| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAE8651124.1 hypothetical protein Csa_000954 [Cucumis sativus] | 5.1e-105 | 96.21 | Show/hide |
Query: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRGRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQF-VDAADAADAKYELD
MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRGRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQF VDAADAADAKYELD
Subjt: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRGRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQF-VDAADAADAKYELD
Query: GEVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSRSPRGRRYREQSYLRSPYDPRGRSYSRS
G+VLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYS RHSPLRYS+SPHYDRKYSR PEYYSPARSRRYSRSPRG RYREQSY RSP DPRGRSYSRS
Subjt: GEVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSRSPRGRRYREQSYLRSPYDPRGRSYSRS
Query: RSRSYSRSYSR
RSRSYSRSYSR
Subjt: RSRSYSRSYSR
|
|
| XP_008443002.1 PREDICTED: serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 [Cucumis melo] | 3.4e-109 | 98.57 | Show/hide |
Query: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRGRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELDG
MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPR RGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELDG
Subjt: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRGRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELDG
Query: EVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSRSPRGRRYREQSYLRSPYDPRGRSYSRSR
+VLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSRSPRGRRYREQSY RSPYDPRGRSYSRSR
Subjt: EVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSRSPRGRRYREQSYLRSPYDPRGRSYSRSR
Query: SRSYSRSYSR
SRSYSRSYSR
Subjt: SRSYSRSYSR
|
|
| XP_011652066.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 isoform X1 [Cucumis sativus] | 2.1e-106 | 96.67 | Show/hide |
Query: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRGRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELDG
MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRGRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELDG
Subjt: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRGRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELDG
Query: EVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSRSPRGRRYREQSYLRSPYDPRGRSYSRSR
+VLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYS RHSPLRYS+SPHYDRKYSR PEYYSPARSRRYSRSPRG RYREQSY RSP DPRGRSYSRSR
Subjt: EVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSRSPRGRRYREQSYLRSPYDPRGRSYSRSR
Query: SRSYSRSYSR
SRSYSRSYSR
Subjt: SRSYSRSYSR
|
|
| XP_011652068.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 isoform X2 [Cucumis sativus] | 2.1e-106 | 96.67 | Show/hide |
Query: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRGRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELDG
MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRGRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELDG
Subjt: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRGRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELDG
Query: EVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSRSPRGRRYREQSYLRSPYDPRGRSYSRSR
+VLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYS RHSPLRYS+SPHYDRKYSR PEYYSPARSRRYSRSPRG RYREQSY RSP DPRGRSYSRSR
Subjt: EVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSRSPRGRRYREQSYLRSPYDPRGRSYSRSR
Query: SRSYSRSYSR
SRSYSRSYSR
Subjt: SRSYSRSYSR
|
|
| XP_031739396.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 isoform X1 [Cucumis sativus] | 5.1e-105 | 96.21 | Show/hide |
Query: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRGRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQF-VDAADAADAKYELD
MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRGRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQF VDAADAADAKYELD
Subjt: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRGRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQF-VDAADAADAKYELD
Query: GEVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSRSPRGRRYREQSYLRSPYDPRGRSYSRS
G+VLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYS RHSPLRYS+SPHYDRKYSR PEYYSPARSRRYSRSPRG RYREQSY RSP DPRGRSYSRS
Subjt: GEVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSRSPRGRRYREQSYLRSPYDPRGRSYSRS
Query: RSRSYSRSYSR
RSRSYSRSYSR
Subjt: RSRSYSRSYSR
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0LGW4 RRM domain-containing protein | 1.0e-106 | 96.67 | Show/hide |
Query: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRGRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELDG
MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRGRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELDG
Subjt: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRGRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELDG
Query: EVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSRSPRGRRYREQSYLRSPYDPRGRSYSRSR
+VLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYS RHSPLRYS+SPHYDRKYSR PEYYSPARSRRYSRSPRG RYREQSY RSP DPRGRSYSRSR
Subjt: EVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSRSPRGRRYREQSYLRSPYDPRGRSYSRSR
Query: SRSYSRSYSR
SRSYSRSYSR
Subjt: SRSYSRSYSR
|
|
| A0A1S3B7U0 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 | 1.6e-109 | 98.57 | Show/hide |
Query: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRGRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELDG
MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPR RGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELDG
Subjt: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRGRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELDG
Query: EVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSRSPRGRRYREQSYLRSPYDPRGRSYSRSR
+VLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSRSPRGRRYREQSY RSPYDPRGRSYSRSR
Subjt: EVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSRSPRGRRYREQSYLRSPYDPRGRSYSRSR
Query: SRSYSRSYSR
SRSYSRSYSR
Subjt: SRSYSRSYSR
|
|
| A0A6J1DCY5 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 | 1.9e-97 | 91.04 | Show/hide |
Query: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRGRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELDG
MRGRSYSYSPSPPRSYGRR+RSPSPR RGGR RDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVD ADA DAKYELDG
Subjt: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRGRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELDG
Query: EVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSR--SPRGRRYREQSYLRSPYDPRGRSYSR
+VLLG ELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSY+Y R SPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPA+S RYSR SPR RRYRE+SYLRSPYD RGRSYSR
Subjt: EVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSR--SPRGRRYREQSYLRSPYDPRGRSYSR
Query: SRSRSYSRSYSR
SRSRSYSRSY R
Subjt: SRSRSYSRSYSR
|
|
| A0A6J1KYI3 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 isoform X3 | 3.6e-88 | 84.43 | Show/hide |
Query: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRGRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELDG
MRGRSYSYSPSPPRSYGRR RS SPRG GGR RDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFG+FGPLKDIYLPRDYYSG+PRGFGFVQ++D ADAADAKYELDG
Subjt: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRGRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELDG
Query: EVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSR--SPRGRRYREQSYLRSPYDPRGRSYSR
+VLLG ELTVVFAEENRKRPE+MRARDSSRGRSYSY R SPL+YS+SP + RKYSRSPEYYSPARSRRYSR SPR + +RE+SY RSPY+ R R YSR
Subjt: EVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSR--SPRGRRYREQSYLRSPYDPRGRSYSR
Query: SRSRSYSRSYSR
SRSRS SRSYSR
Subjt: SRSRSYSRSYSR
|
|
| A0A6J1L0E4 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 isoform X2 | 3.6e-88 | 84.43 | Show/hide |
Query: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRGRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELDG
MRGRSYSYSPSPPRSYGRR RS SPRG GGR RDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFG+FGPLKDIYLPRDYYSG+PRGFGFVQ++D ADAADAKYELDG
Subjt: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRGRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELDG
Query: EVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSR--SPRGRRYREQSYLRSPYDPRGRSYSR
+VLLG ELTVVFAEENRKRPE+MRARDSSRGRSYSY R SPL+YS+SP + RKYSRSPEYYSPARSRRYSR SPR + +RE+SY RSPY+ R R YSR
Subjt: EVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSR--SPRGRRYREQSYLRSPYDPRGRSYSR
Query: SRSRSYSRSYSR
SRSRS SRSYSR
Subjt: SRSRSYSRSYSR
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| O75494 Serine/arginine-rich splicing factor 10 | 1.6e-24 | 41.44 | Show/hide |
Query: TSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELDGEVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSY
TSL VRN+ D R EDLR FGR+GP+ D+Y+P D+Y+ PRGF +VQF D DA DA + LD + + G ++ + FA+ +RK P +M+A++ S S
Subjt: TSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELDGEVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSY
Query: SRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEY-------YSPARSRRYSRSPRGRRYREQSYLRSPYDPRGRSYSRSRSRSYSRSYSR
+ R SRS Y+R+ SRS + YSP SR R R R + + + R RS+SRS+S S SRS S+
Subjt: SRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEY-------YSPARSRRYSRSPRGRRYREQSYLRSPYDPRGRSYSRSRSRSYSRSYSR
|
|
| Q1PDV2 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 6.0e-32 | 47.7 | Show/hide |
Query: RGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRGRGG----RRRDLPTS----------LLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVD
R RS SYSP P R RSP PR R G R R+ P+S LL+RNL D RP DLR F RFGPLKDIYLPR+YY+GEPRGFGFV++
Subjt: RGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRGRGG----RRRDLPTS----------LLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVD
Query: AADAADAKYELDGEVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSR--RHSPLRYSRS-------PHYDRKYS--RSPEYYSP-ARSRRYSRSPR
A DAA+A ++ +V+ G E+ +VFAEENRK P+EMR + + GR Y R SP R RS P + ++S R + YSP RSR SRSP
Subjt: AADAADAKYELDGEVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSR--RHSPLRYSRS-------PHYDRKYS--RSPEYYSP-ARSRRYSRSPR
Query: GRRYRE--QSYLRSPYDP------RGRSYSRSRSRSYSR
R RE RSP + R R SRSRSRS SR
Subjt: GRRYRE--QSYLRSPYDP------RGRSYSRSRSRSYSR
|
|
| Q8L3X8 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30 | 2.4e-33 | 47.3 | Show/hide |
Query: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSP----------RGRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAAD
MR S Y P R YG R RSP P G GGRR SLLVRN+ DCRPE+LR F RFGP++D+Y+PRDYYSG+PRGF FV+FVDA D
Subjt: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSP----------RGRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAAD
Query: AADAKYELDGEVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSRSPRGRRYREQSYLRSPY-
A +A+ ++ G E+TVV A E+RKRPEEMR + +R R S SR S R SRS R SRSP S +RS RYR +SY +P
Subjt: AADAKYELDGEVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSRSPRGRRYREQSYLRSPY-
Query: ---DPRGRSYSRSRSRSYSRSY
PRG RSYS Y
Subjt: ---DPRGRSYSRSRSRSYSRSY
|
|
| Q9LHP2 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A | 4.5e-56 | 63.18 | Show/hide |
Query: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRGR--GGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYEL
MRGR SY+PSPPR YGRR RSPSPRGR G R DLPTSLLVRNLRHDCR EDLR F +FGP+KDIYLPRDYY+G+PRGFGF+QF+D ADAA+AK+++
Subjt: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRGR--GGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYEL
Query: DGEVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSP---HYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSR--SPRGRRY-REQSYLRSP--YD
DG +LLG ELTVVFAEENRK+P EMR RD + RR SP RYSRSP R SRS Y SP R SR SP+ RRY +E+SY RSP
Subjt: DGEVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSP---HYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSR--SPRGRRY-REQSYLRSP--YD
Query: PRGRSYSRSRSRSYSRSYSR
R RS S R +S+SRS R
Subjt: PRGRSYSRSRSRSYSRSYSR
|
|
| Q9SEU4 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 | 7.0e-57 | 64.41 | Show/hide |
Query: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRGR-GGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELD
MRGR SY+PSPPR YGRR RSPSPRGR GGR RDLPTSLLVRNLRHDCR EDLR F +FGP+KDIYLPRDYY+G+PRGFGFVQF+D ADAADAK+ +D
Subjt: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRGR-GGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELD
Query: GEVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRS----PHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSR--SPRGRRY-REQSYLRSPYD--
G +LLG ELTVVFAEENRK+P EMRAR+ GR + RR P YSRS P R SRS +YYSP R + R SPR RY +SY RSP
Subjt: GEVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRS----PHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSR--SPRGRRY-REQSYLRSPYD--
Query: PRGRSYS--RSRSRSYSRSYSR
RGRS + R +SRS S S R
Subjt: PRGRSYS--RSRSRSYSRSYSR
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G55310.1 SC35-like splicing factor 33 | 5.0e-58 | 64.41 | Show/hide |
Query: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRGR-GGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELD
MRGR SY+PSPPR YGRR RSPSPRGR GGR RDLPTSLLVRNLRHDCR EDLR F +FGP+KDIYLPRDYY+G+PRGFGFVQF+D ADAADAK+ +D
Subjt: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRGR-GGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELD
Query: GEVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRS----PHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSR--SPRGRRY-REQSYLRSPYD--
G +LLG ELTVVFAEENRK+P EMRAR+ GR + RR P YSRS P R SRS +YYSP R + R SPR RY +SY RSP
Subjt: GEVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRS----PHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSR--SPRGRRY-REQSYLRSPYD--
Query: PRGRSYS--RSRSRSYSRSYSR
RGRS + R +SRS S S R
Subjt: PRGRSYS--RSRSRSYSRSYSR
|
|
| AT1G55310.2 SC35-like splicing factor 33 | 3.8e-58 | 64.06 | Show/hide |
Query: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRGR-GGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELD
MRGR SY+PSPPR YGRR RSPSPRGR GGR RDLPTSLLVRNLRHDCR EDLR F +FGP+KDIYLPRDYY+G+PRGFGFVQF+D ADAADAK+ +D
Subjt: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRGR-GGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELD
Query: GEVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRS----PHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSR--SPRGRRY-REQSYLRSPYDPR
G +LLG ELTVVFAEENRK+P EMRAR+ GR + RR P YSRS P R SRS +YYSP R + R SPR RY +SY RSP
Subjt: GEVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRS----PHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSR--SPRGRRY-REQSYLRSPYDPR
Query: GRSYSRSRSRSYSRSYS
R S + R SRS S
Subjt: GRSYSRSRSRSYSRSYS
|
|
| AT1G55310.3 SC35-like splicing factor 33 | 6.1e-56 | 60.68 | Show/hide |
Query: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRGR-GGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSG------------EPRGFGFVQFVD
MRGR SY+PSPPR YGRR RSPSPRGR GGR RDLPTSLLVRNLRHDCR EDLR F +FGP+KDIYLPRDYY+G +PRGFGFVQF+D
Subjt: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRGR-GGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSG------------EPRGFGFVQFVD
Query: AADAADAKYELDGEVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRS----PHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSR--SPRGRRY-R
ADAADAK+ +DG +LLG ELTVVFAEENRK+P EMRAR+ G + RR P YSRS P R SRS +YYSP R + R SPR RY
Subjt: AADAADAKYELDGEVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRS----PHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSR--SPRGRRY-R
Query: EQSYLRSPYD--PRGRSYS--RSRSRSYSRSYSR
+SY RSP RGRS + R +SRS S S R
Subjt: EQSYLRSPYD--PRGRSYS--RSRSRSYSRSYSR
|
|
| AT3G13570.1 SC35-like splicing factor 30A | 3.2e-57 | 63.18 | Show/hide |
Query: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRGR--GGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYEL
MRGR SY+PSPPR YGRR RSPSPRGR G R DLPTSLLVRNLRHDCR EDLR F +FGP+KDIYLPRDYY+G+PRGFGF+QF+D ADAA+AK+++
Subjt: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRGR--GGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYEL
Query: DGEVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSP---HYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSR--SPRGRRY-REQSYLRSP--YD
DG +LLG ELTVVFAEENRK+P EMR RD + RR SP RYSRSP R SRS Y SP R SR SP+ RRY +E+SY RSP
Subjt: DGEVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSP---HYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSR--SPRGRRY-REQSYLRSP--YD
Query: PRGRSYSRSRSRSYSRSYSR
R RS S R +S+SRS R
Subjt: PRGRSYSRSRSRSYSRSYSR
|
|
| AT3G55460.1 SC35-like splicing factor 30 | 1.7e-34 | 47.3 | Show/hide |
Query: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSP----------RGRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAAD
MR S Y P R YG R RSP P G GGRR SLLVRN+ DCRPE+LR F RFGP++D+Y+PRDYYSG+PRGF FV+FVDA D
Subjt: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSP----------RGRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAAD
Query: AADAKYELDGEVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSRSPRGRRYREQSYLRSPY-
A +A+ ++ G E+TVV A E+RKRPEEMR + +R R S SR S R SRS R SRSP S +RS RYR +SY +P
Subjt: AADAKYELDGEVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSRSPRGRRYREQSYLRSPY-
Query: ---DPRGRSYSRSRSRSYSRSY
PRG RSYS Y
Subjt: ---DPRGRSYSRSRSRSYSRSY
|
|
