CuGenDBv2

Gene ID	Pay0018391
Organism	Cucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
Description	Transposase
Genome location	chr12:2895416..2895993
RNA-Seq Expression	Pay0018391
Synteny	Pay0018391
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	IPR025312 - Domain of unknown function DUF4216

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAA0041463.1 transposase [Cucumis melo var. makuwa]

1.3e-86

100

Show/hide

Query:  MQVSSSKDKNPVIGDMSFYGVIQEIWELNYNTFNVPVFKCDWVQNSGGVRIDELGYTLVDLNRVGHKSDSFILASQAKQVFYVEDPSDVRWSVVLTPPQR
        MQVSSSKDKNPVIGDMSFYGVIQEIWELNYNTFNVPVFKCDWVQNSGGVRIDELGYTLVDLNRVGHKSDSFILASQAKQVFYVEDPSDVRWSVVLTPPQR
Subjt:  MQVSSSKDKNPVIGDMSFYGVIQEIWELNYNTFNVPVFKCDWVQNSGGVRIDELGYTLVDLNRVGHKSDSFILASQAKQVFYVEDPSDVRWSVVLTPPQR

Query:  DFEDRYNDDELGDTILRCEGIPNDMPDVYLNNDLDENVSTYVRSDCEGTWIPT
        DFEDRYNDDELGDTILRCEGIPNDMPDVYLNNDLDENVSTYVRSDCEGTWIPT
Subjt:  DFEDRYNDDELGDTILRCEGIPNDMPDVYLNNDLDENVSTYVRSDCEGTWIPT

KAA0055588.1 transposase [Cucumis melo var. makuwa]

1.3e-86

100

Show/hide

Query:  MQVSSSKDKNPVIGDMSFYGVIQEIWELNYNTFNVPVFKCDWVQNSGGVRIDELGYTLVDLNRVGHKSDSFILASQAKQVFYVEDPSDVRWSVVLTPPQR
        MQVSSSKDKNPVIGDMSFYGVIQEIWELNYNTFNVPVFKCDWVQNSGGVRIDELGYTLVDLNRVGHKSDSFILASQAKQVFYVEDPSDVRWSVVLTPPQR
Subjt:  MQVSSSKDKNPVIGDMSFYGVIQEIWELNYNTFNVPVFKCDWVQNSGGVRIDELGYTLVDLNRVGHKSDSFILASQAKQVFYVEDPSDVRWSVVLTPPQR

Query:  DFEDRYNDDELGDTILRCEGIPNDMPDVYLNNDLDENVSTYVRSDCEGTWIPT
        DFEDRYNDDELGDTILRCEGIPNDMPDVYLNNDLDENVSTYVRSDCEGTWIPT
Subjt:  DFEDRYNDDELGDTILRCEGIPNDMPDVYLNNDLDENVSTYVRSDCEGTWIPT

KAA0060813.1 transposase [Cucumis melo var. makuwa]

1.3e-86

100

Show/hide

Query:  MQVSSSKDKNPVIGDMSFYGVIQEIWELNYNTFNVPVFKCDWVQNSGGVRIDELGYTLVDLNRVGHKSDSFILASQAKQVFYVEDPSDVRWSVVLTPPQR
        MQVSSSKDKNPVIGDMSFYGVIQEIWELNYNTFNVPVFKCDWVQNSGGVRIDELGYTLVDLNRVGHKSDSFILASQAKQVFYVEDPSDVRWSVVLTPPQR
Subjt:  MQVSSSKDKNPVIGDMSFYGVIQEIWELNYNTFNVPVFKCDWVQNSGGVRIDELGYTLVDLNRVGHKSDSFILASQAKQVFYVEDPSDVRWSVVLTPPQR

Query:  DFEDRYNDDELGDTILRCEGIPNDMPDVYLNNDLDENVSTYVRSDCEGTWIPT
        DFEDRYNDDELGDTILRCEGIPNDMPDVYLNNDLDENVSTYVRSDCEGTWIPT
Subjt:  DFEDRYNDDELGDTILRCEGIPNDMPDVYLNNDLDENVSTYVRSDCEGTWIPT

TYK07545.1 transposase [Cucumis melo var. makuwa]

1.3e-86

100

Show/hide

Query:  MQVSSSKDKNPVIGDMSFYGVIQEIWELNYNTFNVPVFKCDWVQNSGGVRIDELGYTLVDLNRVGHKSDSFILASQAKQVFYVEDPSDVRWSVVLTPPQR
        MQVSSSKDKNPVIGDMSFYGVIQEIWELNYNTFNVPVFKCDWVQNSGGVRIDELGYTLVDLNRVGHKSDSFILASQAKQVFYVEDPSDVRWSVVLTPPQR
Subjt:  MQVSSSKDKNPVIGDMSFYGVIQEIWELNYNTFNVPVFKCDWVQNSGGVRIDELGYTLVDLNRVGHKSDSFILASQAKQVFYVEDPSDVRWSVVLTPPQR

Query:  DFEDRYNDDELGDTILRCEGIPNDMPDVYLNNDLDENVSTYVRSDCEGTWIPT
        DFEDRYNDDELGDTILRCEGIPNDMPDVYLNNDLDENVSTYVRSDCEGTWIPT
Subjt:  DFEDRYNDDELGDTILRCEGIPNDMPDVYLNNDLDENVSTYVRSDCEGTWIPT

TYK08445.1 transposase [Cucumis melo var. makuwa]

1.3e-86

100

Show/hide

Query:  MQVSSSKDKNPVIGDMSFYGVIQEIWELNYNTFNVPVFKCDWVQNSGGVRIDELGYTLVDLNRVGHKSDSFILASQAKQVFYVEDPSDVRWSVVLTPPQR
        MQVSSSKDKNPVIGDMSFYGVIQEIWELNYNTFNVPVFKCDWVQNSGGVRIDELGYTLVDLNRVGHKSDSFILASQAKQVFYVEDPSDVRWSVVLTPPQR
Subjt:  MQVSSSKDKNPVIGDMSFYGVIQEIWELNYNTFNVPVFKCDWVQNSGGVRIDELGYTLVDLNRVGHKSDSFILASQAKQVFYVEDPSDVRWSVVLTPPQR

Query:  DFEDRYNDDELGDTILRCEGIPNDMPDVYLNNDLDENVSTYVRSDCEGTWIPT
        DFEDRYNDDELGDTILRCEGIPNDMPDVYLNNDLDENVSTYVRSDCEGTWIPT
Subjt:  DFEDRYNDDELGDTILRCEGIPNDMPDVYLNNDLDENVSTYVRSDCEGTWIPT

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A5A7UKK6 Transposase

6.4e-87

100

Show/hide

Query:  MQVSSSKDKNPVIGDMSFYGVIQEIWELNYNTFNVPVFKCDWVQNSGGVRIDELGYTLVDLNRVGHKSDSFILASQAKQVFYVEDPSDVRWSVVLTPPQR
        MQVSSSKDKNPVIGDMSFYGVIQEIWELNYNTFNVPVFKCDWVQNSGGVRIDELGYTLVDLNRVGHKSDSFILASQAKQVFYVEDPSDVRWSVVLTPPQR
Subjt:  MQVSSSKDKNPVIGDMSFYGVIQEIWELNYNTFNVPVFKCDWVQNSGGVRIDELGYTLVDLNRVGHKSDSFILASQAKQVFYVEDPSDVRWSVVLTPPQR

Query:  DFEDRYNDDELGDTILRCEGIPNDMPDVYLNNDLDENVSTYVRSDCEGTWIPT
        DFEDRYNDDELGDTILRCEGIPNDMPDVYLNNDLDENVSTYVRSDCEGTWIPT
Subjt:  DFEDRYNDDELGDTILRCEGIPNDMPDVYLNNDLDENVSTYVRSDCEGTWIPT

A0A5D3C2L9 Transposase

6.4e-87

100

Show/hide

Query:  MQVSSSKDKNPVIGDMSFYGVIQEIWELNYNTFNVPVFKCDWVQNSGGVRIDELGYTLVDLNRVGHKSDSFILASQAKQVFYVEDPSDVRWSVVLTPPQR
        MQVSSSKDKNPVIGDMSFYGVIQEIWELNYNTFNVPVFKCDWVQNSGGVRIDELGYTLVDLNRVGHKSDSFILASQAKQVFYVEDPSDVRWSVVLTPPQR
Subjt:  MQVSSSKDKNPVIGDMSFYGVIQEIWELNYNTFNVPVFKCDWVQNSGGVRIDELGYTLVDLNRVGHKSDSFILASQAKQVFYVEDPSDVRWSVVLTPPQR

Query:  DFEDRYNDDELGDTILRCEGIPNDMPDVYLNNDLDENVSTYVRSDCEGTWIPT
        DFEDRYNDDELGDTILRCEGIPNDMPDVYLNNDLDENVSTYVRSDCEGTWIPT
Subjt:  DFEDRYNDDELGDTILRCEGIPNDMPDVYLNNDLDENVSTYVRSDCEGTWIPT

A0A5D3CA82 Transposase

6.4e-87

100

Show/hide

Query:  MQVSSSKDKNPVIGDMSFYGVIQEIWELNYNTFNVPVFKCDWVQNSGGVRIDELGYTLVDLNRVGHKSDSFILASQAKQVFYVEDPSDVRWSVVLTPPQR
        MQVSSSKDKNPVIGDMSFYGVIQEIWELNYNTFNVPVFKCDWVQNSGGVRIDELGYTLVDLNRVGHKSDSFILASQAKQVFYVEDPSDVRWSVVLTPPQR
Subjt:  MQVSSSKDKNPVIGDMSFYGVIQEIWELNYNTFNVPVFKCDWVQNSGGVRIDELGYTLVDLNRVGHKSDSFILASQAKQVFYVEDPSDVRWSVVLTPPQR

Query:  DFEDRYNDDELGDTILRCEGIPNDMPDVYLNNDLDENVSTYVRSDCEGTWIPT
        DFEDRYNDDELGDTILRCEGIPNDMPDVYLNNDLDENVSTYVRSDCEGTWIPT
Subjt:  DFEDRYNDDELGDTILRCEGIPNDMPDVYLNNDLDENVSTYVRSDCEGTWIPT

A0A5D3CBN3 Transposase

6.4e-87

100

Show/hide

Query:  MQVSSSKDKNPVIGDMSFYGVIQEIWELNYNTFNVPVFKCDWVQNSGGVRIDELGYTLVDLNRVGHKSDSFILASQAKQVFYVEDPSDVRWSVVLTPPQR
        MQVSSSKDKNPVIGDMSFYGVIQEIWELNYNTFNVPVFKCDWVQNSGGVRIDELGYTLVDLNRVGHKSDSFILASQAKQVFYVEDPSDVRWSVVLTPPQR
Subjt:  MQVSSSKDKNPVIGDMSFYGVIQEIWELNYNTFNVPVFKCDWVQNSGGVRIDELGYTLVDLNRVGHKSDSFILASQAKQVFYVEDPSDVRWSVVLTPPQR

Query:  DFEDRYNDDELGDTILRCEGIPNDMPDVYLNNDLDENVSTYVRSDCEGTWIPT
        DFEDRYNDDELGDTILRCEGIPNDMPDVYLNNDLDENVSTYVRSDCEGTWIPT
Subjt:  DFEDRYNDDELGDTILRCEGIPNDMPDVYLNNDLDENVSTYVRSDCEGTWIPT

A0A5D3DZF8 Transposase

6.4e-87

100

Show/hide

Query:  MQVSSSKDKNPVIGDMSFYGVIQEIWELNYNTFNVPVFKCDWVQNSGGVRIDELGYTLVDLNRVGHKSDSFILASQAKQVFYVEDPSDVRWSVVLTPPQR
        MQVSSSKDKNPVIGDMSFYGVIQEIWELNYNTFNVPVFKCDWVQNSGGVRIDELGYTLVDLNRVGHKSDSFILASQAKQVFYVEDPSDVRWSVVLTPPQR
Subjt:  MQVSSSKDKNPVIGDMSFYGVIQEIWELNYNTFNVPVFKCDWVQNSGGVRIDELGYTLVDLNRVGHKSDSFILASQAKQVFYVEDPSDVRWSVVLTPPQR

Query:  DFEDRYNDDELGDTILRCEGIPNDMPDVYLNNDLDENVSTYVRSDCEGTWIPT
        DFEDRYNDDELGDTILRCEGIPNDMPDVYLNNDLDENVSTYVRSDCEGTWIPT
Subjt:  DFEDRYNDDELGDTILRCEGIPNDMPDVYLNNDLDENVSTYVRSDCEGTWIPT

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGCAAGTGTCTAGTTCTAAAGATAAAAATCCCGTCATTGGAGATATGTCATTCTATGGAGTGATACAAGAGATATGGGAACTCAATTATAATACGTTTAATGTTCCGGT
GTTTAAATGCGATTGGGTTCAGAATAGTGGTGGTGTTCGGATCGATGAACTTGGTTATACTTTAGTTGATTTAAATAGAGTAGGACACAAGTCAGACTCATTTATACTAG
CAAGCCAAGCAAAGCAAGTGTTTTATGTTGAGGATCCAAGTGATGTTAGATGGTCAGTTGTACTCACTCCACCACAAAGAGACTTTGAAGATAGATATAATGACGATGAA
CTTGGTGATACAATACTCCGGTGTGAAGGAATACCCAATGATATGCCAGATGTCTATTTAAACAATGATTTGGATGAAAATGTCTCAACGTACGTAAGGTCAGATTGTGA
AGGCACATGGATACCTACATAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

ATCCTTTTGTTATTACATATAGTGGTTATGCAATAAACGGATGTCGCTATCACACAAAATCTTCTGAGAAGGATCGAAGTGTACAAAACAGTGGAGTTAGTTTAGTTGCA
AAAACAATGCAAGTGTCTAGTTCTAAAGATAAAAATCCCGTCATTGGAGATATGTCATTCTATGGAGTGATACAAGAGATATGGGAACTCAATTATAATACGTTTAATGT
TCCGGTGTTTAAATGCGATTGGGTTCAGAATAGTGGTGGTGTTCGGATCGATGAACTTGGTTATACTTTAGTTGATTTAAATAGAGTAGGACACAAGTCAGACTCATTTA
TACTAGCAAGCCAAGCAAAGCAAGTGTTTTATGTTGAGGATCCAAGTGATGTTAGATGGTCAGTTGTACTCACTCCACCACAAAGAGACTTTGAAGATAGATATAATGAC
GATGAACTTGGTGATACAATACTCCGGTGTGAAGGAATACCCAATGATATGCCAGATGTCTATTTAAACAATGATTTGGATGAAAATGTCTCAACGTACGTAAGGTCAGA
TTGTGAAGGCACATGGATACCTACATAA

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MQVSSSKDKNPVIGDMSFYGVIQEIWELNYNTFNVPVFKCDWVQNSGGVRIDELGYTLVDLNRVGHKSDSFILASQAKQVFYVEDPSDVRWSVVLTPPQRDFEDRYNDDE
LGDTILRCEGIPNDMPDVYLNNDLDENVSTYVRSDCEGTWIPT

Pay0018391 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome