| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| XP_004135834.1 probable histone H2A variant 3 isoform X2 [Cucumis sativus] | 1.3e-61 | 97.78 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSASNSNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKTRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLA
MSGKGAKGLIMGKSA+N NKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLK+RVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLA
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSASNSNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKTRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLA
Query: IRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
IRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
Subjt: IRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| XP_007202745.1 probable histone H2A variant 3 [Prunus persica] | 1.1e-60 | 94.07 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSASNSNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKTRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLA
MSGKGAKGLIMGKSASNSNKDKDKKKP+SRSSRAGLQFPVGR+HR LK R ANGRVGATAAVY+AAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLA
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSASNSNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKTRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLA
Query: IRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
IRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKS+KE
Subjt: IRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| XP_010033915.1 probable histone H2A variant 3 [Eucalyptus grandis] | 1.0e-61 | 98.52 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSASNSNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKTRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLA
MSGKGAKGLIMGKSASNS KDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLK+RVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLA
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSASNSNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKTRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLA
Query: IRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
IRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
Subjt: IRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| XP_022152569.1 probable histone H2A variant 3 [Momordica charantia] | 5.8e-62 | 98.52 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSASNSNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKTRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLA
MSGKGAKGLIMGKSASN NKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLK+RVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLA
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSASNSNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKTRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLA
Query: IRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
IRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
Subjt: IRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| XP_022953233.1 probable histone H2A variant 3 [Cucurbita moschata] | 2.0e-62 | 99.26 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSASNSNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKTRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLA
MSGKGAKGLIMGKSASN NKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKTRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLA
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSASNSNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKTRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLA
Query: IRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
IRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
Subjt: IRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A059AJB9 Histone H2A | 4.8e-62 | 98.52 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSASNSNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKTRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLA
MSGKGAKGLIMGKSASNS KDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLK+RVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLA
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSASNSNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKTRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLA
Query: IRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
IRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
Subjt: IRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| A0A5D3CH66 Histone H2A | 6.3e-62 | 97.78 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSASNSNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKTRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLA
MSGKGAKGLIMGKSA+N NKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLK+RVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLA
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSASNSNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKTRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLA
Query: IRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
IRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
Subjt: IRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| A0A6J1DGE3 Histone H2A | 2.8e-62 | 98.52 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSASNSNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKTRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLA
MSGKGAKGLIMGKSASN NKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLK+RVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLA
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSASNSNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKTRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLA
Query: IRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
IRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
Subjt: IRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| A0A6J1GMV1 Histone H2A | 9.7e-63 | 99.26 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSASNSNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKTRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLA
MSGKGAKGLIMGKSASN NKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKTRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLA
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSASNSNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKTRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLA
Query: IRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
IRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
Subjt: IRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| A0A6J1JQN2 Histone H2A | 9.7e-63 | 99.26 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSASNSNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKTRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLA
MSGKGAKGLIMGKSASN NKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKTRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLA
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSASNSNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKTRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLA
Query: IRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
IRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
Subjt: IRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| O23628 Histone H2A variant 1 | 8.2e-59 | 86.03 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKS-ASNSNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKTRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQL
M+GKG KGL+ K+ A+N +KDKDKKKP+SRS+RAG+QFPVGR+HRQLKTRV+A+GRVGATAAVYTA+ILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQL
Subjt: MSGKGAKGLIMGKS-ASNSNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKTRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQL
Query: AIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
AIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINK++KE
Subjt: AIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| Q84MP7 Probable histone H2A variant 3 | 7.7e-57 | 86.13 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGK--SASNSNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKTRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQ
M+GKG KGL+ K +A ++ KDK KK PVSRSSRAGLQFPVGR+HRQLK R ANGRVGATAAVY+AAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQ
Subjt: MSGKGAKGLIMGK--SASNSNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKTRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQ
Query: LAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
LAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
Subjt: LAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| Q8H7Y8 Probable histone H2A variant 1 | 1.3e-56 | 85.51 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGK--SASNSNKDKDKKK-PVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKTRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHL
M+GKG KGL+ K +A +++KDKDKKK PVSRSSRAGLQFPVGR+HRQLK+R +A+GRVGATAAVY+AAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHL
Subjt: MSGKGAKGLIMGK--SASNSNKDKDKKK-PVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKTRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHL
Query: QLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
QLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINK+SKE
Subjt: QLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| Q8S857 Probable histone H2A variant 2 | 5.0e-56 | 84.17 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSA---SNSNKDKDKKK-PVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKTRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRH
M+GKG KGL+ K+ + ++KDKD+KK PVSRSSRAG+QFPVGR+HRQLK RV+ANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRH
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSA---SNSNKDKDKKK-PVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKTRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRH
Query: LQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
LQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINK++KE
Subjt: LQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| Q9C944 Probable histone H2A variant 3 | 1.3e-59 | 91.11 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSASNSNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKTRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLA
MSGKGAKGLIMGK S S+KDKDKKKP++RSSRAGLQFPVGRVHR LKTR A+GRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRI+PRHLQLA
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSASNSNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKTRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLA
Query: IRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
IRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKS+KE
Subjt: IRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G52740.1 histone H2A protein 9 | 9.0e-61 | 91.11 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSASNSNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKTRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLA
MSGKGAKGLIMGK S S+KDKDKKKP++RSSRAGLQFPVGRVHR LKTR A+GRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRI+PRHLQLA
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSASNSNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKTRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLA
Query: IRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
IRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKS+KE
Subjt: IRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| AT2G38810.1 histone H2A 8 | 6.7e-56 | 82.35 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGK-SASNSNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKTRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQL
M+GKG KGL+ K +A+ +NKD KKK +SRSSRAG+QFPVGR+HRQLK RV+A+GRVGATAAVYTA+ILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQL
Subjt: MSGKGAKGLIMGK-SASNSNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKTRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQL
Query: AIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
AIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSL+NK +K+
Subjt: AIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| AT2G38810.2 histone H2A 8 | 6.7e-56 | 82.35 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGK-SASNSNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKTRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQL
M+GKG KGL+ K +A+ +NKD KKK +SRSSRAG+QFPVGR+HRQLK RV+A+GRVGATAAVYTA+ILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQL
Subjt: MSGKGAKGLIMGK-SASNSNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKTRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQL
Query: AIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
AIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSL+NK +K+
Subjt: AIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| AT2G38810.3 histone H2A 8 | 6.7e-56 | 82.35 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGK-SASNSNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKTRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQL
M+GKG KGL+ K +A+ +NKD KKK +SRSSRAG+QFPVGR+HRQLK RV+A+GRVGATAAVYTA+ILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQL
Subjt: MSGKGAKGLIMGK-SASNSNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKTRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQL
Query: AIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
AIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSL+NK +K+
Subjt: AIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| AT3G54560.1 histone H2A 11 | 5.8e-60 | 86.03 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKS-ASNSNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKTRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQL
M+GKG KGL+ K+ A+N +KDKDKKKP+SRS+RAG+QFPVGR+HRQLKTRV+A+GRVGATAAVYTA+ILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQL
Subjt: MSGKGAKGLIMGKS-ASNSNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKTRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQL
Query: AIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
AIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINK++KE
Subjt: AIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
