; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0000448 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0000448
OrganismSechium edule (Chayote v1)
Descriptionrhomboid-like protein 20
Genome locationLG12:6992211..6998130
RNA-Seq ExpressionSed0000448
SyntenySed0000448
Gene Ontology termsGO:0006508 - proteolysis (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0004252 - serine-type endopeptidase activity (molecular function)
GO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR009060 - UBA-like superfamily
IPR015940 - Ubiquitin-associated domain
IPR022764 - Peptidase S54, rhomboid domain
IPR035952 - Rhomboid-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6581669.1 Rhomboid-like protein 20, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]8.5e-14390.41Show/hide
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KAG7018158.1 Rhomboid-like protein 20 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.5e-14290.07Show/hide
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XP_022930600.1 rhomboid-like protein 20 [Cucurbita moschata]1.9e-14290.07Show/hide
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XP_022980682.1 rhomboid-like protein 20 [Cucurbita maxima]4.2e-14290.07Show/hide
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XP_023516629.1 rhomboid-like protein 20 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.1e-14290.41Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3CMQ9 rhomboid-like protein 201.0e-14190.41Show/hide
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A0A5D3D5B1 Rhomboid-like protein 201.0e-14190.41Show/hide
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A0A6J1DN01 rhomboid-like protein 206.0e-14291.13Show/hide
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        I SFFS+FSLP  GNPP AAP+R+VRGNMPSF GRQVERNY  VPTAT EPPEDSIATLVSMGFDRNSARQALV ARN+VNMATNILLE+QSH
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A0A6J1EXA3 rhomboid-like protein 209.2e-14390.07Show/hide
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A0A6J1IRZ2 rhomboid-like protein 202.1e-14290.07Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q4R910 Ubiquitin-associated domain-containing protein 22.9e-1624.78Show/hide
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        G SG   AP++++ ++  +  ++   +          Y    VK   + W+L+          +      L+Y FR+FER+ GS K++ F+L S V S L
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Query:  FEVLAISLLK----DPAANLVTSGPYGLLFASFIPFFFDIPVSTQFRVFG-VRFSDKSFIYLAGLQLLLSS---WRRSILPGICGILAGSLYRLNVFGIR
        F+ L +  ++      AA+ + SG    +FA F+PF+  IP     ++ G +  ++K+ IY+ GLQL  S    W    +  I G+++G  Y   +F + 
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Query:  KAK-FPEFIGSFFSRFSLP-FAGNPPAAPS----------------------------------RNVRGNMPSF------------MGRQVERNYTPVPT
        +    P ++  FFS    P F+ + P + +                                  R  +G M ++            +  Q  R   P   
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Query:  ATAEPPEDSIATLVSMGFDRNSARQALVHARNNVNMATNILLE
           E  E+ +A L+ MGF R  A +AL  + N++N+ATN LL+
Subjt:  ATAEPPEDSIATLVSMGFDRNSARQALVHARNNVNMATNILLE

Q5ZJQ8 Ubiquitin-associated domain-containing protein 21.3e-1625.29Show/hide
Query:  GPSGFNNAPITRASIIATALFTIFFGIKGRSSNLGLSYQDVIVK--LRFWKLVMSVFAFSSTPELMFGVFLLYYFRVFERQIGSNKYSVFILFSIVTSLL
        G +G   AP++++ ++  +  +I   +  +      +Y    +K   + W+LV          +      L+Y FR+FER+ GS K+S F+L +   S L
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Query:  FEVLAISLLK---DPAANLVTSGPYGLLFASFIPFFFDIPVSTQFRVFG-VRFSDKSFIYLAGLQLLLSSWRRSILPGICGILAGSLYRLNVFGIRKAK-
        F++L +   +       N + SG  G +FA F+PF+  IP     +V G    ++K+ +Y+ GLQLL S     IL  + G+++G  Y  ++  + +   
Subjt:  FEVLAISLLK---DPAANLVTSGPYGLLFASFIPFFFDIPVSTQFRVFG-VRFSDKSFIYLAGLQLLLSSWRRSILPGICGILAGSLYRLNVFGIRKAK-

Query:  FPEFIGSFFSRFSLPFAGNPPAAPSRNVRGNMPS-----------FMGRQV--------------------------------ERNY---------TPVP
         P ++   FS    P   +  A P+  +R  M +            + RQ+                                  NY         TP P
Subjt:  FPEFIGSFFSRFSLPFAGNPPAAPSRNVRGNMPS-----------FMGRQV--------------------------------ERNY---------TPVP

Query:  TATAEPPEDSIATLVSMGFDRNSARQALVHARNNVNMATNILLE
        T   E  E+ +A L+ MGF R  A +AL  + N++N+ATN LL+
Subjt:  TATAEPPEDSIATLVSMGFDRNSARQALVHARNNVNMATNILLE

Q8NBM4 Ubiquitin-associated domain-containing protein 23.7e-1625.73Show/hide
Query:  GPSGFNNAPITRASIIATALFTIFFGIKGRSSNLGLSYQDVIVK--LRFWKLVMSVFAFSSTPELMFGVFLLYYFRVFERQIGSNKYSVFILFSIVTSLL
        G SG   AP++++ ++  +  ++   +          Y    VK   + W+L+          +      L+Y FR+FER+ GS K++ F+L S V S L
Subjt:  GPSGFNNAPITRASIIATALFTIFFGIKGRSSNLGLSYQDVIVK--LRFWKLVMSVFAFSSTPELMFGVFLLYYFRVFERQIGSNKYSVFILFSIVTSLL

Query:  FEVLAISLLK----DPAANLVTSGPYGLLFASFIPFFFDIPVSTQFRVFG-VRFSDKSFIYLAGLQLLLSS---WRRSILPGICGILAGSLYRLNVFGIR
        F+ L I  ++      AA+ + SG    +FA F+PF+  IP     ++ G +  ++K+ IY+ GLQL  S    W    +  I G+++G  Y   +F + 
Subjt:  FEVLAISLLK----DPAANLVTSGPYGLLFASFIPFFFDIPVSTQFRVFG-VRFSDKSFIYLAGLQLLLSS---WRRSILPGICGILAGSLYRLNVFGIR

Query:  KAK-FPEFIGSFFSRFSLP-FAGNPPAAPSRNVRG--------NMPSFMGRQV---------------------ERNYTPV------------PTATAEP
        +    P ++  FFS    P F+ + P + +R   G             + RQ+                      R + P+             +  A P
Subjt:  KAK-FPEFIGSFFSRFSLP-FAGNPPAAPSRNVRG--------NMPSFMGRQV---------------------ERNYTPV------------PTATAEP

Query:  P----EDSIATLVSMGFDRNSARQALVHARNNVNMATNILLE
        P    E+ +A L+ MGF R  A +AL  + N++N+ATN LL+
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Q8RXQ2 Rhomboid-like protein 181.6e-10768.49Show/hide
Query:  MNGGPSGFNNAPITRASIIATALFTIFFGIKGRSSNLGLSYQDVIVKLRFWKLVMSVFAFSSTPELMFGVFLLYYFRVFERQIGSNKYSVFILFSIVTSL
        MNGGPSGFNNAP+T+A +IATALFT+FFGI+G SS LGLSYQD+  K R WKL++S FAFSST +L+ G++LLY+FRVFERQIGSNKYSVFI FS   SL
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        + E + +SL KDP ANL+TSGPY L+FASF+PFF DIPV+ +F V GV FSDKSFIYLAG+QLLLSSW+RSI  GICGI+AGSLYRLN+FGIRKAKFPEF
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        + S FSRFSLP   +    P R      P+ +GRQ  R Y     +T EP E++IATLVSMGFD+N+ARQALVHARN+VN ATNILLE+ SH
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Q9LET3 Rhomboid-like protein 206.2e-12074.06Show/hide
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        MNGGPSGF+NAP+T+A +I +ALFT+FFGI+GRSS LGLSYQD+  K R WKL+MS FAFSSTPELMFG++LLYYFRVFERQIGSNKYSVFILFS   SL
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        L EV+ +SLLKD  ANL+TSGPYGL+FASFIPF+ DIPVST+FRVFGV FSDKSFIYLAG+QLLLSSW+RSI PGICGI+AGSLYRLN+ GIRKAKFPEF
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        + SFFSR S P  GN PP APSRN+ G +    GR+ ER+      ++ EP E++I TLVSMGFDRN+ARQALVHARN+VN ATNILLE+QSH
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G41160.1 Ubiquitin-associated (UBA) protein1.1e-10868.49Show/hide
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        MNGGPSGFNNAP+T+A +IATALFT+FFGI+G SS LGLSYQD+  K R WKL++S FAFSST +L+ G++LLY+FRVFERQIGSNKYSVFI FS   SL
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        + E + +SL KDP ANL+TSGPY L+FASF+PFF DIPV+ +F V GV FSDKSFIYLAG+QLLLSSW+RSI  GICGI+AGSLYRLN+FGIRKAKFPEF
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        + S FSRFSLP   +    P R      P+ +GRQ  R Y     +T EP E++IATLVSMGFD+N+ARQALVHARN+VN ATNILLE+ SH
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AT3G56740.1 Ubiquitin-associated (UBA) protein4.4e-12174.06Show/hide
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        MNGGPSGF+NAP+T+A +I +ALFT+FFGI+GRSS LGLSYQD+  K R WKL+MS FAFSSTPELMFG++LLYYFRVFERQIGSNKYSVFILFS   SL
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        L EV+ +SLLKD  ANL+TSGPYGL+FASFIPF+ DIPVST+FRVFGV FSDKSFIYLAG+QLLLSSW+RSI PGICGI+AGSLYRLN+ GIRKAKFPEF
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Query:  IGSFFSRFSLPFAGN-PPAAPSRNVRGNMPSFMGRQVERNYTPVPTATAEPPEDSIATLVSMGFDRNSARQALVHARNNVNMATNILLESQSH
        + SFFSR S P  GN PP APSRN+ G +    GR+ ER+      ++ EP E++I TLVSMGFDRN+ARQALVHARN+VN ATNILLE+QSH
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAACGGCGGCCCGTCTGGTTTCAACAATGCCCCCATCACCCGCGCTTCCATAATCGCCACCGCTCTTTTCACCATTTTCTTCGGGATCAAAGGCCGCTCCAGTAACCT
TGGATTGTCCTATCAGGATGTGATTGTGAAGCTTCGGTTTTGGAAGTTAGTAATGTCAGTTTTTGCATTTTCATCTACTCCAGAATTGATGTTTGGAGTGTTTCTGCTTT
ATTACTTTAGAGTATTTGAGAGACAAATAGGTTCCAACAAATATTCGGTCTTTATCTTGTTCTCTATAGTAACATCCTTACTTTTTGAGGTCCTTGCTATATCATTACTT
AAAGATCCTGCTGCGAATCTAGTCACTTCTGGACCATATGGTCTTTTATTTGCCTCCTTCATACCCTTCTTCTTTGATATTCCTGTTTCAACTCAGTTCCGTGTATTTGG
AGTTCGTTTCTCTGACAAGTCTTTCATATATCTGGCTGGTCTTCAGCTCCTTCTGTCCTCGTGGAGAAGATCCATCTTACCAGGAATATGCGGCATTCTCGCTGGTTCCT
TATATCGTTTGAATGTATTTGGCATCCGCAAGGCCAAGTTTCCTGAGTTCATCGGTTCTTTTTTTTCGCGATTTTCTTTACCATTTGCTGGGAATCCTCCAGCAGCCCCA
AGTAGAAATGTTAGAGGAAACATGCCCTCTTTCATGGGCCGCCAGGTTGAGAGGAACTATACTCCTGTGCCAACTGCCACAGCAGAACCACCAGAGGACTCCATTGCTAC
CCTTGTTTCAATGGGCTTTGACAGAAACTCAGCCAGGCAGGCTCTTGTGCATGCCCGAAACAACGTTAACATGGCGACAAACATCCTTCTTGAATCACAATCTCACTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CACAGACCAGTCCAAAGGTCCCAACAAACAGACAACAAATCAAAATCAAAATCAAAATCACAGAGAAAATTCTCCGGCCATCTGAGGCGGTCGTCGCTTCCTCTCCGGCA
CGATGAACGGCGGCCCGTCTGGTTTCAACAATGCCCCCATCACCCGCGCTTCCATAATCGCCACCGCTCTTTTCACCATTTTCTTCGGGATCAAAGGCCGCTCCAGTAAC
CTTGGATTGTCCTATCAGGATGTGATTGTGAAGCTTCGGTTTTGGAAGTTAGTAATGTCAGTTTTTGCATTTTCATCTACTCCAGAATTGATGTTTGGAGTGTTTCTGCT
TTATTACTTTAGAGTATTTGAGAGACAAATAGGTTCCAACAAATATTCGGTCTTTATCTTGTTCTCTATAGTAACATCCTTACTTTTTGAGGTCCTTGCTATATCATTAC
TTAAAGATCCTGCTGCGAATCTAGTCACTTCTGGACCATATGGTCTTTTATTTGCCTCCTTCATACCCTTCTTCTTTGATATTCCTGTTTCAACTCAGTTCCGTGTATTT
GGAGTTCGTTTCTCTGACAAGTCTTTCATATATCTGGCTGGTCTTCAGCTCCTTCTGTCCTCGTGGAGAAGATCCATCTTACCAGGAATATGCGGCATTCTCGCTGGTTC
CTTATATCGTTTGAATGTATTTGGCATCCGCAAGGCCAAGTTTCCTGAGTTCATCGGTTCTTTTTTTTCGCGATTTTCTTTACCATTTGCTGGGAATCCTCCAGCAGCCC
CAAGTAGAAATGTTAGAGGAAACATGCCCTCTTTCATGGGCCGCCAGGTTGAGAGGAACTATACTCCTGTGCCAACTGCCACAGCAGAACCACCAGAGGACTCCATTGCT
ACCCTTGTTTCAATGGGCTTTGACAGAAACTCAGCCAGGCAGGCTCTTGTGCATGCCCGAAACAACGTTAACATGGCGACAAACATCCTTCTTGAATCACAATCTCACTA
ATATCATGAAAAACTTTCTGGATATATGAAACATTGAAACCTTTGCTGTCCATAATTCCGGGAACAATCGAATTCAGTATCGAGGAATGACGGTCCGACAAACTTGCATT
TGCTGACAACTGAGTTTTGATAGGTTGCAGGAACCCAAACTCTTAGTGGGTTCCCATTTTGTTCCTCTATTGTAGCTGTCAAATTTTATTGATACTTGATGTCTGATTAC
AAAAGATTGCTTAGTCTGTACTTATTAAGTTAAGATGGTAGAGATATTTGTGGAAGCAGAATGTGCAGAATTCTTTTGTTCTGAGATATCTGCATAAAAATTGCAGATTA
TTACTCAAGTTTTATTTGCGGCTAATCGTGATTAACTCGTTATATTCAAACAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MNGGPSGFNNAPITRASIIATALFTIFFGIKGRSSNLGLSYQDVIVKLRFWKLVMSVFAFSSTPELMFGVFLLYYFRVFERQIGSNKYSVFILFSIVTSLLFEVLAISLL
KDPAANLVTSGPYGLLFASFIPFFFDIPVSTQFRVFGVRFSDKSFIYLAGLQLLLSSWRRSILPGICGILAGSLYRLNVFGIRKAKFPEFIGSFFSRFSLPFAGNPPAAP
SRNVRGNMPSFMGRQVERNYTPVPTATAEPPEDSIATLVSMGFDRNSARQALVHARNNVNMATNILLESQSH