; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Pay0015660 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome

Gene IDPay0015660
OrganismCucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
DescriptionRetrotransposon protein
Genome locationchr04:26801572..26804174
RNA-Seq ExpressionPay0015660
SyntenyPay0015660
Gene Ontology termsGO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR027806 - Harbinger transposase-derived nuclease domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0031556.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]1.6e-16095.88Show/hide
Query:  MFLHVLAHDVKNRIIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVLVTSNYNDQRWKCFENCLGALDGTYIKVNVPAGDRPTFRTRKGEIATNVLR
        MFLHVLAHDVKNR+IQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPV VTSN NDQRWKCFENCLGALDGTYIKVNVPAGDRPTFRTRKGEIATNVL 
Subjt:  MFLHVLAHDVKNRIIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVLVTSNYNDQRWKCFENCLGALDGTYIKVNVPAGDRPTFRTRKGEIATNVLR

Query:  VCDTKGDFVYVLAGWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKGYYYLCDAGYPNAEGFLAPYRGQRYHLQEWRGAANAPTNAKEYFNMKHSSARNVIERAFGV
        VCDTKGDFVYVLAGWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKGYYYLCDAGYPNAEGFLAPYRGQRYHLQEWRGAANAPTNAKEYFNMKHSSARNVIERAFGV
Subjt:  VCDTKGDFVYVLAGWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKGYYYLCDAGYPNAEGFLAPYRGQRYHLQEWRGAANAPTNAKEYFNMKHSSARNVIERAFGV

Query:  LKGRWAILRGKSYYPLQVQCRTILACALLHNLINREMTYCD---DEDEGDSTYATTTASEDTQYIETTNEWSQWRDDLAESMFTEWQLRNA
        LKGRWAILRGKSYYPLQVQCRTILACALLHNLINREMTYCD   DEDEGDSTYATTTASED QYIETTNEWSQWRD+LA SMFT+WQ RNA
Subjt:  LKGRWAILRGKSYYPLQVQCRTILACALLHNLINREMTYCD---DEDEGDSTYATTTASEDTQYIETTNEWSQWRDDLAESMFTEWQLRNA

KAA0044609.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]4.8e-16095.53Show/hide
Query:  MFLHVLAHDVKNRIIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVLVTSNYNDQRWKCFENCLGALDGTYIKVNVPAGDRPTFRTRKGEIATNVLR
        MFLHVLAHDVKNR+IQREFVRSGETVSRHFNIVLL VLRLYEELIKRPV VTSN NDQRWKCFENCLGALDGTYIKVNVPAGDRPTFRTRKGEIATNVL 
Subjt:  MFLHVLAHDVKNRIIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVLVTSNYNDQRWKCFENCLGALDGTYIKVNVPAGDRPTFRTRKGEIATNVLR

Query:  VCDTKGDFVYVLAGWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKGYYYLCDAGYPNAEGFLAPYRGQRYHLQEWRGAANAPTNAKEYFNMKHSSARNVIERAFGV
        VCDTKGDFVYVLAGWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKGYYYLCDAGYPNAEGFLAPYRGQRYHLQEWRGAANAPTNAKEYFNMKHSSARNVIERAFGV
Subjt:  VCDTKGDFVYVLAGWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKGYYYLCDAGYPNAEGFLAPYRGQRYHLQEWRGAANAPTNAKEYFNMKHSSARNVIERAFGV

Query:  LKGRWAILRGKSYYPLQVQCRTILACALLHNLINREMTYCD---DEDEGDSTYATTTASEDTQYIETTNEWSQWRDDLAESMFTEWQLRNA
        LKGRWAILRGKSYYPLQVQCRTILACALLHNLINREMTYCD   DEDEGDSTYATTTASED QYIETTNEWSQWRD+LA SMFT+WQ RNA
Subjt:  LKGRWAILRGKSYYPLQVQCRTILACALLHNLINREMTYCD---DEDEGDSTYATTTASEDTQYIETTNEWSQWRDDLAESMFTEWQLRNA

KAA0048383.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]6.2e-16094.85Show/hide
Query:  MFLHVLAHDVKNRIIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVLVTSNYNDQRWKCFENCLGALDGTYIKVNVPAGDRPTFRTRKGEIATNVLR
        MFLHVLAHDVKNR+IQREFVRSGETVSRHFNIVLL +LRLYEELIKRPV VTSN NDQRWKCFENCLG LDGTYIKVNVPAGDRPTFRTRKGEIATN+L 
Subjt:  MFLHVLAHDVKNRIIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVLVTSNYNDQRWKCFENCLGALDGTYIKVNVPAGDRPTFRTRKGEIATNVLR

Query:  VCDTKGDFVYVLAGWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKGYYYLCDAGYPNAEGFLAPYRGQRYHLQEWRGAANAPTNAKEYFNMKHSSARNVIERAFGV
        VCDTKGDFVYVLAGWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKGYYYLCDAGYPNAEGFLAPYRGQRYHLQEWRGAANAPTNAKEYFNMKHSSARNVIERAFGV
Subjt:  VCDTKGDFVYVLAGWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKGYYYLCDAGYPNAEGFLAPYRGQRYHLQEWRGAANAPTNAKEYFNMKHSSARNVIERAFGV

Query:  LKGRWAILRGKSYYPLQVQCRTILACALLHNLINREMTYCD---DEDEGDSTYATTTASEDTQYIETTNEWSQWRDDLAESMFTEWQLRNA
        LKGRWAILRGKSYYPLQVQCRTILACALLHNLINREMTYCD   DEDEGDSTYATTTASED QYIETTNEWSQWRDDLA SMFT+WQ RNA
Subjt:  LKGRWAILRGKSYYPLQVQCRTILACALLHNLINREMTYCD---DEDEGDSTYATTTASEDTQYIETTNEWSQWRDDLAESMFTEWQLRNA

KAA0056561.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]4.3e-16196.22Show/hide
Query:  MFLHVLAHDVKNRIIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVLVTSNYNDQRWKCFENCLGALDGTYIKVNVPAGDRPTFRTRKGEIATNVLR
        MFLHVLAHDVKNR+IQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPV VTSN NDQRWKCFENCLGALDGTYIKVNVPAGDRPTFRTRKGEIATNVL 
Subjt:  MFLHVLAHDVKNRIIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVLVTSNYNDQRWKCFENCLGALDGTYIKVNVPAGDRPTFRTRKGEIATNVLR

Query:  VCDTKGDFVYVLAGWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKGYYYLCDAGYPNAEGFLAPYRGQRYHLQEWRGAANAPTNAKEYFNMKHSSARNVIERAFGV
        VCDTKGDFVYVLAGWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKGYYYLCDAGYPNAEGFLAPYRGQRYHLQEWRGAANAPTNAKEYFNMKHSSARNVIERAFGV
Subjt:  VCDTKGDFVYVLAGWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKGYYYLCDAGYPNAEGFLAPYRGQRYHLQEWRGAANAPTNAKEYFNMKHSSARNVIERAFGV

Query:  LKGRWAILRGKSYYPLQVQCRTILACALLHNLINREMTYCD---DEDEGDSTYATTTASEDTQYIETTNEWSQWRDDLAESMFTEWQLRNA
        LKGRWAILRGKSYYPLQVQCRTILACALLHNLINREMTYCD   DEDEGDSTYATTTASED QYIETTNEWSQWRDDLA SMFT+WQ RNA
Subjt:  LKGRWAILRGKSYYPLQVQCRTILACALLHNLINREMTYCD---DEDEGDSTYATTTASEDTQYIETTNEWSQWRDDLAESMFTEWQLRNA

KAA0064809.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]4.8e-16095.53Show/hide
Query:  MFLHVLAHDVKNRIIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVLVTSNYNDQRWKCFENCLGALDGTYIKVNVPAGDRPTFRTRKGEIATNVLR
        MFLHVLAHDVKNR+IQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPV VTSN NDQRWKCFENCLGALDGTYIKVNVPAGDRPTFRTRKGEIATNVL 
Subjt:  MFLHVLAHDVKNRIIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVLVTSNYNDQRWKCFENCLGALDGTYIKVNVPAGDRPTFRTRKGEIATNVLR

Query:  VCDTKGDFVYVLAGWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKGYYYLCDAGYPNAEGFLAPYRGQRYHLQEWRGAANAPTNAKEYFNMKHSSARNVIERAFGV
        VCDTKGDFVYVLAGWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKGYYYLCDAGYPNAEGFLAPYRGQRYHLQEWRGAANAPTNAKEYFNMKHSSARNV ERAFGV
Subjt:  VCDTKGDFVYVLAGWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKGYYYLCDAGYPNAEGFLAPYRGQRYHLQEWRGAANAPTNAKEYFNMKHSSARNVIERAFGV

Query:  LKGRWAILRGKSYYPLQVQCRTILACALLHNLINREMTYCD---DEDEGDSTYATTTASEDTQYIETTNEWSQWRDDLAESMFTEWQLRNA
        LKGRWAILRGKSYYPLQVQCRTILACALLHNLINREMTYCD   DEDEGDSTYATTTASED QYIETTNEWSQWRDDL  SMFT+WQ RNA
Subjt:  LKGRWAILRGKSYYPLQVQCRTILACALLHNLINREMTYCD---DEDEGDSTYATTTASEDTQYIETTNEWSQWRDDLAESMFTEWQLRNA

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7TTQ6 Retrotransposon protein2.3e-16095.53Show/hide
Query:  MFLHVLAHDVKNRIIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVLVTSNYNDQRWKCFENCLGALDGTYIKVNVPAGDRPTFRTRKGEIATNVLR
        MFLHVLAHDVKNR+IQREFVRSGETVSRHFNIVLL VLRLYEELIKRPV VTSN NDQRWKCFENCLGALDGTYIKVNVPAGDRPTFRTRKGEIATNVL 
Subjt:  MFLHVLAHDVKNRIIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVLVTSNYNDQRWKCFENCLGALDGTYIKVNVPAGDRPTFRTRKGEIATNVLR

Query:  VCDTKGDFVYVLAGWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKGYYYLCDAGYPNAEGFLAPYRGQRYHLQEWRGAANAPTNAKEYFNMKHSSARNVIERAFGV
        VCDTKGDFVYVLAGWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKGYYYLCDAGYPNAEGFLAPYRGQRYHLQEWRGAANAPTNAKEYFNMKHSSARNVIERAFGV
Subjt:  VCDTKGDFVYVLAGWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKGYYYLCDAGYPNAEGFLAPYRGQRYHLQEWRGAANAPTNAKEYFNMKHSSARNVIERAFGV

Query:  LKGRWAILRGKSYYPLQVQCRTILACALLHNLINREMTYCD---DEDEGDSTYATTTASEDTQYIETTNEWSQWRDDLAESMFTEWQLRNA
        LKGRWAILRGKSYYPLQVQCRTILACALLHNLINREMTYCD   DEDEGDSTYATTTASED QYIETTNEWSQWRD+LA SMFT+WQ RNA
Subjt:  LKGRWAILRGKSYYPLQVQCRTILACALLHNLINREMTYCD---DEDEGDSTYATTTASEDTQYIETTNEWSQWRDDLAESMFTEWQLRNA

A0A5A7TXM1 Retrotransposon protein3.0e-16094.85Show/hide
Query:  MFLHVLAHDVKNRIIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVLVTSNYNDQRWKCFENCLGALDGTYIKVNVPAGDRPTFRTRKGEIATNVLR
        MFLHVLAHDVKNR+IQREFVRSGETVSRHFNIVLL +LRLYEELIKRPV VTSN NDQRWKCFENCLG LDGTYIKVNVPAGDRPTFRTRKGEIATN+L 
Subjt:  MFLHVLAHDVKNRIIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVLVTSNYNDQRWKCFENCLGALDGTYIKVNVPAGDRPTFRTRKGEIATNVLR

Query:  VCDTKGDFVYVLAGWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKGYYYLCDAGYPNAEGFLAPYRGQRYHLQEWRGAANAPTNAKEYFNMKHSSARNVIERAFGV
        VCDTKGDFVYVLAGWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKGYYYLCDAGYPNAEGFLAPYRGQRYHLQEWRGAANAPTNAKEYFNMKHSSARNVIERAFGV
Subjt:  VCDTKGDFVYVLAGWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKGYYYLCDAGYPNAEGFLAPYRGQRYHLQEWRGAANAPTNAKEYFNMKHSSARNVIERAFGV

Query:  LKGRWAILRGKSYYPLQVQCRTILACALLHNLINREMTYCD---DEDEGDSTYATTTASEDTQYIETTNEWSQWRDDLAESMFTEWQLRNA
        LKGRWAILRGKSYYPLQVQCRTILACALLHNLINREMTYCD   DEDEGDSTYATTTASED QYIETTNEWSQWRDDLA SMFT+WQ RNA
Subjt:  LKGRWAILRGKSYYPLQVQCRTILACALLHNLINREMTYCD---DEDEGDSTYATTTASEDTQYIETTNEWSQWRDDLAESMFTEWQLRNA

A0A5A7UST8 Retrotransposon protein2.1e-16196.22Show/hide
Query:  MFLHVLAHDVKNRIIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVLVTSNYNDQRWKCFENCLGALDGTYIKVNVPAGDRPTFRTRKGEIATNVLR
        MFLHVLAHDVKNR+IQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPV VTSN NDQRWKCFENCLGALDGTYIKVNVPAGDRPTFRTRKGEIATNVL 
Subjt:  MFLHVLAHDVKNRIIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVLVTSNYNDQRWKCFENCLGALDGTYIKVNVPAGDRPTFRTRKGEIATNVLR

Query:  VCDTKGDFVYVLAGWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKGYYYLCDAGYPNAEGFLAPYRGQRYHLQEWRGAANAPTNAKEYFNMKHSSARNVIERAFGV
        VCDTKGDFVYVLAGWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKGYYYLCDAGYPNAEGFLAPYRGQRYHLQEWRGAANAPTNAKEYFNMKHSSARNVIERAFGV
Subjt:  VCDTKGDFVYVLAGWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKGYYYLCDAGYPNAEGFLAPYRGQRYHLQEWRGAANAPTNAKEYFNMKHSSARNVIERAFGV

Query:  LKGRWAILRGKSYYPLQVQCRTILACALLHNLINREMTYCD---DEDEGDSTYATTTASEDTQYIETTNEWSQWRDDLAESMFTEWQLRNA
        LKGRWAILRGKSYYPLQVQCRTILACALLHNLINREMTYCD   DEDEGDSTYATTTASED QYIETTNEWSQWRDDLA SMFT+WQ RNA
Subjt:  LKGRWAILRGKSYYPLQVQCRTILACALLHNLINREMTYCD---DEDEGDSTYATTTASEDTQYIETTNEWSQWRDDLAESMFTEWQLRNA

A0A5A7VH63 Retrotransposon protein2.3e-16095.53Show/hide
Query:  MFLHVLAHDVKNRIIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVLVTSNYNDQRWKCFENCLGALDGTYIKVNVPAGDRPTFRTRKGEIATNVLR
        MFLHVLAHDVKNR+IQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPV VTSN NDQRWKCFENCLGALDGTYIKVNVPAGDRPTFRTRKGEIATNVL 
Subjt:  MFLHVLAHDVKNRIIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVLVTSNYNDQRWKCFENCLGALDGTYIKVNVPAGDRPTFRTRKGEIATNVLR

Query:  VCDTKGDFVYVLAGWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKGYYYLCDAGYPNAEGFLAPYRGQRYHLQEWRGAANAPTNAKEYFNMKHSSARNVIERAFGV
        VCDTKGDFVYVLAGWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKGYYYLCDAGYPNAEGFLAPYRGQRYHLQEWRGAANAPTNAKEYFNMKHSSARNV ERAFGV
Subjt:  VCDTKGDFVYVLAGWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKGYYYLCDAGYPNAEGFLAPYRGQRYHLQEWRGAANAPTNAKEYFNMKHSSARNVIERAFGV

Query:  LKGRWAILRGKSYYPLQVQCRTILACALLHNLINREMTYCD---DEDEGDSTYATTTASEDTQYIETTNEWSQWRDDLAESMFTEWQLRNA
        LKGRWAILRGKSYYPLQVQCRTILACALLHNLINREMTYCD   DEDEGDSTYATTTASED QYIETTNEWSQWRDDL  SMFT+WQ RNA
Subjt:  LKGRWAILRGKSYYPLQVQCRTILACALLHNLINREMTYCD---DEDEGDSTYATTTASEDTQYIETTNEWSQWRDDLAESMFTEWQLRNA

A0A5D3D7X8 Retrotransposon protein7.9e-16195.88Show/hide
Query:  MFLHVLAHDVKNRIIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVLVTSNYNDQRWKCFENCLGALDGTYIKVNVPAGDRPTFRTRKGEIATNVLR
        MFLHVLAHDVKNR+IQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPV VTSN NDQRWKCFENCLGALDGTYIKVNVPAGDRPTFRTRKGEIATNVL 
Subjt:  MFLHVLAHDVKNRIIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVLVTSNYNDQRWKCFENCLGALDGTYIKVNVPAGDRPTFRTRKGEIATNVLR

Query:  VCDTKGDFVYVLAGWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKGYYYLCDAGYPNAEGFLAPYRGQRYHLQEWRGAANAPTNAKEYFNMKHSSARNVIERAFGV
        VCDTKGDFVYVLAGWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKGYYYLCDAGYPNAEGFLAPYRGQRYHLQEWRGAANAPTNAKEYFNMKHSSARNVIERAFGV
Subjt:  VCDTKGDFVYVLAGWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKGYYYLCDAGYPNAEGFLAPYRGQRYHLQEWRGAANAPTNAKEYFNMKHSSARNVIERAFGV

Query:  LKGRWAILRGKSYYPLQVQCRTILACALLHNLINREMTYCD---DEDEGDSTYATTTASEDTQYIETTNEWSQWRDDLAESMFTEWQLRNA
        LKGRWAILRGKSYYPLQVQCRTILACALLHNLINREMTYCD   DEDEGDSTYATTTASED QYIETTNEWSQWRD+LA SMFT+WQ RNA
Subjt:  LKGRWAILRGKSYYPLQVQCRTILACALLHNLINREMTYCD---DEDEGDSTYATTTASEDTQYIETTNEWSQWRDDLAESMFTEWQLRNA

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G43722.1 unknown protein3.0e-2734.56Show/hide
Query:  MFLHVLAHDVKNRIIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPV------LVTSNYNDQR-WKCFENCLGALDGTYIKVNVPAGDRPTFRTRKGE
        MFL +  H+   R +   F R+ ETV R F  VL A   L  + I+ P       +      DQR W  F   +GA+DGT++ V V    +  +  R   
Subjt:  MFLHVLAHDVKNRIIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPV------LVTSNYNDQR-WKCFENCLGALDGTYIKVNVPAGDRPTFRTRKGE

Query:  IATNVLRVCDTKGDFVYVLAGWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKG-YYYLCDAGYPNAEGFLAPYRGQ-----RYHLQEWRGAANAPTNAKEYFNMKH
         + N++ +CD K  F Y+  G  GS  D+ +L+ A   ++   +P    YYL D+GYPN +G LAPYR       RYH+ ++      P N  E FN  H
Subjt:  IATNVLRVCDTKGDFVYVLAGWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKG-YYYLCDAGYPNAEGFLAPYRGQ-----RYHLQEWRGAANAPTNAKEYFNMKH

Query:  SSARNVIERAFGVLKGR
        +S R+VIER F + K +
Subjt:  SSARNVIERAFGVLKGR

AT5G12010.1 unknown protein1.3e-1429.38Show/hide
Query:  NCLGALDGTYIKVNVPA-------GDRPTFRTRKGEIATNVLRVCDTKGDFVYVLAGWEGSAADSRILRDAI--SRENGLQVPKGYYYLCDAGYPNAEGF
        N +G++  T+I +  P          R T R +K   +  +  V + KG F  +  GW GS  D ++L  ++   R N   + KG +     G+P  +  
Subjt:  NCLGALDGTYIKVNVPA-------GDRPTFRTRKGEIATNVLRVCDTKGDFVYVLAGWEGSAADSRILRDAI--SRENGLQVPKGYYYLCDAGYPNAEGF

Query:  LAPYRGQRYHLQEWRGAANAPTNAKEYFNMKHSSARNVIERAFGVLKGRWAILRGKSYYPLQVQCRTILACALLHNL
        L PY  Q              T  +  FN K S  + V + AFG LKGRWA L+ ++   LQ     + AC +LHN+
Subjt:  LAPYRGQRYHLQEWRGAANAPTNAKEYFNMKHSSARNVIERAFGVLKGRWAILRGKSYYPLQVQCRTILACALLHNL

AT5G28950.1 unknown protein4.8e-1739.29Show/hide
Query:  FENCLGALDGTYIKVNVPAGDRPTFRTRKGEIATNVLRVCDTKGDFVYVLAGWEGSAADSRILRDAISR-ENGLQVP---KGYYYLCDAGYPNAEGFLAP
        F++C+GA+D T+I   V     P+FR RKG+I+ N+L  C+   +F+YVL+GWEGSA DS++L DA++R  N L VP   +    + +    N +  L  
Subjt:  FENCLGALDGTYIKVNVPAGDRPTFRTRKGEIATNVLRVCDTKGDFVYVLAGWEGSAADSRILRDAISR-ENGLQVP---KGYYYLCDAGYPNAEGFLAP

Query:  YRGQRYHLQEWR
           QR +  +WR
Subjt:  YRGQRYHLQEWR

AT5G35695.1 CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Putative harbinger transposase-derived nuclease (InterPro:IPR006912)2.1e-2837.7Show/hide
Query:  FVYVLAGWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKGYYYLCDAGYPNAEGFLAPYRGQRYHLQEWRGAANAPTNAKEYFNMKHSSARNVIERAFGVLKGRWAI
        F+YVL+GWEGSA DSR+L DA+ +          +YL D G+ N   FLAP+RG RYHLQE+ G    P    E FN++H S RNVIER FG+ K R+AI
Subjt:  FVYVLAGWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKGYYYLCDAGYPNAEGFLAPYRGQRYHLQEWRGAANAPTNAKEYFNMKHSSARNVIERAFGVLKGRWAI

Query:  LRGKSYYPLQVQCRTILACALLHNLINREMTYCDDED-------EGD-----STYATTTASEDTQYIETTNE----WSQWRDDLAESMFTE
         +    +  + Q   +L CA LHN + +E    D+ D       EGD          T   ++ + +E   +     + WR  +AE M+ +
Subjt:  LRGKSYYPLQVQCRTILACALLHNLINREMTYCDDED-------EGD-----STYATTTASEDTQYIETTNE----WSQWRDDLAESMFTE

AT5G41980.1 CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Putative harbinger transposase-derived nuclease (InterPro:IPR006912)2.4e-4537.94Show/hide
Query:  RLLMENTKPKRYSCNGPMFLHVLAHDVKNRIIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVLVTSNYNDQRWKCFENCLGALDGTYIKVNVPAGD
        R L+ +T   +      +FL ++ H+++ R +Q  F  SGET+SRHFN VL AV+ + ++  +      +  ND  +  F++C+G +D  +I V V   +
Subjt:  RLLMENTKPKRYSCNGPMFLHVLAHDVKNRIIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVLVTSNYNDQRWKCFENCLGALDGTYIKVNVPAGD

Query:  RPTFRTRKGEIATNVLRVCDTKGDFVYVLAGWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKGYYYLCDAGYPNAEGFLAPYRGQRYHLQEWRGAANAPTNAKEYF
        +  FR   G +  NVL        F YVLAGWEGSA+D ++L  A++R N LQVP+G YY+ D  YPN  GF+APY G          + N+   AKE F
Subjt:  RPTFRTRKGEIATNVLRVCDTKGDFVYVLAGWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKGYYYLCDAGYPNAEGFLAPYRGQRYHLQEWRGAANAPTNAKEYF

Query:  NMKHSSARNVIERAFGVLKGRWAILRGKSYYPLQVQCRTILACALLHNLINRE
        N +H      I R FG LK R+ IL     YPLQ Q + ++A   LHN +  E
Subjt:  NMKHSSARNVIERAFGVLKGRWAILRGKSYYPLQVQCRTILACALLHNLINRE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCGTTTGTAGGCTTTTAATGGAAAATACAAAACCGAAGAGGTACTCTTGTAATGGCCCAATGTTCTTGCACGTCCTCGCTCATGACGTGAAGAACCGCATCATCCA
ACGGGAATTTGTACGGTCCGGTGAGACAGTATCTCGACATTTCAACATCGTATTGTTGGCTGTTCTTCGACTGTACGAGGAGTTGATAAAGAGACCTGTTCTGGTAACAA
GTAACTATAATGATCAACGTTGGAAGTGTTTCGAGAACTGCCTTGGCGCGTTAGACGGGACGTACATAAAGGTCAACGTCCCCGCAGGAGATCGGCCTACATTCAGAACG
CGTAAGGGGGAAATTGCCACAAACGTTCTGAGGGTCTGTGACACGAAAGGGGATTTCGTTTATGTCCTCGCCGGTTGGGAAGGATCCGCAGCAGACTCGCGGATCCTACG
TGATGCGATTTCACGAGAAAATGGACTACAAGTGCCAAAGGGATATTATTATCTGTGCGATGCGGGATATCCAAACGCGGAGGGGTTTCTCGCCCCGTACAGAGGCCAGC
GGTACCATTTGCAAGAGTGGCGTGGTGCTGCAAATGCGCCAACAAATGCAAAGGAGTACTTCAACATGAAGCACTCCTCCGCAAGGAATGTTATTGAGCGCGCGTTCGGT
GTTCTCAAGGGTCGTTGGGCCATTCTTCGTGGAAAGTCGTACTATCCCCTGCAAGTCCAGTGTCGCACCATTCTAGCATGTGCCTTGCTTCACAATTTGATCAACAGGGA
AATGACATATTGCGACGACGAGGACGAGGGGGACTCCACGTACGCGACGACCACCGCTTCAGAAGACACTCAGTACATTGAGACAACAAACGAGTGGTCTCAGTGGCGCG
ATGACCTAGCCGAATCGATGTTCACCGAATGGCAGTTGCGTAACGCTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCCGTTTGTAGGCTTTTAATGGAAAATACAAAACCGAAGAGGTACTCTTGTAATGGCCCAATGTTCTTGCACGTCCTCGCTCATGACGTGAAGAACCGCATCATCCA
ACGGGAATTTGTACGGTCCGGTGAGACAGTATCTCGACATTTCAACATCGTATTGTTGGCTGTTCTTCGACTGTACGAGGAGTTGATAAAGAGACCTGTTCTGGTAACAA
GTAACTATAATGATCAACGTTGGAAGTGTTTCGAGAACTGCCTTGGCGCGTTAGACGGGACGTACATAAAGGTCAACGTCCCCGCAGGAGATCGGCCTACATTCAGAACG
CGTAAGGGGGAAATTGCCACAAACGTTCTGAGGGTCTGTGACACGAAAGGGGATTTCGTTTATGTCCTCGCCGGTTGGGAAGGATCCGCAGCAGACTCGCGGATCCTACG
TGATGCGATTTCACGAGAAAATGGACTACAAGTGCCAAAGGGATATTATTATCTGTGCGATGCGGGATATCCAAACGCGGAGGGGTTTCTCGCCCCGTACAGAGGCCAGC
GGTACCATTTGCAAGAGTGGCGTGGTGCTGCAAATGCGCCAACAAATGCAAAGGAGTACTTCAACATGAAGCACTCCTCCGCAAGGAATGTTATTGAGCGCGCGTTCGGT
GTTCTCAAGGGTCGTTGGGCCATTCTTCGTGGAAAGTCGTACTATCCCCTGCAAGTCCAGTGTCGCACCATTCTAGCATGTGCCTTGCTTCACAATTTGATCAACAGGGA
AATGACATATTGCGACGACGAGGACGAGGGGGACTCCACGTACGCGACGACCACCGCTTCAGAAGACACTCAGTACATTGAGACAACAAACGAGTGGTCTCAGTGGCGCG
ATGACCTAGCCGAATCGATGTTCACCGAATGGCAGTTGCGTAACGCTTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAVCRLLMENTKPKRYSCNGPMFLHVLAHDVKNRIIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAVLRLYEELIKRPVLVTSNYNDQRWKCFENCLGALDGTYIKVNVPAGDRPTFRT
RKGEIATNVLRVCDTKGDFVYVLAGWEGSAADSRILRDAISRENGLQVPKGYYYLCDAGYPNAEGFLAPYRGQRYHLQEWRGAANAPTNAKEYFNMKHSSARNVIERAFG
VLKGRWAILRGKSYYPLQVQCRTILACALLHNLINREMTYCDDEDEGDSTYATTTASEDTQYIETTNEWSQWRDDLAESMFTEWQLRNA