; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Pay0022012 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome

Gene IDPay0022012
OrganismCucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
DescriptionEF hand calcium-binding protein family
Genome locationchr06:14388590..14389172
RNA-Seq ExpressionPay0022012
SyntenyPay0022012
Gene Ontology termsGO:0005509 - calcium ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002048 - EF-hand domain
IPR011992 - EF-hand domain pair
IPR018247 - EF-Hand 1, calcium-binding site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8650604.1 hypothetical protein Csa_010664 [Cucumis sativus]1.3e-5595.76Show/hide
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XP_004145834.1 probable calcium-binding protein CML23 [Cucumis sativus]6.8e-6094.66Show/hide
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XP_008457051.1 PREDICTED: probable calcium-binding protein CML27 [Cucumis melo]4.1e-65100Show/hide
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XP_022143269.1 probable calcium-binding protein CML23 [Momordica charantia]9.6e-4675.37Show/hide
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XP_038879983.1 probable calcium-binding protein CML23 [Benincasa hispida]7.6e-5184.33Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LCM1 Uncharacterized protein3.3e-6094.66Show/hide
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A0A1S3C5W9 probable calcium-binding protein CML272.0e-65100Show/hide
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A0A5A7UHX3 Putative calcium-binding protein CML272.0e-65100Show/hide
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A0A6J1CNU4 probable calcium-binding protein CML234.6e-4675.37Show/hide
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A0A6J1G9H5 probable calcium-binding protein CML233.9e-4576.92Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P25070 Calcium-binding protein CML242.5e-2854.92Show/hide
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        S LGSMD++ +VF +FDKNGDGKISV EL   +  LS   S  E   +M + D DG+GFIDLDEF        GG         DL++AF+LYD+D NG 
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        ISAKELHSV+K LGEKCS++DC
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Q9C8Y1 Probable calcium-binding protein CML231.3e-2955.93Show/hide
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        LGSM+++ +VF +FDKN DGKIS+ EL   +G LS N S  E   +M E D DG+GFIDLDEF         SS+    +DL++AFDLYD+D+NG ISA 
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Q9C9U8 Probable calcium-binding protein CML263.1e-2347.69Show/hide
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        MAN N     ST  S++  +  E+ +VF+KFD NGDGKISVSELG     +  + +  E++R++ EID D DGFI+ +EF     SS+    ++++AFDL
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        YD +KNGLIS+ E+H VL RLG  CS++DC
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Q9LE22 Probable calcium-binding protein CML274.2e-2848.46Show/hide
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        MA+ NP  +  TP +  + + +E+ +VF++FD NGDGKISV ELG     +  + +  E++R++ E+D D DG+I+LDEF+    SS+    +++DAFDL
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        YD DKNGLISA ELH VL RLG  CS++DC
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Q9M7R0 Calcium-binding allergen Ole e 83.7e-2448.51Show/hide
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        N+ PS+ +  P        +EV  VFN+FD NGDGKIS  EL   L  L  N S  EI RIM EID D DGFI++ EF  F  +      S+GG  +L++
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        AF+LYD D NGLIS+ ELH +L RLGE+ +  DC
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G18210.1 Calcium-binding EF-hand family protein3.0e-2948.46Show/hide
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        MA+ NP  +  TP +  + + +E+ +VF++FD NGDGKISV ELG     +  + +  E++R++ E+D D DG+I+LDEF+    SS+    +++DAFDL
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AT1G18210.2 Calcium-binding EF-hand family protein3.0e-2948.46Show/hide
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AT1G66400.1 calmodulin like 239.3e-3155.93Show/hide
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        LGSM+++ +VF +FDKN DGKIS+ EL   +G LS N S  E   +M E D DG+GFIDLDEF         SS+    +DL++AFDLYD+D+NG ISA 
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        ELHSV+K LGEKCS++DC
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AT1G73630.1 EF hand calcium-binding protein family2.2e-2447.69Show/hide
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        MAN N     ST  S++  +  E+ +VF+KFD NGDGKISVSELG     +  + +  E++R++ EID D DGFI+ +EF     SS+    ++++AFDL
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Query:  YDIDKNGLISAKELHSVLKRLGEKCSLKDC
        YD +KNGLIS+ E+H VL RLG  CS++DC
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AT5G37770.1 EF hand calcium-binding protein family1.8e-2954.92Show/hide
Query:  SSLGSMDEVIRVFNKFDKNGDGKISVSELGAALGELSGNISTGEIHRIMSEIDKDGDGFIDLDEFTDFTSSSTGGN-------KDLQDAFDLYDIDKNGL
        S LGSMD++ +VF +FDKNGDGKISV EL   +  LS   S  E   +M + D DG+GFIDLDEF        GG         DL++AF+LYD+D NG 
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        ISAKELHSV+K LGEKCS++DC
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCAATAACAACCCCTCCCTTTCTATTTCAACTCCTGGATCTTCCTCCTTAGGCTCCATGGACGAAGTCATCAGAGTCTTCAACAAATTCGACAAGAACGGCGACGG
CAAGATTTCCGTCTCAGAACTCGGCGCTGCTCTCGGTGAACTCAGCGGCAACATCTCCACCGGCGAGATCCACCGCATTATGTCCGAGATCGACAAGGACGGTGACGGTT
TCATCGACCTCGACGAGTTCACCGACTTCACCTCCTCTTCCACTGGTGGTAACAAAGATCTGCAGGACGCTTTCGATCTCTACGATATTGATAAGAACGGCTTAATCTCT
GCCAAGGAGTTGCACTCTGTTCTCAAACGCCTTGGTGAAAAATGTAGCCTCAAAGATTGTTGTTCCTGTTTATTTTTTTTATTGATCATTTTTTTACTGGTTGACTTTGT
GTTTTTTATCTTGTTTTTTGGTATTTTTATTGTACAGTGTATAATTCAGGTGAATTCATTAGGAAATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AGAAAAGAAAAAGAAAAGGATATCTCTCTCTATTCAAATTTCAAATCCCCTTCACATCATCACAATCAATCCCATGGCCAATAACAACCCCTCCCTTTCTATTTCAACTC
CTGGATCTTCCTCCTTAGGCTCCATGGACGAAGTCATCAGAGTCTTCAACAAATTCGACAAGAACGGCGACGGCAAGATTTCCGTCTCAGAACTCGGCGCTGCTCTCGGT
GAACTCAGCGGCAACATCTCCACCGGCGAGATCCACCGCATTATGTCCGAGATCGACAAGGACGGTGACGGTTTCATCGACCTCGACGAGTTCACCGACTTCACCTCCTC
TTCCACTGGTGGTAACAAAGATCTGCAGGACGCTTTCGATCTCTACGATATTGATAAGAACGGCTTAATCTCTGCCAAGGAGTTGCACTCTGTTCTCAAACGCCTTGGTG
AAAAATGTAGCCTCAAAGATTGTTGTTCCTGTTTATTTTTTTTATTGATCATTTTTTTACTGGTTGACTTTGTGTTTTTTATCTTGTTTTTTGGTATTTTTATTGTACAG
TGTATAATTCAGGTGAATTCATTAGGAAATTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MANNNPSLSISTPGSSSLGSMDEVIRVFNKFDKNGDGKISVSELGAALGELSGNISTGEIHRIMSEIDKDGDGFIDLDEFTDFTSSSTGGNKDLQDAFDLYDIDKNGLIS
AKELHSVLKRLGEKCSLKDCCSCLFFLLIIFLLVDFVFFILFFGIFIVQCIIQVNSLGN