| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| XP_004145851.1 THO complex subunit 4D [Cucumis sativus] | 3.0e-148 | 97.9 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
VSNLDYGVTKEDI+ELFSEIGD+KRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
Subjt: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
Query: PESGRNATFNVVNPFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGL-GGSGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
ESGRNAT NVVN FPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGL GGSGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
Subjt: PESGRNATFNVVNPFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGL-GGSGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| XP_008457020.1 PREDICTED: THO complex subunit 4D [Cucumis melo] | 8.9e-153 | 99.65 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
Subjt: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
Query: PESGRNATFNVVNPFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGLGGSGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
PESGRNATFNVVNPFPGPSHRGGLRNARGRGRGAW+RGVGLGGSGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
Subjt: PESGRNATFNVVNPFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGLGGSGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| XP_022982649.1 THO complex subunit 4D-like [Cucurbita maxima] | 6.0e-133 | 85.57 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
M TPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGS+NGGR VVIGSVRRGPLGINAR SA+SI KPP RMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGI+IGTKLY
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNA+ PVSARINVTG NGR+RRTVVLT
Subjt: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
Query: PESGRNATFNVVNPFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGV------GLGGSGG------GRGRGR--------GRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHA
ESGR + N VNPFPGPSHRGGLR+ RGRGRG WSRG+ GLGG GG GRGRGR GRGRGQGRKKPVEKSS ELDKELENYHA
Subjt: PESGRNATFNVVNPFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGV------GLGGSGG------GRGRGR--------GRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHA
Query: EAMQT
EAMQT
Subjt: EAMQT
|
|
| XP_023527122.1 THO complex subunit 4D [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 3.5e-133 | 88.14 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
M TPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGS+NGGR VVIGSVRRGPLGINAR SA+SI KPP RMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGI+IGTKLY
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNA+ PVSARINVTG NGR+RRTVVLT
Subjt: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
Query: PESGRNATFNVVNPFPGPSHRGGLRN--ARGRGRGAWSRGVGLGG----SGGGRGRGR----GRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
ESGR + N VNPFPGPSHRGGLR+ RGRGRG WSRG+G GG GGGRGRGR GRGRGQGRKKPVEKSS ELDKELENYHAEAMQT
Subjt: PESGRNATFNVVNPFPGPSHRGGLRN--ARGRGRGAWSRGVGLGG----SGGGRGRGR----GRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| XP_038896761.1 THO complex subunit 4D-like [Benincasa hispida] | 9.8e-144 | 93.68 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
M TPLDMSLEDVIKK+NREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVV+GSVRRGPLGINARASAYSIRKPP RMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGI+IGTKLY
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
VSNLDYGV+KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDG+PMKIEMLGDNAEMPVSARINVTG NGR+RRTVVLT
Subjt: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
Query: PESGRNATFNVVNPFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGLGGSGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
PESGR A+ NVVNPFPGPSHRGGLRN RGRGRG W+RG G+GG GGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
Subjt: PESGRNATFNVVNPFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGLGGSGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0L717 RRM domain-containing protein | 1.5e-105 | 99 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
VSNLDYGVTKEDI+ELFSEIGD+KRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
Subjt: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
|
|
| A0A1S3C452 THO complex subunit 4D | 4.3e-153 | 99.65 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
Subjt: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
Query: PESGRNATFNVVNPFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGLGGSGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
PESGRNATFNVVNPFPGPSHRGGLRNARGRGRGAW+RGVGLGGSGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
Subjt: PESGRNATFNVVNPFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGLGGSGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| A0A6J1CP51 THO complex subunit 4D-like | 1.1e-127 | 88.07 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
M TPLDMSLED+IKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGR VVIGS+RRGPL IN R SA+SI KPP RMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGI+IGTKLY
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIE+LGDNAEMPVSARINVTG NGR+RRTVVLT
Subjt: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
Query: PESGRNATFNVVNPFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGLGGSGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
ESGR + VVN FPGPS+RG LR RGRGRG WSR G G GGGRGRGRGRGRG GRKK VEKSSDELDK+LENYHAEAMQT
Subjt: PESGRNATFNVVNPFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGLGGSGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| A0A6J1FAB9 THO complex subunit 4D-like | 6.5e-133 | 87.8 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
M TPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGS+NGGR VVIGSVRRGPLGINAR SA+SI KPP RMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGI+IGTKLY
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNA+ PVSARINVTG NGR+RRTVVLT
Subjt: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
Query: PESGRNATFNVVNPFPGPSHRGGLRN--ARGRGRGAWSRGVGLGG----SGGGRGRGR----GRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
ESGR + + VNPFPGPSHRGGLR+ RGRGRG WSRG+G GG GGGRGRGR GRGRGQGRKKPVEKSS ELDKELENYHAEAMQT
Subjt: PESGRNATFNVVNPFPGPSHRGGLRN--ARGRGRGAWSRGVGLGG----SGGGRGRGR----GRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| A0A6J1J564 THO complex subunit 4D-like | 2.9e-133 | 85.57 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
M TPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGS+NGGR VVIGSVRRGPLGINAR SA+SI KPP RMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGI+IGTKLY
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNA+ PVSARINVTG NGR+RRTVVLT
Subjt: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
Query: PESGRNATFNVVNPFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGV------GLGGSGG------GRGRGR--------GRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHA
ESGR + N VNPFPGPSHRGGLR+ RGRGRG WSRG+ GLGG GG GRGRGR GRGRGQGRKKPVEKSS ELDKELENYHA
Subjt: PESGRNATFNVVNPFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGV------GLGGSGG------GRGRGR--------GRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHA
Query: EAMQT
EAMQT
Subjt: EAMQT
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| B5FXN8 THO complex subunit 4 | 1.6e-32 | 38.06 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGG----RGVVIGSVRRGPL---GINARASAYSIRKPPHRMKNV--QWQHDLFEDSLRASGIS
M +DMSL+D+IK N ++ +RG R GRG GG+ GG GV G GP+ + AR + P R K + +WQHDLF+ A +
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGG----RGVVIGSVRRGPL---GINARASAYSIRKPPHRMKNV--QWQHDLFEDSLRASGIS
Query: GIQIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNG
G++ G KL VSNLD+GV+ DI+ELF+E G LK+ A+HYD++GR G+A+V + R++DA A+K+YN V LDG+PM I++ V+++I+ T
Subjt: GIQIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNG
Query: RNRRTVVLTPESGRNATFNVVNPFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGLGGSGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHA
R ++V +RGG+ R RG G G G RG RGRGRG GR + S++ELD +L+ Y+A
Subjt: RNRRTVVLTPESGRNATFNVVNPFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGLGGSGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHA
|
|
| Q6NQ72 THO complex subunit 4D | 1.2e-70 | 54.42 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKL
M+ L+M+L++++K+ + RG +R RGRG GG GGRG G RRGPL +NAR S+++I KP R++++ WQ LFED LRA+G SG+++GT+L
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKL
Query: YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--AEMPVSAR--INVTGTNGRNRR
+V+NLD GVT EDIRELFSEIG+++R+AIHYDKNGRPSG+AEVVY RRSDAF ALK+YNNVLLDG+PM++E+LG N +E P+S R +NVTG NGR +R
Subjt: YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--AEMPVSAR--INVTGTNGRNRR
Query: TVVLTPESGRNATF----NVVNPFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGLGGSGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
TVV+ G P P S R + N +G G G G G G GRGRG GRG G KKPVEKS+ +LDK+LE+YHA+AM T
Subjt: TVVLTPESGRNATF----NVVNPFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGLGGSGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| Q8L719 THO complex subunit 4B | 1.7e-45 | 45.07 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLF--EDSLRAS----------
M+ LDMSL+D+I K+NR+ +RGR G G GG G G RR + AR + YS + + WQ+D+F + S+ A+
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLF--EDSLRAS----------
Query: GISGIQIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTG
G S I+ GTKLY+SNLDYGV+ EDI+ELFSE+GDLKR+ IHYD++GR G+AEVV++RR DA AA+KRYNNV LDGK MKIE++G N P + +
Subjt: GISGIQIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTG
Query: TNGRNRRTVVLTPESGRNATFNVVNPFPGPSHRGGLRNARGRGRGAW---SRGVGLGGSG--GGRG-RGRGRGRGQ-GRKKPVEKSSDELDKELENYHAE
T + P +G FN F G + N RGRGRG + RG G GG GGRG RGRG GRG GR + S+++LD EL+ YH E
Subjt: TNGRNRRTVVLTPESGRNATFNVVNPFPGPSHRGGLRNARGRGRGAW---SRGVGLGGSG--GGRG-RGRGRGRGQ-GRKKPVEKSSDELDKELENYHAE
Query: AMQT
AM+T
Subjt: AMQT
|
|
| Q8L773 THO complex subunit 4A | 1.5e-41 | 42.27 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLF----EDSLRASGISGIQIG
M+T LDMSL+D+I KN ++RG A RG G G + R P + R++ Y K P W HD+F ED +GI+ G
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLF----EDSLRASGISGIQIG
Query: TKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRT
TKLY+SNLDYGV EDI+ELF+E+G+LKR+ +H+D++GR G+AEVVY+RR DA AA+K+YN+V LDGKPMKIE++G N + +
Subjt: TKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRT
Query: VVLTPESGRNATFNVVNPFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGLGGSG-GGRGRGRGRGRGQGRKKPVEK-SSDELDKELENYHAEAMQT
SGR A N G RG G+GRG RG G GG G GG GRGR G+G P EK S+++LD +L+ YH+ M+T
Subjt: VVLTPESGRNATFNVVNPFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGLGGSG-GGRGRGRGRGRGQGRKKPVEK-SSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| Q94EH8 THO complex subunit 4C | 6.6e-66 | 51.6 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGS---FNGGRGVVIGSVRRGPLGINAR-ASAYSIRKPPHRMKNVQW--QHDLFEDSLRAS
M+ L+M+L++++KK+ E+ A +G +R+ GRG GG GGRG G VRRGPL +N R +S++SI K R +++ W Q+DL+E++LRA
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGS---FNGGRGVVIGSVRRGPLGINAR-ASAYSIRKPPHRMKNVQW--QHDLFEDSLRAS
Query: GISGIQIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE-MPVSARINVT
G+SG+++GT +Y++NLD GVT EDIREL++EIG+LKR+AIHYDKNGRPSGSAEVVY RRSDA A+++YNNVLLDG+PMK+E+LG N E PV+AR+NVT
Subjt: GISGIQIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE-MPVSARINVT
Query: GTNGRNRRTVVLTPESGRNATFNVVNPFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGL---------GGSGGGRGRGRGRGRGQGR-------KKPVEKSSDEL
G NGR +R+V F G RGG R RGRG G R + L G GG RGRGRG G G+G KKPVEKS+ +L
Subjt: GTNGRNRRTVVLTPESGRNATFNVVNPFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGL---------GGSGGGRGRGRGRGRGQGR-------KKPVEKSSDEL
Query: DKELENYHAEAM
DK+LE+YHAEAM
Subjt: DKELENYHAEAM
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G66260.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 4.7e-67 | 51.6 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGS---FNGGRGVVIGSVRRGPLGINAR-ASAYSIRKPPHRMKNVQW--QHDLFEDSLRAS
M+ L+M+L++++KK+ E+ A +G +R+ GRG GG GGRG G VRRGPL +N R +S++SI K R +++ W Q+DL+E++LRA
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGS---FNGGRGVVIGSVRRGPLGINAR-ASAYSIRKPPHRMKNVQW--QHDLFEDSLRAS
Query: GISGIQIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE-MPVSARINVT
G+SG+++GT +Y++NLD GVT EDIREL++EIG+LKR+AIHYDKNGRPSGSAEVVY RRSDA A+++YNNVLLDG+PMK+E+LG N E PV+AR+NVT
Subjt: GISGIQIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE-MPVSARINVT
Query: GTNGRNRRTVVLTPESGRNATFNVVNPFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGL---------GGSGGGRGRGRGRGRGQGR-------KKPVEKSSDEL
G NGR +R+V F G RGG R RGRG G R + L G GG RGRGRG G G+G KKPVEKS+ +L
Subjt: GTNGRNRRTVVLTPESGRNATFNVVNPFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGL---------GGSGGGRGRGRGRGRGQGR-------KKPVEKSSDEL
Query: DKELENYHAEAM
DK+LE+YHAEAM
Subjt: DKELENYHAEAM
|
|
| AT1G66260.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 4.7e-67 | 51.6 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGS---FNGGRGVVIGSVRRGPLGINAR-ASAYSIRKPPHRMKNVQW--QHDLFEDSLRAS
M+ L+M+L++++KK+ E+ A +G +R+ GRG GG GGRG G VRRGPL +N R +S++SI K R +++ W Q+DL+E++LRA
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGS---FNGGRGVVIGSVRRGPLGINAR-ASAYSIRKPPHRMKNVQW--QHDLFEDSLRAS
Query: GISGIQIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE-MPVSARINVT
G+SG+++GT +Y++NLD GVT EDIREL++EIG+LKR+AIHYDKNGRPSGSAEVVY RRSDA A+++YNNVLLDG+PMK+E+LG N E PV+AR+NVT
Subjt: GISGIQIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE-MPVSARINVT
Query: GTNGRNRRTVVLTPESGRNATFNVVNPFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGL---------GGSGGGRGRGRGRGRGQGR-------KKPVEKSSDEL
G NGR +R+V F G RGG R RGRG G R + L G GG RGRGRG G G+G KKPVEKS+ +L
Subjt: GTNGRNRRTVVLTPESGRNATFNVVNPFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGL---------GGSGGGRGRGRGRGRGQGR-------KKPVEKSSDEL
Query: DKELENYHAEAM
DK+LE+YHAEAM
Subjt: DKELENYHAEAM
|
|
| AT5G02530.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.2e-46 | 45.07 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLF--EDSLRAS----------
M+ LDMSL+D+I K+NR+ +RGR G G GG G G RR + AR + YS + + WQ+D+F + S+ A+
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLF--EDSLRAS----------
Query: GISGIQIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTG
G S I+ GTKLY+SNLDYGV+ EDI+ELFSE+GDLKR+ IHYD++GR G+AEVV++RR DA AA+KRYNNV LDGK MKIE++G N P + +
Subjt: GISGIQIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTG
Query: TNGRNRRTVVLTPESGRNATFNVVNPFPGPSHRGGLRNARGRGRGAW---SRGVGLGGSG--GGRG-RGRGRGRGQ-GRKKPVEKSSDELDKELENYHAE
T + P +G FN F G + N RGRGRG + RG G GG GGRG RGRG GRG GR + S+++LD EL+ YH E
Subjt: TNGRNRRTVVLTPESGRNATFNVVNPFPGPSHRGGLRNARGRGRGAW---SRGVGLGGSG--GGRG-RGRGRGRGQ-GRKKPVEKSSDELDKELENYHAE
Query: AMQT
AM+T
Subjt: AMQT
|
|
| AT5G37720.1 ALWAYS EARLY 4 | 8.2e-72 | 54.42 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKL
M+ L+M+L++++K+ + RG +R RGRG GG GGRG G RRGPL +NAR S+++I KP R++++ WQ LFED LRA+G SG+++GT+L
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKL
Query: YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--AEMPVSAR--INVTGTNGRNRR
+V+NLD GVT EDIRELFSEIG+++R+AIHYDKNGRPSG+AEVVY RRSDAF ALK+YNNVLLDG+PM++E+LG N +E P+S R +NVTG NGR +R
Subjt: YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--AEMPVSAR--INVTGTNGRNRR
Query: TVVLTPESGRNATF----NVVNPFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGLGGSGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
TVV+ G P P S R + N +G G G G G G GRGRG GRG G KKPVEKS+ +LDK+LE+YHA+AM T
Subjt: TVVLTPESGRNATF----NVVNPFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGLGGSGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| AT5G37720.2 ALWAYS EARLY 4 | 2.6e-73 | 55.52 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKL
M+ L+M+L++++K+ + RG +R RGRG GG GGRG G RRGPL +NAR S+++I KP R++++ WQ LFED LRA+G SG+++GT+L
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKL
Query: YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--AEMPVSAR--INVTGTNGRNRR
+V+NLD GVT EDIRELFSEIG+++R+AIHYDKNGRPSG+AEVVY RRSDAF ALK+YNNVLLDG+PM++E+LG N +E P+S R +NVTG NGR +R
Subjt: YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--AEMPVSAR--INVTGTNGRNRR
Query: TVVLTPESGRNATFNVVNPFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGLGGSGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
TVV+ GR P P S R + N +G G G G G G GRGRG GRG G KKPVEKS+ +LDK+LE+YHA+AM T
Subjt: TVVLTPESGRNATFNVVNPFPGPSHRGGLRNARGRGRGAWSRGVGLGGSGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
