; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0000570 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0000570
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionDevelopmentally-regulated GTP-binding protein 1
Genome locationLG10:2812178..2813617
RNA-Seq ExpressionSed0000570
SyntenySed0000570
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6604241.1 hypothetical protein SDJN03_04850, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.6e-3965.99Show/hide
Query:  NPKSGRCKLIIVLLIFMIQFASCFAKESNKGYERPSFGDFIQQSVSILKKSHATHLDKIKSLIHQVQLQFFPPNLDFRSRDETSDEQGVVDEMKEAAEKS
        NPK+ R +L+++  IFM+  ASCFA E NK  ERPSFG+FIQ++V+ILKKSH +  DK+K LIHQ+QLQFFPPNLDFRS DE    +GVVDE+KEA EKS
Subjt:  NPKSGRCKLIIVLLIFMIQFASCFAKESNKGYERPSFGDFIQQSVSILKKSHATHLDKIKSLIHQVQLQFFPPNLDFRSRDETSDEQGVVDEMKEAAEKS

Query:  FETSKDAVEESAKSAAKAMEEAVDKVKENLIDKENNNNNNQNSHDEL
        F  SKDAV ESA+SAAK MEEAVDKVKENL+DK+ + + +++SHDEL
Subjt:  FETSKDAVEESAKSAAKAMEEAVDKVKENLIDKENNNNNNQNSHDEL

KAG7034399.1 hypothetical protein SDJN02_04127 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]7.1e-4066.67Show/hide
Query:  NPKSGRCKLIIVLLIFMIQFASCFAKESNKGYERPSFGDFIQQSVSILKKSHATHLDKIKSLIHQVQLQFFPPNLDFRSRDETSDEQGVVDEMKEAAEKS
        NPK+ R +L+++  IFM+  ASCFA E NK  ERPSFG+FIQ++V+ILKKSH +  DK+K LIHQ+QLQFFPPNLDFRS DE    +GVVDE+KEA EKS
Subjt:  NPKSGRCKLIIVLLIFMIQFASCFAKESNKGYERPSFGDFIQQSVSILKKSHATHLDKIKSLIHQVQLQFFPPNLDFRSRDETSDEQGVVDEMKEAAEKS

Query:  FETSKDAVEESAKSAAKAMEEAVDKVKENLIDKENNNNNNQNSHDEL
        F  SKDAV ESA+SAAK MEEAVDKVKENL+DKE + + +++SHDEL
Subjt:  FETSKDAVEESAKSAAKAMEEAVDKVKENLIDKENNNNNNQNSHDEL

XP_008440136.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103484692 [Cucumis melo]3.5e-3970.71Show/hide
Query:  KLIIVLLIFMIQFASCFAKESNKGYERPSFGDFIQQSVSILKKSHATHLDKIKSLIHQVQLQFFPPNLDFRSRDETSDEQGVVDEMKEAAEKSFETSKDA
        +L++VLLI M+  ASCFA +SNK  ERPSF +FIQ++V+ILKKSH+T LDKI+S+IHQ+Q QFFPPNLDFRS DET  + GVVDE+KEA EKSFE SKDA
Subjt:  KLIIVLLIFMIQFASCFAKESNKGYERPSFGDFIQQSVSILKKSHATHLDKIKSLIHQVQLQFFPPNLDFRSRDETSDEQGVVDEMKEAAEKSFETSKDA

Query:  VEESAKSAAKAMEEAVDKVKENLIDKENNNNNNQNSHDEL
        VEESAKSAAK MEEAVDKVKENL+D   N +  +N HDEL
Subjt:  VEESAKSAAKAMEEAVDKVKENLIDKENNNNNNQNSHDEL

XP_011657792.2 uncharacterized protein LOC105435898 [Cucumis sativus]1.6e-3969.13Show/hide
Query:  MCNPKSGRCKLIIVLLIFMIQFASCFAKESNKGYERPSFGDFIQQSVSILKKSHATHLDKIKSLIHQVQLQFFPPNLDFRSRDETSDEQGVVDEMKEAAE
        +CN ++ R  L++VLLI M+  ASCFA +SN   ERPSF +FIQ++V+ILKKSH+T L+KIKSLIHQ+QLQFFPPNLDFRS DET  + GVVDEMKEA E
Subjt:  MCNPKSGRCKLIIVLLIFMIQFASCFAKESNKGYERPSFGDFIQQSVSILKKSHATHLDKIKSLIHQVQLQFFPPNLDFRSRDETSDEQGVVDEMKEAAE

Query:  KSFETSKDAVEESAKSAAKAMEEAVDKVKENLIDKENNNNNNQNSHDEL
        KSF  SKDAVEESAKSAAK MEEAVDKVKENL D   N +  +N HDEL
Subjt:  KSFETSKDAVEESAKSAAKAMEEAVDKVKENLIDKENNNNNNQNSHDEL

XP_022950287.1 uncharacterized protein LOC111453420 [Cucurbita moschata]7.9e-3965.31Show/hide
Query:  NPKSGRCKLIIVLLIFMIQFASCFAKESNKGYERPSFGDFIQQSVSILKKSHATHLDKIKSLIHQVQLQFFPPNLDFRSRDETSDEQGVVDEMKEAAEKS
        NPK+ R +L+++  I M+  ASCFA E NK  ERPSFG+FIQ++V+ILKKSH +  DK+K LIHQ+QLQFFPPNLDFRS DE    +GVVDE+KEA EKS
Subjt:  NPKSGRCKLIIVLLIFMIQFASCFAKESNKGYERPSFGDFIQQSVSILKKSHATHLDKIKSLIHQVQLQFFPPNLDFRSRDETSDEQGVVDEMKEAAEKS

Query:  FETSKDAVEESAKSAAKAMEEAVDKVKENLIDKENNNNNNQNSHDEL
        F  SKDAV ESA+SAAK MEEAVDKVKENL+DK+ + + +++SHDEL
Subjt:  FETSKDAVEESAKSAAKAMEEAVDKVKENLIDKENNNNNNQNSHDEL

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KFX9 Uncharacterized protein7.7e-4069.13Show/hide
Query:  MCNPKSGRCKLIIVLLIFMIQFASCFAKESNKGYERPSFGDFIQQSVSILKKSHATHLDKIKSLIHQVQLQFFPPNLDFRSRDETSDEQGVVDEMKEAAE
        +CN ++ R  L++VLLI M+  ASCFA +SN   ERPSF +FIQ++V+ILKKSH+T L+KIKSLIHQ+QLQFFPPNLDFRS DET  + GVVDEMKEA E
Subjt:  MCNPKSGRCKLIIVLLIFMIQFASCFAKESNKGYERPSFGDFIQQSVSILKKSHATHLDKIKSLIHQVQLQFFPPNLDFRSRDETSDEQGVVDEMKEAAE

Query:  KSFETSKDAVEESAKSAAKAMEEAVDKVKENLIDKENNNNNNQNSHDEL
        KSF  SKDAVEESAKSAAK MEEAVDKVKENL D   N +  +N HDEL
Subjt:  KSFETSKDAVEESAKSAAKAMEEAVDKVKENLIDKENNNNNNQNSHDEL

A0A1S3B154 uncharacterized protein LOC1034846921.7e-3970.71Show/hide
Query:  KLIIVLLIFMIQFASCFAKESNKGYERPSFGDFIQQSVSILKKSHATHLDKIKSLIHQVQLQFFPPNLDFRSRDETSDEQGVVDEMKEAAEKSFETSKDA
        +L++VLLI M+  ASCFA +SNK  ERPSF +FIQ++V+ILKKSH+T LDKI+S+IHQ+Q QFFPPNLDFRS DET  + GVVDE+KEA EKSFE SKDA
Subjt:  KLIIVLLIFMIQFASCFAKESNKGYERPSFGDFIQQSVSILKKSHATHLDKIKSLIHQVQLQFFPPNLDFRSRDETSDEQGVVDEMKEAAEKSFETSKDA

Query:  VEESAKSAAKAMEEAVDKVKENLIDKENNNNNNQNSHDEL
        VEESAKSAAK MEEAVDKVKENL+D   N +  +N HDEL
Subjt:  VEESAKSAAKAMEEAVDKVKENLIDKENNNNNNQNSHDEL

A0A5D3CLZ9 Uncharacterized protein1.7e-3970.71Show/hide
Query:  KLIIVLLIFMIQFASCFAKESNKGYERPSFGDFIQQSVSILKKSHATHLDKIKSLIHQVQLQFFPPNLDFRSRDETSDEQGVVDEMKEAAEKSFETSKDA
        +L++VLLI M+  ASCFA +SNK  ERPSF +FIQ++V+ILKKSH+T LDKI+S+IHQ+Q QFFPPNLDFRS DET  + GVVDE+KEA EKSFE SKDA
Subjt:  KLIIVLLIFMIQFASCFAKESNKGYERPSFGDFIQQSVSILKKSHATHLDKIKSLIHQVQLQFFPPNLDFRSRDETSDEQGVVDEMKEAAEKSFETSKDA

Query:  VEESAKSAAKAMEEAVDKVKENLIDKENNNNNNQNSHDEL
        VEESAKSAAK MEEAVDKVKENL+D   N +  +N HDEL
Subjt:  VEESAKSAAKAMEEAVDKVKENLIDKENNNNNNQNSHDEL

A0A6J1GEE2 uncharacterized protein LOC1114534203.8e-3965.31Show/hide
Query:  NPKSGRCKLIIVLLIFMIQFASCFAKESNKGYERPSFGDFIQQSVSILKKSHATHLDKIKSLIHQVQLQFFPPNLDFRSRDETSDEQGVVDEMKEAAEKS
        NPK+ R +L+++  I M+  ASCFA E NK  ERPSFG+FIQ++V+ILKKSH +  DK+K LIHQ+QLQFFPPNLDFRS DE    +GVVDE+KEA EKS
Subjt:  NPKSGRCKLIIVLLIFMIQFASCFAKESNKGYERPSFGDFIQQSVSILKKSHATHLDKIKSLIHQVQLQFFPPNLDFRSRDETSDEQGVVDEMKEAAEKS

Query:  FETSKDAVEESAKSAAKAMEEAVDKVKENLIDKENNNNNNQNSHDEL
        F  SKDAV ESA+SAAK MEEAVDKVKENL+DK+ + + +++SHDEL
Subjt:  FETSKDAVEESAKSAAKAMEEAVDKVKENLIDKENNNNNNQNSHDEL

A0A6J1ILF3 uncharacterized protein LOC1114780913.2e-3865.1Show/hide
Query:  NPKSGRCKLIIVLLIFMIQFASCFAKESNKGYERPSFGDFIQQSVSILKKSHATHLDKIKSLIHQVQLQFFPPNLDFRSRDETSDEQGVVDEMKEAAEKS
        NPK+ R +L+++  + M+  ASCFA E NK  ERPSFG+FIQ++V+ILKKSH +  DK+K LIHQ+QLQFFPPNLDFRS DE    +GVVDE+KEA EKS
Subjt:  NPKSGRCKLIIVLLIFMIQFASCFAKESNKGYERPSFGDFIQQSVSILKKSHATHLDKIKSLIHQVQLQFFPPNLDFRSRDETSDEQGVVDEMKEAAEKS

Query:  FETSKDAVEESAKSAAKAMEEAVDKVKENLI--DKENNNNNNQNSHDEL
        F  SKDAV ESAKSAAK MEEAVDKVKENL+  DKE + + +++SHDEL
Subjt:  FETSKDAVEESAKSAAKAMEEAVDKVKENLI--DKENNNNNNQNSHDEL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G16850.1 unknown protein1.0e-0732.06Show/hide
Query:  KSGRC-KLIIVLLIFMIQFASCFAKESNKGYER--PSFGDFIQQSVSILKKSHATHLDKIKSLIHQVQLQFFPPNLDFRSRDETSDEQGVVDEMKEAAEK
        KSG+   L+ +  IF   F       ++   ER  PS        ++ +K+S   +  K++  + + Q  FFPPN  F  +++     G  + MKEAA +
Subjt:  KSGRC-KLIIVLLIFMIQFASCFAKESNKGYER--PSFGDFIQQSVSILKKSHATHLDKIKSLIHQVQLQFFPPNLDFRSRDETSDEQGVVDEMKEAAEK

Query:  SFETSKDAVEESAKSAAKAMEEAVDKVKENL
        SFE SK  VEE+A+SAA+ + +  + VKE +
Subjt:  SFETSKDAVEESAKSAAKAMEEAVDKVKENL

AT5G64820.1 unknown protein6.9e-0932.86Show/hide
Query:  IIVLLIFMIQFASCFAKESNKGYERPSFGDFIQQSVSILKKSHATHLDKIKSLIHQVQLQFFPPNLDFRSRDETS--DEQGVVDEMKEAAEKSFETSKDA
        II++LI  +      +  + K  E PS    I  S     K   +  + I+  + ++Q++ +PPNLDFRS  + S  +E+   ++++EAA +S E SK+A
Subjt:  IIVLLIFMIQFASCFAKESNKGYERPSFGDFIQQSVSILKKSHATHLDKIKSLIHQVQLQFFPPNLDFRSRDETS--DEQGVVDEMKEAAEKSFETSKDA

Query:  VEESAKSAAKAMEEAVDKVKENLIDKENNNNNNQNSHDEL
        +EESAK A   + E V K  E +          Q SHDE+
Subjt:  VEESAKSAAKAMEEAVDKVKENLIDKENNNNNNQNSHDEL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAACAATAATGTGCAATCCAAAAAGTGGAAGATGCAAATTGATTATTGTGTTGTTGATTTTTATGATTCAATTTGCTTCATGTTTTGCCAAAGAGTCCAATAAAGG
TTATGAGAGACCATCTTTTGGGGATTTTATTCAACAAAGTGTTTCAATTTTGAAGAAATCTCATGCAACTCATTTGGACAAGATCAAATCTCTCATTCACCAAGTGCAGT
TGCAGTTTTTTCCTCCCAATTTAGATTTCAGGAGTAGAGATGAAACAAGTGATGAACAAGGTGTTGTTGATGAAATGAAAGAAGCTGCAGAGAAGAGCTTTGAGACAAGC
AAAGATGCAGTTGAAGAGTCTGCTAAATCTGCAGCAAAAGCTATGGAGGAAGCAGTGGATAAGGTTAAAGAGAATCTCATCGACAAGGAAAACAACAACAACAACAACCA
AAATTCTCATGATGAGCTTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAAACAATAATGTGCAATCCAAAAAGTGGAAGATGCAAATTGATTATTGTGTTGTTGATTTTTATGATTCAATTTGCTTCATGTTTTGCCAAAGAGTCCAATAAAGG
TTATGAGAGACCATCTTTTGGGGATTTTATTCAACAAAGTGTTTCAATTTTGAAGAAATCTCATGCAACTCATTTGGACAAGATCAAATCTCTCATTCACCAAGTGCAGT
TGCAGTTTTTTCCTCCCAATTTAGATTTCAGGAGTAGAGATGAAACAAGTGATGAACAAGGTGTTGTTGATGAAATGAAAGAAGCTGCAGAGAAGAGCTTTGAGACAAGC
AAAGATGCAGTTGAAGAGTCTGCTAAATCTGCAGCAAAAGCTATGGAGGAAGCAGTGGATAAGGTTAAAGAGAATCTCATCGACAAGGAAAACAACAACAACAACAACCA
AAATTCTCATGATGAGCTTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
METIMCNPKSGRCKLIIVLLIFMIQFASCFAKESNKGYERPSFGDFIQQSVSILKKSHATHLDKIKSLIHQVQLQFFPPNLDFRSRDETSDEQGVVDEMKEAAEKSFETS
KDAVEESAKSAAKAMEEAVDKVKENLIDKENNNNNNQNSHDEL