CuGenDBv2

Gene ID	Pay0017445
Organism	Cucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
Description	DUF1279 domain-containing protein
Genome location	chr05:5602812..5604698
RNA-Seq Expression	Pay0017445
Synteny	Pay0017445
Gene Ontology terms	GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	IPR009688 - Protein FAM210A/B-like domain

Homology

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GenBank top hits

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KAA0061727.1 FAM210B-like protein [Cucumis melo var. makuwa]

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XP_004140165.1 uncharacterized protein LOC101219558 [Cucumis sativus]

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XP_008449587.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103491427 [Cucumis melo]

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XP_023512163.1 uncharacterized protein LOC111776967 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

4.4e-71

79.8

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XP_038901803.1 uncharacterized protein LOC120088508 [Benincasa hispida]

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TrEMBL top hits

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A0A0A0KEW3 DUF1279 domain-containing protein

8.9e-94

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A0A1S3BN10 uncharacterized protein LOC103491427

1.0e-97

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A0A5A7V4A0 FAM210B-like protein

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A0A5D3B9U1 DUF1279 domain-containing protein

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A0A6J1JG12 uncharacterized protein LOC111484182

2.8e-71

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SwissProt top hits

e value

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Q96KR6 Protein FAM210B, mitochondrial

9.4e-08

29.56

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        PPL     P R+ A   +T   D       S A   T             SS    E   +SK  Q K++  +YG   ++  I +SLIS  + Y ++S+G
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        VD+ A+L K+G        K+     TF +AYA HK  +P+R   T+   P++  +  K
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Q9D8B6 Protein FAM210B, mitochondrial

3.6e-07

32.67

Show/hide

Query:  GTNK--SKGDQAKELLAKYGGAYLATSITLSLISFSLCYALISAGVDVQALLQKVGISTDETGGKV----GTFALAYAAHKAASPIRFPPTVALTPIVAS
        GT K  S+  Q K++  +YG   ++  I +SL+S  + Y ++S+G+D+ A+L K+G        K+     TF +AYA HK  +P+R   T+   P V  
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Query:  W
        +
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Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G20940.1 Protein of unknown function (DUF1279)

2.9e-04

29.91

Show/hide

Query:  KELLAKYGGAYLATSITLSLISFSLCYALISAGVDVQALLQK---------------VGISTDETGGKV-------------GTFALAYAAHKAASPIRF
        KE++ KYG   L    ++S +S S  Y  I   VDV++LL+K               + +  +E G                G  ALA   +KA  PIR 
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Query:  PPTVALTPIVASWIGKK
        P T+ALTP +A ++ ++
Subjt:  PPTVALTPIVASWIGKK

AT2G27290.1 Protein of unknown function (DUF1279)

1.1e-56

73.94

Show/hide

Query:  NSKPFRVQALKQKTGEIDRP-SPSSSS----SADEVTKKYGLEAGLWKIFSSKEE--GEGTN---KSKGDQAKELLAKYGGAYLATSITLSLISFSLCYA
        +SK FR +A+++K  +ID+  SP SSS    SA+EVTKKYGLE GLWKI SSK++   +G N   KSK D+AKELLAKYGGAYLATSITLSLISFSLCY 
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Query:  LISAGVDVQALLQKVGISTDETGGKVGTFALAYAAHKAASPIRFPPTVALTPIVASWIGKKVEKE
        L+++GVDVQALL KVGIST+ETG KVG FALAYAAHKAASPIRFPPTVALTPIVA+WIGKKV+KE
Subjt:  LISAGVDVQALLQKVGISTDETGGKVGTFALAYAAHKAASPIRFPPTVALTPIVASWIGKKVEKE

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCAACTGCTTCTTCTCTAATTGCCTTTTCATCTTTTTCCAACTTTTCCTTTACTCATCCAAATTTCAGATTTCATTTCAATTTTCCTAACCCACCTCTCAAATTCAA
CTCCAAACCTTTCAGGGTTCAAGCCCTTAAACAGAAAACCGGCGAAATCGATCGCCCATCTCCATCTTCCTCTTCTTCTGCAGATGAAGTTACCAAGAAGTACGGACTTG
AAGCTGGTCTTTGGAAGATATTTAGCTCTAAGGAGGAGGGTGAAGGGACAAACAAATCAAAGGGTGATCAAGCAAAAGAGTTGCTAGCGAAATATGGGGGTGCATATTTA
GCCACCTCCATAACTCTATCCTTGATCTCTTTCTCTCTATGTTATGCGCTCATCAGTGCCGGTGTCGACGTTCAAGCTCTTCTGCAGAAGGTAGGAATTTCAACTGATGA
GACAGGAGGGAAAGTTGGAACATTTGCTTTGGCATATGCAGCACATAAAGCTGCTTCTCCGATAAGGTTTCCTCCAACAGTGGCTCTCACTCCAATTGTTGCAAGTTGGA
TTGGGAAGAAAGTTGAGAAAGAGAATTAG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

ACGATTCTAACTATAATAAGTTGAAACTGCAAACTAGAGTTATACACTTCAATTTTAGTGTATGATTGCCAAAAAGAAGGAAAAAAGACACCTTTTTAGCTAACTTTTTG
TGTTTGCAAGTGTGTGAAGAACAACGGTGGTGACGACAGTCGATTAAGCTAGGAAGCAAATATCTGGCTTATAATGCTTCACATAAATTTCTCTTTCTCTGTTGATTTTG
TGGGATCCTTGTTTTCTCTCTAAACCCAAACTCTCAATTCAGAGCCTATGTCTTGAGATCCCGACCTTTGATTTTCTGATAATGGCAACTGCTTCTTCTCTAATTGCCTT
TTCATCTTTTTCCAACTTTTCCTTTACTCATCCAAATTTCAGATTTCATTTCAATTTTCCTAACCCACCTCTCAAATTCAACTCCAAACCTTTCAGGGTTCAAGCCCTTA
AACAGAAAACCGGCGAAATCGATCGCCCATCTCCATCTTCCTCTTCTTCTGCAGATGAAGTTACCAAGAAGTACGGACTTGAAGCTGGTCTTTGGAAGATATTTAGCTCT
AAGGAGGAGGGTGAAGGGACAAACAAATCAAAGGGTGATCAAGCAAAAGAGTTGCTAGCGAAATATGGGGGTGCATATTTAGCCACCTCCATAACTCTATCCTTGATCTC
TTTCTCTCTATGTTATGCGCTCATCAGTGCCGGTGTCGACGTTCAAGCTCTTCTGCAGAAGGTAGGAATTTCAACTGATGAGACAGGAGGGAAAGTTGGAACATTTGCTT
TGGCATATGCAGCACATAAAGCTGCTTCTCCGATAAGGTTTCCTCCAACAGTGGCTCTCACTCCAATTGTTGCAAGTTGGATTGGGAAGAAAGTTGAGAAAGAGAATTAG
TATAATGTCTTACTTTGAGACTACAAAGTTATTCGTTAGAGTTCTTATCTAAAGTTACTTGATAGTGTATATTGGGTTTAATTTTAATCCATGTAGATTGTATACTAATG
AGTTATAATGTACACGTCCTTTTTGAATCATAGCTAATGGTTCCAGCATTTAGGAGTCTTTAAGATTGATGATTTTACACAATCACTTGGTCATTTAGTTCCAACCATTT
TCAAATGGAGTATCGAGTAACATGGAGAAAGGCGACATGAATGAATGAATGAAGAATGAAGAGAAACGAAAATCGAGAAA

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MATASSLIAFSSFSNFSFTHPNFRFHFNFPNPPLKFNSKPFRVQALKQKTGEIDRPSPSSSSSADEVTKKYGLEAGLWKIFSSKEEGEGTNKSKGDQAKELLAKYGGAYL
ATSITLSLISFSLCYALISAGVDVQALLQKVGISTDETGGKVGTFALAYAAHKAASPIRFPPTVALTPIVASWIGKKVEKEN

Pay0017445 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome