; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Pay0017611 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome

Gene IDPay0017611
OrganismCucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
DescriptionLOB domain-containing protein
Genome locationchr04:26542432..26545069
RNA-Seq ExpressionPay0017611
SyntenyPay0017611
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR004883 - Lateral organ boundaries, LOB


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_008443563.1 PREDICTED: LOB domain-containing protein 25-like [Cucumis melo]3.1e-95100Show/hide
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XP_011652293.1 LOB domain-containing protein 25 isoform X2 [Cucumis sativus]9.0e-9599.44Show/hide
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XP_022935530.1 LOB domain-containing protein 25-like [Cucurbita moschata]6.2e-8892.66Show/hide
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XP_038905774.1 LOB domain-containing protein 25-like [Benincasa hispida]2.9e-9397.74Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LI15 LOB domain-containing protein4.3e-9599.44Show/hide
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A0A1S3B938 LOB domain-containing protein 25-like1.5e-95100Show/hide
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A0A5D3BPW0 LOB domain-containing protein 25-like1.5e-95100Show/hide
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A0A6J1DD95 LOB domain-containing protein 25-like3.9e-8894.44Show/hide
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A0A6J1FAW3 LOB domain-containing protein 25-like3.0e-8892.66Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2WXT0 LOB domain-containing protein 68.6e-4063.64Show/hide
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          +L +Y  +   A + S+S+
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O04479 Protein ASYMMETRIC LEAVES 22.5e-3951.43Show/hide
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        L    ++L +Y    + A +  S        ++      ++T+   HY+   +F P      G   P G+ +D G
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Q8L8Q3 LOB domain-containing protein 251.7e-5184.68Show/hide
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        S Y+NSPCAACKFLRRKC  DCVFAPYFPPEEP KFANVH+IFGASNVSK+L+EV PHQREDAVNSLAYEAEAR+KDPVYGCVGAIS+LQRQV++LQ+EL
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Query:  DATNADLIRYA
        + TNADL+RYA
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Q8LQH4 LOB domain-containing protein 68.6e-4063.64Show/hide
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          +L +Y  +   A + S+S+
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Q9FML4 Protein LATERAL ORGAN BOUNDARIES1.8e-5078.23Show/hide
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        SSS   NSPCAACKFLRRKC+P C+FAPYFPPEEP KFANVHKIFGASNV+KLLNE+ PHQREDAVNSLAYEAEAR++DPVYGCVGAIS LQRQV +LQK
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G27650.1 LOB domain-containing protein 251.2e-5284.68Show/hide
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        + TNADL+RYA
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AT5G63090.1 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein1.3e-5178.23Show/hide
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        SSS   NSPCAACKFLRRKC+P C+FAPYFPPEEP KFANVHKIFGASNV+KLLNE+ PHQREDAVNSLAYEAEAR++DPVYGCVGAIS LQRQV +LQK
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        ELDA NADL  Y  S   A +P +
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AT5G63090.2 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein1.3e-5178.23Show/hide
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        SSS   NSPCAACKFLRRKC+P C+FAPYFPPEEP KFANVHKIFGASNV+KLLNE+ PHQREDAVNSLAYEAEAR++DPVYGCVGAIS LQRQV +LQK
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        ELDA NADL  Y  S   A +P +
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AT5G63090.3 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein1.3e-5178.23Show/hide
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        ELDA NADL  Y  S   A +P +
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AT5G63090.4 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein1.3e-5178.23Show/hide
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        SSS   NSPCAACKFLRRKC+P C+FAPYFPPEEP KFANVHKIFGASNV+KLLNE+ PHQREDAVNSLAYEAEAR++DPVYGCVGAIS LQRQV +LQK
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCTTCTTCCACCTACTCTAATTCTCCCTGTGCAGCCTGCAAGTTCCTACGTCGAAAATGCCTACCGGATTGTGTTTTTGCGCCATATTTTCCACCCGAAGAGCCTCA
AAAGTTCGCCAATGTTCACAAGATCTTTGGTGCCAGTAACGTCAGCAAACTGTTGAACGAAGTCCAGCCGCATCAGCGGGAGGATGCCGTGAACTCGCTCGCCTACGAGG
CCGAGGCAAGGATGAAAGACCCTGTCTATGGCTGTGTTGGCGCCATCTCTATACTCCAAAGGCAAGTCATCAAACTCCAAAAAGAGCTCGATGCTACTAACGCCGACCTC
ATTCGCTATGCCTGCAGTGAAATGCCAGCCCCATCTCCGTCTTCTTCGTCACAATATGCTCGAAGGTCGTCGTCAACAAGCCACGAGGGAAGCTCGTCTACCTCTAGCTA
TGGTCATTACTATACTGGTCTCTACTTTTCTCCATGGAGTAACAACAATAATGGCCCTTGTGGAGATGGCCATGACAAAGGAGAATACAAGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTCTCTCTCACACATGTAAACATTATTTAGGGATATCCCATAAAATAAAGTTTGTTCCTTTTTCCTCTCTCTCTCTCCCTCTCTCTTTTCCTATGGCTTCAACTTCATTT
TGCTTAAGGTTTTCATACAAGAGATGTTGAAACAACAGCTTACAGAAAGGAGAGAAAGGGGGAAAAAATTATTGGACGATGTCTTCTTCCACCTACTCTAATTCTCCCTG
TGCAGCCTGCAAGTTCCTACGTCGAAAATGCCTACCGGATTGTGTTTTTGCGCCATATTTTCCACCCGAAGAGCCTCAAAAGTTCGCCAATGTTCACAAGATCTTTGGTG
CCAGTAACGTCAGCAAACTGTTGAACGAAGTCCAGCCGCATCAGCGGGAGGATGCCGTGAACTCGCTCGCCTACGAGGCCGAGGCAAGGATGAAAGACCCTGTCTATGGC
TGTGTTGGCGCCATCTCTATACTCCAAAGGCAAGTCATCAAACTCCAAAAAGAGCTCGATGCTACTAACGCCGACCTCATTCGCTATGCCTGCAGTGAAATGCCAGCCCC
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CATGGAGTAACAACAATAATGGCCCTTGTGGAGATGGCCATGACAAAGGAGAATACAAGTAAATATTTTTCATCAATTGATATCATTATCTTTATAATTTGAATCATCAC
AAGGGATATAATATCATATGCTGATGTGGGTGTGAAAATTTTATGATATTTTGATCATAAAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSSSTYSNSPCAACKFLRRKCLPDCVFAPYFPPEEPQKFANVHKIFGASNVSKLLNEVQPHQREDAVNSLAYEAEARMKDPVYGCVGAISILQRQVIKLQKELDATNADL
IRYACSEMPAPSPSSSSQYARRSSSTSHEGSSSTSSYGHYYTGLYFSPWSNNNNGPCGDGHDKGEYK