; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Pay0016236 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome

Gene IDPay0016236
OrganismCucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
DescriptionCentromere protein X
Genome locationchr02:23884305..23885890
RNA-Seq ExpressionPay0016236
SyntenyPay0016236
Gene Ontology termsGO:0006281 - DNA repair (biological process)
GO:0051382 - kinetochore assembly (biological process)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR018552 - Centromere protein X


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0057803.1 centromere protein X isoform X2 [Cucumis melo var. makuwa]1.2e-4698.04Show/hide
Query:  MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGIGRIEPTHLERVLPQ
        MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGIGRIEPTHLERVLP 
Subjt:  MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGIGRIEPTHLERVLPQ

Query:  LL
         L
Subjt:  LL

TYJ98487.1 centromere protein X isoform X2 [Cucumis melo var. makuwa]1.4e-4797.09Show/hide
Query:  MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGIGRIEPTHLERVLPQ
        MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGIGRIEPTHLERVLPQ
Subjt:  MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGIGRIEPTHLERVLPQ

Query:  LLL
        +++
Subjt:  LLL

XP_008464488.1 PREDICTED: centromere protein X isoform X1 [Cucumis melo]4.6e-4695.28Show/hide
Query:  MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFI-SEAVQRAATIAEAEGIGRIEPTHLERVLP
        MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLV   I +EAVQRAATIAEAEGIGRIEPTHLERVLP
Subjt:  MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFI-SEAVQRAATIAEAEGIGRIEPTHLERVLP

Query:  QLLLDF
        QLLLDF
Subjt:  QLLLDF

XP_008464489.1 PREDICTED: centromere protein X isoform X2 [Cucumis melo]8.9e-50100Show/hide
Query:  MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGIGRIEPTHLERVLPQ
        MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGIGRIEPTHLERVLPQ
Subjt:  MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGIGRIEPTHLERVLPQ

Query:  LLLDF
        LLLDF
Subjt:  LLLDF

XP_031736274.1 protein MHF2 homolog isoform X2 [Cucumis sativus]1.1e-4798.11Show/hide
Query:  MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNE-NPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGIGRIEPTHLERVLP
        MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNE NPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGI RIEPTHLERVLP
Subjt:  MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNE-NPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGIGRIEPTHLERVLP

Query:  QLLLDF
        QLLLDF
Subjt:  QLLLDF

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LU58 Uncharacterized protein5.3e-4898.11Show/hide
Query:  MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNE-NPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGIGRIEPTHLERVLP
        MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNE NPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGI RIEPTHLERVLP
Subjt:  MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNE-NPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGIGRIEPTHLERVLP

Query:  QLLLDF
        QLLLDF
Subjt:  QLLLDF

A0A1S3CLJ8 centromere protein X isoform X12.2e-4695.28Show/hide
Query:  MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFI-SEAVQRAATIAEAEGIGRIEPTHLERVLP
        MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLV   I +EAVQRAATIAEAEGIGRIEPTHLERVLP
Subjt:  MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFI-SEAVQRAATIAEAEGIGRIEPTHLERVLP

Query:  QLLLDF
        QLLLDF
Subjt:  QLLLDF

A0A1S3CLK5 centromere protein X isoform X24.3e-50100Show/hide
Query:  MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGIGRIEPTHLERVLPQ
        MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGIGRIEPTHLERVLPQ
Subjt:  MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGIGRIEPTHLERVLPQ

Query:  LLLDF
        LLLDF
Subjt:  LLLDF

A0A5A7UPL0 Centromere protein X isoform X25.8e-4798.04Show/hide
Query:  MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGIGRIEPTHLERVLPQ
        MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGIGRIEPTHLERVLP 
Subjt:  MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGIGRIEPTHLERVLPQ

Query:  LL
         L
Subjt:  LL

A0A5D3BH88 Centromere protein X isoform X26.9e-4897.09Show/hide
Query:  MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGIGRIEPTHLERVLPQ
        MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGIGRIEPTHLERVLPQ
Subjt:  MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGIGRIEPTHLERVLPQ

Query:  LLL
        +++
Subjt:  LLL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A8MT69 Centromere protein X7.7e-0441.38Show/hide
Query:  KSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGIGRIEPTHLERVLPQLLLDF
        K      + +AL+L  +L+++F+ EA  R    A+AE   R++   LE+VLPQLLLDF
Subjt:  KSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGIGRIEPTHLERVLPQLLLDF

P0DJH7 Centromere protein X2.2e-0649.02Show/hide
Query:  NANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGIGRIEPTHLERVLPQLLLDF
        N +AL L ++L+++F+ EA  RAA  A+AE + +++  H+E+VLPQLLLDF
Subjt:  NANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGIGRIEPTHLERVLPQLLLDF

Q2NKU0 Centromere protein X1.1e-0543.1Show/hide
Query:  KSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGIGRIEPTHLERVLPQLLLDF
        K +    + +AL+L ++L++IF+ EA  R+   A+AEG+  ++   LE+VLPQLLLDF
Subjt:  KSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGIGRIEPTHLERVLPQLLLDF

Q8C4X1 Centromere protein X5.9e-0445.1Show/hide
Query:  NANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGIGRIEPTHLERVLPQLLLDF
        + +AL+L ++ ++IF+ EA  R    A+AE +  +E   LE+VLPQLLLDF
Subjt:  NANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGIGRIEPTHLERVLPQLLLDF

Q8L7N3 Protein MHF2 homolog4.2e-2665Show/hide
Query:  FHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGIGRIEPTHLERVLPQLLLDF
        F  DLIHAIFK  W+RR  ERE+++  DA + EV    GT+KK+R  SANANALKLS +L++ F+SEAVQRAA IAEAEG+ +IE THLER+LPQLLLDF
Subjt:  FHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGIGRIEPTHLERVLPQLLLDF

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G78790.1 unknown protein3.0e-2765Show/hide
Query:  FHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGIGRIEPTHLERVLPQLLLDF
        F  DLIHAIFK  W+RR  ERE+++  DA + EV    GT+KK+R  SANANALKLS +L++ F+SEAVQRAA IAEAEG+ +IE THLER+LPQLLLDF
Subjt:  FHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGIGRIEPTHLERVLPQLLLDF

AT1G78790.2 unknown protein5.6e-1853Show/hide
Query:  FHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGIGRIEPTHLERVLPQLLLDF
        F  DLIHAIFK  W+RR  ERE+++  DA + EV    GT+KK+R                    SEAVQRAA IAEAEG+ +IE THLER+LPQLLLDF
Subjt:  FHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGIGRIEPTHLERVLPQLLLDF


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAGAGACCGGATTTCATCCTGATCTAATTCACGCCATTTTCAAGCTCGAGTGGAGCAGAAGATCACTTGAGCGCGAGAAAAACGAGAATCCGGATGCTATGGATTG
TGAGGTTGACGCTGGGGCTGGAACATCCAAGAAAAGCAGGCCGATGTCAGCTAATGCAAATGCTCTTAAATTGAGCTCTAAACTTGTACAAATTTTTATCTCAGAGGCTG
TGCAGCGCGCTGCAACAATTGCAGAAGCAGAAGGTATTGGCAGAATTGAACCCACTCATTTGGAGAGAGTTCTTCCGCAGTTATTACTGGATTTTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TGCGGGGACAAGTCGAAATTTGAAACTTGAAAGTTGCGTCTGACGGACTTGCACTCCTCAGTTTCAACTCACCATGGAAGAGACCGGATTTCATCCTGATCTAATTCACG
CCATTTTCAAGCTCGAGTGGAGCAGAAGATCACTTGAGCGCGAGAAAAACGAGAATCCGGATGCTATGGATTGTGAGGTTGACGCTGGGGCTGGAACATCCAAGAAAAGC
AGGCCGATGTCAGCTAATGCAAATGCTCTTAAATTGAGCTCTAAACTTGTACAAATTTTTATCTCAGAGGCTGTGCAGCGCGCTGCAACAATTGCAGAAGCAGAAGGTAT
TGGCAGAATTGAACCCACTCATTTGGAGAGAGTTCTTCCGCAGTTATTACTGGATTTTTGAGGTAGCATTCCGTTCCACACATTGCAATGTCTTTGCTCTTGAAGATTAA
GTTCTTGTTTTATAGAGTGATTATTTGGATTGTATCCTTCATTAGTAAGTTAGCTAATATGATTGATGTCTCACAAACTGAGTGGGATTGGGGTGGGGAGGCTTCTCAAG
TTATGAAGTCTTCTCTGATCCCAATACAAACATCAATCTGAATCATCGGTCCGAATCTAATTTGGTGCTTCATATTGGTTTCAATAAATTTCTCAATGAAAGAATTTCCT
ATCCTTTAAGAAATGTCTAAGAAGGTTGGTCTTAGTGCTATAAAATTCTAATGTCTTCTGTAAGAGATTTCTCTAAGGTCGGTTAACAAATGTCTTTTCCAGGAGGACCA
AGCAGCTAATGATTTATCATGATTGGTAAGTAATAGAAAGACGAGCCCTTATTTTATGAAGGAAGAATAAAAGATCGAGAAGCAGAAAAATAGAAAGGCAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEETGFHPDLIHAIFKLEWSRRSLEREKNENPDAMDCEVDAGAGTSKKSRPMSANANALKLSSKLVQIFISEAVQRAATIAEAEGIGRIEPTHLERVLPQLLLDF