; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Pay0019320 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome

Gene IDPay0019320
OrganismCucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
DescriptionTPRXL protein
Genome locationchr03:20373407..20374528
RNA-Seq ExpressionPay0019320
SyntenyPay0019320
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8646577.1 hypothetical protein Csa_005771 [Cucumis sativus]5.5e-10895.2Show/hide
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XP_016901982.1 PREDICTED: putative uncharacterized protein DDB_G0277255 [Cucumis melo]9.9e-11899.14Show/hide
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XP_022134140.1 putative protein TPRXL [Momordica charantia]2.6e-7372.77Show/hide
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XP_038885974.1 putative protein TPRXL [Benincasa hispida]6.0e-9989.27Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K7T8 Uncharacterized protein7.4e-11195.28Show/hide
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A0A1S4E178 Uncharacterized protein4.8e-11899.14Show/hide
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A0A5A7UC51 Putative serine-rich protein4.8e-11899.14Show/hide
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A0A6J1BX95 Uncharacterized protein1.2e-7372.77Show/hide
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        S RAS F GCYQLVSVK A LS+VGHGSA RGT+N
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A0A6J1K022 uncharacterized serine-rich protein C215.13-like1.7e-6776.73Show/hide
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        KE NS  NSSFRVYYGGATGAIPFRWESRPGTPKHT+SDTSIPPLTPPPSY+SSSHSTSK S KPT  +SIF     RKSRT  SFS SS SSSSSSS  
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        SW    SSS SSPS FVRPKFFK RR FS+ PSLPFE +FDD +GDE V    +P+SPTS LCFGGGSS  RASLF GCYQLVSVK ALLSIVGHGSASR
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Query:  GT
        GT
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G06930.1 unknown protein3.6e-0945.92Show/hide
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        YYGG++ A+PF+WES+PGTP+           ++ SD + P   PLTPPPSYF +S S++K  S P   +++F  L   K+R+ PS  +SS SSSSSS
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AT2G40475.1 unknown protein8.1e-1739.61Show/hide
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        ++ + KE +   +SS   YYGGA  ++PF WE+RPGTPKH  FS++  +PPLTPPPSY+SSS S+ +K S   T+  + F +    +  + PSFS SS S
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        SSSSSS         SSSS PS        + R+ +S   S    Y  +D D +E+V+     +SPTS LC+  G S           + S+K+AL S++
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Query:  GHGSASR
         HGS+ +
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AT3G56260.2 unknown protein7.8e-1243.48Show/hide
Query:  YYGGATGAIPFRWESRPGTPK-HTFSDTSIP-PLTPPPSYFSSSHSTSKASSKPTLLSSIFPRLTPRKSRTFPSFS----SSSGSSSSSSSLASWSSSFS
        YYGGA  +IPF WESRPGTPK H  SD+S+P PLTPPPSY+SS        S P   S +  +L+  K  +F  FS    S+ GS  ++SS  SWSS+ S
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Query:  SSSSSPSPFVRPKFFKRRRHFSDIPSLPFEYTFDDKDGDEVVAGSTAPNSPTSIL-CFGGGSSGRASLFGGCYQLVSVKKALLS
        SSS S SP    K  KR  H    P L   Y  D+             +SPTS L C  GG  G +S  G      SV +AL S
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AT5G01790.1 unknown protein5.1e-1159.65Show/hide
Query:  SFRV-YYGGATGAIPFRWESRPGTPKHTFSD-TSIPPLTPPPSYFSSSHSTSKASSK
        SFR+ YY GA GA+PF WES PGTPKH  S+  ++PPLTPPPS+FS S    +  SK
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAAACTCAAAACTACGACCAAATCTCTCAAAAATCTTCCCAAATTACCAAACATGAAGATAGATTCTTCACTCGAGCCCTATCCAAGGAGCTCAATTCCACCACCAA
CTCCTCTTTTCGAGTCTATTACGGCGGCGCCACTGGTGCTATTCCCTTCCGGTGGGAGTCCCGACCGGGAACCCCAAAGCATACTTTTTCAGACACTTCAATCCCTCCTC
TTACTCCTCCTCCGTCTTACTTTTCCTCTTCACATTCTACTTCCAAAGCCTCTTCCAAACCAACCCTTTTGAGCTCGATTTTTCCTCGCCTTACACCAAGGAAATCTCGA
ACTTTCCCATCTTTCTCCTCCTCTTCTGGCTCCTCTTCCTCATCCTCTTCATTAGCTTCATGGTCATCCTCTTTCTCATCGTCCTCCTCATCTCCCTCTCCTTTCGTTAG
ACCTAAATTCTTCAAACGTCGTCGTCACTTCTCGGATATTCCAAGCTTACCGTTTGAGTATACTTTTGACGATAAAGACGGAGACGAGGTGGTGGCCGGGAGTACTGCTC
CGAATTCTCCTACTTCAATTTTGTGCTTTGGTGGTGGTTCTTCAGGCAGAGCTTCATTGTTTGGAGGTTGTTATCAGTTAGTGAGTGTGAAGAAAGCTTTGTTGTCCATT
GTTGGCCATGGATCTGCAAGTAGAGGTACTCTTAATGATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAGCATTTAGAAACCCAAATAGCTTGTCCTAGCTACTTCATATACCACCCAATTCTTTTTCCCTCCATTTGTCATTATTATATATCAATCAAATTCAGCTGCTTTGGATC
TTGAAATCCAATTCTTAGATCCCTGGAAACACAGAAACAGAAGAGATCTCATTTTCATATATCGTTTTTGGGCTTCAAGATGCAAACTCAAAACTACGACCAAATCTCTC
AAAAATCTTCCCAAATTACCAAACATGAAGATAGATTCTTCACTCGAGCCCTATCCAAGGAGCTCAATTCCACCACCAACTCCTCTTTTCGAGTCTATTACGGCGGCGCC
ACTGGTGCTATTCCCTTCCGGTGGGAGTCCCGACCGGGAACCCCAAAGCATACTTTTTCAGACACTTCAATCCCTCCTCTTACTCCTCCTCCGTCTTACTTTTCCTCTTC
ACATTCTACTTCCAAAGCCTCTTCCAAACCAACCCTTTTGAGCTCGATTTTTCCTCGCCTTACACCAAGGAAATCTCGAACTTTCCCATCTTTCTCCTCCTCTTCTGGCT
CCTCTTCCTCATCCTCTTCATTAGCTTCATGGTCATCCTCTTTCTCATCGTCCTCCTCATCTCCCTCTCCTTTCGTTAGACCTAAATTCTTCAAACGTCGTCGTCACTTC
TCGGATATTCCAAGCTTACCGTTTGAGTATACTTTTGACGATAAAGACGGAGACGAGGTGGTGGCCGGGAGTACTGCTCCGAATTCTCCTACTTCAATTTTGTGCTTTGG
TGGTGGTTCTTCAGGCAGAGCTTCATTGTTTGGAGGTTGTTATCAGTTAGTGAGTGTGAAGAAAGCTTTGTTGTCCATTGTTGGCCATGGATCTGCAAGTAGAGGTACTC
TTAATGATTAGTTGTGTGAATGAAATTAGTTAATTCTCATAAGTTTTTCTTTTTCTTTTCCTTTTTTTGGGTTCAATCTTCTCTCATTGTGCATTTGTGTTTGTGGAGTG
AAATGTTATATTATATGGAACAGAAGTTCTTGAATTGATGTTTTTTGGGCTATTAGGCTCAAATTAAACATTAAATTTCTTGAATGTGACATATCTCATGTCAAATTATA
ACAAAAAATCAAAACATTTTTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MQTQNYDQISQKSSQITKHEDRFFTRALSKELNSTTNSSFRVYYGGATGAIPFRWESRPGTPKHTFSDTSIPPLTPPPSYFSSSHSTSKASSKPTLLSSIFPRLTPRKSR
TFPSFSSSSGSSSSSSSLASWSSSFSSSSSSPSPFVRPKFFKRRRHFSDIPSLPFEYTFDDKDGDEVVAGSTAPNSPTSILCFGGGSSGRASLFGGCYQLVSVKKALLSI
VGHGSASRGTLND