; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Pay0019949 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome

Gene IDPay0019949
OrganismCucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
Descriptionextensin
Genome locationchr11:31422016..31423270
RNA-Seq ExpressionPay0019949
SyntenyPay0019949
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0039837.1 extensin [Cucumis melo var. makuwa]9.8e-21199.74Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KAD5 Uncharacterized protein3.4e-20195.23Show/hide
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A0A6J1JLM5 extensin-like1.3e-16878.76Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9FPQ6 Vegetative cell wall protein gp15.7e-0444.93Show/hide
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Q9T0K5 Leucine-rich repeat extensin-like protein 33.6e-0635.37Show/hide
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Query:  -----PSFPSPPLP---PLPPLPPLPPVPFFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPP----SPPQPSTPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSPFSPPPPPP---
             P  PSPP P   P PP PP PPV + P P  P PP  P   PP PP  P PP    SPP PS PPPPPP     P    P   P   PPPPP   
Subjt:  -----PSFPSPPLP---PLPPLPPLPPVPFFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPP----SPPQPSTPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSPFSPPPPPP---

Query:  SSPPPFSLSDPRTWIPHLPPFSP--PPPPAFDPRDPRTWIPNIPPFSPSPPPAFNPRDPRSWIPRIPPFFPPPPPSFDLRDPRTWIPHLPPSPP
        S PPP S +    +    PP  P  PPPP F P  P  +  + PP   S PP  +P  P S  P I P+  PPPP   +  P     + PP PP
Subjt:  SSPPPFSLSDPRTWIPHLPPFSP--PPPPAFDPRDPRTWIPNIPPFSPSPPPAFNPRDPRSWIPRIPPFFPPPPPSFDLRDPRTWIPHLPPSPP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G26960.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein1.2e-3342.77Show/hide
Query:  LLLLLVLTSFFTSLRIAEALTSVTRITIVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDG
        +LL  +L +  +S   +        ITI+G VYCD C  NS SKHSYF+ GV+V + C+F+A +    E + FS NRTT+++G+Y++ I S+D   C D 
Subjt:  LLLLLVLTSFFTSLRIAEALTSVTRITIVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDG

Query:  MTMQSFCQASLIGSPS---EVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGSK
         ++ S CQASLIG  +     CN+PG RTT++++  KS+Q N C++  NAL++RP K++ +LCG K
Subjt:  MTMQSFCQASLIGSPS---EVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGSK

AT4G13340.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein2.5e-0735.37Show/hide
Query:  PSEVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCI------FSLNALSYRPMKKNESLCG---SKKEKNPDPLTSSKFFLPF------FPPYSLPFPFPPLPPF---
        P+ +C +P L   +   +  + +  +C+         N L  RP +++   C    S+   N    +  +   P        PP SLP P PP P F   
Subjt:  PSEVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCI------FSLNALSYRPMKKNESLCG---SKKEKNPDPLTSSKFFLPF------FPPYSLPFPFPPLPPF---

Query:  -----PSFPSPPLP---PLPPLPPLPPVPFFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPP----SPPQPSTPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSPFSPPPPPP---
             P  PSPP P   P PP PP PPV + P P  P PP  P   PP PP  P PP    SPP PS PPPPPP     P    P   P   PPPPP   
Subjt:  -----PSFPSPPLP---PLPPLPPLPPVPFFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPP----SPPQPSTPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSPFSPPPPPP---

Query:  SSPPPFSLSDPRTWIPHLPPFSP--PPPPAFDPRDPRTWIPNIPPFSPSPPPAFNPRDPRSWIPRIPPFFPPPPPSFDLRDPRTWIPHLPPSPP
        S PPP S +    +    PP  P  PPPP F P  P  +  + PP   S PP  +P  P S  P I P+  PPPP   +  P     + PP PP
Subjt:  SSPPPFSLSDPRTWIPHLPPFSP--PPPPAFDPRDPRTWIPNIPPFSPSPPPAFNPRDPRSWIPRIPPFFPPPPPSFDLRDPRTWIPHLPPSPP

AT5G13140.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein2.1e-4642.76Show/hide
Query:  ISLLLLLVLTSFFTSLRIAE---------ALTSVTRITIVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEI
        + LL LL L S  T   +           +L   +RIT+VG VYCDTC  N+ S+ SYFL GV+VH+ C+F+A +PK AE++  SVNRTT++ GVY+LEI
Subjt:  ISLLLLLVLTSFFTSLRIAE---------ALTSVTRITIVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEI

Query:  PSVDGINCVDGMTMQSFCQASLIGSPSE---VCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGS-------KKEKNPDPLTSSKFFLP
        P VDGI+CVDG+ + S C A ++ + S+    C++P  +T + E+S+KSKQD +CI+SL+ALSY+P  KN SLCG+       K EK       SKFF P
Subjt:  PSVDGINCVDGMTMQSFCQASLIGSPSE---VCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGS-------KKEKNPDPLTSSKFFLP

Query:  FFPPYSLPFPFPPLPPFPSFPSPPLPPLPPLPPLPPVPFFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPPSPPQPSTPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSPFSP
        +  PY  P+P+           P LPPLP LPP P  PF         PSLPF  P L                   P F   +P TWIPY+  F P
Subjt:  FFPPYSLPFPFPPLPPFPSFPSPPLPPLPPLPPLPPVPFFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPPSPPQPSTPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSPFSP

AT5G41050.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein2.6e-3646.11Show/hide
Query:  ISLLLLLVLTSFFT-SLRIAEALTSVTRITIVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINC
        I LLLLL L S  + SL+ + A  +  +IT++G VYCD C +NS S HSYF+PGV+V + C+F + + +  E + FS NRTT++ G+Y+L+I S++G+ C
Subjt:  ISLLLLLVLTSFFT-SLRIAEALTSVTRITIVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINC

Query:  VDGM---TMQSFCQASLIGSPSEVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCG
               ++ + CQASLIG   + CNVPG RTT+E++  KSK  NLC++   AL++RP++KN  LCG
Subjt:  VDGM---TMQSFCQASLIGSPSEVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTTCTTATGGATCCCACCATTTCTCTCCTTCTTCTCCTTGTTTTAACATCTTTCTTCACTAGTTTGCGAATAGCTGAAGCTCTAACGTCAGTCACTCGAATCACAAT
AGTGGGCGCAGTTTATTGTGACACATGTTTGAGCAACAGTGTCTCCAAACACAGCTACTTCTTGCCTGGTGTGGATGTTCATTTACAGTGCAAATTCAGAGCAATTGCTC
CCAAAATGGCGGAGCAAATGGCCTTCTCTGTCAACAGAACAACAGATAAATATGGAGTATATAGATTGGAAATTCCATCTGTGGATGGAATCAATTGTGTTGATGGTATG
ACAATGCAGTCATTTTGCCAGGCAAGCTTAATAGGAAGCCCATCTGAAGTTTGCAATGTCCCAGGTTTAAGAACTACTTCGGAAGAGATATCAGTCAAGTCTAAGCAAGA
TAATCTATGTATATTCAGCTTAAATGCTTTGAGTTATAGGCCAATGAAGAAGAATGAAAGCTTATGCGGGAGTAAGAAAGAGAAAAATCCAGATCCCTTGACCTCCTCAA
AGTTTTTTCTCCCTTTCTTCCCTCCTTATTCCCTCCCTTTCCCCTTTCCTCCTCTTCCACCATTCCCTTCCTTTCCTTCACCTCCACTTCCTCCACTGCCTCCACTGCCC
CCACTGCCCCCTGTTCCATTTTTTCCTCTCCCTACTTGTCCTAACCCACCATCTTTACCATTTCCTTTCCCACCTTTGCCTCCTTTATTTCCTTCACCTCCAAGTCCACC
TCAACCATCTACACCACCTCCGCCACCCCCATTTAGTCTCAGTGATCCAAGGACCTGGATACCCTATGTTTCTCCATTTTCTCCTCCACCGCCTCCGCCATCATCACCAC
CTCCATTCAGTCTCAGCGATCCAAGAACCTGGATACCCCATCTTCCTCCATTTTCCCCTCCCCCACCTCCTGCTTTCGATCCCCGAGACCCGAGAACCTGGATTCCCAAT
ATCCCTCCATTTTCTCCTTCCCCACCTCCTGCATTTAATCCTAGAGACCCCAGATCATGGATTCCTCGTATTCCTCCATTTTTCCCTCCCCCACCTCCATCATTCGACCT
TAGAGACCCCAGAACATGGATACCCCATTTGCCACCATCCCCTCCACAAGGCCCTCAAAATCAAAAACCCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTTTCTTATGGATCCCACCATTTCTCTCCTTCTTCTCCTTGTTTTAACATCTTTCTTCACTAGTTTGCGAATAGCTGAAGCTCTAACGTCAGTCACTCGAATCACAAT
AGTGGGCGCAGTTTATTGTGACACATGTTTGAGCAACAGTGTCTCCAAACACAGCTACTTCTTGCCTGGTGTGGATGTTCATTTACAGTGCAAATTCAGAGCAATTGCTC
CCAAAATGGCGGAGCAAATGGCCTTCTCTGTCAACAGAACAACAGATAAATATGGAGTATATAGATTGGAAATTCCATCTGTGGATGGAATCAATTGTGTTGATGGTATG
ACAATGCAGTCATTTTGCCAGGCAAGCTTAATAGGAAGCCCATCTGAAGTTTGCAATGTCCCAGGTTTAAGAACTACTTCGGAAGAGATATCAGTCAAGTCTAAGCAAGA
TAATCTATGTATATTCAGCTTAAATGCTTTGAGTTATAGGCCAATGAAGAAGAATGAAAGCTTATGCGGGAGTAAGAAAGAGAAAAATCCAGATCCCTTGACCTCCTCAA
AGTTTTTTCTCCCTTTCTTCCCTCCTTATTCCCTCCCTTTCCCCTTTCCTCCTCTTCCACCATTCCCTTCCTTTCCTTCACCTCCACTTCCTCCACTGCCTCCACTGCCC
CCACTGCCCCCTGTTCCATTTTTTCCTCTCCCTACTTGTCCTAACCCACCATCTTTACCATTTCCTTTCCCACCTTTGCCTCCTTTATTTCCTTCACCTCCAAGTCCACC
TCAACCATCTACACCACCTCCGCCACCCCCATTTAGTCTCAGTGATCCAAGGACCTGGATACCCTATGTTTCTCCATTTTCTCCTCCACCGCCTCCGCCATCATCACCAC
CTCCATTCAGTCTCAGCGATCCAAGAACCTGGATACCCCATCTTCCTCCATTTTCCCCTCCCCCACCTCCTGCTTTCGATCCCCGAGACCCGAGAACCTGGATTCCCAAT
ATCCCTCCATTTTCTCCTTCCCCACCTCCTGCATTTAATCCTAGAGACCCCAGATCATGGATTCCTCGTATTCCTCCATTTTTCCCTCCCCCACCTCCATCATTCGACCT
TAGAGACCCCAGAACATGGATACCCCATTTGCCACCATCCCCTCCACAAGGCCCTCAAAATCAAAAACCCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MFLMDPTISLLLLLVLTSFFTSLRIAEALTSVTRITIVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGM
TMQSFCQASLIGSPSEVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGSKKEKNPDPLTSSKFFLPFFPPYSLPFPFPPLPPFPSFPSPPLPPLPPLP
PLPPVPFFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPPSPPQPSTPPPPPPFSLSDPRTWIPYVSPFSPPPPPPSSPPPFSLSDPRTWIPHLPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPN
IPPFSPSPPPAFNPRDPRSWIPRIPPFFPPPPPSFDLRDPRTWIPHLPPSPPQGPQNQKP