; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Pay0017876 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome

Gene IDPay0017876
OrganismCucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
DescriptionCold regulated protein 27, putative isoform 2
Genome locationchr01:416502..420915
RNA-Seq ExpressionPay0017876
SyntenyPay0017876
Gene Ontology termsGO:0009409 - response to cold (biological process)
GO:0042752 - regulation of circadian rhythm (biological process)
InterPro domainsIPR044678 - Cold-regulated protein 27/28


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0031301.1 Cold regulated protein 27, putative isoform 2 [Cucumis melo var. makuwa]2.8e-114100Show/hide
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XP_008454953.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103495241 isoform X2 [Cucumis melo]1.3e-8280.77Show/hide
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XP_038887003.1 cold-regulated protein 27 isoform X1 [Benincasa hispida]1.3e-7675.71Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K7Z2 Uncharacterized protein8.5e-10190.38Show/hide
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A0A1S3BZQ8 uncharacterized protein LOC103495241 isoform X26.1e-8380.77Show/hide
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A0A1S3BZU8 uncharacterized protein LOC103495241 isoform X11.3e-114100Show/hide
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A0A5D3C4A3 Cold regulated protein 27, putative isoform 21.3e-114100Show/hide
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A0A6J1GKR5 uncharacterized protein LOC111454842 isoform X11.4e-7471.09Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L8T7 Cold-regulated protein 271.4e-0432.67Show/hide
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Q8L983 Cold-regulated protein 285.8e-0631.5Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G33980.1 BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cold regulated gene 27 (TAIR:AT5G42900.2)4.1e-0731.5Show/hide
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AT4G33980.2 FUNCTIONS IN: molecular_function unknown4.1e-0731.5Show/hide
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AT5G42900.1 cold regulated gene 271.0e-0532.67Show/hide
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AT5G42900.2 cold regulated gene 271.0e-0532.67Show/hide
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AT5G42900.3 cold regulated gene 271.0e-0532.67Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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ATCTTGATTCTTTAGAAGCATCTTTTGTCCAAGGTTTGCATCAACATAGGCGTATGCATGCTTTATCCTCAAAACAGAAGATGCGTCGAAAGCCGATCATGCTTGATACA
TCTTCTTCAGAGTTGATGGTCCTTCAAGATGCCTCTTGGCAGAAGGCTAACATTGGGAGGAATGATCCTTTATTGGATAAGACTGCTGATTCTCCTGCTATTTTAGAGGA
TCTATGGATAAATCATTTTCCTTCTGCAGGAAAACAGTGTAGTTTGGAAACTCCTGATCTCCTTGAAGAATGTGGAAGTTGTAGTGATAGGAGACACATAAGACACATGA
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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AGATCGACAATCACCCATGCCGCCGGCCTCTTCTACTACTGACTCCACTGGCTTCAACTCTGAATCTCACTCTTCTTCCATTACTGTTGATGGGTCCAAGCGTTTTTTGG
ATTCTCATCATTGTTTGCAACTGGATGCGGAGCAAACACATTGGACAGACGAGAAACATAGATCATATCTTGATTCTTTAGAAGCATCTTTTGTCCAAGGTTTGCATCAA
CATAGGCGTATGCATGCTTTATCCTCAAAACAGAAGATGCGTCGAAAGCCGATCATGCTTGATACATCTTCTTCAGAGTTGATGGTCCTTCAAGATGCCTCTTGGCAGAA
GGCTAACATTGGGAGGAATGATCCTTTATTGGATAAGACTGCTGATTCTCCTGCTATTTTAGAGGATCTATGGATAAATCATTTTCCTTCTGCAGGAAAACAGTGTAGTT
TGGAAACTCCTGATCTCCTTGAAGAATGTGGAAGTTGTAGTGATAGGAGACACATAAGACACATGACGAACTCCTGTGGATCTGCCAGAAATTCACAGCAGACCCGTCCA
TGCTGTTTTAATTCTTATACAATCATTACAGGTAATTTGATCAGTGCCATATGTTCTTGAAAGTTTCATTTATATCTCTTTTAATTGGGTTCTTTATGTACTCTTTTCTT
TTGTCTGGGTGGTACATAATCTACCCCTCAATCTCCTCTTATAGACACACCTGAACACATCGTTCATGTTTACCAAACCCCTTACTGGAGAAAGTTTTCCAGACTCTCAC
TTTTTGTTGAAGACCTTCTAATATACTAAAATTTGTAATCTATATTCTCAATACTCATTATGCATGTACACTTAACTGTGAATAGCCGTCTTCCAATCAAATTTTGTAAT
GGTGAAGGTGTTAGCTTTTGCAATAATTATTTTGGCTGTAGTATTTCCCTCTAGCACCATTTAGATGCACTCACTTTTCTGATTTAATTTTGTGTTGGTGTATCAATTTG
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CAAATGTATGACTTGAGCTTGTGAGTTGTAAAATCTGTAAGTCAAGCTTAGGATATTGTGTTATCTTCTTAGCAATGGAAATTCTACATGCTTTGATATATTAATTGGAT
AGTTCCAACGGTTTTCAGTGTTGTTATAGCTTTGTTCCCATAGCATGTTTTTAGTGTTTACAGATGCACACCAGGGTTACAAGATTTAACGTCATAATTCTCATGTTATT
TCTCTACTAAGAATTCATGGATTAACTGATTGCATATCTTATTCATTTGAAGATCTTCGATCAGTATCTATAAGTGGAAAAGTACAAATCCTTTCTTTAAAGTTAAATGA
GCATTTTTGTGCATTATATCAGTGGAAGAAACTATTAAAACTGAGTAGACATGTCTGGGATGGACTGCATTATGGATATTGATGAACTACTAGATGAAGCTAGGCTGATT
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TCTCTATTTCCCCTTTGAATATGTATAAATGTTCCTGAAGAGTAGAAAACCTGCTGAAGAATAATTTTATTGTTATGGGTCAAATAAACGAGATTATTCATAATTCTGCA
AGCAATAACAAATAGATGCTTTAAAGCGAATAATGCTTGTCTAATTAAAGGACGAGATGCCAATGGGAAAGTTCTTCCTTTCCCATCTTAGGTGCATGCTACCGCACTTC
ATTGCAATGTTTAATGTGATTTCCTGTTGCAAACTAATTTGGTGTCTTTTATCTCTTCATTTTGTCTTCTATGCAGAAGTTTCGGATCAAAACTTTGTGGATAATCAACC
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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