| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| XP_004139072.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X1 [Cucumis sativus] | 2.6e-136 | 92.81 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Query: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSHTNSGRFHDRRRSPLRYSRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDR
VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG SGR+HDRRRSP RSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYAS PPKQRAYSRS+SPRDR
Subjt: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSHTNSGRFHDRRRSPLRYSRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDR
Query: PDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSDSPTR--GRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSV--SRSRSRSPQHSPRHEEEYRSEPNGDRSPGQ
PDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRS SPT+ RSPSPVRGRSLSRSRSRSKSV SRSRSRSP+ SPRHEEEYRSEPNGDRSP Q
Subjt: PDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSDSPTR--GRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSV--SRSRSRSPQHSPRHEEEYRSEPNGDRSPGQ
|
|
| XP_008450302.1 PREDICTED: serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X1 [Cucumis melo] | 3.1e-153 | 100 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Query: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSHTNSGRFHDRRRSPLRYSRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDR
VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSHTNSGRFHDRRRSPLRYSRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDR
Subjt: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSHTNSGRFHDRRRSPLRYSRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDR
Query: PDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSDSPTRGRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSPQHSPRHEEEYRSEPNGDRSPGQ
PDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSDSPTRGRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSPQHSPRHEEEYRSEPNGDRSPGQ
Subjt: PDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSDSPTRGRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSPQHSPRHEEEYRSEPNGDRSPGQ
|
|
| XP_008450303.1 PREDICTED: serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X2 [Cucumis melo] | 6.0e-149 | 98.61 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Query: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSHTNSGRFHDRRRSPLRYSRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDR
VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG SGRFHDRRRSPLRYSRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDR
Subjt: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSHTNSGRFHDRRRSPLRYSRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDR
Query: PDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSDSPTRGRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSPQHSPRHEEEYRSEPNGDRSPGQ
PDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSDSPTRGRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSPQHSPRHEEEYRSEPNGDRSPGQ
Subjt: PDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSDSPTRGRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSPQHSPRHEEEYRSEPNGDRSPGQ
|
|
| XP_038879567.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X1 [Benincasa hispida] | 3.1e-137 | 93.1 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKH MDGC
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Query: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSHTNSGRFHDRRRSPLRYSRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDR
VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSHTNSGR HDRRRSP RYSRSPRYSRSPAQR RYSRSP PRHAR+RSRSYDYASPPPKQ+AYSRSVSPRDR
Subjt: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSHTNSGRFHDRRRSPLRYSRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDR
Query: PDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSDSPTR--GRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSPQHSPRHEEEYRSEPNGDRSPGQ
PDSRERSFPRQ+SRGR SRSPRLDGSRSRS SP R RSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSP+ SPRH EEYRSEPNGDRSP Q
Subjt: PDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSDSPTR--GRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSPQHSPRHEEEYRSEPNGDRSPGQ
|
|
| XP_038879568.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X2 [Benincasa hispida] | 6.1e-133 | 91.72 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKH MDGC
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Query: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSHTNSGRFHDRRRSPLRYSRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDR
VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG SGR HDRRRSP RYSRSPRYSRSPAQR RYSRSP PRHAR+RSRSYDYASPPPKQ+AYSRSVSPRDR
Subjt: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSHTNSGRFHDRRRSPLRYSRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDR
Query: PDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSDSPTR--GRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSPQHSPRHEEEYRSEPNGDRSPGQ
PDSRERSFPRQ+SRGR SRSPRLDGSRSRS SP R RSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSP+ SPRH EEYRSEPNGDRSP Q
Subjt: PDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSDSPTR--GRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSPQHSPRHEEEYRSEPNGDRSPGQ
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0LZX6 RRM domain-containing protein | 1.3e-136 | 92.81 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Query: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSHTNSGRFHDRRRSPLRYSRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDR
VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG SGR+HDRRRSP RSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYAS PPKQRAYSRS+SPRDR
Subjt: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSHTNSGRFHDRRRSPLRYSRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDR
Query: PDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSDSPTR--GRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSV--SRSRSRSPQHSPRHEEEYRSEPNGDRSPGQ
PDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRS SPT+ RSPSPVRGRSLSRSRSRSKSV SRSRSRSP+ SPRHEEEYRSEPNGDRSP Q
Subjt: PDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSDSPTR--GRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSV--SRSRSRSPQHSPRHEEEYRSEPNGDRSPGQ
|
|
| A0A1S3BNX5 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X1 | 1.5e-153 | 100 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Query: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSHTNSGRFHDRRRSPLRYSRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDR
VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSHTNSGRFHDRRRSPLRYSRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDR
Subjt: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSHTNSGRFHDRRRSPLRYSRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDR
Query: PDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSDSPTRGRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSPQHSPRHEEEYRSEPNGDRSPGQ
PDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSDSPTRGRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSPQHSPRHEEEYRSEPNGDRSPGQ
Subjt: PDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSDSPTRGRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSPQHSPRHEEEYRSEPNGDRSPGQ
|
|
| A0A1S3BPL2 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X2 | 2.9e-149 | 98.61 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Query: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSHTNSGRFHDRRRSPLRYSRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDR
VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG SGRFHDRRRSPLRYSRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDR
Subjt: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSHTNSGRFHDRRRSPLRYSRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDR
Query: PDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSDSPTRGRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSPQHSPRHEEEYRSEPNGDRSPGQ
PDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSDSPTRGRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSPQHSPRHEEEYRSEPNGDRSPGQ
Subjt: PDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSDSPTRGRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSPQHSPRHEEEYRSEPNGDRSPGQ
|
|
| A0A6J1DH06 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X1 | 1.2e-126 | 86.99 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRG--RDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMD
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRY GRG RDLPTSLLVRNL HDCRPEDLRR FGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKH MD
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRG--RDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMD
Query: GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSHTNSGRFHDRRRSPLRYSRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPR
GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGS TNSGRFHDRRRSP RYSRSPRYSRSPA R RYSRSPAPRHARSRSRSYDY SPPPKQRA SRSVSPR
Subjt: GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSHTNSGRFHDRRRSPLRYSRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPR
Query: DRPDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSDSPTRG--RSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSPQHSPRHEEEYRSEPNGDRSPGQ
DR DSRERS+PRQ SRGRSYS+SPRL+GSRSRS SP RG RS SP RGRS SR S SRSRSP+ SPRHEEEYRS+PNGDRSP Q
Subjt: DRPDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSDSPTRG--RSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSPQHSPRHEEEYRSEPNGDRSPGQ
|
|
| A0A6J1DIJ4 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X2 | 2.7e-123 | 85.96 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRG--RDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMD
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRY GRG RDLPTSLLVRNL HDCRPEDLRR FGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKH MD
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRG--RDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMD
Query: GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSHTNSGRFHDRRRSPLRYSRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPR
GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG SGRFHDRRRSP RYSRSPRYSRSPA R RYSRSPAPRHARSRSRSYDY SPPPKQRA SRSVSPR
Subjt: GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSHTNSGRFHDRRRSPLRYSRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPR
Query: DRPDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSDSPTRG--RSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSPQHSPRHEEEYRSEPNGDRSPGQ
DR DSRERS+PRQ SRGRSYS+SPRL+GSRSRS SP RG RS SP RGRS SR S SRSRSP+ SPRHEEEYRS+PNGDRSP Q
Subjt: DRPDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSDSPTRG--RSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSPQHSPRHEEEYRSEPNGDRSPGQ
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| O75494 Serine/arginine-rich splicing factor 10 | 2.7e-27 | 40.7 | Show/hide |
Query: TSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSHTNSGR
TSL VRN++ D R EDLRR FG++G I D+Y+P D+YT PRGF +VQ+ D DA DA H++D + GR++ + FA+ +RK P+ M+A+E + +S R
Subjt: TSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSHTNSGR
Query: FHDRRRSPLRYSRSPRYSRSPAQRRG---RYSRSPAPRHAR-----SRSRSY-DYASPPPKQRAYSRSVSPRDRPDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDG
+ D R R SRS Y R ++ R Y RS +PR++R RSRS+ D + R++SRS + SR +S P++E + +S SRS
Subjt: FHDRRRSPLRYSRSPRYSRSPAQRRG---RYSRSPAPRHAR-----SRSRSY-DYASPPPKQRAYSRSVSPRDRPDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDG
Query: SR--SRSDSPTRGRSPS----------PVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSPQHSPRH
+R S++DS T +S S P R +S SRS+SRS+S SRSRS + S H
Subjt: SR--SRSDSPTRGRSPS----------PVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSPQHSPRH
|
|
| Q1PDV2 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 7.7e-30 | 41.29 | Show/hide |
Query: RGRSYTP-----SPPR---GYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADA
R RSY+P SPPR GY P R P+ LL+RNL D RP DLR F +FG +KDIYLP++YYTGEPRGFGFV+Y DAA+A
Subjt: RGRSYTP-----SPPR---GYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADA
Query: KHHMDGCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSHTNSGRFHDRRRSPLRYSRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSR
M+ V+ GRE+ +VFAEENRK P +MR S + RSP R RS SRSP +R R+ S+ R D SP + R+ SR
Subjt: KHHMDGCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSHTNSGRFHDRRRSPLRYSRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSR
Query: SVSPRDRPDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSDSPTRGRSPSPVRGRSLSRSRSRSKS
S PR+ + + R+ RSPR + R +P+R R LSRSRSRS S
Subjt: SVSPRDRPDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSDSPTRGRSPSPVRGRSLSRSRSRSKS
|
|
| Q8L3X8 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30 | 2.4e-31 | 44.23 | Show/hide |
Query: RSYTP---SPP-RGYGRRGRSPSP---------RGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADA
R Y+P SPP RGYG RGRSP P G GR SLLVRN+ DCRPE+LR PF +FG ++D+Y+P+DYY+G+PRGF FV++VD DA
Subjt: RSYTP---SPP-RGYGRRGRSPSP---------RGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADA
Query: ADAKHHMDGCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARER-GSHTNSG---RFHDRRRS-PLRYSRSPRYSRSPAQRRGRY---SRSPAPRHARSRSR-----
+A+ M+ GRE+TVV A E+RK+P +MR + R S SG R H R RS + SRSP R P+ R RY S SPAPR R
Subjt: ADAKHHMDGCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARER-GSHTNSG---RFHDRRRS-PLRYSRSPRYSRSPAQRRGRY---SRSPAPRHARSRSR-----
Query: SYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDR-PDSRERSFPRQESR-----GRSYSRSPRLDGSRSRS
+Y S P + + RDR D+ R P E+ GR+ SRSP GSRSRS
Subjt: SYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDR-PDSRERSFPRQESR-----GRSYSRSPRLDGSRSRS
|
|
| Q9LHP2 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A | 3.2e-76 | 62.54 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVG-RGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDG
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGR+ G R DLPTSLLVRNL HDCR EDLRRPF QFG +KDIYLP+DYYTG+PRGFGF+Q++DPADAA+AKH MDG
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVG-RGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDG
Query: CVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSHTNSGRFHDRRRSPLRYSRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRD
+LLGRELTVVFAEENRKKP++MR R+RG +N RF DRRRSP PRYSRSP RRGR RSRSRS Y SPP K R SRSVSP+D
Subjt: CVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSHTNSGRFHDRRRSPLRYSRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRD
Query: RPDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSDSPTRGRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRS--PQHSPRHEEEYRSEPNGDRSPGQ
R +E RSYSRSP +GSR RS SP R +S S RS+S ++RS + ++RS+S P+ S R NGDRSP Q
Subjt: RPDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSDSPTRGRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRS--PQHSPRHEEEYRSEPNGDRSPGQ
|
|
| Q9SEU4 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 | 9.5e-81 | 63.33 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRY GR RDLPTSLLVRNL HDCR EDLR+ F QFG +KDIYLP+DYYTG+PRGFGFVQ++DPADAADAKHHMDG
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Query: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSHTNSGRFHDRRRSPLRYSRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDR
+LLGRELTVVFAEENRKKP++MRARERG GRF DRRR+P RY YSR SRSP PR RSRSRS DY SPPP+ R + RS+SPR+
Subjt: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSHTNSGRFHDRRRSPLRYSRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDR
Query: PDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSDSPTRGR----SPSPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSPQHS-----------PRHEEEYRSEPNGDRS
R + R RSYSRSP DGSR RS +P RG+ SPSP R S S RSRS S R+RS SP+ S R Y EP RS
Subjt: PDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSDSPTRGR----SPSPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSPQHS-----------PRHEEEYRSEPNGDRS
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G55310.1 SC35-like splicing factor 33 | 6.8e-82 | 63.33 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRY GR RDLPTSLLVRNL HDCR EDLR+ F QFG +KDIYLP+DYYTG+PRGFGFVQ++DPADAADAKHHMDG
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Query: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSHTNSGRFHDRRRSPLRYSRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDR
+LLGRELTVVFAEENRKKP++MRARERG GRF DRRR+P RY YSR SRSP PR RSRSRS DY SPPP+ R + RS+SPR+
Subjt: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSHTNSGRFHDRRRSPLRYSRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDR
Query: PDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSDSPTRGR----SPSPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSPQHS-----------PRHEEEYRSEPNGDRS
R + R RSYSRSP DGSR RS +P RG+ SPSP R S S RSRS S R+RS SP+ S R Y EP RS
Subjt: PDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSDSPTRGR----SPSPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSPQHS-----------PRHEEEYRSEPNGDRS
|
|
| AT1G55310.2 SC35-like splicing factor 33 | 8.3e-80 | 69.71 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRY GR RDLPTSLLVRNL HDCR EDLR+ F QFG +KDIYLP+DYYTG+PRGFGFVQ++DPADAADAKHHMDG
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDGC
Query: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSHTNSGRFHDRRRSPLRYSRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDR
+LLGRELTVVFAEENRKKP++MRARERG GRF DRRR+P RY YSR SRSP PR RSRSRS DY SPPP+ R + RS+SPR+
Subjt: VLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSHTNSGRFHDRRRSPLRYSRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDR
Query: PDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSDSPTRGRSPS
R + R RSYSRSP DGSR RS +P RG+S S
Subjt: PDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSDSPTRGRSPS
|
|
| AT1G55310.3 SC35-like splicing factor 33 | 1.6e-78 | 60.58 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTG------------EPRGFGFVQYVDPA
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRY GR RDLPTSLLVRNL HDCR EDLR+ F QFG +KDIYLP+DYYTG +PRGFGFVQ++DPA
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTG------------EPRGFGFVQYVDPA
Query: DAADAKHHMDGCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSHTNSGRFHDRRRSPLRYSRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQ
DAADAKHHMDG +LLGRELTVVFAEENRKKP++MRARERG RF DRRR+P RY YSR SRSP PR RSRSRS DY SPPP+
Subjt: DAADAKHHMDGCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSHTNSGRFHDRRRSPLRYSRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQ
Query: RAYSRSVSPRDRPDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSDSPTRGR----SPSPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSPQHS-----------PRHE
R + RS+SPR+ R + R RSYSRSP DGSR RS +P RG+ SPSP R S S RSRS S R+RS SP+ S R
Subjt: RAYSRSVSPRDRPDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSDSPTRGR----SPSPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRSPQHS-----------PRHE
Query: EEYRSEPNGDRS
Y EP RS
Subjt: EEYRSEPNGDRS
|
|
| AT3G13570.1 SC35-like splicing factor 30A | 2.3e-77 | 62.54 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVG-RGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDG
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGR+ G R DLPTSLLVRNL HDCR EDLRRPF QFG +KDIYLP+DYYTG+PRGFGF+Q++DPADAA+AKH MDG
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYVG-RGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHHMDG
Query: CVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSHTNSGRFHDRRRSPLRYSRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRD
+LLGRELTVVFAEENRKKP++MR R+RG +N RF DRRRSP PRYSRSP RRGR RSRSRS Y SPP K R SRSVSP+D
Subjt: CVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSHTNSGRFHDRRRSPLRYSRSPRYSRSPAQRRGRYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRD
Query: RPDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSDSPTRGRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRS--PQHSPRHEEEYRSEPNGDRSPGQ
R +E RSYSRSP +GSR RS SP R +S S RS+S ++RS + ++RS+S P+ S R NGDRSP Q
Subjt: RPDSRERSFPRQESRGRSYSRSPRLDGSRSRSDSPTRGRSPSPVRGRSLSRSRSRSKSVSRSRSRS--PQHSPRHEEEYRSEPNGDRSPGQ
|
|
| AT3G55460.1 SC35-like splicing factor 30 | 1.7e-32 | 44.23 | Show/hide |
Query: RSYTP---SPP-RGYGRRGRSPSP---------RGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADA
R Y+P SPP RGYG RGRSP P G GR SLLVRN+ DCRPE+LR PF +FG ++D+Y+P+DYY+G+PRGF FV++VD DA
Subjt: RSYTP---SPP-RGYGRRGRSPSP---------RGRYVGRGRDLPTSLLVRNLSHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADA
Query: ADAKHHMDGCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARER-GSHTNSG---RFHDRRRS-PLRYSRSPRYSRSPAQRRGRY---SRSPAPRHARSRSR-----
+A+ M+ GRE+TVV A E+RK+P +MR + R S SG R H R RS + SRSP R P+ R RY S SPAPR R
Subjt: ADAKHHMDGCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARER-GSHTNSG---RFHDRRRS-PLRYSRSPRYSRSPAQRRGRY---SRSPAPRHARSRSR-----
Query: SYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDR-PDSRERSFPRQESR-----GRSYSRSPRLDGSRSRS
+Y S P + + RDR D+ R P E+ GR+ SRSP GSRSRS
Subjt: SYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDR-PDSRERSFPRQESR-----GRSYSRSPRLDGSRSRS
|
|
