; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0000563 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0000563
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionB box-type domain-containing protein
Genome locationLG04:41201092..41203295
RNA-Seq ExpressionSed0000563
SyntenySed0000563
Gene Ontology termsGO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR006734 - PLATZ transcription factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6599925.1 hypothetical protein SDJN03_05158, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.4e-9485.85Show/hide
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KAG7030608.1 hypothetical protein SDJN02_04645 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.4e-9485.85Show/hide
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XP_022942707.1 uncharacterized protein LOC111447662 [Cucurbita moschata]1.4e-9485.85Show/hide
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XP_022996504.1 uncharacterized protein LOC111491731 [Cucurbita maxima]5.2e-9485.37Show/hide
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XP_023548890.1 uncharacterized protein LOC111807405 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.2e-9385.92Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KL89 Uncharacterized protein1.5e-7870.05Show/hide
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A0A6J1D096 uncharacterized protein LOC111015876 isoform X13.5e-8879.71Show/hide
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A0A6J1D0E9 uncharacterized protein LOC111015876 isoform X22.1e-6968.6Show/hide
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A0A6J1FR06 uncharacterized protein LOC1114476626.6e-9585.85Show/hide
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A0A6J1K8W8 uncharacterized protein LOC1114917312.5e-9485.37Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q1G3Q4 Protein RGF1 INDUCIBLE TRANSCRIPTION FACTOR 14.2e-2239.06Show/hide
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        WL  L   KFF  C  H   +KNE+N  C+DC  S C +C   H  HR + + +YVYH+VVR++D++K   CS +  Y +N    V +K R Q+   K  
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           +G  C  C R +Q+P   CS+ CKV
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G31040.1 PLATZ transcription factor family protein3.3e-2232.6Show/hide
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        WL  L+   FF+SC +H   RK+EKN  C+ C +S C +C   H  H  + + +YVYH+VVR+ D+EK   CS +  Y +NG   + L  R Q     S 
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           S   C  C R +Q+P  FCS++CKV   S   +    I+      DF        G+    E ++ E        ++ SE  +     E ++  K  
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        P S+ L          RRKG PHR+PF
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AT2G01818.1 PLATZ transcription factor family protein6.0e-4045.62Show/hide
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        E  W+ TLLNS+FF  C  H  LRKNEKN  C+DC+V  C++C  TV   H LHR++ I KYVY +V+R+ +++ +F CSEI TYK+NGE  +HL SR Q
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Query:  SVDTK-SPKTKSGGSCEDCGRYVQD-PNRFCSIACKVSVDSKLKNQCIGIILSSSPDFGNLSFKEKTSRETNASELES-TISMAESREDTKASPSS----
        + D + S K K+G SC  C RY+QD PN FCSI+CK+S  SK    C    L  S     +  KE +++E +  E +S T S+ +  ED++   S     
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Query:  SLLRKRRRKGTPHRSPF
         LLR  +RKG   RSPF
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AT2G12646.1 PLATZ transcription factor family protein3.0e-2339.06Show/hide
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        WL  L   KFF  C  H   +KNE+N  C+DC  S C +C   H  HR + + +YVYH+VVR++D++K   CS +  Y +N    V +K R Q+   K  
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Query:  KTKSGGSCEDCGRYVQDPNRFCSIACKV
           +G  C  C R +Q+P   CS+ CKV
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AT3G60670.1 PLATZ transcription factor family protein1.1e-2035.56Show/hide
Query:  WLGTLLNSKFFTSCDVHHNLRKNEKNKLCVDCSVSFCKNC-TVHDLHRQVHIWKYVYHEVVRVQDMEKHFCCSEIHTYKVNGEICVHLKSRGQSVDTKSP
        WL  LL  KFF +C  H + +KNEKN LC+DC ++ C +C + H  HR + I +YVY +V+RV+D  K   CS I  Y  N    V +  R QS   +  
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           SG  C  C R +Q P  FC ++CK+S D  ++ + +   L        L   ++ +  T +S LE T S   S E +
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AT5G46710.1 PLATZ transcription factor family protein1.3e-1834.15Show/hide
Query:  WLGTLLNSKFFTSCDVHHNLRKNEKNKLCVDC-SVSFCKNC-TVHDLHRQVHIWKYVYHEVVRVQDMEKHFCCSEIHTYKVNGEICVHLKSRGQSVDTKS
        WL  LLN  FF  C  H +L + E    C+DC + SFC  C + H+ HR + I    YH V +V +++K+   S I TY +N    + L  R QS     
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Query:  PKTKSGGSCEDCGR-YVQDPNRFCSIACKVSVDSKLKNQCIGIILSSSPDFGNLSFKEKTSRETNASELESTISMAESREDTKASPSSSLLRKRRRKGTP
        P      +C  C R   ++  RFCSI CKV+  S +  + +    + S +  N S       E N+S  E+  S  +S            LRKR RKG P
Subjt:  PKTKSGGSCEDCGR-YVQDPNRFCSIACKVSVDSKLKNQCIGIILSSSPDFGNLSFKEKTSRETNASELESTISMAESREDTKASPSSSLLRKRRRKGTP

Query:  HRSPF
        HR+PF
Subjt:  HRSPF


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAATCGGATTGGCTCGGTACGCTTTTGAATTCGAAATTCTTCACTTCTTGCGATGTTCATCATAATCTCCGGAAAAATGAGAAAAATAAATTATGCGTTGATTGTAG
TGTTAGCTTCTGCAAGAATTGTACAGTACATGATCTTCATCGACAGGTTCATATCTGGAAATATGTCTATCATGAAGTTGTGCGCGTTCAGGACATGGAGAAACACTTTT
GCTGTTCAGAGATTCATACATATAAAGTCAATGGTGAAATATGTGTTCACCTAAAGTCCCGGGGGCAATCGGTCGACACGAAATCACCAAAGACGAAGTCGGGTGGTTCT
TGTGAAGATTGTGGTAGATATGTGCAAGATCCTAATCGCTTCTGTTCAATTGCTTGCAAGGTTTCTGTGGACTCAAAGCTTAAGAACCAGTGCATAGGAATCATCCTTTC
TTCGAGCCCGGATTTCGGTAACTTATCATTCAAGGAAAAAACCAGCCGAGAAACAAATGCAAGCGAATTGGAATCAACCATATCAATGGCAGAGTCCAGAGAAGATACCA
AAGCTAGCCCTTCATCTTCACTACTTCGAAAACGTAGAAGAAAAGGAACCCCTCACAGATCTCCATTCATCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTGAACACTCACAGACACACTCGTAAAACATTTCTGTTCATCAAATAAAAAAATAAAATAAAATAATAATCCTACACATTTCCGTTTCCATTTTCACTTTAATCTTCTTT
CTTCTTTGTTCTTCCTCCATTTTTCAGAGCTTAATCCGATTTATTCATAGCTTCCTCTGCGTTTTTGTACTGATTTCGATCTTTCTCTTCAGCCTGCAATCGCAAGAATC
TGTTACAATTATGCGATTCTTTTAGGATGGAATCGGATTGGCTCGGTACGCTTTTGAATTCGAAATTCTTCACTTCTTGCGATGTTCATCATAATCTCCGGAAAAATGAG
AAAAATAAATTATGCGTTGATTGTAGTGTTAGCTTCTGCAAGAATTGTACAGTACATGATCTTCATCGACAGGTTCATATCTGGAAATATGTCTATCATGAAGTTGTGCG
CGTTCAGGACATGGAGAAACACTTTTGCTGTTCAGAGATTCATACATATAAAGTCAATGGTGAAATATGTGTTCACCTAAAGTCCCGGGGGCAATCGGTCGACACGAAAT
CACCAAAGACGAAGTCGGGTGGTTCTTGTGAAGATTGTGGTAGATATGTGCAAGATCCTAATCGCTTCTGTTCAATTGCTTGCAAGGTTTCTGTGGACTCAAAGCTTAAG
AACCAGTGCATAGGAATCATCCTTTCTTCGAGCCCGGATTTCGGTAACTTATCATTCAAGGAAAAAACCAGCCGAGAAACAAATGCAAGCGAATTGGAATCAACCATATC
AATGGCAGAGTCCAGAGAAGATACCAAAGCTAGCCCTTCATCTTCACTACTTCGAAAACGTAGAAGAAAAGGAACCCCTCACAGATCTCCATTCATCTGATGAGATGCAA
CATTTTCATCTCCTTTTTTACTTCATTAATTCCTTGTGGCTCTCAATTGGTATGTGCTTCTAAAACTTTATTTACCATAACTAAAATTTATATAAAATGATCAATATAAA
ATCCAAGATTTTAGATAACAGCTTTTCAAATCTCTCTATTTGCATGGTTTTAAAATTTTCATTTTGCAGCTTTGACTAGGAAGATTAGTTGGTAGAGAAAGCTGACATAA
GCAGACATTTTTGACCCATTTTGAAGAATTATTATTTATATGTCCATGTGATTGCATTTCCCATCTGAGAATAGTTAAATAGGATATTGTTCATCACTGCAATTAGCATG
TGGGTGTGGGTCTTATTATTGATGAGAATGTTTGTGAATGTGTTTACATGAAAGTTTGCTTTCTCACTTTTTCTTTATCTTTTTCTCTTTTTGCTGTATGGC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MESDWLGTLLNSKFFTSCDVHHNLRKNEKNKLCVDCSVSFCKNCTVHDLHRQVHIWKYVYHEVVRVQDMEKHFCCSEIHTYKVNGEICVHLKSRGQSVDTKSPKTKSGGS
CEDCGRYVQDPNRFCSIACKVSVDSKLKNQCIGIILSSSPDFGNLSFKEKTSRETNASELESTISMAESREDTKASPSSSLLRKRRRKGTPHRSPFI