; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Pay0016625 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome

Gene IDPay0016625
OrganismCucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
Descriptionarabinogalactan peptide 23-like
Genome locationchr01:33472888..33473467
RNA-Seq ExpressionPay0016625
SyntenyPay0016625
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR044702 - Arabinogalactan protein 23/40


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7025661.1 Arabinogalactan peptide 23, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.3e-1080.65Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESISPAAAPGPSSAASAALPVL----GASVVSFVAAYF
        MEMKKIACAALFAAA V+A VA+DES+SPAAAPGPSSAASAALP L    GAS+VSFVA YF
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESISPAAAPGPSSAASAALPVL----GASVVSFVAAYF
KGN45143.1 hypothetical protein Csa_016530 [Cucumis sativus]1.2e-1490.62Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESI----SPAAAPGPSSAASAALPVLGASVVSFVAAYFLN
        MEMKKIACAALFAAAA+SAAVAADES+    SPAAAPGPSSAASAALPVLGASVVSFVAAYFLN
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESI----SPAAAPGPSSAASAALPVLGASVVSFVAAYFLN
XP_008461276.1 PREDICTED: arabinogalactan peptide 23-like [Cucumis melo]9.7e-17100Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESISPAAAPGPSSAASAALPVLGASVVSFVAAYFLN
        MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESISPAAAPGPSSAASAALPVLGASVVSFVAAYFLN
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESISPAAAPGPSSAASAALPVLGASVVSFVAAYFLN
XP_023004714.1 arabinogalactan peptide 23-like [Cucurbita maxima]2.3e-1080.65Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESISPAAAPGPSSAASAALPVL----GASVVSFVAAYF
        MEMKKIACAALFAAA V+A VA+DES+SPAAAPGPSSAASAALP L    GAS+VSFVA YF
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESISPAAAPGPSSAASAALPVL----GASVVSFVAAYF
XP_038899473.1 arabinogalactan protein 23-like [Benincasa hispida]1.6e-1184.38Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESISPAAAPGPSSAASAALPVL----GASVVSFVAAYFLN
        MEMKKIACAALFAAAAVS+AVAADES+SPAAAPGPSSAASAALP L    GAS+V+FV AYFLN
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESISPAAAPGPSSAASAALPVL----GASVVSFVAAYFLN
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K6L5 Uncharacterized protein5.7e-1590.62Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESI----SPAAAPGPSSAASAALPVLGASVVSFVAAYFLN
        MEMKKIACAALFAAAA+SAAVAADES+    SPAAAPGPSSAASAALPVLGASVVSFVAAYFLN
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESI----SPAAAPGPSSAASAALPVLGASVVSFVAAYFLN
A0A1S3CDX5 arabinogalactan peptide 23-like4.7e-17100Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESISPAAAPGPSSAASAALPVLGASVVSFVAAYFLN
        MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESISPAAAPGPSSAASAALPVLGASVVSFVAAYFLN
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESISPAAAPGPSSAASAALPVLGASVVSFVAAYFLN
A0A6J1F3F5 arabinogalactan peptide 23-like1.6e-0977.42Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESISPAAAPGPSSAASAALPVL----GASVVSFVAAYF
        MEMKKIACAALFAAA V+A VA+DES+SPAAAPGPSSAASA LP L    GAS+VS VA YF
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESISPAAAPGPSSAASAALPVL----GASVVSFVAAYF
A0A6J1H8I1 arabinogalactan peptide 23-like2.5e-1079.03Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESISPAAAPGPSSAASAALPVL----GASVVSFVAAYF
        MEMKKIACAALFAAA ++A VA+DES+SPAAAPGPSSAASAALP L    GAS+VSFVA YF
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESISPAAAPGPSSAASAALPVL----GASVVSFVAAYF
A0A6J1KX42 arabinogalactan peptide 23-like1.1e-1080.65Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESISPAAAPGPSSAASAALPVL----GASVVSFVAAYF
        MEMKKIACAALFAAA V+A VA+DES+SPAAAPGPSSAASAALP L    GAS+VSFVA YF
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESISPAAAPGPSSAASAALPVL----GASVVSFVAAYF
SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8S2W4 Arabinogalactan protein 233.0e-0560.66Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESISPAAAPGPSSAASAALPVL----GASVVSFVAAY
        MEMKKIAC  LFAAA+++A +AA+E  +P  APGP+SAASAALP L    GAS+VS  + Y
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESISPAAAPGPSSAASAALPVL----GASVVSFVAAY
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G57690.1 arabinogalactan protein 232.2e-0660.66Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESISPAAAPGPSSAASAALPVL----GASVVSFVAAY
        MEMKKIAC  LFAAA+++A +AA+E  +P  APGP+SAASAALP L    GAS+VS  + Y
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESISPAAAPGPSSAASAALPVL----GASVVSFVAAY

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAATGAAGAAGATCGCTTGCGCTGCTCTTTTCGCCGCTGCTGCCGTCAGCGCCGCGGTGGCTGCCGATGAGTCTATCTCTCCCGCCGCCGCCCCAGGGCCGAGCAG
CGCCGCCTCCGCAGCTCTCCCCGTTCTCGGTGCCTCAGTTGTTTCCTTTGTTGCTGCTTACTTCTTGAACTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GGGCAGCAATATCCACCAATCAAAGGCTTCTTCGGTTCGATCTCTCTCATCTCAACCGAAGAAAGCCAATTCCGTCTCAATCTCATCACATCATTTCATCATCAATGGAA
ATGAAGAAGATCGCTTGCGCTGCTCTTTTCGCCGCTGCTGCCGTCAGCGCCGCGGTGGCTGCCGATGAGTCTATCTCTCCCGCCGCCGCCCCAGGGCCGAGCAGCGCCGC
CTCCGCAGCTCTCCCCGTTCTCGGTGCCTCAGTTGTTTCCTTTGTTGCTGCTTACTTCTTGAACTGAAGCCCCCGTTGGAGAGGGAGAGATTAATGTATTTCAAATTTCA
AATTTTATGTTTTATGTTCATTTTTCTTTAATGTGTTTATTTCCATGGATGATGACGATGATGATGTGACGTGACGTCATATATTAATTGAAAACAATAATAATAAAAAA
AAAGAAAAAAAGGAATCCGGATTCGTTATATTTATATATTTTACGATTTCTGTCCTTCTAAATCTATGTTTATTGCTTTTAAAATAAACAATCAAGAGTATGTAATATAA
TGTTGGATCCTTCAACTTTTGTAAAATAAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESISPAAAPGPSSAASAALPVLGASVVSFVAAYFLN