; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Pay0015735 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome

Gene IDPay0015735
OrganismCucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
DescriptionRetrotransposon protein
Genome locationchr04:4236630..4237766
RNA-Seq ExpressionPay0015735
SyntenyPay0015735
Gene Ontology termsGO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR027806 - Harbinger transposase-derived nuclease domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0062747.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]8.6e-11069.44Show/hide
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TYK08389.1 putative nuclease HARBI1 [Cucumis melo var. makuwa]1.8e-10775.09Show/hide
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XP_008441953.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103485952 [Cucumis melo]1.5e-10674.73Show/hide
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XP_008455792.1 PREDICTED: putative nuclease HARBI1 [Cucumis melo]6.8e-10769.25Show/hide
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XP_008466673.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103504027 [Cucumis melo]2.6e-14699.62Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3C1U8 putative nuclease HARBI13.3e-10769.25Show/hide
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A0A1S3CRU3 uncharacterized protein LOC1035040271.2e-14699.62Show/hide
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A0A5D3CDG6 Putative nuclease HARBI18.7e-10875.09Show/hide
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A0A5D3CQK6 Putative nuclease HARBI11.2e-14699.62Show/hide
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A0A5D3DG22 Retrotransposon protein4.2e-11069.44Show/hide
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        SNEWSE RDQLAHTMFSDWEL+ Q
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G55350.1 PIF / Ping-Pong family of plant transposases8.0e-0542.31Show/hide
Query:  FNMKHSSARNVIERAFGLLKGHWTILRGKSYYP-VDVQSRTIMVCCLLHNLI
        FN +HS A    + A   LK  W I+ G  + P  +   R I VCCLLHN+I
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AT4G10890.1 unknown protein2.4e-0928Show/hide
Query:  LLRTTAGLVGTKVIDVEEMVAMFLHILAHDVKNRMIQREFVRSGETVSRHFNLALLAVLRLHDELLKKPQPNFLGALDGTYIKVNVSATVVQGLAADSRI
        +L    GL   + + +EE VAMFL  +  +   R I   + +S   V R  +  L A+L+   + LK  + +                 V++  A +   
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Query:  LGDAISR-----HNVLKVPKGFLASYRGERYHLSEWRGGGNAPTTAREFFNMKHSSARNVIERAFGLLKGHWTIL
             +R     ++V     G+L  +R   YHL ++ G G  P T +E FN KH   R+VI+R FG+ K  W IL
Subjt:  LGDAISR-----HNVLKVPKGFLASYRGERYHLSEWRGGGNAPTTAREFFNMKHSSARNVIERAFGLLKGHWTIL

AT5G35695.1 CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Putative harbinger transposase-derived nuclease (InterPro:IPR006912)3.1e-1737.07Show/hide
Query:  QGLAADSRILGDAISRHNVLKV----PKGFLASYRGERYHLSEWRGGGNAPTTAREFFNMKHSSARNVIERAFGLLKGHWTILRGKSYYPVDVQSRTIMV
        +G A DSR+L DA+ +  ++         FLA +RG RYHL E+ G    P T  E FN++H S RNVIER FG+ K  + I +    +    Q+  ++ 
Subjt:  QGLAADSRILGDAISRHNVLKV----PKGFLASYRGERYHLSEWRGGGNAPTTAREFFNMKHSSARNVIERAFGLLKGHWTILRGKSYYPVDVQSRTIMV

Query:  CCLLHNLINREMTNSE
        C  LHN + +E  + E
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AT5G41980.1 CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Putative harbinger transposase-derived nuclease (InterPro:IPR006912)3.6e-2128.06Show/hide
Query:  MDRRCVAILGHLLRTTAGLVGTKVIDVEEMVAMFLHILAHDVKNRMIQREFVRSGETVSRHFNLALLAVLRL---------HDELLKKPQPNF---LGAL
        MD+     L  LL+T   L  T  I +E  +A+FL I+ H+++ R +Q  F  SGET+SRHFN  L AV+ +         + + L+   P F   +G +
Subjt:  MDRRCVAILGHLLRTTAGLVGTKVIDVEEMVAMFLHILAHDVKNRMIQREFVRSGETVSRHFNLALLAVLRL---------HDELLKKPQPNF---LGAL

Query:  DGTYIKV-------------------NVSATVV------------QGLAADSRILGDAISRHNVLKVPK--------------GFLASYRGERYHLSEWR
        D  +I V                   NV A               +G A+D ++L  A++R N L+VP+              GF+A Y G         
Subjt:  DGTYIKV-------------------NVSATVV------------QGLAADSRILGDAISRHNVLKVPK--------------GFLASYRGERYHLSEWR

Query:  GGGNAPTTAREFFNMKHSSARNVIERAFGLLKGHWTILRGKSYYPVDVQSRTIMVCCLLHNLINREMTNSEIINNLDE
           N+   A+E FN +H      I R FG LK  + IL     YP+  Q + ++  C LHN +  E  +  +    +E
Subjt:  GGGNAPTTAREFFNMKHSSARNVIERAFGLLKGHWTILRGKSYYPVDVQSRTIMVCCLLHNLINREMTNSEIINNLDE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATAGAAGGTGTGTTGCCATTTTAGGCCATTTACTAAGGACAACTGCTGGATTAGTCGGAACAAAAGTTATAGATGTAGAGGAGATGGTTGCCATGTTCCTGCATAT
ATTAGCTCATGACGTGAAGAATCGAATGATACAAAGGGAATTTGTACGATCTGGTGAGACTGTTTCTAGACATTTCAACCTTGCCTTGTTAGCAGTTTTGCGGTTACACG
ACGAGTTGTTGAAAAAACCTCAGCCAAATTTTCTTGGTGCGTTAGATGGCACATACATTAAGGTGAATGTCAGTGCAACCGTTGTCCAAGGATTGGCCGCTGATTCCAGA
ATTCTTGGAGATGCAATATCAAGACATAACGTACTGAAGGTTCCAAAGGGTTTTTTGGCCTCATATAGGGGAGAAAGATATCATCTTTCAGAGTGGCGTGGAGGAGGTAA
TGCACCAACAACAGCTCGAGAGTTCTTCAACATGAAACATTCGTCAGCACGAAATGTCATCGAAAGAGCATTTGGGTTGTTAAAAGGTCACTGGACAATTTTAAGAGGAA
AGTCATACTACCCAGTCGATGTCCAAAGTCGAACAATCATGGTTTGTTGTCTGCTACACAATCTTATCAATAGAGAGATGACTAACAGTGAAATAATCAATAATTTGGAT
GAGGGTGATGCAACATACGCTACAACTAGAGGTGACGAGATTAATTACATTGCGGCTTCAAATGAATGGAGTGAATTGAGGGATCAATTGGCTCATACGATGTTCAGTGA
TTGGGAGTTACGTGACCAGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGATAGAAGGTGTGTTGCCATTTTAGGCCATTTACTAAGGACAACTGCTGGATTAGTCGGAACAAAAGTTATAGATGTAGAGGAGATGGTTGCCATGTTCCTGCATAT
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ACGAGTTGTTGAAAAAACCTCAGCCAAATTTTCTTGGTGCGTTAGATGGCACATACATTAAGGTGAATGTCAGTGCAACCGTTGTCCAAGGATTGGCCGCTGATTCCAGA
ATTCTTGGAGATGCAATATCAAGACATAACGTACTGAAGGTTCCAAAGGGTTTTTTGGCCTCATATAGGGGAGAAAGATATCATCTTTCAGAGTGGCGTGGAGGAGGTAA
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AGTCATACTACCCAGTCGATGTCCAAAGTCGAACAATCATGGTTTGTTGTCTGCTACACAATCTTATCAATAGAGAGATGACTAACAGTGAAATAATCAATAATTTGGAT
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TTGGGAGTTACGTGACCAGTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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ILGDAISRHNVLKVPKGFLASYRGERYHLSEWRGGGNAPTTAREFFNMKHSSARNVIERAFGLLKGHWTILRGKSYYPVDVQSRTIMVCCLLHNLINREMTNSEIINNLD
EGDATYATTRGDEINYIAASNEWSELRDQLAHTMFSDWELRDQ