| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG7022543.1 Serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma] | 2.1e-122 | 88.4 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSV
I KGKISE FPKSR+RSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRR RSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY DERR+RS
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSV
Query: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSP------------SPRRSPSPRRSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSD
S SRSRGRSRSV+S SPGRRSP SPRRS SP+RSLSPRRSPSPR ESPERNG+ GGRSPT RSVSPRG+PADSRSPSPQNSD
Subjt: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSP------------SPRRSPSPRRSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSD
|
|
| XP_004136874.2 serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Cucumis sativus] | 5.6e-139 | 97.53 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSV
IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRR+RDDYRD+DYRRRSRSRSRSRSLD++DRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRS+
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSV
Query: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSDDK
SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPR+ESPERNGNG GRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSDDK
Subjt: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSDDK
|
|
| XP_008455209.1 PREDICTED: serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Cucumis melo] | 1.8e-142 | 100 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSV
IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSV
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSV
Query: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSDDK
SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSDDK
Subjt: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSDDK
|
|
| XP_022927926.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like [Cucurbita moschata] | 7.3e-123 | 88.74 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSV
I KGKISE FPKSR+RSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRR RSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY DERR+RS
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSV
Query: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPR------------RSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSD
S SRSRGRSRSV+S SPGRRSPSPRRS SPR RSLSPRRSPSPR ESPERNG+ GGRSPT RSVSPRG+PADSRSPSPQNSD
Subjt: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPR------------RSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSD
|
|
| XP_038888048.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Benincasa hispida] | 4.1e-134 | 95.76 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDER--RSR
IHKGKISEAFPKSRY+SRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRS DRSDRDRRGRE+ERER++RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDER RSR
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDER--RSR
Query: SVSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSD
S SRSRSRGRSRSVDSGSPGR+SPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPR SPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRP DSRSPSPQNSD
Subjt: SVSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSD
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0K7C0 RRM domain-containing protein | 2.7e-139 | 97.53 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSV
IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRR+RDDYRD+DYRRRSRSRSRSRSLD++DRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRS+
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSV
Query: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSDDK
SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPR+ESPERNGNG GRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSDDK
Subjt: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSDDK
|
|
| A0A1S3C0I4 serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 8.9e-143 | 100 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSV
IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSV
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSV
Query: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSDDK
SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSDDK
Subjt: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSDDK
|
|
| A0A6J1CKN2 serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 2.3e-122 | 90.81 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDER--RSR
IHKGKISEAF K RYRSRSRSPRRRYRDD RDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDER RSR
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDER--RSR
Query: SVSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSD
S SRS+SRG+SRSVDS SPG RRS SPRRSLSP+RSPSPR ESP RNG+ GGR+PT RSVSPRG+PADSRSPSPQNSD
Subjt: SVSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSD
|
|
| A0A6J1EIV3 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like | 3.5e-123 | 88.74 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSV
I KGKISE FPKSR+RSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRR RSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY DERR+RS
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSV
Query: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPR------------RSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSD
S SRSRGRSRSV+S SPGRRSPSPRRS SPR RSLSPRRSPSPR ESPERNG+ GGRSPT RSVSPRG+PADSRSPSPQNSD
Subjt: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPR------------RSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSD
|
|
| A0A6J1JE82 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like | 5.6e-121 | 86.29 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSV
I KGKISE FPKSR+RSRSRSPRRRYRD+YRDRDYRR RSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY DERR+RS
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSV
Query: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPR------------------RSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSD
S SRSRGRSRSV+S SPGRRSPSPRRS SPR RSLSPRRSPSPR ESPERNG+ GGRSPT RSVSPRG+ ADSRSPSPQNSD
Subjt: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPR------------------RSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPSPQNSD
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P30352 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 2.0e-27 | 45.19 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYG--PNAERI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A++ +DG ++DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYG--PNAERI
Query: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSVS
+G + S Y RSRSPRR RRRSRSRSRSRS RS R R R + R R R RSRS S + R + +S SVS
Subjt: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSVS
Query: RSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSP
RSRSR RSRS P S R S S RS SP +SP
Subjt: RSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSP
|
|
| Q01130 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 1.0e-26 | 44.77 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYG--PNAERI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A++ +DG ++DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYG--PNAERI
Query: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSVS
+G + Y RSRSPRR RRRSRSRSRSRS RS R R R + R R R RSRS S + R + +S SVS
Subjt: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSVS
Query: RSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSP
RSRSR RSRS P S R S S RS SP +SP
Subjt: RSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSP
|
|
| Q06A98 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 7.8e-27 | 44.77 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYG--PNAERI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A++ +DG ++DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYG--PNAERI
Query: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSVS
+G + Y RSRSPRR RRRSRSRSRSRS RS R R R + R R R RSRS S + R + +S SVS
Subjt: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSVS
Query: RSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSP
RSRSR RSRS P S R S S RS SP +SP
Subjt: RSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSP
|
|
| Q3MHR5 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 1.0e-26 | 44.77 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYG--PNAERI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A++ +DG ++DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYG--PNAERI
Query: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSVS
+G + Y RSRSPRR RRRSRSRSRSRS RS R R R + R R R RSRS S + R + +S SVS
Subjt: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSVS
Query: RSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSP
RSRSR RSRS P S R S S RS SP +SP
Subjt: RSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSP
|
|
| Q9FMG4 Serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 3.7e-69 | 61.39 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDI+DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVD+FIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KAVERLDG +VDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRR
I KG++ E PKSR RSRSPRRR RDDYR++DYR+RSRSRS DRR R E++RDHRRR+RS R
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRR
Query: PSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSVSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSP---------SPRRSPSPRRSLSPR------RSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRS
SPD K R RGRYD+E RS S S S S R RS S SP + SP S RSPSPRRSLSPR SPS ++ SPER N RSP+ S
Subjt: PSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSVSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSP---------SPRRSPSPRRSLSPR------RSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRS
Query: VSP-RGRPADSRSPSP
+P R A SRS SP
Subjt: VSP-RGRPADSRSPSP
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G55310.1 SC35-like splicing factor 33 | 5.0e-13 | 38.83 | Show/hide |
Query: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYR
SLLV N+ +DL F ++G V DI++PRD TGD RGF FV++ +A A +DG ++ GRE+TV FA+ R
Subjt: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYR
Query: SRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDH------RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSVSRSRSRGRSR
+ R R R R RD RRR+ R SRS RS RRGR R R D+ R RSISPR D + R D R RS++ R + RS
Subjt: SRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDH------RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSVSRSRSRGRSR
Query: SVDSGSPGRRSPSPRRSPSPR--RSLSPRRSPS---PRDESPERNGNGGGRSPT-SRSVSPRGRPAD-SRSPS
S RSP RSPSP+ RS+SPRRS S R SP R+ P SRS SP G D RSPS
Subjt: SVDSGSPGRRSPSPRRSPSPR--RSLSPRRSPS---PRDESPERNGNGGGRSPT-SRSVSPRGRPAD-SRSPS
|
|
| AT1G55310.3 SC35-like splicing factor 33 | 7.8e-14 | 36.14 | Show/hide |
Query: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTG------------DSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAERIHKG
SLLV N+ +DL F ++G V DI++PRD TG D RGF FV++ +A A +DG ++ GRE+TV FA+ N ++ +
Subjt: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTG------------DSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAERIHKG
Query: KISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDH------RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSR
+ E SR+R R R+P R Y S RS RRGR R R D+ R RSISPR D + R D R R
Subjt: KISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDH------RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSR
Query: SVSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPR--RSLSPRRSPS---PRDESPERNGNGGGRSPT-SRSVSPRGRPAD-SRSPS
S++ R + RS S RSP RSPSP+ RS+SPRRS S R SP R+ P SRS SP G D RSPS
Subjt: SVSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPR--RSLSPRRSPS---PRDESPERNGNGGGRSPT-SRSVSPRGRPAD-SRSPS
|
|
| AT3G13570.1 SC35-like splicing factor 30A | 1.1e-12 | 37.28 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAERIHK
FG S D+ SLLV N+ +DL F ++G V DI++PRD TGD RGF F+++ +A +A ++DG ++ GRE+TV FA+ N ++ +
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAERIHK
Query: GKISEAFPKS-RYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSVSR
+ + +S R++ R RSP R R RR RSRSRSR + R +SRS+SP+ RY+ E RS SR
Subjt: GKISEAFPKS-RYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSVSR
Query: SRSRGRSRSVDSGSPGR---RSPSPRRSPSPR--RSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPS
S SR V SGSPGR S SPRRS SPR RS +P ++ R +SP + RSPT PRG RSPS
Subjt: SRSRGRSRSVDSGSPGR---RSPSPRRSPSPR--RSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPADSRSPS
|
|
| AT5G64200.1 ortholog of human splicing factor SC35 | 2.6e-70 | 61.39 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDI+DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVD+FIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KAVERLDG +VDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRR
I KG++ E PKSR RSRSPRRR RDDYR++DYR+RSRSRS DRR R E++RDHRRR+RS R
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRR
Query: PSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSVSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSP---------SPRRSPSPRRSLSPR------RSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRS
SPD K R RGRYD+E RS S S S S R RS S SP + SP S RSPSPRRSLSPR SPS ++ SPER N RSP+ S
Subjt: PSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSVSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSP---------SPRRSPSPRRSLSPR------RSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRS
Query: VSP-RGRPADSRSPSP
+P R A SRS SP
Subjt: VSP-RGRPADSRSPSP
|
|
| AT5G64200.2 ortholog of human splicing factor SC35 | 2.6e-70 | 61.39 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDI+DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVD+FIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KAVERLDG +VDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRR
I KG++ E PKSR RSRSPRRR RDDYR++DYR+RSRSRS DRR R E++RDHRRR+RS R
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRR
Query: PSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSVSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSP---------SPRRSPSPRRSLSPR------RSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRS
SPD K R RGRYD+E RS S S S S R RS S SP + SP S RSPSPRRSLSPR SPS ++ SPER N RSP+ S
Subjt: PSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSVSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSP---------SPRRSPSPRRSLSPR------RSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRS
Query: VSP-RGRPADSRSPSP
+P R A SRS SP
Subjt: VSP-RGRPADSRSPSP
|
|
