CuGenDBv2

Gene ID	Sed0000795
Organism	Sechium edule (Chayote v1)
Description	Unknown protein
Genome location	LG03:47444163..47445435
RNA-Seq Expression	Sed0000795
Synteny	Sed0000795
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG6603168.1 hypothetical protein SDJN03_03777, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

4.4e-91

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XP_008442091.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103486052 [Cucumis melo]

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XP_022933122.1 uncharacterized protein LOC111439886 [Cucurbita moschata]

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        +  AA
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XP_023543246.1 uncharacterized protein LOC111803187 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

3.8e-90

65.46

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        +  A
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XP_038882551.1 uncharacterized protein LOC120073784 [Benincasa hispida]

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        AA
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TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0KZ92 Uncharacterized protein

1.3e-88

63.88

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A0A1S3B5N3 uncharacterized protein LOC103486052

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A0A5D3C2B3 Uncharacterized protein

2.4e-90

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A0A6J1EYV8 uncharacterized protein LOC111439886

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A0A6J1HT92 uncharacterized protein LOC111467245

2.6e-89

64.8

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Query:  PFMVLDKIGIGIEHVDGGDPSNLKEEGSLGNKDLDC--FCLKRQFEVLERENGLMKKGIEDLRNQFKSFSSSGE----FGRRF---KAPELAALDGATAE
        P ++LDK  IGIEHV+ GD  +  E+GS  N+DLD   F +KR+FEVL+ ENGL+KKGIEDLR Q K FS+SG+      RRF   KAPE   LDG    
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Query:  DTAA
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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT3G57990.1 unknown protein

1.3e-59

48.8

Show/hide

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        MKAS+KFREEQKPL RAKVPLSILGLPFQS I AG SK+L+L+LST F+SGPSL+++YRPNDS NPFSL+++TG   FGSPISS MLM+A+FNLL  G+P
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Query:  SFSLHFKPSLGDFSFKKSQSSSSSSSMFHNPLKSAAAAEEEEDESALV-----------------------GSAISKTVSGLEVMATTAVPVFRCAAVRF
        SF LHFKP  GDFS KKS SSS       N +KS   +  E+D S  V                          I+  +SG+EV A T++PV   A + F
Subjt:  SFSLHFKPSLGDFSFKKSQSSSSSSSMFHNPLKSAAAAEEEEDESALV-----------------------GSAISKTVSGLEVMATTAVPVFRCAAVRF

Query:  RWGLRVPAEGMK------VAAFREAPFMVLDKIGIGIEHVDGGDPSNLKEEGSLGN-----KDLDCFCLKRQFEVLERENGLMKKGIEDLR
        RWG+RVP E  +        + R  PF+V++K  IGIEHVDG D    K  G  G      +      +    E L  EN  +K+ +EDLR
Subjt:  RWGLRVPAEGMK------VAAFREAPFMVLDKIGIGIEHVDGGDPSNLKEEGSLGN-----KDLDCFCLKRQFEVLERENGLMKKGIEDLR

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGAAAGCATCACTGAAATTCCGCGAAGAGCAGAAGCCATTGATGAGGGCCAAGGTTCCTCTGAGCATTCTGGGCCTCCCTTTCCAGTCCGCCATCGCCGCCGGCAGCTC
CAAGGACCTCACTCTCCACCTCTCCACCCTCTTCGACTCCGGCCCCTCCTTACGCCTCTCTTACCGCCCCAACGATTCCTCCAACCCCTTCTCCCTCCTCATCAGAACCG
GCATCGCCCACTTCGGCTCCCCGATCTCCTCCCCCATGCTCATGACCGCCCAGTTCAACCTCCTCGCCGGCGGCAGCCCCTCCTTCTCCCTCCATTTCAAGCCCTCACTC
GGCGATTTCTCCTTCAAGAAATCGCAATCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCATGTTTCACAACCCTCTCAAATCGGCGGCGGCGGCGGAGGAGGAGGAGGACGAGTCCGCCCT
TGTCGGATCTGCTATTTCCAAGACGGTTTCTGGTCTGGAAGTGATGGCGACCACCGCGGTGCCGGTTTTCCGCTGCGCCGCCGTGAGGTTTCGGTGGGGGCTTAGGGTTC
CGGCGGAGGGGATGAAGGTGGCGGCGTTCCGGGAGGCGCCGTTTATGGTGCTGGATAAGATCGGGATCGGGATCGAACACGTGGACGGTGGGGATCCTTCGAATTTGAAG
GAGGAGGGTAGTTTGGGAAATAAGGATTTGGATTGTTTTTGCCTGAAGCGCCAGTTTGAGGTTTTGGAAAGGGAAAATGGGTTAATGAAGAAAGGCATTGAGGATCTCAG
GAACCAGTTTAAATCGTTTTCCAGTTCCGGCGAGTTTGGCCGCCGGTTCAAGGCGCCGGAGTTGGCCGCTTTAGATGGAGCCACGGCGGAGGACACGGCGGCTGCCTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

GCTACAGATAATTTTTGTCCGTATCAATCAATAATTCCGATTTCAAAATTCAAATCCCAAATCCAAAATCCCCCTTAAAAACACCTATAAATTTTCTCTAATTTCCCTCA
ATTCGCATTCGAAATCTAGGGTTTCCAATTCAGAGGAAGAAGATGAAAGCATCACTGAAATTCCGCGAAGAGCAGAAGCCATTGATGAGGGCCAAGGTTCCTCTGAGCAT
TCTGGGCCTCCCTTTCCAGTCCGCCATCGCCGCCGGCAGCTCCAAGGACCTCACTCTCCACCTCTCCACCCTCTTCGACTCCGGCCCCTCCTTACGCCTCTCTTACCGCC
CCAACGATTCCTCCAACCCCTTCTCCCTCCTCATCAGAACCGGCATCGCCCACTTCGGCTCCCCGATCTCCTCCCCCATGCTCATGACCGCCCAGTTCAACCTCCTCGCC
GGCGGCAGCCCCTCCTTCTCCCTCCATTTCAAGCCCTCACTCGGCGATTTCTCCTTCAAGAAATCGCAATCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCATGTTTCACAACCCTCTCAA
ATCGGCGGCGGCGGCGGAGGAGGAGGAGGACGAGTCCGCCCTTGTCGGATCTGCTATTTCCAAGACGGTTTCTGGTCTGGAAGTGATGGCGACCACCGCGGTGCCGGTTT
TCCGCTGCGCCGCCGTGAGGTTTCGGTGGGGGCTTAGGGTTCCGGCGGAGGGGATGAAGGTGGCGGCGTTCCGGGAGGCGCCGTTTATGGTGCTGGATAAGATCGGGATC
GGGATCGAACACGTGGACGGTGGGGATCCTTCGAATTTGAAGGAGGAGGGTAGTTTGGGAAATAAGGATTTGGATTGTTTTTGCCTGAAGCGCCAGTTTGAGGTTTTGGA
AAGGGAAAATGGGTTAATGAAGAAAGGCATTGAGGATCTCAGGAACCAGTTTAAATCGTTTTCCAGTTCCGGCGAGTTTGGCCGCCGGTTCAAGGCGCCGGAGTTGGCCG
CTTTAGATGGAGCCACGGCGGAGGACACGGCGGCTGCCTGAATTTGTCGATACAACCAGCGCCACTTCAAATGTATATTATATATATAAATGTGAGTTTTTGTTTCTTCT
CTGCTGTTCTGCTTTTTAAATTAAATAGTTTTATATGTTATTTTCCGGGCTAATTGTTTTTTTTTTCATTATTTAGTGGTAGTAAATTTTGGGTTGAACTATTTATTATA
GATTTGGTTTATGTGAGTTTCATATGAGATTCAAAATCTTGGAATTAGTATTGGGTTGTAATG

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MKASLKFREEQKPLMRAKVPLSILGLPFQSAIAAGSSKDLTLHLSTLFDSGPSLRLSYRPNDSSNPFSLLIRTGIAHFGSPISSPMLMTAQFNLLAGGSPSFSLHFKPSL
GDFSFKKSQSSSSSSSMFHNPLKSAAAAEEEEDESALVGSAISKTVSGLEVMATTAVPVFRCAAVRFRWGLRVPAEGMKVAAFREAPFMVLDKIGIGIEHVDGGDPSNLK
EEGSLGNKDLDCFCLKRQFEVLERENGLMKKGIEDLRNQFKSFSSSGEFGRRFKAPELAALDGATAEDTAAA

Sed0000795 (gene) of Chayote v1 genome