CuGenDBv2

Gene ID	Pay0020056
Organism	Cucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
Description	Ribonuclease H
Genome location	chr10:23549105..23550684
RNA-Seq Expression	Pay0020056
Synteny	Pay0020056
Gene Ontology terms	GO:0006259 - DNA metabolic process (biological process) GO:0003676 - nucleic acid binding (molecular function) GO:0016787 - hydrolase activity (molecular function) GO:0140640 - catalytic activity, acting on a nucleic acid (molecular function)
InterPro domains	IPR021109 - Aspartic peptidase domain superfamily

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAA0031753.1 gag protease polyprotein [Cucumis melo var. makuwa]

4.3e-171

72.78

Show/hide

Query:  MNQLGISVEELSNSKLVIQGFNQGAQRAIGTVRLEIVIGDLQASTIFHVIDSKTTYKMLLGRPWIHENGIVTSTLHQCFKFYKQRIKKVDADSRPFTKAE
        MNQLGISVEELSNSKLVIQGFNQGAQRAIGTVRLEIVIGDLQASTIFHVIDSKTTYKMLLGRPWIHENGIVTSTLHQCFKFYKQ IKKVDADSRPFTKAE
Subjt:  MNQLGISVEELSNSKLVIQGFNQGAQRAIGTVRLEIVIGDLQASTIFHVIDSKTTYKMLLGRPWIHENGIVTSTLHQCFKFYKQRIKKVDADSRPFTKAE

Query:  SHFADAKFYTKSEDVSEIISTEVPVTKGTFKNEQEMITSKKSNKGNALNSQQNGESTTETKLRAPVAEKIATLQKEVSNPPVLRYIPLSRRKKGESPFAE
        SHFADAKFYTKSEDVSEIISTEVPVTKGTF NEQEMITSKKSNKGNALNSQQNGESTTETKLRAP AEKIATLQKEVSNPPVLRYI LSRRKKGESPF E
Subjt:  SHFADAKFYTKSEDVSEIISTEVPVTKGTFKNEQEMITSKKSNKGNALNSQQNGESTTETKLRAPVAEKIATLQKEVSNPPVLRYIPLSRRKKGESPFAE

Query:  CSKNLTVKNTEILKENFTASLTKIEKGEAKKIEKKDLEAYLPERRTVEGFDPKAYKLMAKAGYDFTT---------------------------------
        CSKNLTVKNTEILKENFTA LTKIEKGEA KIEKKDLEAYLPERRTVEGFDPKAYKLMAKAGYDFTT                                 
Subjt:  CSKNLTVKNTEILKENFTASLTKIEKGEAKKIEKKDLEAYLPERRTVEGFDPKAYKLMAKAGYDFTT---------------------------------

Query:  ------------------------------------------LSTCSSTRLSAFQRLNTNAKKVQSISPTSTTRKSAFKRLSVSVTKGQKKASISVSNKS
                                                  +STCSSTRLSAFQRLNT+AKKV+SISPT TTRKSAFKRLSVSVT+ QKKAS+SVSNKS
Subjt:  ------------------------------------------LSTCSSTRLSAFQRLNTNAKKVQSISPTSTTRKSAFKRLSVSVTKGQKKASISVSNKS

Query:  SLVTGDEEIRSAFPSRMKRKMF------------------------------------------TSEHDIFEEDAEAAPLSLEDG
        SLVTGDEEIRSAFPSRMKRKMF                                          TS+HDIFEEDAEAAPLSLEDG
Subjt:  SLVTGDEEIRSAFPSRMKRKMF------------------------------------------TSEHDIFEEDAEAAPLSLEDG

KAA0047477.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold498G00940 [Cucumis melo var. makuwa]

4.9e-167

67.44

Show/hide

Query:  MNQLGISVEELSNSKLVIQGFNQGAQRAIGTVRLEIVIGDLQASTIFHVIDSKTTYKMLLGRPWIHENGIVTSTLHQCFKFYKQRIKKVDADSRPFTKAE
        MNQLGISVEELSNSKLVIQGFNQGAQRAIGTVRLE+VIGDLQASTIFHVIDS+TTYKMLLGRPWIHENGIVTSTLHQCFKFYKQ IKKVDADSRPFTKAE
Subjt:  MNQLGISVEELSNSKLVIQGFNQGAQRAIGTVRLEIVIGDLQASTIFHVIDSKTTYKMLLGRPWIHENGIVTSTLHQCFKFYKQRIKKVDADSRPFTKAE

Query:  SHFADAKFYTKSEDVSEIISTEVPVTKGTFKNEQEMITSKKSNKGNALNSQQNGESTTETKLRAPVAEKIATLQKEVSNPPVLRYIPLSRRKKGESPFAE
        SHFADAKFYTKSEDVSEIISTEVPVTKGTFKNEQEMITSKKS+KG+ALNSQQNGE TTETKLRAP AEKIATLQKEVSNPPVLRYIPLSRRKKGESPF E
Subjt:  SHFADAKFYTKSEDVSEIISTEVPVTKGTFKNEQEMITSKKSNKGNALNSQQNGESTTETKLRAPVAEKIATLQKEVSNPPVLRYIPLSRRKKGESPFAE

Query:  CSKNLTVKNTEILKENFTASLTKIEKGEAKKIEKKDLEAYLPERRTVEGFDPKAYKLMAKAGYDFTT---------------------------------
        CSKNLTVKNTEILKENFTA LTKIEKGEAKKIEKKDL+AYLPERRTVEGFDPKAYKLMAKAGYDFTT                                 
Subjt:  CSKNLTVKNTEILKENFTASLTKIEKGEAKKIEKKDLEAYLPERRTVEGFDPKAYKLMAKAGYDFTT---------------------------------

Query:  ----------------------------------------------------------------------------LSTCSSTRLSAFQRLNTNAKKVQS
                                                                                    +STCSSTRLSAFQRLNT+AKKV+S
Subjt:  ----------------------------------------------------------------------------LSTCSSTRLSAFQRLNTNAKKVQS

Query:  ISPTSTTRKSAFKRLSVSVTKGQKKASISVSNKSSLVTGDEEIRSAFPSRMKRKMF------------------------------------------TS
        ISPT TTRKSAFKRLSVSVT+ QKKAS+SVSNKSSLVTGDEEIRSAFPSRMKRKMF                                          TS
Subjt:  ISPTSTTRKSAFKRLSVSVTKGQKKASISVSNKSSLVTGDEEIRSAFPSRMKRKMF------------------------------------------TS

Query:  EHDIFEEDAEAAPLSLEDG
        +HDIFEEDAEAAPLSLEDG
Subjt:  EHDIFEEDAEAAPLSLEDG

KAA0065377.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold17G00390 [Cucumis melo var. makuwa]

1.4e-174

70.33

Show/hide

Query:  MNQLGISVEELSNSKLVIQGFNQGAQRAIGTVRLEIVIGDLQASTIFHVIDSKTTYKMLLGRPWIHENGIVTSTLHQCFKFYKQRIKKVDADSRPFTKAE
        MNQLGISVEELSNSKLVIQGFNQGAQRAIGTVRLEIVIGDLQASTIFHVIDSKTTYKMLLGRPWIHENGIVTSTLHQCFKFYKQRIKKVDADSRPFTKAE
Subjt:  MNQLGISVEELSNSKLVIQGFNQGAQRAIGTVRLEIVIGDLQASTIFHVIDSKTTYKMLLGRPWIHENGIVTSTLHQCFKFYKQRIKKVDADSRPFTKAE

Query:  SHFADAKFYTKSEDVSEIISTEVPVTKGTFKNEQEMITSKKSNKGNALNSQQNGESTTETKLRAPVAEKIATLQKEVSNPPVLRYIPLSRRKKGESPFAE
        SHFADAKFYTKSEDVSEIISTEVPVTKGTFKNEQEMITSKKSNKGNALNSQQNGESTTETKLRAPVAEKIATLQKEVSNPPVLRYIPLSRRKKGESPFAE
Subjt:  SHFADAKFYTKSEDVSEIISTEVPVTKGTFKNEQEMITSKKSNKGNALNSQQNGESTTETKLRAPVAEKIATLQKEVSNPPVLRYIPLSRRKKGESPFAE

Query:  CSKNLTVKNTEILKENFTASLTKIEKGEAKKIEKKDLEAYLPERRTVEGFDPKAYKLMAKAGYDFTT---------------------------------
        CSKNLTVKNT+ILKENF ASLTKIEKGEAKKIEKKDLEAYLPERRTVEGFDPKAYKLMAKAGYDFTT                                 
Subjt:  CSKNLTVKNTEILKENFTASLTKIEKGEAKKIEKKDLEAYLPERRTVEGFDPKAYKLMAKAGYDFTT---------------------------------

Query:  ----------------------------------------------------------------------------LSTCSSTRLSAFQRLNTNAKKVQS
                                                                                    +STCSSTRLSAFQRLNTNAKKVQS
Subjt:  ----------------------------------------------------------------------------LSTCSSTRLSAFQRLNTNAKKVQS

Query:  ISPTSTTRKSAFKRLSVSVTKGQKKASISVSNKSSLVTGDEEIRSAFPSRMKRKMF------------------------------------------TS
        ISPTSTTRKSAFKRLSVSVTKGQKKASISVSNKSSLVTGDEEIRSAFPSRMKRKMF                                          TS
Subjt:  ISPTSTTRKSAFKRLSVSVTKGQKKASISVSNKSSLVTGDEEIRSAFPSRMKRKMF------------------------------------------TS

Query:  EHDIFEEDAEAAPLSLEDG
        EHDIFEEDAEAAPLSLEDG
Subjt:  EHDIFEEDAEAAPLSLEDG

TYJ98225.1 uncharacterized protein E5676_scaffold180G001270 [Cucumis melo var. makuwa]

4.9e-167

67.44

Show/hide

Query:  MNQLGISVEELSNSKLVIQGFNQGAQRAIGTVRLEIVIGDLQASTIFHVIDSKTTYKMLLGRPWIHENGIVTSTLHQCFKFYKQRIKKVDADSRPFTKAE
        MNQLGISVEELSNSKLVIQGFNQGAQRAIGTVRLE+VIGDLQASTIFHVIDS+TTYKMLLGRPWIHENGIVTSTLHQCFKFYKQ IKKVDADSRPFTKAE
Subjt:  MNQLGISVEELSNSKLVIQGFNQGAQRAIGTVRLEIVIGDLQASTIFHVIDSKTTYKMLLGRPWIHENGIVTSTLHQCFKFYKQRIKKVDADSRPFTKAE

Query:  SHFADAKFYTKSEDVSEIISTEVPVTKGTFKNEQEMITSKKSNKGNALNSQQNGESTTETKLRAPVAEKIATLQKEVSNPPVLRYIPLSRRKKGESPFAE
        SHFADAKFYTKSEDVSEIISTEVPVTKGTFKNEQEMITSKKS+KG+ALNSQQNGE TTETKLRAP AEKIATLQKEVSNPPVLRYIPLSRRKKGESPF E
Subjt:  SHFADAKFYTKSEDVSEIISTEVPVTKGTFKNEQEMITSKKSNKGNALNSQQNGESTTETKLRAPVAEKIATLQKEVSNPPVLRYIPLSRRKKGESPFAE

Query:  CSKNLTVKNTEILKENFTASLTKIEKGEAKKIEKKDLEAYLPERRTVEGFDPKAYKLMAKAGYDFTT---------------------------------
        CSKNLTVKNTEILKENFTA LTKIEKGEAKKIEKKDL+AYLPERRTVEGFDPKAYKLMAKAGYDFTT                                 
Subjt:  CSKNLTVKNTEILKENFTASLTKIEKGEAKKIEKKDLEAYLPERRTVEGFDPKAYKLMAKAGYDFTT---------------------------------

Query:  ----------------------------------------------------------------------------LSTCSSTRLSAFQRLNTNAKKVQS
                                                                                    +STCSSTRLSAFQRLNT+AKKV+S
Subjt:  ----------------------------------------------------------------------------LSTCSSTRLSAFQRLNTNAKKVQS

Query:  ISPTSTTRKSAFKRLSVSVTKGQKKASISVSNKSSLVTGDEEIRSAFPSRMKRKMF------------------------------------------TS
        ISPT TTRKSAFKRLSVSVT+ QKKAS+SVSNKSSLVTGDEEIRSAFPSRMKRKMF                                          TS
Subjt:  ISPTSTTRKSAFKRLSVSVTKGQKKASISVSNKSSLVTGDEEIRSAFPSRMKRKMF------------------------------------------TS

Query:  EHDIFEEDAEAAPLSLEDG
        +HDIFEEDAEAAPLSLEDG
Subjt:  EHDIFEEDAEAAPLSLEDG

TYK02262.1 uncharacterized protein E5676_scaffold18G00630 [Cucumis melo var. makuwa]

2.6e-168

68.02

Show/hide

Query:  MNQLGISVEELSNSKLVIQGFNQGAQRAIGTVRLEIVIGDLQASTIFHVIDSKTTYKMLLGRPWIHENGIVTSTLHQCFKFYKQRIKKVDADSRPFTKAE
        MNQLGISVE+LSNSKLVIQGFNQGAQ+AIGTVRLE+VIGDLQASTIFHVIDS+TTYKMLLGRPWIHENGIVTSTLHQCFKFYKQ I+KVDADSRPFTKAE
Subjt:  MNQLGISVEELSNSKLVIQGFNQGAQRAIGTVRLEIVIGDLQASTIFHVIDSKTTYKMLLGRPWIHENGIVTSTLHQCFKFYKQRIKKVDADSRPFTKAE

Query:  SHFADAKFYTKSEDVSEIISTEVPVTKGTFKNEQEMITSKKSNKGNALNSQQNGESTTETKLRAPVAEKIATLQKEVSNPPVLRYIPLSRRKKGESPFAE
         HFADAKFYTKSEDVSEIISTEVPVTKGTFKNEQEMITSKKSNKGN LNSQQNGESTTETKLRAP AEKIATLQKEVSNPPVLRYIPLSRRKKGESPFAE
Subjt:  SHFADAKFYTKSEDVSEIISTEVPVTKGTFKNEQEMITSKKSNKGNALNSQQNGESTTETKLRAPVAEKIATLQKEVSNPPVLRYIPLSRRKKGESPFAE

Query:  CSKNLTVKNTEILKENFTASLTKIEKGEAKKIEKKDLEAYLPERRTVEGFDPKAYKLMAKAGYDFTT---------------------------------
        CSKN TVKNTEILKENFT  LTKIEKGEAKKIEKK+LEAYLPERRTVEGFDPKAYKLMAKAGYDFTT                                 
Subjt:  CSKNLTVKNTEILKENFTASLTKIEKGEAKKIEKKDLEAYLPERRTVEGFDPKAYKLMAKAGYDFTT---------------------------------

Query:  ----------------------------------------------------------------------------LSTCSSTRLSAFQRLNTNAKKVQS
                                                                                    +STCSSTRLSAFQRLNTNAKKVQS
Subjt:  ----------------------------------------------------------------------------LSTCSSTRLSAFQRLNTNAKKVQS

Query:  ISPTSTTRKSAFKRLSVSVTKGQKKASISVSNKSSLVTGDEEIRSAFPSRMKRKMF------------------------------------------TS
        ISPTSTTRKSAFKRLSV VTKGQKKASISVSNKSSLVTGDEEIRSAFPSRMKRKMF                                          TS
Subjt:  ISPTSTTRKSAFKRLSVSVTKGQKKASISVSNKSSLVTGDEEIRSAFPSRMKRKMF------------------------------------------TS

Query:  EHDIFEEDAEAAPLSLEDG
        EHDIFEEDAEAAPLSLEDG
Subjt:  EHDIFEEDAEAAPLSLEDG

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A5A7SND9 Gag protease polyprotein

2.1e-171

72.78

Show/hide

Query:  MNQLGISVEELSNSKLVIQGFNQGAQRAIGTVRLEIVIGDLQASTIFHVIDSKTTYKMLLGRPWIHENGIVTSTLHQCFKFYKQRIKKVDADSRPFTKAE
        MNQLGISVEELSNSKLVIQGFNQGAQRAIGTVRLEIVIGDLQASTIFHVIDSKTTYKMLLGRPWIHENGIVTSTLHQCFKFYKQ IKKVDADSRPFTKAE
Subjt:  MNQLGISVEELSNSKLVIQGFNQGAQRAIGTVRLEIVIGDLQASTIFHVIDSKTTYKMLLGRPWIHENGIVTSTLHQCFKFYKQRIKKVDADSRPFTKAE

Query:  SHFADAKFYTKSEDVSEIISTEVPVTKGTFKNEQEMITSKKSNKGNALNSQQNGESTTETKLRAPVAEKIATLQKEVSNPPVLRYIPLSRRKKGESPFAE
        SHFADAKFYTKSEDVSEIISTEVPVTKGTF NEQEMITSKKSNKGNALNSQQNGESTTETKLRAP AEKIATLQKEVSNPPVLRYI LSRRKKGESPF E
Subjt:  SHFADAKFYTKSEDVSEIISTEVPVTKGTFKNEQEMITSKKSNKGNALNSQQNGESTTETKLRAPVAEKIATLQKEVSNPPVLRYIPLSRRKKGESPFAE

Query:  CSKNLTVKNTEILKENFTASLTKIEKGEAKKIEKKDLEAYLPERRTVEGFDPKAYKLMAKAGYDFTT---------------------------------
        CSKNLTVKNTEILKENFTA LTKIEKGEA KIEKKDLEAYLPERRTVEGFDPKAYKLMAKAGYDFTT                                 
Subjt:  CSKNLTVKNTEILKENFTASLTKIEKGEAKKIEKKDLEAYLPERRTVEGFDPKAYKLMAKAGYDFTT---------------------------------

Query:  ------------------------------------------LSTCSSTRLSAFQRLNTNAKKVQSISPTSTTRKSAFKRLSVSVTKGQKKASISVSNKS
                                                  +STCSSTRLSAFQRLNT+AKKV+SISPT TTRKSAFKRLSVSVT+ QKKAS+SVSNKS
Subjt:  ------------------------------------------LSTCSSTRLSAFQRLNTNAKKVQSISPTSTTRKSAFKRLSVSVTKGQKKASISVSNKS

Query:  SLVTGDEEIRSAFPSRMKRKMF------------------------------------------TSEHDIFEEDAEAAPLSLEDG
        SLVTGDEEIRSAFPSRMKRKMF                                          TS+HDIFEEDAEAAPLSLEDG
Subjt:  SLVTGDEEIRSAFPSRMKRKMF------------------------------------------TSEHDIFEEDAEAAPLSLEDG

A0A5A7TZU9 Ribonuclease H

2.4e-167

67.44

Show/hide

Query:  MNQLGISVEELSNSKLVIQGFNQGAQRAIGTVRLEIVIGDLQASTIFHVIDSKTTYKMLLGRPWIHENGIVTSTLHQCFKFYKQRIKKVDADSRPFTKAE
        MNQLGISVEELSNSKLVIQGFNQGAQRAIGTVRLE+VIGDLQASTIFHVIDS+TTYKMLLGRPWIHENGIVTSTLHQCFKFYKQ IKKVDADSRPFTKAE
Subjt:  MNQLGISVEELSNSKLVIQGFNQGAQRAIGTVRLEIVIGDLQASTIFHVIDSKTTYKMLLGRPWIHENGIVTSTLHQCFKFYKQRIKKVDADSRPFTKAE

Query:  SHFADAKFYTKSEDVSEIISTEVPVTKGTFKNEQEMITSKKSNKGNALNSQQNGESTTETKLRAPVAEKIATLQKEVSNPPVLRYIPLSRRKKGESPFAE
        SHFADAKFYTKSEDVSEIISTEVPVTKGTFKNEQEMITSKKS+KG+ALNSQQNGE TTETKLRAP AEKIATLQKEVSNPPVLRYIPLSRRKKGESPF E
Subjt:  SHFADAKFYTKSEDVSEIISTEVPVTKGTFKNEQEMITSKKSNKGNALNSQQNGESTTETKLRAPVAEKIATLQKEVSNPPVLRYIPLSRRKKGESPFAE

Query:  CSKNLTVKNTEILKENFTASLTKIEKGEAKKIEKKDLEAYLPERRTVEGFDPKAYKLMAKAGYDFTT---------------------------------
        CSKNLTVKNTEILKENFTA LTKIEKGEAKKIEKKDL+AYLPERRTVEGFDPKAYKLMAKAGYDFTT                                 
Subjt:  CSKNLTVKNTEILKENFTASLTKIEKGEAKKIEKKDLEAYLPERRTVEGFDPKAYKLMAKAGYDFTT---------------------------------

Query:  ----------------------------------------------------------------------------LSTCSSTRLSAFQRLNTNAKKVQS
                                                                                    +STCSSTRLSAFQRLNT+AKKV+S
Subjt:  ----------------------------------------------------------------------------LSTCSSTRLSAFQRLNTNAKKVQS

Query:  ISPTSTTRKSAFKRLSVSVTKGQKKASISVSNKSSLVTGDEEIRSAFPSRMKRKMF------------------------------------------TS
        ISPT TTRKSAFKRLSVSVT+ QKKAS+SVSNKSSLVTGDEEIRSAFPSRMKRKMF                                          TS
Subjt:  ISPTSTTRKSAFKRLSVSVTKGQKKASISVSNKSSLVTGDEEIRSAFPSRMKRKMF------------------------------------------TS

Query:  EHDIFEEDAEAAPLSLEDG
        +HDIFEEDAEAAPLSLEDG
Subjt:  EHDIFEEDAEAAPLSLEDG

A0A5A7VE63 Uncharacterized protein

6.9e-175

70.33

Show/hide

Query:  MNQLGISVEELSNSKLVIQGFNQGAQRAIGTVRLEIVIGDLQASTIFHVIDSKTTYKMLLGRPWIHENGIVTSTLHQCFKFYKQRIKKVDADSRPFTKAE
        MNQLGISVEELSNSKLVIQGFNQGAQRAIGTVRLEIVIGDLQASTIFHVIDSKTTYKMLLGRPWIHENGIVTSTLHQCFKFYKQRIKKVDADSRPFTKAE
Subjt:  MNQLGISVEELSNSKLVIQGFNQGAQRAIGTVRLEIVIGDLQASTIFHVIDSKTTYKMLLGRPWIHENGIVTSTLHQCFKFYKQRIKKVDADSRPFTKAE

Query:  SHFADAKFYTKSEDVSEIISTEVPVTKGTFKNEQEMITSKKSNKGNALNSQQNGESTTETKLRAPVAEKIATLQKEVSNPPVLRYIPLSRRKKGESPFAE
        SHFADAKFYTKSEDVSEIISTEVPVTKGTFKNEQEMITSKKSNKGNALNSQQNGESTTETKLRAPVAEKIATLQKEVSNPPVLRYIPLSRRKKGESPFAE
Subjt:  SHFADAKFYTKSEDVSEIISTEVPVTKGTFKNEQEMITSKKSNKGNALNSQQNGESTTETKLRAPVAEKIATLQKEVSNPPVLRYIPLSRRKKGESPFAE

Query:  CSKNLTVKNTEILKENFTASLTKIEKGEAKKIEKKDLEAYLPERRTVEGFDPKAYKLMAKAGYDFTT---------------------------------
        CSKNLTVKNT+ILKENF ASLTKIEKGEAKKIEKKDLEAYLPERRTVEGFDPKAYKLMAKAGYDFTT                                 
Subjt:  CSKNLTVKNTEILKENFTASLTKIEKGEAKKIEKKDLEAYLPERRTVEGFDPKAYKLMAKAGYDFTT---------------------------------

Query:  ----------------------------------------------------------------------------LSTCSSTRLSAFQRLNTNAKKVQS
                                                                                    +STCSSTRLSAFQRLNTNAKKVQS
Subjt:  ----------------------------------------------------------------------------LSTCSSTRLSAFQRLNTNAKKVQS

Query:  ISPTSTTRKSAFKRLSVSVTKGQKKASISVSNKSSLVTGDEEIRSAFPSRMKRKMF------------------------------------------TS
        ISPTSTTRKSAFKRLSVSVTKGQKKASISVSNKSSLVTGDEEIRSAFPSRMKRKMF                                          TS
Subjt:  ISPTSTTRKSAFKRLSVSVTKGQKKASISVSNKSSLVTGDEEIRSAFPSRMKRKMF------------------------------------------TS

Query:  EHDIFEEDAEAAPLSLEDG
        EHDIFEEDAEAAPLSLEDG
Subjt:  EHDIFEEDAEAAPLSLEDG

A0A5D3BIH8 Uncharacterized protein

2.4e-167

67.44

Show/hide

Query:  MNQLGISVEELSNSKLVIQGFNQGAQRAIGTVRLEIVIGDLQASTIFHVIDSKTTYKMLLGRPWIHENGIVTSTLHQCFKFYKQRIKKVDADSRPFTKAE
        MNQLGISVEELSNSKLVIQGFNQGAQRAIGTVRLE+VIGDLQASTIFHVIDS+TTYKMLLGRPWIHENGIVTSTLHQCFKFYKQ IKKVDADSRPFTKAE
Subjt:  MNQLGISVEELSNSKLVIQGFNQGAQRAIGTVRLEIVIGDLQASTIFHVIDSKTTYKMLLGRPWIHENGIVTSTLHQCFKFYKQRIKKVDADSRPFTKAE

Query:  SHFADAKFYTKSEDVSEIISTEVPVTKGTFKNEQEMITSKKSNKGNALNSQQNGESTTETKLRAPVAEKIATLQKEVSNPPVLRYIPLSRRKKGESPFAE
        SHFADAKFYTKSEDVSEIISTEVPVTKGTFKNEQEMITSKKS+KG+ALNSQQNGE TTETKLRAP AEKIATLQKEVSNPPVLRYIPLSRRKKGESPF E
Subjt:  SHFADAKFYTKSEDVSEIISTEVPVTKGTFKNEQEMITSKKSNKGNALNSQQNGESTTETKLRAPVAEKIATLQKEVSNPPVLRYIPLSRRKKGESPFAE

Query:  CSKNLTVKNTEILKENFTASLTKIEKGEAKKIEKKDLEAYLPERRTVEGFDPKAYKLMAKAGYDFTT---------------------------------
        CSKNLTVKNTEILKENFTA LTKIEKGEAKKIEKKDL+AYLPERRTVEGFDPKAYKLMAKAGYDFTT                                 
Subjt:  CSKNLTVKNTEILKENFTASLTKIEKGEAKKIEKKDLEAYLPERRTVEGFDPKAYKLMAKAGYDFTT---------------------------------

Query:  ----------------------------------------------------------------------------LSTCSSTRLSAFQRLNTNAKKVQS
                                                                                    +STCSSTRLSAFQRLNT+AKKV+S
Subjt:  ----------------------------------------------------------------------------LSTCSSTRLSAFQRLNTNAKKVQS

Query:  ISPTSTTRKSAFKRLSVSVTKGQKKASISVSNKSSLVTGDEEIRSAFPSRMKRKMF------------------------------------------TS
        ISPT TTRKSAFKRLSVSVT+ QKKAS+SVSNKSSLVTGDEEIRSAFPSRMKRKMF                                          TS
Subjt:  ISPTSTTRKSAFKRLSVSVTKGQKKASISVSNKSSLVTGDEEIRSAFPSRMKRKMF------------------------------------------TS

Query:  EHDIFEEDAEAAPLSLEDG
        +HDIFEEDAEAAPLSLEDG
Subjt:  EHDIFEEDAEAAPLSLEDG

A0A5D3BTY1 Ribonuclease H

1.3e-168

68.02

Show/hide

Query:  MNQLGISVEELSNSKLVIQGFNQGAQRAIGTVRLEIVIGDLQASTIFHVIDSKTTYKMLLGRPWIHENGIVTSTLHQCFKFYKQRIKKVDADSRPFTKAE
        MNQLGISVE+LSNSKLVIQGFNQGAQ+AIGTVRLE+VIGDLQASTIFHVIDS+TTYKMLLGRPWIHENGIVTSTLHQCFKFYKQ I+KVDADSRPFTKAE
Subjt:  MNQLGISVEELSNSKLVIQGFNQGAQRAIGTVRLEIVIGDLQASTIFHVIDSKTTYKMLLGRPWIHENGIVTSTLHQCFKFYKQRIKKVDADSRPFTKAE

Query:  SHFADAKFYTKSEDVSEIISTEVPVTKGTFKNEQEMITSKKSNKGNALNSQQNGESTTETKLRAPVAEKIATLQKEVSNPPVLRYIPLSRRKKGESPFAE
         HFADAKFYTKSEDVSEIISTEVPVTKGTFKNEQEMITSKKSNKGN LNSQQNGESTTETKLRAP AEKIATLQKEVSNPPVLRYIPLSRRKKGESPFAE
Subjt:  SHFADAKFYTKSEDVSEIISTEVPVTKGTFKNEQEMITSKKSNKGNALNSQQNGESTTETKLRAPVAEKIATLQKEVSNPPVLRYIPLSRRKKGESPFAE

Query:  CSKNLTVKNTEILKENFTASLTKIEKGEAKKIEKKDLEAYLPERRTVEGFDPKAYKLMAKAGYDFTT---------------------------------
        CSKN TVKNTEILKENFT  LTKIEKGEAKKIEKK+LEAYLPERRTVEGFDPKAYKLMAKAGYDFTT                                 
Subjt:  CSKNLTVKNTEILKENFTASLTKIEKGEAKKIEKKDLEAYLPERRTVEGFDPKAYKLMAKAGYDFTT---------------------------------

Query:  ----------------------------------------------------------------------------LSTCSSTRLSAFQRLNTNAKKVQS
                                                                                    +STCSSTRLSAFQRLNTNAKKVQS
Subjt:  ----------------------------------------------------------------------------LSTCSSTRLSAFQRLNTNAKKVQS

Query:  ISPTSTTRKSAFKRLSVSVTKGQKKASISVSNKSSLVTGDEEIRSAFPSRMKRKMF------------------------------------------TS
        ISPTSTTRKSAFKRLSV VTKGQKKASISVSNKSSLVTGDEEIRSAFPSRMKRKMF                                          TS
Subjt:  ISPTSTTRKSAFKRLSVSVTKGQKKASISVSNKSSLVTGDEEIRSAFPSRMKRKMF------------------------------------------TS

Query:  EHDIFEEDAEAAPLSLEDG
        EHDIFEEDAEAAPLSLEDG
Subjt:  EHDIFEEDAEAAPLSLEDG

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGAATCAATTAGGTATCTCAGTGGAAGAGTTATCAAATAGTAAACTGGTGATTCAAGGCTTTAATCAAGGAGCACAACGGGCAATAGGCACTGTTCGTTTGGAAATCGT
CATAGGGGATTTGCAGGCAAGCACAATATTCCATGTGATCGATTCCAAGACTACTTATAAAATGTTATTGGGACGTCCATGGATACATGAAAATGGAATAGTAACCTCCA
CGCTTCATCAATGCTTTAAATTTTATAAACAGAGAATTAAGAAGGTCGATGCTGACTCTAGGCCATTTACAAAGGCTGAGTCTCACTTCGCTGATGCAAAATTTTACACA
AAAAGTGAAGACGTGAGTGAAATCATATCAACTGAAGTTCCAGTGACTAAGGGCACTTTTAAGAACGAGCAAGAAATGATCACAAGCAAGAAATCAAATAAAGGGAATGC
ACTTAATAGTCAACAAAATGGTGAATCAACGACCGAAACTAAGTTAAGGGCGCCAGTGGCTGAAAAGATAGCAACCTTACAAAAGGAAGTCTCAAATCCCCCTGTTTTAC
GTTATATCCCTTTGTCCCGACGTAAGAAGGGAGAATCACCATTTGCAGAATGTTCAAAAAACCTGACGGTCAAAAATACCGAGATATTAAAGGAAAATTTCACCGCGTCG
CTTACCAAGATAGAGAAAGGAGAAGCGAAAAAAATTGAGAAAAAGGACTTAGAAGCATACCTTCCAGAAAGACGAACAGTGGAGGGATTCGACCCAAAGGCATATAAGTT
GATGGCAAAGGCGGGTTATGACTTTACAACTCTTTCAACCTGCAGCTCCACTCGACTTTCTGCCTTTCAAAGGCTAAACACAAATGCAAAGAAAGTACAATCTATAAGCC
CAACTTCGACCACAAGAAAATCTGCCTTCAAAAGGTTAAGCGTGTCAGTAACAAAAGGCCAAAAGAAAGCCTCCATATCCGTCTCAAACAAATCTAGCCTAGTGACAGGA
GACGAGGAAATTCGCAGTGCATTTCCATCGAGAATGAAAAGAAAGATGTTCACATCTGAGCATGATATATTTGAAGAGGATGCCGAAGCGGCTCCGTTATCGCTTGAGGA
TGGGGTCAATCAACGATTGACGAGTTAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MNQLGISVEELSNSKLVIQGFNQGAQRAIGTVRLEIVIGDLQASTIFHVIDSKTTYKMLLGRPWIHENGIVTSTLHQCFKFYKQRIKKVDADSRPFTKAESHFADAKFYT
KSEDVSEIISTEVPVTKGTFKNEQEMITSKKSNKGNALNSQQNGESTTETKLRAPVAEKIATLQKEVSNPPVLRYIPLSRRKKGESPFAECSKNLTVKNTEILKENFTAS
LTKIEKGEAKKIEKKDLEAYLPERRTVEGFDPKAYKLMAKAGYDFTTLSTCSSTRLSAFQRLNTNAKKVQSISPTSTTRKSAFKRLSVSVTKGQKKASISVSNKSSLVTG
DEEIRSAFPSRMKRKMFTSEHDIFEEDAEAAPLSLEDGVNQRLTS

Pay0020056 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome