATTCTCTCCCTACT
GAGAATGATAATAATCATCATCATCAAACTGAGTCCTTAAAGAGTTTCTTCCCAAATCCTATTCAAAATAAAGTTTAGTTAATTTCTTTTCTTTTTTATTATATTATTCA
TTTAGTATTATAATTACATATATACTGAATTATCAGGGATATATGTTTAGAGGTAAAACCCCCTTTGTTTTTTGGAAATGTGTAATTATATATATATGCATAAAAAAAGA
ATCATTACATTGATCATTGTTGTGTGAGAGATCAAACTCATTAGGTCAAGAGAGTTTTTCTTTTCTTTTTTAACAATATTCAAAATGCAAGAAGGATCGAGAGGTACATC
AAGACATCTCACTTGGATTGATGATAGTACCGTCGAGCGTCCTCACCG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKRKWEDPQGENFNSPTDNIELHLETPLPLEWQRCLDIQSGEIHFFNTKTQKRTSMDPRRNKLEGPTTTPSRSHVSDHQALSLDLELNLNCQSNKKILSNNNDDTGGLMK
LQANNYGISCPWLRFEREQQEMVARVCMQCHLLVMLLKSSPTCPNCKFIHPMTDHHQYLQNNPPTTTTTTTTTFFLPNSLPTENDNNHHHQTESLKSFFPNPIQNKV