; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Pay0018539 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome

Gene IDPay0018539
OrganismCucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
DescriptionProtein of unknown function, DUF584
Genome locationchr12:23877978..23879218
RNA-Seq ExpressionPay0018539
SyntenyPay0018539
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR007608 - Senescence regulator S40


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004153812.1 uncharacterized protein LOC101208118 [Cucumis sativus]9.4e-8493.89Show/hide
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XP_022139905.1 uncharacterized protein LOC111010704 [Momordica charantia]3.1e-6677.05Show/hide
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XP_022924226.1 uncharacterized protein LOC111431737 [Cucurbita moschata]8.9e-6675.14Show/hide
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XP_038894875.1 uncharacterized protein LOC120083273 [Benincasa hispida]7.7e-7890.11Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LX30 Uncharacterized protein4.6e-8493.89Show/hide
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A0A1S3B355 uncharacterized protein LOC1034852648.9e-8896.67Show/hide
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A0A5D3BLZ0 Zinc-regulated protein 88.9e-8896.67Show/hide
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A0A6J1CDL0 uncharacterized protein LOC1110107041.5e-6677.05Show/hide
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E5GC55 Uncharacterized protein8.9e-8896.67Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G15040.1 Protein of unknown function, DUF5849.0e-1641.79Show/hide
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AT4G04630.1 Protein of unknown function, DUF5843.8e-3048.52Show/hide
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        S+   +   D +D +DD  MVPPHEW+A+KLAR++ISSFS+CEGVGRTLKGRDLSKVRNA+L+KTGFLE
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AT4G21970.1 Protein of unknown function, DUF5849.6e-2642.51Show/hide
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AT4G26950.1 Protein of unknown function, DUF5841.7e-1439.39Show/hide
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        D +E+DVW+ ++G                Y S    SS+ ++  S S+   LP+ P+MIP+   T   E      + S PV++PDWS +  K        
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                   DD+ V P E+    L RSR  SS SV EGVGR LKGRDLSKVRNAIL +TGFLE
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AT4G26950.2 Protein of unknown function, DUF5841.7e-1439.39Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGAATTGGAGCAGTGCTTTGAGAAAAAACTATGGATTCAGTGATGATTTGGAAGAAGAAGATGTATGGAATTCTGTTGAAGGTAAAGAAGATTCTTCAAATTTCAT
CAATAGGAAGTCTCATGACTATTATTACTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCGTCTTCCACTTGGCGTCTTCCAACTGCTCCAAAAA
TGATCCCGAAATCCATTTCAACGAGAACACATGAAACCCAGATGGCGAATAATCGATCCTCTGCTCCAGTGGATATTCCCGATTGGTCCAAAATTTACGGAAAAATGGGT
TCGTCGTCCGCCGGTGAAAAAACTGACGTTAGAGATCAAGAAGACGGTGAAGATGACGATATGGTGCCTCCTCATGAATGGATAGCTCAGAAATTAGCAAGAAGCAGAAT
TTCGTCTTTCTCTGTTTGTGAAGGGGTTGGAAGAACTCTCAAAGGAAGAGATTTAAGTAAAGTTCGAAACGCCATTTTAACAAAGACGGGTTTTTTAGAGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTTTTCTCTCATCTTTGAATTATTATTATTATTATTATTATTATTTCTTCTTTTCAGTTTTTAATTGGCCATTAAAACCCATCTCTGATTTCTCTCTGTTTCTGTGGTCT
TCTCTTTTGCCACATTACATTCAAACCTCTGTTCTTCACCTTTTCTTTCTCCTTCTTTCTTTACACCTTCTCTTCCATTTTCTTCATGCGGTTTTGGATTATGAACAAAA
CCCATTTCAGGAATTCTTGAAAAAAGCGAGCTTTTTTTCTTTTTTGATTTCTCAACAGAACTCTGCCACAAAAGCCTGGATATCAATGGCGAATTGGAGCAGTGCTTTGA
GAAAAAACTATGGATTCAGTGATGATTTGGAAGAAGAAGATGTATGGAATTCTGTTGAAGGTAAAGAAGATTCTTCAAATTTCATCAATAGGAAGTCTCATGACTATTAT
TACTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCGTCTTCCACTTGGCGTCTTCCAACTGCTCCAAAAATGATCCCGAAATCCATTTCAACGAG
AACACATGAAACCCAGATGGCGAATAATCGATCCTCTGCTCCAGTGGATATTCCCGATTGGTCCAAAATTTACGGAAAAATGGGTTCGTCGTCCGCCGGTGAAAAAACTG
ACGTTAGAGATCAAGAAGACGGTGAAGATGACGATATGGTGCCTCCTCATGAATGGATAGCTCAGAAATTAGCAAGAAGCAGAATTTCGTCTTTCTCTGTTTGTGAAGGG
GTTGGAAGAACTCTCAAAGGAAGAGATTTAAGTAAAGTTCGAAACGCCATTTTAACAAAGACGGGTTTTTTAGAGTGATTTGAGAGATTATTATCATCATCTTCATCATT
TTGTTCTGTGTTTTCTTGTTTTGCTTTACTGCCATTGTTATGAGCTTAGTTAGAACAGATGAGTTTCTAGCAAGAACTCGAAGAAAAAAAAATTGAAGAATTTGTAGCTT
TTTTTGAGTATTTAAAATGGAGTGGGAACTGTCTCATGTTCTATGATTTTGAGTTAAGAAATGGTTTGTTGGAGTTCTTAGTTTATAGTGTTGTGTCAATGCAATTTTTT
TAATATATTAATTGATAGATCTTCT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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