CuGenDBv2

Gene ID	Sed0000142
Organism	Sechium edule (Chayote v1)
Description	Protein TIC 214
Genome location	LG13:18705453..18706412
RNA-Seq Expression	Sed0000142
Synteny	Sed0000142
Gene Ontology terms	GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	IPR008896 - Protein TIC214

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

QIT04190.1 Ycf1 protein [Sechium edule]

8.5e-69

55.17

Show/hide

Query:  MEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP-----------------------------------------------------
        MEEGTEKKVSATTG ITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP                                                     
Subjt:  MEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP-----------------------------------------------------

Query:  ---------------------------------------------------------------------------------------IPSPILTKKLKET
                                                                                               IPSPILTKKLKET
Subjt:  ---------------------------------------------------------------------------------------IPSPILTKKLKET

Query:  SETEQRGESEKETDVEIETTSETKGTKQEQEQEGSTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRVNGKEKTKDEFHFKRTRYQNIKRPVYETSYPPDGNKEN
        SETEQRGESEKETDVEIETTSETKGTKQEQEQEGSTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRVNGKEKTKDEFHFKRTRYQNIKRPVYETSYPPDGNKEN
Subjt:  SETEQRGESEKETDVEIETTSETKGTKQEQEQEGSTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRVNGKEKTKDEFHFKRTRYQNIKRPVYETSYPPDGNKEN

Query:  SKLEIDKKEKYLFWFENLL
        SKLEIDKKEKYLFWFE  L
Subjt:  SKLEIDKKEKYLFWFENLL

QWQ50148.1 hypothetical protein RF1 [Cyclanthera pedata]

8.8e-66

54.23

Show/hide

Query:  MEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP-----------------------------------------------------
        MEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP                                                     
Subjt:  MEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP-----------------------------------------------------

Query:  ---------------------------------------------------------------------------------------IPSPILTKKLKET
                                                                                               IPSPILTKKLKET
Subjt:  ---------------------------------------------------------------------------------------IPSPILTKKLKET

Query:  SETEQRGESEKETDVEIETTSETKGTKQEQEQEGSTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRVNGKEKTKDEFHFKRTRYQNIKRPVYETSYPPDGNKEN
        SETEQRGES+KETDVEIETTSETKGTK  QEQEGSTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRVNGKEKTKDEFHFKRTRYQNIKRPVYETSYPPDGNKEN
Subjt:  SETEQRGESEKETDVEIETTSETKGTKQEQEQEGSTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRVNGKEKTKDEFHFKRTRYQNIKRPVYETSYPPDGNKEN

Query:  SKLEIDKKEKYLFWFENLL
        SKLEIDKKEK LFWFE  L
Subjt:  SKLEIDKKEKYLFWFENLL

YP_009526349.1 hypothetical chloroplast RF19-like protein [Hemsleya lijiangensis]

2.3e-66

54.23

Show/hide

Query:  MEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP-----------------------------------------------------
        MEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP                                                     
Subjt:  MEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP-----------------------------------------------------

Query:  ---------------------------------------------------------------------------------------IPSPILTKKLKET
                                                                                               IPSPILTKKLKET
Subjt:  ---------------------------------------------------------------------------------------IPSPILTKKLKET

Query:  SETEQRGESEKETDVEIETTSETKGTKQEQEQEGSTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRVNGKEKTKDEFHFKRTRYQNIKRPVYETSYPPDGNKEN
        SETE+RGESE+ETDVEIETTSETKGTK  QEQEGSTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRVNGKEKTKDEFHFKRTRYQNIKRPVYETSYPPDGNKEN
Subjt:  SETEQRGESEKETDVEIETTSETKGTKQEQEQEGSTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRVNGKEKTKDEFHFKRTRYQNIKRPVYETSYPPDGNKEN

Query:  SKLEIDKKEKYLFWFENLL
        SKLEIDKKEKYLFWFE  L
Subjt:  SKLEIDKKEKYLFWFENLL

YP_009526361.1 photosystem I assembly protein Ycf1 [Hemsleya lijiangensis]

2.3e-66

54.23

Show/hide

Query:  MEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP-----------------------------------------------------
        MEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP                                                     
Subjt:  MEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP-----------------------------------------------------

Query:  ---------------------------------------------------------------------------------------IPSPILTKKLKET
                                                                                               IPSPILTKKLKET
Subjt:  ---------------------------------------------------------------------------------------IPSPILTKKLKET

Query:  SETEQRGESEKETDVEIETTSETKGTKQEQEQEGSTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRVNGKEKTKDEFHFKRTRYQNIKRPVYETSYPPDGNKEN
        SETE+RGESE+ETDVEIETTSETKGTK  QEQEGSTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRVNGKEKTKDEFHFKRTRYQNIKRPVYETSYPPDGNKEN
Subjt:  SETEQRGESEKETDVEIETTSETKGTKQEQEQEGSTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRVNGKEKTKDEFHFKRTRYQNIKRPVYETSYPPDGNKEN

Query:  SKLEIDKKEKYLFWFENLL
        SKLEIDKKEKYLFWFE  L
Subjt:  SKLEIDKKEKYLFWFENLL

YP_009753231.1 Ycf1 protein [Trichosanthes truncata]

5.2e-66

53.92

Show/hide

Query:  MEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP-----------------------------------------------------
        MEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP                                                     
Subjt:  MEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP-----------------------------------------------------

Query:  ---------------------------------------------------------------------------------------IPSPILTKKLKET
                                                                                               IPSPI+TKKLKET
Subjt:  ---------------------------------------------------------------------------------------IPSPILTKKLKET

Query:  SETEQRGESEKETDVEIETTSETKGTKQEQEQEGSTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRVNGKEKTKDEFHFKRTRYQNIKRPVYETSYPPDGNKEN
        SETE+RGESE+ETDVEIETTSETKGTK  QEQEGSTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRVNGKEKTKDEFHFKRTRYQNIKRPVYETSYPPDGNKEN
Subjt:  SETEQRGESEKETDVEIETTSETKGTKQEQEQEGSTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRVNGKEKTKDEFHFKRTRYQNIKRPVYETSYPPDGNKEN

Query:  SKLEIDKKEKYLFWFENLL
        SKLEIDKKEKYLFWFE  L
Subjt:  SKLEIDKKEKYLFWFENLL

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A346TM87 Protein TIC 214

1.1e-66

54.23

Show/hide

Query:  MEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP-----------------------------------------------------
        MEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP                                                     
Subjt:  MEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP-----------------------------------------------------

Query:  ---------------------------------------------------------------------------------------IPSPILTKKLKET
                                                                                               IPSPILTKKLKET
Subjt:  ---------------------------------------------------------------------------------------IPSPILTKKLKET

Query:  SETEQRGESEKETDVEIETTSETKGTKQEQEQEGSTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRVNGKEKTKDEFHFKRTRYQNIKRPVYETSYPPDGNKEN
        SETE+RGESE+ETDVEIETTSETKGTK  QEQEGSTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRVNGKEKTKDEFHFKRTRYQNIKRPVYETSYPPDGNKEN
Subjt:  SETEQRGESEKETDVEIETTSETKGTKQEQEQEGSTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRVNGKEKTKDEFHFKRTRYQNIKRPVYETSYPPDGNKEN

Query:  SKLEIDKKEKYLFWFENLL
        SKLEIDKKEKYLFWFE  L
Subjt:  SKLEIDKKEKYLFWFENLL

A0A346TMB2 Protein TIC 214

1.1e-66

54.23

Show/hide

Query:  MEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP-----------------------------------------------------
        MEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP                                                     
Subjt:  MEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP-----------------------------------------------------

Query:  ---------------------------------------------------------------------------------------IPSPILTKKLKET
                                                                                               IPSPILTKKLKET
Subjt:  ---------------------------------------------------------------------------------------IPSPILTKKLKET

Query:  SETEQRGESEKETDVEIETTSETKGTKQEQEQEGSTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRVNGKEKTKDEFHFKRTRYQNIKRPVYETSYPPDGNKEN
        SETE+RGESE+ETDVEIETTSETKGTK  QEQEGSTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRVNGKEKTKDEFHFKRTRYQNIKRPVYETSYPPDGNKEN
Subjt:  SETEQRGESEKETDVEIETTSETKGTKQEQEQEGSTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRVNGKEKTKDEFHFKRTRYQNIKRPVYETSYPPDGNKEN

Query:  SKLEIDKKEKYLFWFENLL
        SKLEIDKKEKYLFWFE  L
Subjt:  SKLEIDKKEKYLFWFENLL

A0A6H0EQ81 Protein TIC 214

4.1e-69

55.17

Show/hide

Query:  MEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP-----------------------------------------------------
        MEEGTEKKVSATTG ITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP                                                     
Subjt:  MEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP-----------------------------------------------------

Query:  ---------------------------------------------------------------------------------------IPSPILTKKLKET
                                                                                               IPSPILTKKLKET
Subjt:  ---------------------------------------------------------------------------------------IPSPILTKKLKET

Query:  SETEQRGESEKETDVEIETTSETKGTKQEQEQEGSTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRVNGKEKTKDEFHFKRTRYQNIKRPVYETSYPPDGNKEN
        SETEQRGESEKETDVEIETTSETKGTKQEQEQEGSTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRVNGKEKTKDEFHFKRTRYQNIKRPVYETSYPPDGNKEN
Subjt:  SETEQRGESEKETDVEIETTSETKGTKQEQEQEGSTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRVNGKEKTKDEFHFKRTRYQNIKRPVYETSYPPDGNKEN

Query:  SKLEIDKKEKYLFWFENLL
        SKLEIDKKEKYLFWFE  L
Subjt:  SKLEIDKKEKYLFWFENLL

A0A6H0ER70 Protein TIC 214

4.3e-66

54.23

Show/hide

Query:  MEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP-----------------------------------------------------
        MEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP                                                     
Subjt:  MEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP-----------------------------------------------------

Query:  ---------------------------------------------------------------------------------------IPSPILTKKLKET
                                                                                               IPSPILTKKLKET
Subjt:  ---------------------------------------------------------------------------------------IPSPILTKKLKET

Query:  SETEQRGESEKETDVEIETTSETKGTKQEQEQEGSTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRVNGKEKTKDEFHFKRTRYQNIKRPVYETSYPPDGNKEN
        SETEQRGES+KETDVEIETTSETKGTK  QEQEGSTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRVNGKEKTKDEFHFKRTRYQNIKRPVYETSYPPDGNKEN
Subjt:  SETEQRGESEKETDVEIETTSETKGTKQEQEQEGSTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRVNGKEKTKDEFHFKRTRYQNIKRPVYETSYPPDGNKEN

Query:  SKLEIDKKEKYLFWFENLL
        SKLEIDKKEK LFWFE  L
Subjt:  SKLEIDKKEKYLFWFENLL

A0A6H0EWE4 Protein TIC 214

2.5e-66

53.92

Show/hide

Query:  MEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP-----------------------------------------------------
        MEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP                                                     
Subjt:  MEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP-----------------------------------------------------

Query:  ---------------------------------------------------------------------------------------IPSPILTKKLKET
                                                                                               IPSPI+TKKLKET
Subjt:  ---------------------------------------------------------------------------------------IPSPILTKKLKET

Query:  SETEQRGESEKETDVEIETTSETKGTKQEQEQEGSTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRVNGKEKTKDEFHFKRTRYQNIKRPVYETSYPPDGNKEN
        SETE+RGESE+ETDVEIETTSETKGTK  QEQEGSTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRVNGKEKTKDEFHFKRTRYQNIKRPVYETSYPPDGNKEN
Subjt:  SETEQRGESEKETDVEIETTSETKGTKQEQEQEGSTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRVNGKEKTKDEFHFKRTRYQNIKRPVYETSYPPDGNKEN

Query:  SKLEIDKKEKYLFWFENLL
        SKLEIDKKEKYLFWFE  L
Subjt:  SKLEIDKKEKYLFWFENLL

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

A4GYX4 Protein TIC 214

8.6e-48

47.34

Show/hide

Query:  EEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP------------------------------------------------------
        EEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP                                                      
Subjt:  EEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP------------------------------------------------------

Query:  --------------------------------------------------------------------------------------IPSPILTKKLKETS
                                                                                              IPSPI TKKLKETS
Subjt:  --------------------------------------------------------------------------------------IPSPILTKKLKETS

Query:  ETEQRGESEKETDVEIETTSETKGTKQEQEQEGSTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRVNGKEKTKDE--FHFKRTRYQNIKRPVYETSYPPDGNKE
        ETE+R   E+ETDVEIETT ETKGTK  QEQEGSTEED S SLFSEEKE+PDKIDETEEIRVNGKEKTKDE  FHFK T Y+N  RPVYET Y  DGN+E
Subjt:  ETEQRGESEKETDVEIETTSETKGTKQEQEQEGSTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRVNGKEKTKDE--FHFKRTRYQNIKRPVYETSYPPDGNKE

Query:  NSKLEI--DKKEKYLFWFE
        NSKLEI  DKK+K L WFE
Subjt:  NSKLEI--DKKEKYLFWFE

A6MM95 Protein TIC 214

2.5e-47

46.11

Show/hide

Query:  MEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP-----------------------------------------------------
        MEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP                                                     
Subjt:  MEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP-----------------------------------------------------

Query:  ---------------------------------------------------------------------------------------IPSPILTKKLKET
                                                                                               +P+PI+TKKLKET
Subjt:  ---------------------------------------------------------------------------------------IPSPILTKKLKET

Query:  SETEQRGESEKETDVEIETTSETKGTKQEQEQEGSTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRVNGKEKTKDEFHFKRTRYQNIKRPVYETSYPPDGNKEN
        S+TE+RGESE+E DVEIETTSETKGTKQEQE+  STEED SPSL SEEKEDPDKIDETEEIRVNGKEKTKDE  FK T Y++  RPVYE +Y  +GN+EN
Subjt:  SETEQRGESEKETDVEIETTSETKGTKQEQEQEGSTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRVNGKEKTKDEFHFKRTRYQNIKRPVYETSYPPDGNKEN

Query:  SKLEI--DKKEKYLFWFENLL
        SKLEI  DK++K LFWFE  L
Subjt:  SKLEI--DKKEKYLFWFENLL

A6MMG9 Protein TIC 214

1.4e-42

44.24

Show/hide

Query:  MEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP-----------------------------------------------------
        MEEGTEK+VSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVL LP                                                     
Subjt:  MEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP-----------------------------------------------------

Query:  ---------------------------------------------------------------------------------------IPSPILTKKLKET
                                                                                               IPSPI+TKKLKET
Subjt:  ---------------------------------------------------------------------------------------IPSPILTKKLKET

Query:  SETEQRGESEKETDVEIETTSETKGTKQEQEQEGSTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRVNGKEKTKDEFHFKRTRYQNIKRPVYETSYPPDGNK--
        SETE+ GESE+ETDVEIETTSET+GT  ++EQEGSTEED  PSL SEEKEDPDKIDETEEIRVNGKEKTKDEFH          RPVYE SY  DG K  
Subjt:  SETEQRGESEKETDVEIETTSETKGTKQEQEQEGSTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRVNGKEKTKDEFHFKRTRYQNIKRPVYETSYPPDGNK--

Query:  ENSKLEIDKKEKYLFWFENLL
        EN +L I K++K LFWFE  L
Subjt:  ENSKLEIDKKEKYLFWFENLL

Q0ZIW0 Protein TIC 214

1.9e-50

47.35

Show/hide

Query:  EEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP------------------------------------------------------
        EEGTEKKVSA TGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP                                                      
Subjt:  EEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP------------------------------------------------------

Query:  --------------------------------------------------------------------------------------IPSPILTKKLKETS
                                                                                              IPSPILTKK+KETS
Subjt:  --------------------------------------------------------------------------------------IPSPILTKKLKETS

Query:  ETEQRGESEKETDVEIETTSETKGTKQEQEQEGSTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRVNGKEKTKDEFHFKRTRYQNIKRPVYETSYPPDGNKENS
        ETE+RGESE+ETDVEIE TSETKGTKQEQE+  STEED SPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRVNGKEKTKDEFHFK T Y+N   PVYETSY  DGN+ENS
Subjt:  ETEQRGESEKETDVEIETTSETKGTKQEQEQEGSTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRVNGKEKTKDEFHFKRTRYQNIKRPVYETSYPPDGNKENS

Query:  KLEI---DKKEKYLFWFENLL
        KLEI   D+  K   WFE  L
Subjt:  KLEI---DKKEKYLFWFENLL

Q14FA0 Protein TIC 214

8.6e-48

47.34

Show/hide

Query:  EEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP------------------------------------------------------
        EEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP                                                      
Subjt:  EEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP------------------------------------------------------

Query:  --------------------------------------------------------------------------------------IPSPILTKKLKETS
                                                                                              IPSPI TKKLKETS
Subjt:  --------------------------------------------------------------------------------------IPSPILTKKLKETS

Query:  ETEQRGESEKETDVEIETTSETKGTKQEQEQEGSTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRVNGKEKTKDE--FHFKRTRYQNIKRPVYETSYPPDGNKE
        ETE+R   E+ETDVEIETT ETKGTK  QEQEGSTEED S SLFSEEKE+PDKIDETEEIRVNGKEKTKDE  FHFK T Y+N  RPVYET Y  DGN+E
Subjt:  ETEQRGESEKETDVEIETTSETKGTKQEQEQEGSTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRVNGKEKTKDE--FHFKRTRYQNIKRPVYETSYPPDGNKE

Query:  NSKLEI--DKKEKYLFWFE
        NSKLEI  DKK+K L WFE
Subjt:  NSKLEI--DKKEKYLFWFE

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G07739.1 Ycf1 protein

6.6e-19

97.83

Show/hide

Query:  EEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP
        EEGTEKKVSATTGFI GQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP
Subjt:  EEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP

ATCG01000.1 Ycf1 protein

3.2e-21

37.88

Show/hide

Query:  EEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP-----------------------------------------------IPSPIL-
        EEGTEKKVSATTGFI GQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP                                               +PS +L 
Subjt:  EEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP-----------------------------------------------IPSPIL-

Query:  -----------TKKLKETSE-------------------------------------------TEQRGESEKETDV--------------------EIET
                    K L  TS                                            +E R    +   +                    +++ 
Subjt:  -----------TKKLKETSE-------------------------------------------TEQRGESEKETDV--------------------EIET

Query:  TSETKGTKQEQEQEGSTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRVNGKEKTK--DEFHFKRTRYQNIKRPVYETSYPPDGNKENSKLEIDKKEK
        TSET GTKQ+QE   STEE   PSLFSEE ED DKIDE EEIRVNGK+K    DEFH +   Y N K  V E  Y   GNKENS LE  K +K
Subjt:  TSETKGTKQEQEQEGSTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRVNGKEKTK--DEFHFKRTRYQNIKRPVYETSYPPDGNKENSKLEIDKKEK

ATCG01130.1 Ycf1 protein

8.9e-24

38.41

Show/hide

Query:  EEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP-----------------------------------------------IPSPIL-
        EEGTEKKVSATTGFI GQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP                                               +PS +L 
Subjt:  EEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP-----------------------------------------------IPSPIL-

Query:  -----------TKKLKETSE-------------------------------------------TEQRGESEKETDV--------------------EIET
                    K L  TS                                            +E R    +   +                    +++ 
Subjt:  -----------TKKLKETSE-------------------------------------------TEQRGESEKETDV--------------------EIET

Query:  TSETKGTKQEQEQEGSTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRVNGKEKTK--DEFHFKRTRYQNIKRPVYETSYPPDGNKENSKLE---IDKKEKYLFW
        TSET GTKQ+QE   STEE   PSLFSEE ED DKIDE EEIRVNGK+K    DEFH +   Y N K  V E  Y   GNKENS LE   I KKE +  W
Subjt:  TSETKGTKQEQEQEGSTEEDTSPSLFSEEKEDPDKIDETEEIRVNGKEKTK--DEFHFKRTRYQNIKRPVYETSYPPDGNKENSKLE---IDKKEKYLFW

Query:  FE
        FE
Subjt:  FE

ATMG00370.1 Ycf1 protein

6.6e-19

97.83

Show/hide

Query:  EEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP
        EEGTEKKVSATTGFI GQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP
Subjt:  EEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALP

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGAAGAAGGAACCGAGAAGAAAGTATCAGCAACAACAGGTTTTATTACGGGACAGCTCATGATGTTCATATCGATCTATTATGCGCCTCTGCATCTAGCATTGGGTAG
ACCTCATACAATAACTGTCCTAGCTCTACCAATACCGTCACCCATTCTTACTAAGAAACTGAAAGAAACCTCAGAAACGGAGCAAAGGGGGGAAAGCGAGAAAGAAACAG
ATGTAGAAATAGAAACCACTTCCGAAACGAAGGGGACTAAACAGGAACAGGAACAGGAGGGATCCACCGAAGAAGATACTTCTCCTTCCCTTTTTTCGGAAGAAAAGGAG
GATCCGGACAAAATCGATGAAACGGAAGAGATCCGAGTGAATGGAAAGGAAAAAACAAAGGATGAATTCCACTTTAAAAGGACACGCTATCAAAATATAAAAAGACCAGT
TTATGAAACTTCTTACCCTCCGGATGGAAATAAAGAAAATTCGAAGTTAGAAATAGATAAAAAAGAAAAATATCTCTTCTGGTTTGAAAACCTCTTGTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPIPSPILTKKLKETSETEQRGESEKETDVEIETTSETKGTKQEQEQEGSTEEDTSPSLFSEEKE
DPDKIDETEEIRVNGKEKTKDEFHFKRTRYQNIKRPVYETSYPPDGNKENSKLEIDKKEKYLFWFENLL

Sed0000142 (gene) of Chayote v1 genome