; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Pay0016074 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome

Gene IDPay0016074
OrganismCucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
DescriptionTLC domain-containing protein
Genome locationchr12:18449910..18455116
RNA-Seq ExpressionPay0016074
SyntenyPay0016074
Gene Ontology termsGO:0055088 - lipid homeostasis (biological process)
GO:0005783 - endoplasmic reticulum (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR006634 - TRAM/LAG1/CLN8 homology domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6573446.1 TLC domain-containing protein 4-B, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.5e-14495.26Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0M188 TLC domain-containing protein1.2e-14798.54Show/hide
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A0A1S4E2B6 transmembrane protein 56-like2.1e-149100Show/hide
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A0A5D3E1H6 Transmembrane protein 56-like2.1e-149100Show/hide
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A0A6J1K6A0 transmembrane protein 56-like1.3e-14395.26Show/hide
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A0A6J1KGK7 transmembrane protein 56-like1.3e-14394.89Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q550S9 TLC domain-containing protein 4 B4.4e-1125.42Show/hide
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        +    +I + + F  P +  ++NL W   I K + K
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Q5XIY2 TLC domain-containing protein 4-B5.8e-1123.75Show/hide
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           + ++G + +V HH  +  A  Y +  G    +    LISE++TP +N RW+ +     R+   ++ NGI +   + + RI +    +  V+ + Y  
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          +   +   + + +  V L ++N++W  KI +G  K I+
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Q6GLX2 TLC domain-containing protein 4-A1.7e-1023.6Show/hide
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        D  + +  V G  L  +L++  ++  +   Y  +Y  L+  ++ EW++R +ST HA+ +    LY + + D  +     G   +    ++     I+ GY
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         + DL L+   +  +     V HH     +  Y +  G    +    LISE++TP +N RW+ D  G  RS    L+NG+ +   + I RI +    +  
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        V+  +  +  I++ +   +       VL ++N+ W  KI +G  K +  +
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Q6PGS5 TLC domain-containing protein 4-B1.1e-1428.84Show/hide
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        L+  Q++EWN+R +S+FHA+ +    LY + + D  +     G        +    + ++ GY ++DL LI++ +  +G   +V HH L+ L   Y V  
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        GEG L  +    LI+E +TP +N RW+ +  G  K S   ++NG+++  ++ I RI +    +  V+  +  +      +G    + + +V L +MN+MW
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          KI KG  K +  R
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Q8CGF5 TLC domain-containing protein 41.9e-1427.91Show/hide
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        Y  L+  +++EWN+R +ST H++ + I  LY  F+ +        G  T+ +  ++T     + GY ++DL +I++ +  +G   +++HH  +GL   Y 
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        V +     Y     L++E+++P +N RW+ +     K S A +INGI++   + I RI+     ++ +Y  Y  +  I+   +   +      +L +MN+
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        MW  KI KG +K IS
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G31300.1 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein3.2e-11372.32Show/hide
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        SL+T+ AIKSY  QA  LVKNYLLAD F+P+TSVL G+  CK++YDL   +SN + K+Y+ LTKIQR+EWNNRG+ST HAI+IS MSLYFVFWSDLFSD+
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Query:  RHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLI
         H  LV F+SS LS+  LGIS+GYFLADLG+I W YPSLGG+EY+VHHSLSG+AVAYS+FSGEGQLYTYMVLISEITTPEIN+RWYLDTAGMK+S AY++
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Query:  NGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKR
        NG+ IF AWL+ARILLF Y FYHVYLHY+QV++MH+ GY+LVFGVP  LG+MNL+WFGKIV+G+ KT++KR
Subjt:  NGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKR

AT1G31300.2 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein3.2e-11372.32Show/hide
Query:  SLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLADHFVPFTSVLGGMLACKLIYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQ
        SL+T+ AIKSY  QA  LVKNYLLAD F+P+TSVL G+  CK++YDL   +SN + K+Y+ LTKIQR+EWNNRG+ST HAI+IS MSLYFVFWSDLFSD+
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Query:  RHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLI
         H  LV F+SS LS+  LGIS+GYFLADLG+I W YPSLGG+EY+VHHSLSG+AVAYS+FSGEGQLYTYMVLISEITTPEIN+RWYLDTAGMK+S AY++
Subjt:  RHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLI

Query:  NGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKR
        NG+ IF AWL+ARILLF Y FYHVYLHY+QV++MH+ GY+LVFGVP  LG+MNL+WFGKIV+G+ KT++KR
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AT4G10360.1 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein1.4e-6550Show/hide
Query:  SVLGGMLACKLIYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLI
        S+  G L CK++YDLT+ +S   F  Y  L    R+EWNNRG STFHA++ S+ S+YF+  SD F +  H   V   ++ LS  ++GIS+GYFLADL +I
Subjt:  SVLGGMLACKLIYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLI

Query:  VWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLINGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVI
         W +P+LGG+EYV HH LS  A+  SV SG+ Q Y ++VL+SE TTP +N+RWYLD +G K S AY +NGI +F  WL+AR+LLF + F H+YLH+ QV 
Subjt:  VWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLINGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVI

Query:  KMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISK
        ++  +G+  +  +P  L +MNL+WF KI KGL+KT+SK
Subjt:  KMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISK

AT4G19645.1 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein2.2e-10671.54Show/hide
Query:  MAIKSYQSQADALVKNYLLADHFVPFTSVLGGMLACKLIYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGL
        M IKSYQ+QA+  V++YLLAD F+P+TSVL G+  CKL+YDLT+L S+ + KSY  LTKI+R+EWNNRG+ST HAI+IS M+LYF F+SDLFSDQR    
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Query:  VT-FQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLINGIV
        +T F++S LSTF LG+SVGYFLADLG+I WLYPSLGG EY++HH LSG AVAYS+FSGE QLYTYMVLISE+TTPEIN+RWYLD AG+KRS AYL+NG+ 
Subjt:  VT-FQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLINGIV

Query:  IFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKR
        IFFAWL ARILLF Y FYHVY HYDQVI+MH  GYLLVF VP  L +MNL+WFGKIVKGL KT+ KR
Subjt:  IFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKR

AT4G19645.2 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein2.2e-10671.54Show/hide
Query:  MAIKSYQSQADALVKNYLLADHFVPFTSVLGGMLACKLIYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGL
        M IKSYQ+QA+  V++YLLAD F+P+TSVL G+  CKL+YDLT+L S+ + KSY  LTKI+R+EWNNRG+ST HAI+IS M+LYF F+SDLFSDQR    
Subjt:  MAIKSYQSQADALVKNYLLADHFVPFTSVLGGMLACKLIYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGL

Query:  VT-FQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLINGIV
        +T F++S LSTF LG+SVGYFLADLG+I WLYPSLGG EY++HH LSG AVAYS+FSGE QLYTYMVLISE+TTPEIN+RWYLD AG+KRS AYL+NG+ 
Subjt:  VT-FQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLINGIV

Query:  IFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKR
        IFFAWL ARILLF Y FYHVY HYDQVI+MH  GYLLVF VP  L +MNL+WFGKIVKGL KT+ KR
Subjt:  IFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAATGTCTTTGAAGACTGTAATGGCTATCAAATCTTACCAAAGTCAAGCTGATGCACTAGTAAAGAACTATTTATTAGCAGACCATTTTGTCCCATTCACTTCTGT
ACTTGGAGGGATGCTTGCTTGTAAATTGATTTATGATCTCACTCAATTAGTTAGCAATTTTTATTTTAAAAGTTATCTTGGTCTTACAAAAATCCAACGAGTGGAGTGGA
ATAACCGCGGCATGTCCACTTTTCATGCAATCTATATCTCAATCATGTCATTGTACTTCGTTTTCTGGTCAGATCTCTTCTCTGACCAGCGTCATGCTGGGCTTGTTACC
TTTCAAAGTTCAACGTTGTCTACTTTCATATTGGGGATTTCAGTTGGGTACTTCTTGGCAGATCTTGGATTGATTGTTTGGCTGTATCCTTCCTTAGGTGGGATGGAGTA
TGTTGTCCACCACTCTCTTTCCGGACTAGCAGTGGCTTACTCTGTTTTTTCTGGAGAAGGGCAACTCTATACTTATATGGTCCTCATTTCGGAGATTACAACTCCTGAGA
TTAATATGAGATGGTATCTTGATACTGCTGGTATGAAGAGGTCCTGTGCATATTTGATTAATGGCATTGTAATATTTTTTGCATGGCTGATTGCTCGCATACTGCTGTTT
GGATACACATTCTATCACGTTTACTTGCACTATGATCAGGTAATTAAGATGCATGTAATTGGATATCTTTTGGTATTTGGAGTGCCAACAGTGCTAGGTATGATGAACTT
GATGTGGTTCGGAAAGATTGTCAAGGGATTAATGAAAACTATATCAAAGAGGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAGATTCAATTTTTCTTTGTCACGATGCGTACCATATTGAAGTAATAAATAAATAAAGGACAATCAAAAGAATAAAGAAAAGGAAAAAATCATCGGCTAAGGCGCGAAG
CTATCATATTTCTTCGGTTAGCAGTAGTGCAAGGATTGGATAGATAGAATGCAATTGAATGATGAATCCACATCAACACGAGGATCCCATCTCTGGACACTCAAATCCAT
TGCTGATTAGCGAAAAACACTTGCATTTCGCATTACCCAAATCCTCATACGCTATTATAATTTCTAATTTCTAATTTCTCTTCTATCTTCCCTTGATTTTCCCCTTTTGG
ATCGTTGCGTTGCGGTTGAAGATTCCTAACGCTTCACATTGATTCAACCTCACGGTTCTTTTGTACCGGTCGGTTGTTGCATTCCCTTTACACATTATCTTTTTTTTTGT
TTTCTTCCCATTTTCTTATCTTTCGAAAAGCGAAAAAACCCACCTTCTACATCTTCTCCTGATCTGGGGTTCTCATCTATATGGTATTGTTTCTATCTCTTATTTCTTTT
GGCTGTGATTTTCATCTTTCCTTCCGTTTTTATGGGTTACCCATTTGGGTTTTGATCCTTTAATTTGATGGGATCTTTTAGTTTGTTCTTTTATACTTGTGAATTTGTGT
GATTGCTGTTAGCCTCACCATTCGATCTTTAAGCTTACCTGGTTATAAGTTTTTTGAGCGTTTTGGGTGTTTTTTCCAGAAATCGCATCCTCTTGCAGTTTGTTTAAATT
CAATGAATGAGCATCATTTCTAGTCTAGTCCTTTTGTTCTGTTCCAGCAAATCTGTCTTACTGAAACATTTGATCTTATATGTGTTGTTGAATTTTTTTCTCTTTTTCTT
CCCCTAGTTTTCTGTTCAAGTCTTTATGTTTGAGTTCGGAGTGTTCAAAAAGGAATTAGTATAGATCTTCGGGATGATCATGAAAGTTGAAGATTACTTGAACACAGTGA
CAGCTACTGCTTTAGAAAACATATACGAAAATAGTGGATGGGATGTGCTATTTGTCAAAATGGTCTATATGATCATGATGTGACTCTGTAGATTTTAGGATGACATTTCT
TTAATGTCTCTAATTAGAGTTTTCTACTCGAAGTTGTGTAATTAAATATTTTTATGATAGATCTTGACTGGGGAGATTTAATTTTTGATCCCATAAGAAAACTAAAAAAT
ATGGAACCACTTCAGCTAAATGATTCCTGCTCTTTTTTGTGGGAAGTTCCGAATGAATGCATAGCAGAGTTTTACGAGATGGAATGAGGGGTGGACTAGATTTTGGATGT
TGTTTTGTTATTGTCCTTTTCTTGGTGCCTTGAGACCAAATTCTTTGTGAGATTAGTTACCGTTGTGGACACTGATTTCTTGTGCACAAATGTTTTTATCACCATTCTTT
GCATCTCCACTTACTAACTTCTTCATATTTGATCAAGAAAGGATGACAGCATGGAGGGAAGGAGCAACTAGTTAATTCAGTCTGAGGTACTGTGATCTGTTGAATGTTAT
GTAGTCAAACAACACAATGGCAATGTCTTTGAAGACTGTAATGGCTATCAAATCTTACCAAAGTCAAGCTGATGCACTAGTAAAGAACTATTTATTAGCAGACCATTTTG
TCCCATTCACTTCTGTACTTGGAGGGATGCTTGCTTGTAAATTGATTTATGATCTCACTCAATTAGTTAGCAATTTTTATTTTAAAAGTTATCTTGGTCTTACAAAAATC
CAACGAGTGGAGTGGAATAACCGCGGCATGTCCACTTTTCATGCAATCTATATCTCAATCATGTCATTGTACTTCGTTTTCTGGTCAGATCTCTTCTCTGACCAGCGTCA
TGCTGGGCTTGTTACCTTTCAAAGTTCAACGTTGTCTACTTTCATATTGGGGATTTCAGTTGGGTACTTCTTGGCAGATCTTGGATTGATTGTTTGGCTGTATCCTTCCT
TAGGTGGGATGGAGTATGTTGTCCACCACTCTCTTTCCGGACTAGCAGTGGCTTACTCTGTTTTTTCTGGAGAAGGGCAACTCTATACTTATATGGTCCTCATTTCGGAG
ATTACAACTCCTGAGATTAATATGAGATGGTATCTTGATACTGCTGGTATGAAGAGGTCCTGTGCATATTTGATTAATGGCATTGTAATATTTTTTGCATGGCTGATTGC
TCGCATACTGCTGTTTGGATACACATTCTATCACGTTTACTTGCACTATGATCAGGTAATTAAGATGCATGTAATTGGATATCTTTTGGTATTTGGAGTGCCAACAGTGC
TAGGTATGATGAACTTGATGTGGTTCGGAAAGATTGTCAAGGGATTAATGAAAACTATATCAAAGAGGTGACGGGACACGCTTTCTTCTTGTCGATATCTCTTCCCCTTC
ACCCTCTTGGTCTATTTCTTAACATCTACACGTGGGTTGAGGAGAGAGGAATTTGATGATGGTATGTAGTGTGTTGTAAATGGTTCAAAATAACTTAAACTTGTTGACAT
TTAGTGCCTTTTTCGTCTTGTCAGATTTGTGTACCAATCCATTTTTTCTGTATAGTTCCTTTTTATTTTTTCTCATTTTTTTTTTGAAGAGTGCATACATACAAACGTAT
GGAAGAAAGTTGGTGTTACTACAGCAATAATTTTTTTGTATTCAGTTATGTCTTGGATCTCTTCTTTATTGTCCCTTAGTAATATCAGGCATTGTTATACTTTTCTGCAA
CCTTCGCTTATGGTTAATTAAATCTTCC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAMSLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLADHFVPFTSVLGGMLACKLIYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGLVT
FQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLINGIVIFFAWLIARILLF
GYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKR