; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Pay0022886 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome

Gene IDPay0022886
OrganismCucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
Descriptionzinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like
Genome locationchr02:11235882..11237132
RNA-Seq ExpressionPay0022886
SyntenyPay0022886
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR008906 - HAT, C-terminal dimerisation domain
IPR012337 - Ribonuclease H-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
ACX85638.1 putative transposase [Cucumis melo]1.1e-12570.64Show/hide
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ADN33674.1 transposase [Cucumis melo subsp. melo]1.1e-12570.64Show/hide
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KAA0058067.1 putative transposase [Cucumis melo var. makuwa]1.8e-11586.11Show/hide
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XP_016899473.1 PREDICTED: zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like isoform X2 [Cucumis melo]1.5e-10663.31Show/hide
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XP_016903394.1 PREDICTED: zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like [Cucumis melo]2.6e-11988.66Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S4DU07 zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like isoform X17.3e-10763.31Show/hide
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        I SISSSGSYK R  + DRFKQSNKTCLDDAKTEVTRYLDEA I    DEYLDLL WWKVNSSRFKIISQV RD+YSIPIS VPSE AFSTGGRVL SFR
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A0A1S4E592 zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like1.3e-11988.66Show/hide
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A0A5A7UTL3 Putative transposase8.5e-11686.11Show/hide
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D0UIX2 Putative transposase5.3e-12670.64Show/hide
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E5GB32 Transposase5.3e-12670.64Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B9FJG3 Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 15.7e-1624.52Show/hide
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        +DV T+W++T+ ML  A+  ++ F  LE  D +Y   ++ P+ EDW   +    +LK                                 A   ED    
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Query:  -----------KIWTN----------------------------KVEEA-FHRLCDDYYMRMSKEKYSQTQSCTPI---EGFGFQSQSEISSISSSGSYK
                   K W +                             VE A + ++ DD    +  E  +Q    TP    +G G  + +  +S  ++    
Subjt:  -----------KIWTN----------------------------KVEEA-FHRLCDDYYMRMSKEKYSQTQSCTPI---EGFGFQSQSEISSISSSGSYK

Query:  ARATIRDRFKQSNKTCLDDAKTEVTRYLDEARIDCMDDEYLDLLTWWKVNSSRFKIISQVARDIYSIPISTVPS-ESAFS--TGGRVLDSFRSSLTPQTA
            +      S        K+E+ +YLDE+    + +   D+L WWK+N+ ++  +S++ARDI +IP+S V S  S FS  TG R+LD +RSS  P+  
Subjt:  ARATIRDRFKQSNKTCLDDAKTEVTRYLDEARIDCMDDEYLDLLTWWKVNSSRFKIISQVARDIYSIPISTVPS-ESAFS--TGGRVLDSFRSSLTPQTA

Query:  EVLICVQNWIQFKP
        E L+C ++W+Q+ P
Subjt:  EVLICVQNWIQFKP

P03010 Putative AC9 transposase4.5e-1329.27Show/hide
Query:  DYYMRMSKEKYSQTQSCTPIEGFGFQSQSEISSISSSGSYKARATIRDRFKQSNKTCLDDAKTEVTRYLDEAR-IDCMD----DEYL-----------DL
        D ++R+ ++ Y    SC+P                   + K + T  D     + T +++   E   YL E +  D ++    D+Y+           D+
Subjt:  DYYMRMSKEKYSQTQSCTPIEGFGFQSQSEISSISSSGSYKARATIRDRFKQSNKTCLDDAKTEVTRYLDEAR-IDCMD----DEYL-----------DL

Query:  LTWWKVNSSRFKIISQVARDIYSIPISTVPSESAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEVLICVQNWI
        L+WW+   + + I++Q+ARD+ +I +STV SESAFS GGRV+D +R+ L  +  E LIC ++W+
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P08770 Putative AC transposase4.5e-1329.27Show/hide
Query:  DYYMRMSKEKYSQTQSCTPIEGFGFQSQSEISSISSSGSYKARATIRDRFKQSNKTCLDDAKTEVTRYLDEAR-IDCMD----DEYL-----------DL
        D ++R+ ++ Y    SC+P                   + K + T  D     + T +++   E   YL E +  D ++    D+Y+           D+
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Query:  LTWWKVNSSRFKIISQVARDIYSIPISTVPSESAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEVLICVQNWI
        L+WW+   + + I++Q+ARD+ +I +STV SESAFS GGRV+D +R+ L  +  E LIC ++W+
Subjt:  LTWWKVNSSRFKIISQVARDIYSIPISTVPSESAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEVLICVQNWI

Q6AVI0 Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 26.3e-1532.1Show/hide
Query:  RLCDDYYMRMSKEKYSQTQSCTPI---EGFGFQSQSEISSISSSGSYKARATIRDRFKQSNKTCLDDAKTEVTRYLDEARIDCMDDEYLDLLTWWKVNSS
        ++ DD    + KE  +Q    TP    +G G  + +  +   ++        +      S        K+E+ +YLDE+    + +   D+L WWK+N+ 
Subjt:  RLCDDYYMRMSKEKYSQTQSCTPI---EGFGFQSQSEISSISSSGSYKARATIRDRFKQSNKTCLDDAKTEVTRYLDEARIDCMDDEYLDLLTWWKVNSS

Query:  RFKIISQVARDIYSIPISTVPS-ESAFS--TGGRVLDSFRSSLTPQTAEVLICVQNWIQFKP
        +F  +S++ARDI +IP+S V S  S FS  TG R+LD +RSSL P+  E L+C ++W+Q+ P
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Q75HY5 Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 32.2e-1541.49Show/hide
Query:  TEVTRYLDEARIDCMDDEYLDLLTWWKVNSSRFKIISQVARDIYSIPISTVPSE----SAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEVLICVQNWIQFKP
        +E+ +YL+EA +  + D   ++L WWK+N+ +F  +S++ARD+ +IP+S V S     SA +TG ++LD +RSSL P+T E L C ++W+Q+ P
Subjt:  TEVTRYLDEARIDCMDDEYLDLLTWWKVNSSRFKIISQVARDIYSIPISTVPSE----SAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEVLICVQNWIQFKP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G18560.1 BED zinc finger ;hAT family dimerisation domain9.0e-0930.23Show/hide
Query:  EVTRYLDEARIDCMDDEYLDLLTWWKVNSSRFKIISQVARDIYSIPISTVPSESAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEVLICVQNWIQ
        E+T+YL E+ +        D+L WWKVNS R+  +S +ARD  ++  ++   E  F   G  +D  +  +   + + +IC+++WI+
Subjt:  EVTRYLDEARIDCMDDEYLDLLTWWKVNSSRFKIISQVARDIYSIPISTVPSESAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEVLICVQNWIQ

AT3G42170.1 BED zinc finger ;hAT family dimerisation domain9.3e-1436.17Show/hide
Query:  KTCLDDAKTEVTRYLDEARIDCMDDEYLDLLTWWKVNSSRFKIISQVARDIYSIPISTVPSESAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEVLICVQNWI
        +T   + K+E+ +YLDE  +  + +   D+L WWK N  ++  +S++ARDI SIP+S    +  F    R +D +++SL P+T E LIC + W+
Subjt:  KTCLDDAKTEVTRYLDEARIDCMDDEYLDLLTWWKVNSSRFKIISQVARDIYSIPISTVPSESAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEVLICVQNWI


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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