; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Pay0015835 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome

Gene IDPay0015835
OrganismCucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
DescriptionTransmembrane protein, putative
Genome locationchr08:1525202..1525972
RNA-Seq ExpressionPay0015835
SyntenyPay0015835
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0052545.1 hypothetical protein E6C27_scaffold120G001480 [Cucumis melo var. makuwa]5.1e-8198.74Show/hide
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KAG6581427.1 hypothetical protein SDJN03_21429, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.6e-2655Show/hide
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        K KKK      F+S+ NN  N+KG+AFSVMLPKGFVPPSGSSPCHN++PQSSS AFYCHL
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KAG6594469.1 hypothetical protein SDJN03_11022, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.4e-1946.2Show/hide
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        MGFKI     P  SPNYL +  ISLSLILFFL+ S  SS +PLP    N+  HHR    +H  A  TT             + +KKL+ME          
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                    +N  KK +K +AFS MLPKGFVPPSGSSPCHNENP+   +AFYCHL
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KAG7026467.1 hypothetical protein SDJN02_10467, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.9e-2046.2Show/hide
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                    +N  KK +K +AFS MLPKGFVPPSGSSPCHNENP+   +AFYCHL
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KGN49393.1 hypothetical protein Csa_004373 [Cucumis sativus]2.4e-6284.66Show/hide
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         K+ VV  PGGFKSSN+  KNDKGSAFS MLPKGFVPPSGSSPCHNE+PQSSSLAFYCHLDRP
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KIK1 Uncharacterized protein1.1e-6284.66Show/hide
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         K+ VV  PGGFKSSN+  KNDKGSAFS MLPKGFVPPSGSSPCHNE+PQSSSLAFYCHLDRP
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A0A444WWS8 Uncharacterized protein1.6e-0835.62Show/hide
Query:  SLILFFLI------TSTTSSFKPLPHESNNVHHRATAVVHGSAMITTLGREVDHHHHHHEYRSKKLEMEIKINKISKKMKKKGVVPGGFKSSNNNKKNDK
        ++ LFFLI      +S++SSF       NN H+   +    S ++++      +H       +KK +    I K  + +K+   +    ++ NNNK  +K
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         S         AFSVMLPKGFVPPSGSSPCHN+ P S+  +F+CHL
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A0A445BCG1 Uncharacterized protein9.5e-0935.62Show/hide
Query:  SLILFFLITSTTSSFKPLPHESNNVHHRATAVVHGSAMITTLGREVDHHHHHHEYRSKKL-----EMEIKINKISKKMKKKGVVPGGFKSSNNNKKNDKG
        ++ LFFLI   T         +N+  + +++    S+ I +    +  +H     ++ K      +M  K  +I K MKKK       K+ N NK  +K 
Subjt:  SLILFFLITSTTSSFKPLPHESNNVHHRATAVVHGSAMITTLGREVDHHHHHHEYRSKKL-----EMEIKINKISKKMKKKGVVPGGFKSSNNNKKNDKG

Query:  S----------AFSVMLPKGFVPPSGSSPCHNENPQSSSLAFYCHL
        S          AFSVMLPKGFVPPSGSSPCHN+ P S+  +F+CHL
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A0A445I8K3 Uncharacterized protein4.7e-0835.66Show/hide
Query:  SLSLILFFLITSTTSSFKPLPHESNNVHHRATAVVHGSAMITTLGREVDHHHHHHEYRSK--------KLEMEIKINKISKKMKKKGVVPGGFKS--SNN
        +++L + FL++ T SS       S++ H     + + S+  TT      H+H H  +  K        K E   K  +I +   K  ++    K    N 
Subjt:  SLSLILFFLITSTTSSFKPLPHESNNVHHRATAVVHGSAMITTLGREVDHHHHHHEYRSK--------KLEMEIKINKISKKMKKKGVVPGGFKS--SNN

Query:  NKKNDKGSAFSVMLPKGFVPPSGSSPCHNENPQSSSLAFYCHL
         +  D   AFSVMLPKGFVPPSGSSPCHN+ P S S +F+CHL
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A0A5A7UFQ9 Uncharacterized protein2.5e-8198.74Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G18335.1 unknown protein2.0e-0630.2Show/hide
Query:  FQISLSLILFFLITSTTSSFKPLPHESNNVH-----------HRATAVVHGSAMITTLGREVDHH------HHHHEYRSKKLEMEIKINKISKKMKKKGV
        F +SL L L FLI+ ++SS       S+              H+   +   +  I     + D+H      H ++ Y    L     ++  +   K    
Subjt:  FQISLSLILFFLITSTTSSFKPLPHESNNVH-----------HRATAVVHGSAMITTLGREVDHH------HHHHEYRSKKLEMEIKINKISKKMKKKGV

Query:  VPGGFKSSNNNKKNDKGSAFSVMLPKGFVPPSGSSPCHNENPQSSSLAF
             K +N   +  +   FSVMLPKGFVPPSGSSPCHN+NP S++  F
Subjt:  VPGGFKSSNNNKKNDKGSAFSVMLPKGFVPPSGSSPCHNENPQSSSLAF


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGTTTCAAGATTCCCTCTTCATTCTCCCCATATTCATCGCCAAATTACCTTTGTTTCTTTCAAATCTCTCTCTCTCTCATTCTCTTTTTCCTCATAACTTCCACCAC
CTCTTCCTTTAAACCCCTTCCCCATGAATCAAACAACGTCCACCACCGGGCCACCGCCGTCGTCCATGGCAGCGCAATGATCACCACACTAGGGCGAGAAGTAGATCATC
ATCATCATCATCATGAATACAGAAGCAAGAAATTGGAAATGGAGATCAAAATTAACAAGATAAGCAAGAAGATGAAAAAGAAGGGTGTAGTCCCGGGCGGGTTTAAAAGC
AGTAATAATAATAAAAAAAACGATAAAGGAAGTGCTTTTTCTGTAATGCTTCCAAAGGGATTTGTTCCTCCTTCTGGTTCTTCGCCTTGTCATAACGAAAATCCTCAATC
TTCATCTCTTGCCTTTTACTGCCATCTCGATCGCCCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CCTTTCTTTCTCATCCTCGATTAAAAATTTGGATCTCCATAGCATTTTTGCACACAAAATGAAATTTACCCATCACCATAACATCCAAATTAAAACCCTTTTGATTTCTC
TTTCTCAAAAGTGAAAAATGGGTTTCAAGATTCCCTCTTCATTCTCCCCATATTCATCGCCAAATTACCTTTGTTTCTTTCAAATCTCTCTCTCTCTCATTCTCTTTTTC
CTCATAACTTCCACCACCTCTTCCTTTAAACCCCTTCCCCATGAATCAAACAACGTCCACCACCGGGCCACCGCCGTCGTCCATGGCAGCGCAATGATCACCACACTAGG
GCGAGAAGTAGATCATCATCATCATCATCATGAATACAGAAGCAAGAAATTGGAAATGGAGATCAAAATTAACAAGATAAGCAAGAAGATGAAAAAGAAGGGTGTAGTCC
CGGGCGGGTTTAAAAGCAGTAATAATAATAAAAAAAACGATAAAGGAAGTGCTTTTTCTGTAATGCTTCCAAAGGGATTTGTTCCTCCTTCTGGTTCTTCGCCTTGTCAT
AACGAAAATCCTCAATCTTCATCTCTTGCCTTTTACTGCCATCTCGATCGCCCTTGATTAATCTTCTTTTATCCATTTGGGCATTCTTTTTGAGGTGGGTTTCAGCTAAT
TTCTTGTTTTTGTTTGTTTATTCTATTATAAAATTTCCCCCTTCTTGAAATCGTGACAAATTAAACAGTGTAATATGGTCTCTCCATATATAAATATATAGAAGAAAAAA
G
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGFKIPSSFSPYSSPNYLCFFQISLSLILFFLITSTTSSFKPLPHESNNVHHRATAVVHGSAMITTLGREVDHHHHHHEYRSKKLEMEIKINKISKKMKKKGVVPGGFKS
SNNNKKNDKGSAFSVMLPKGFVPPSGSSPCHNENPQSSSLAFYCHLDRP