; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0000743 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0000743
OrganismSechium edule (Chayote v1)
Descriptionhistone-lysine N-methyltransferase setd3
Genome locationLG03:6718397..6729302
RNA-Seq ExpressionSed0000743
SyntenySed0000743
Gene Ontology termsGO:0018026 - peptidyl-lysine monomethylation (biological process)
GO:0016279 - protein-lysine N-methyltransferase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR015353 - Rubisco LSMT, substrate-binding domain
IPR036464 - Rubisco LSMT, substrate-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7032561.1 Histone-lysine N-methyltransferase setd3 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.8e-18993.46Show/hide
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XP_008467099.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103504533 isoform X3 [Cucumis melo]5.1e-20587.2Show/hide
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XP_022990856.1 histone-lysine N-methyltransferase setd3 [Cucurbita maxima]1.3e-18993.73Show/hide
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XP_023521347.1 histone-lysine N-methyltransferase setd3-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.0e-18993.46Show/hide
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XP_038876214.1 uncharacterized protein LOC120068497 isoform X2 [Benincasa hispida]6.6e-20587.44Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3CSQ9 uncharacterized protein LOC103504533 isoform X11.1e-18490.19Show/hide
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A0A1S3CSX5 uncharacterized protein LOC103504533 isoform X32.5e-20587.2Show/hide
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A0A6J1CZH5 histone-lysine N-methyltransferase setd31.5e-18691.01Show/hide
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A0A6J1E725 histone-lysine N-methyltransferase setd34.2e-18993.19Show/hide
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A0A6J1JP42 histone-lysine N-methyltransferase setd36.5e-19093.73Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A9X1D0 Actin-histidine N-methyltransferase9.5e-1322.59Show/hide
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Query:  SSLGWAMAAVSSRAFRLYGKNLTDGTPNSVPMMLPLIDMCNHSFNSNARIVQEQSAGSIKLKVKVVAETEIEGNVPLTLNYGCLDNDLFLLDYGFVIPSN
            WA+++V +R  ++     T+        ++PL DMCNH   +N  I    +      + + VA  +      + + YG   N  F++  GF   +N
Subjt:  SSLGWAMAAVSSRAFRLYGKNLTDGTPNSVPMMLPLIDMCNHSFNSNARIVQEQSAGSIKLKVKVVAETEIEGNVPLTLNYGCLDNDLFLLDYGFVIPSN

Query:  QYDSIELKYDEALLEAASIVAGISSEKFSSPAPWQKLVLSKLNLHGEAALLKVCIGGTEI----IDGRLLAALRVLLSVDEEIVQ----KQDLDVLKSL-
         +D +++K             G+S           +L   K  +   A +    +         I  +LLA LRV    +EE+ +       +D + +L 
Subjt:  QYDSIELKYDEALLEAASIVAGISSEKFSSPAPWQKLVLSKLNLHGEAALLKVCIGGTEI----IDGRLLAALRVLLSVDEEIVQ----KQDLDVLKSL-

Query:  SAEAPLGVANEIAALRTLIALCVIALGHFPTKIMEDETLLKKCE-KESSKLAIQFRIQKKSVI
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B0VX69 Actin-histidine N-methyltransferase3.6e-1222.31Show/hide
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        + + + ++ L   LL ERA   SFW PYI  LP  +  P++F  ++++ LQ    ++ V         Y+   ++     K  + HP   +     +   
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Query:  SSLGWAMAAVSSRAFRLYGKNLTDGTPNSVPMMLPLIDMCNHSFNSNARIVQEQSAGSIKLKVKVVAETEIEGNVPLTLNYGCLDNDLFLLDYGFVIPSN
            WA+++V +R  ++     T+        ++PL DMCNH   +N  I    +      + + VA  +      + + YG   N  F++  GF   +N
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         +D +++K             G+S           +L   K  +   A +    +         I  +LLA LRV    +EE+ +       +D + +L 
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        ++E P+   NE+     L     + L  + T I ED+++LK  +    +K+AI+ R+ +K ++
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B1MTJ4 Actin-histidine N-methyltransferase9.5e-1322.59Show/hide
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        + + + ++ L   LL ERA   SFW PYI  LP  +  P++F  D+++ LQ    ++ V         Y+   ++     K  + HP   +     +   
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            WA+++V +R  ++     T+        ++PL DMCNH   +N  I    +      + + VA  +      + + YG   N  F++  GF   +N
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         +D +++K             G+S           +L   K  +   A +    +         I  +LLA LRV    +EE+ +       +D + +L 
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        ++E P+   NE+     L     + L  + T I ED+++LK  +    +K+AI+ R+ +K ++
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G3V6U9 Actin-histidine N-methyltransferase4.7e-1222.31Show/hide
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        + + + ++ L   LL ERA   SFW PYI  LP  +  P++F  ++++ LQ    ++ V         Y+   ++     K  + HP   +     +   
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            WA+++V +R  ++     T+        ++PL DMCNH   +N  I    +      + + VA  + +    + + YG   N  F++  GF   +N
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         +D +++K             G+S           +L   K  +   A +    +         I  +LLA LRV    +EE+ +       +D + +L 
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Query:  SAEAPLGVANEIAALRTLIALCVIALGHFPTKIMEDETLLKKCE-KESSKLAIQFRIQKKSVI
        ++E P+   NE+     L     + L  + T I ED+T+LK  +    + +AI+ R+ +K ++
Subjt:  SAEAPLGVANEIAALRTLIALCVIALGHFPTKIMEDETLLKKCE-KESSKLAIQFRIQKKSVI

Q86TU7 Actin-histidine N-methyltransferase9.5e-1322.59Show/hide
Query:  LAEELWSMKLGLKLLKERAKVGSFWWPYIANLPEVFSVPIFFPGDDIKNLQYAPLLYQVNKRCRFLLDYEKEVKRTLDSVKP-EDHPFCGQ-----TVDA
        + + + ++ L   LL ERA   SFW PYI  LP  +  P++F  D+++ LQ    ++ V         Y+   ++     K  + HP   +     +   
Subjt:  LAEELWSMKLGLKLLKERAKVGSFWWPYIANLPEVFSVPIFFPGDDIKNLQYAPLLYQVNKRCRFLLDYEKEVKRTLDSVKP-EDHPFCGQ-----TVDA

Query:  SSLGWAMAAVSSRAFRLYGKNLTDGTPNSVPMMLPLIDMCNHSFNSNARIVQEQSAGSIKLKVKVVAETEIEGNVPLTLNYGCLDNDLFLLDYGFVIPSN
            WA+++V +R  ++     T+        ++PL DMCNH   +N  I    +      + + VA  +      + + YG   N  F++  GF   +N
Subjt:  SSLGWAMAAVSSRAFRLYGKNLTDGTPNSVPMMLPLIDMCNHSFNSNARIVQEQSAGSIKLKVKVVAETEIEGNVPLTLNYGCLDNDLFLLDYGFVIPSN

Query:  QYDSIELKYDEALLEAASIVAGISSEKFSSPAPWQKLVLSKLNLHGEAALLKVCIGGTEI----IDGRLLAALRVLLSVDEEIVQ----KQDLDVLKSL-
         +D +++K             G+S           +L   K  +   A +    +         I  +LLA LRV    +EE+ +       +D + +L 
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Query:  SAEAPLGVANEIAALRTLIALCVIALGHFPTKIMEDETLLKKCE-KESSKLAIQFRIQKKSVI
        ++E P+   NE+     L     + L  + T I ED+++LK  +    +K+AI+ R+ +K ++
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G24610.1 Rubisco methyltransferase family protein5.0e-14267.47Show/hide
Query:  SSIWPAKFLYLAEELWSMKLGLKLLKERAKVGSFWWPYIANLPEVFSVPIFFPGDDIKNLQYAPLLYQVNKRCRFLLDYEKEVKRTLDSVKPEDHPFCGQ
        SS+  A    + EELW+MKLGL+LL+ERA   SFWWPYI+NLPE ++VPIFFPG+DIKNLQYAPLL+QVNKRCRFLL++E+E++RTL+ VK  DHPF GQ
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Query:  TVDASSLGWAMAAVSSRAFRLYG-KNLTDGTPNSVPMMLPLIDMCNHSFNSNARIVQEQSAGSIKLKVKVVAETEIEGNVPLTLNYGCLDNDLFLLDYGF
         V+AS+LGW M+AVS+RAFRL+G K L  G+ + VPMMLPLIDMCNHSF  NARI+QEQ+       VKVVAETE++ N PL LNYGCL ND FLLDYGF
Subjt:  TVDASSLGWAMAAVSSRAFRLYG-KNLTDGTPNSVPMMLPLIDMCNHSFNSNARIVQEQSAGSIKLKVKVVAETEIEGNVPLTLNYGCLDNDLFLLDYGF

Query:  VIPSNQYDSIELKYDEALLEAASIVAGISSEKFSSPAPWQKLVLSKLNLHGEAALLKVCIGGTEIIDGRLLAALRVLLSVDEEIVQKQDLDVLKSLSAEA
        VI SN YD+IELKYDE L++AAS+ AG+SS KFSSPAPWQ  +LS+LNL GE   LKV IGG E ++GRLLAALR+LL  +   V+K D D LKSLSA A
Subjt:  VIPSNQYDSIELKYDEALLEAASIVAGISSEKFSSPAPWQKLVLSKLNLHGEAALLKVCIGGTEIIDGRLLAALRVLLSVDEEIVQKQDLDVLKSLSAEA

Query:  PLGVANEIAALRTLIALCVIALGHFPTKIMEDETLLKKCEKESSKLAIQFRIQKKSVIVDVMSNLTRRVKLLSSK
        P G+ANEIA  RT+IALCVIAL HFPTKIMEDE ++K+    +++L+I++RIQKKSVI+DVM +LTRRVKLLSSK
Subjt:  PLGVANEIAALRTLIALCVIALGHFPTKIMEDETLLKKCEKESSKLAIQFRIQKKSVIVDVMSNLTRRVKLLSSK

AT3G55080.1 SET domain-containing protein1.8e-0622.12Show/hide
Query:  LAEELWSMKLGLKLLKERAKVG--SFWWPYIANLPEVFSV--PIFFPGDDIKNLQYAPLLYQVNKRCRFLLDYEKEVKRTLDSVKPEDHPFCGQTVDASS
        L+ E+ ++ +   +L    K+G  S W PYI+ LP+   +   IF+  D++  ++ + +  +  K+       EK+      + K +  P   +  D   
Subjt:  LAEELWSMKLGLKLLKERAKVG--SFWWPYIANLPEVFSV--PIFFPGDDIKNLQYAPLLYQVNKRCRFLLDYEKEVKRTLDSVKPEDHPFCGQTVDASS

Query:  LGWAMAAVSSRAFRLYGKNLTDGTPNSVPMMLPLIDMCNHSFNSNARIVQEQSAGSIKLKVKVVAETEIEGNVPLTLNYGCLDNDLFLLDYGFVIPSNQY
          +A A V SRA+    K ++         ++P  D  NH   S + +++++         +V A+        + + YG   N   +LD+GF  P N +
Subjt:  LGWAMAAVSSRAFRLYGKNLTDGTPNSVPMMLPLIDMCNHSFNSNARIVQEQSAGSIKLKVKVVAETEIEGNVPLTLNYGCLDNDLFLLDYGFVIPSNQY

Query:  DSIELKYD
        D ++++ D
Subjt:  DSIELKYD

AT3G55080.2 SET domain-containing protein1.4e-0623Show/hide
Query:  LGLKLLKERAKVG--SFWWPYIANLPEVFSV--PIFFPGDDIKNLQYAPLLYQVNKRCRFLLDYEKEVKRTLDSVKPEDHPFCGQTVDASSLGWAMAAVS
        L   L++E+ K+G  S W PYI+ LP+   +   IF+  D++  ++ + +  +  K+       EK+      + K +  P   +  D     +A A V 
Subjt:  LGLKLLKERAKVG--SFWWPYIANLPEVFSV--PIFFPGDDIKNLQYAPLLYQVNKRCRFLLDYEKEVKRTLDSVKPEDHPFCGQTVDASSLGWAMAAVS

Query:  SRAFRLYGKNLTDGTPNSVPMMLPLIDMCNHSFNSNARIVQEQSAGSIKLK-VKVVAETEIEGNVPLTLNYGCLDNDLFLLDYGFVIPSNQYDSIELKYD
        SRA+    K ++         ++P  D  NH   S + +++++     +   ++V A+        + + YG   N   +LD+GF  P N +D ++++ D
Subjt:  SRAFRLYGKNLTDGTPNSVPMMLPLIDMCNHSFNSNARIVQEQSAGSIKLK-VKVVAETEIEGNVPLTLNYGCLDNDLFLLDYGFVIPSNQYDSIELKYD


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCTGGCCTCGGGCTCCTCGCTTCCGACCACATTCCCAAAGGCTCTCAACTCATCGCCCTTCCTCACAATCTTCCCCTGCGGTTCGACTCGCCGGAGGCCGGAGATTCT
CAAGACCCCGACTCCGTTCTCGTCAATTTGGCCCGCCAAGTTCCTGTATTTGGCAGAGGAACTTTGGTCCATGAAATTGGGTTTGAAACTTCTGAAAGAAAGGGCAAAAG
TTGGATCCTTCTGGTGGCCGTATATTGCCAATCTCCCTGAAGTTTTCAGTGTTCCTATATTTTTTCCTGGAGATGATATAAAGAACTTGCAGTATGCTCCTCTTCTTTAC
CAGGTAAACAAAAGGTGTCGGTTTCTCCTTGATTACGAGAAAGAAGTCAAACGTACTCTTGATAGTGTAAAGCCCGAAGATCACCCTTTTTGCGGCCAAACTGTAGATGC
CTCGTCCCTGGGATGGGCAATGGCAGCAGTCTCATCAAGGGCATTTCGTTTATATGGTAAAAATCTAACGGATGGTACTCCTAACAGTGTTCCTATGATGCTCCCACTCA
TTGATATGTGCAATCATAGCTTTAATTCAAATGCACGTATAGTCCAGGAACAAAGTGCAGGATCCATCAAGTTGAAAGTGAAGGTTGTAGCTGAGACTGAAATTGAAGGA
AACGTTCCTTTAACACTAAATTATGGTTGTCTTGACAATGATCTTTTCCTGCTTGATTATGGATTCGTGATACCATCAAACCAATATGATTCTATTGAGCTCAAATATGA
TGAAGCTCTCTTAGAAGCTGCTAGCATTGTTGCTGGGATTTCTTCAGAAAAATTCTCTTCTCCTGCTCCATGGCAAAAACTTGTCTTATCCAAGTTAAATCTACATGGAG
AAGCTGCTCTTCTCAAGGTGTGCATTGGTGGCACAGAAATAATTGATGGCCGCTTGTTAGCTGCCTTAAGAGTGTTGCTCTCGGTTGATGAAGAAATAGTACAGAAGCAA
GACTTGGACGTGCTCAAATCTTTATCAGCTGAAGCACCTCTCGGTGTTGCAAATGAAATAGCTGCGTTACGTACGCTAATTGCTTTATGTGTGATCGCATTGGGACACTT
CCCGACCAAGATAATGGAGGATGAAACCCTTTTGAAAAAGTGTGAAAAGGAATCATCAAAATTGGCAATCCAGTTCAGAATTCAGAAGAAATCAGTTATCGTAGATGTGA
TGAGCAACCTAACAAGAAGAGTGAAATTGCTTTCATCTAAGGCGGTCTCTCAGGGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTTTTACACACAGTAGACATAGGAGGAGCAGAAAATGGCGGCTTCGAAGATCGCAATGGCGTCTCTATCGCTGACCCATTTCCGGCCATTATCCTCCGCCTCCGTTTCTC
CCTCTTTCTCCTCCAGGTTGGCTCCCCATCCACCGGACCTCATCAAGTGGGTCCGCACTCAAGGCGGATTTGTCCACCCTTCTCTCAAGATGGCTCAACTCGGCGATGCT
GGCCTCGGGCTCCTCGCTTCCGACCACATTCCCAAAGGCTCTCAACTCATCGCCCTTCCTCACAATCTTCCCCTGCGGTTCGACTCGCCGGAGGCCGGAGATTCTCAAGA
CCCCGACTCCGTTCTCGTCAATTTGGCCCGCCAAGTTCCTGTATTTGGCAGAGGAACTTTGGTCCATGAAATTGGGTTTGAAACTTCTGAAAGAAAGGGCAAAAGTTGGA
TCCTTCTGGTGGCCGTATATTGCCAATCTCCCTGAAGTTTTCAGTGTTCCTATATTTTTTCCTGGAGATGATATAAAGAACTTGCAGTATGCTCCTCTTCTTTACCAGGT
AAACAAAAGGTGTCGGTTTCTCCTTGATTACGAGAAAGAAGTCAAACGTACTCTTGATAGTGTAAAGCCCGAAGATCACCCTTTTTGCGGCCAAACTGTAGATGCCTCGT
CCCTGGGATGGGCAATGGCAGCAGTCTCATCAAGGGCATTTCGTTTATATGGTAAAAATCTAACGGATGGTACTCCTAACAGTGTTCCTATGATGCTCCCACTCATTGAT
ATGTGCAATCATAGCTTTAATTCAAATGCACGTATAGTCCAGGAACAAAGTGCAGGATCCATCAAGTTGAAAGTGAAGGTTGTAGCTGAGACTGAAATTGAAGGAAACGT
TCCTTTAACACTAAATTATGGTTGTCTTGACAATGATCTTTTCCTGCTTGATTATGGATTCGTGATACCATCAAACCAATATGATTCTATTGAGCTCAAATATGATGAAG
CTCTCTTAGAAGCTGCTAGCATTGTTGCTGGGATTTCTTCAGAAAAATTCTCTTCTCCTGCTCCATGGCAAAAACTTGTCTTATCCAAGTTAAATCTACATGGAGAAGCT
GCTCTTCTCAAGGTGTGCATTGGTGGCACAGAAATAATTGATGGCCGCTTGTTAGCTGCCTTAAGAGTGTTGCTCTCGGTTGATGAAGAAATAGTACAGAAGCAAGACTT
GGACGTGCTCAAATCTTTATCAGCTGAAGCACCTCTCGGTGTTGCAAATGAAATAGCTGCGTTACGTACGCTAATTGCTTTATGTGTGATCGCATTGGGACACTTCCCGA
CCAAGATAATGGAGGATGAAACCCTTTTGAAAAAGTGTGAAAAGGAATCATCAAAATTGGCAATCCAGTTCAGAATTCAGAAGAAATCAGTTATCGTAGATGTGATGAGC
AACCTAACAAGAAGAGTGAAATTGCTTTCATCTAAGGCGGTCTCTCAGGGTTGAAAATCATGGCAAAGCGAATCAAAAGAGATAGTTCAATGGTGAAGAATTTAAACAAA
GTGGGTTGAAGAACAAAACTTGGAATGCTCTCAACTCAGAATTTCTGAGGCAAGATTGTTGGTGGGAGAGACTGATGCACAATTTGCAGGGAATTCATGCCACAATTAGG
TATATGATTTAAGCTTGTATTTACTCTTGCTTCATGCCACAAGGAATGAACTACCACTTCAAATTCCTTAGGGATTTGCACTTTGATTGAAACTTCGCATGCTTTGACAT
AACAAATATTTGACCATTTCTCCCTGTCTAGATAAGACACCTGACATATGGCAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLASGSSLPTTFPKALNSSPFLTIFPCGSTRRRPEILKTPTPFSSIWPAKFLYLAEELWSMKLGLKLLKERAKVGSFWWPYIANLPEVFSVPIFFPGDDIKNLQYAPLLY
QVNKRCRFLLDYEKEVKRTLDSVKPEDHPFCGQTVDASSLGWAMAAVSSRAFRLYGKNLTDGTPNSVPMMLPLIDMCNHSFNSNARIVQEQSAGSIKLKVKVVAETEIEG
NVPLTLNYGCLDNDLFLLDYGFVIPSNQYDSIELKYDEALLEAASIVAGISSEKFSSPAPWQKLVLSKLNLHGEAALLKVCIGGTEIIDGRLLAALRVLLSVDEEIVQKQ
DLDVLKSLSAEAPLGVANEIAALRTLIALCVIALGHFPTKIMEDETLLKKCEKESSKLAIQFRIQKKSVIVDVMSNLTRRVKLLSSKAVSQG