; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Pay0021198 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome

Gene IDPay0021198
OrganismCucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
DescriptionSKI/DACH domain-containing protein 1
Genome locationchr04:2054833..2055543
RNA-Seq ExpressionPay0021198
SyntenyPay0021198
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8651391.1 hypothetical protein Csa_002099 [Cucumis sativus]5.5e-6079.33Show/hide
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KAG7024556.1 hypothetical protein SDJN02_13373, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.2e-3765Show/hide
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XP_008466205.1 PREDICTED: SKI/DACH domain-containing protein 1 [Cucumis melo]9.0e-8799.44Show/hide
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XP_011652564.1 uncharacterized protein LOC105435032 [Cucumis sativus]5.5e-6079.33Show/hide
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XP_038899400.1 uncharacterized protein LOC120086706 [Benincasa hispida]5.7e-4170.17Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LJL6 Uncharacterized protein2.7e-6079.33Show/hide
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A0A1S3CQP1 SKI/DACH domain-containing protein 14.3e-8799.44Show/hide
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A0A6J1FD38 uncharacterized protein LOC1114430182.4e-3764.44Show/hide
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A0A6J1FKF2 uncharacterized protein LOC1114460762.7e-2860.11Show/hide
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            KA    +ASSI+KKS+SMA   R +RG  T+SD GKKS+   LGFWSRFLNRPR KRME ++ LM SR+  VV  NVHG
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A0A6J1IHL9 uncharacterized protein LOC1114761651.9e-3765.56Show/hide
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        MANFH SKSDYD         +   CK HP HHQSPGVCSLCL EKLS+I+S   +S  K+S SLSSSCSSSYYSS +SS SSCSS   PY  YN+D   
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         R+KAFV FSASSIFKKS+SMA   RLKR   TESD GK SN   LGFWSRFL RPR K MEF++VLM SRTVV R+VHG
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCAACTTTCACACCTCTAAATCCGATTACGACCACCACCACCACCACCGCCGTCACCGCAACCACCACCACTGCAAACACCATCCAAATCACCACCAATCTCCTGG
TGTTTGTTCTCTATGTTTAACCGAAAAGCTCTCGCGAATTCTCTCCACCGCCGGTTCATCGCGTAATAAAATCTCTAGTTCTCTTTCTTCTTCTTGTTCCTCTTCTTATT
ACTCCTCTTGTTCCTCTTCTTCTTCTTCTTGTTCTTCTTCGCCGAAGCCTTACAATTATTACAATTCGGATAATCATCGTCGTCGTAAGAAGGCTTTTGTGTTGTTTTCT
GCGTCTTCGATCTTTAAGAAGAGTAAATCGATGGCGAGATTGAAACGAGGAACGACAACGGAGAGTGATTGTGGAAAGAAGAGTAATAATAATGACTTAGGGTTTTGGTC
GAGGTTTCTGAATCGACCGAGACCGAAGAGGATGGAATTTCAGGATGTTTTGATGCGTTCGAGAACTGTTGTACACAGGAACGTGCATGGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CCCCAATATGGCCAACTTTCACACCTCTAAATCCGATTACGACCACCACCACCACCACCGCCGTCACCGCAACCACCACCACTGCAAACACCATCCAAATCACCACCAAT
CTCCTGGTGTTTGTTCTCTATGTTTAACCGAAAAGCTCTCGCGAATTCTCTCCACCGCCGGTTCATCGCGTAATAAAATCTCTAGTTCTCTTTCTTCTTCTTGTTCCTCT
TCTTATTACTCCTCTTGTTCCTCTTCTTCTTCTTCTTGTTCTTCTTCGCCGAAGCCTTACAATTATTACAATTCGGATAATCATCGTCGTCGTAAGAAGGCTTTTGTGTT
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TTTGGTCGAGGTTTCTGAATCGACCGAGACCGAAGAGGATGGAATTTCAGGATGTTTTGATGCGTTCGAGAACTGTTGTACACAGGAACGTGCATGGATGAACATAATCG
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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