; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Pay0021992 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome

Gene IDPay0021992
OrganismCucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
DescriptionLYR motif-containing protein 2
Genome locationchr04:3435051..3436001
RNA-Seq ExpressionPay0021992
SyntenyPay0021992
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR008011 - Complex 1 LYR protein


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0063314.1 LYR motif-containing protein 2 [Cucumis melo var. makuwa]1.6e-35100Show/hide
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XP_008466455.1 PREDICTED: LYR motif-containing protein 2 [Cucumis melo]8.1e-3598.77Show/hide
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XP_023535371.1 uncharacterized protein LOC111796833 [Cucurbita pepo subsp. pepo]9.0e-2679.01Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3CRB8 LYR motif-containing protein 23.9e-3598.77Show/hide
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A0A5A7V7X8 LYR motif-containing protein 27.9e-36100Show/hide
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A0A5D3E7B8 LYR motif-containing protein 23.9e-3598.77Show/hide
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A0A6J1F8N3 uncharacterized protein LOC1114433217.4e-2679.01Show/hide
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A0A6J1IFA5 uncharacterized protein LOC1114764182.2e-2579.01Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q5RES3 LYR motif-containing protein 22.6e-0436.62Show/hide
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Q8R033 LYR motif-containing protein 27.7e-0436.62Show/hide
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Q9NU23 LYR motif-containing protein 23.5e-0436.62Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G76065.1 LYR family of Fe/S cluster biogenesis protein2.4e-2471.05Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTCTTCTCCCATGATTTACGTGAATTTATTCTTCGAGCAAGAGTGTTGAAACTGTATAGACAGGGTTTAAGAACAGCTCGGAAAGCACCTGTTGATGGTCGAGATGA
ATTGAGGCATATGATGAGAGAAGAAATGGAGAAGAACAGAAAGTGTAATGATAGACAGAAAATAAGATTTTTGTTGAGCGAAGGAATAGAGAGATTGAAGCAATTAGATG
AGATGTTGGATATGCAAGGCCATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GGCTACTCAATATCAAAATCGGTCTTCCGTCGTTGAATCCTCAAAGAAATCGGAACCGAACGACAGAAATGATTATACCTCCGATTGAATCAAGCAGGGAATTCGCTTCA
CTTTAATCTGCACCATCAGTGTTATCCTCTTCATTTTGATCATTAAGGAAAGAGAAATCGCGATGGTCTTCTCCCATGATTTACGTGAATTTATTCTTCGAGCAAGAGTG
TTGAAACTGTATAGACAGGGTTTAAGAACAGCTCGGAAAGCACCTGTTGATGGTCGAGATGAATTGAGGCATATGATGAGAGAAGAAATGGAGAAGAACAGAAAGTGTAA
TGATAGACAGAAAATAAGATTTTTGTTGAGCGAAGGAATAGAGAGATTGAAGCAATTAGATGAGATGTTGGATATGCAAGGCCATTAACTAGAGATCTTTCTTTTCTTTC
TTTTTTTTATTAATTTTGATTATTGGGAGTTAAGTTTTTCTCCAATCATTTTGGAGTGTCTCATAGAAAGGAATGTTGTTTTAGGGGAAGGATATGAGTTTGGTTAAGGG
CTTATCTTCAAGTTATTGTAATCAAATTGTGATTAAGGTACAAAGGAGTTATTAATTCCATTTCCCACATTATTTGTATCAGTTTGATTTTTATGTTAGGTTTTGAAATA
AGAAACTGAAATCATCTAAAATTGAGATGAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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