; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0001030 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0001030
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionRibosome production factor 2 homolog
Genome locationLG02:43307973..43310877
RNA-Seq ExpressionSed0001030
SyntenySed0001030
Gene Ontology termsGO:0000027 - ribosomal large subunit assembly (biological process)
GO:0000463 - maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) (biological process)
GO:0032774 - RNA biosynthetic process (biological process)
GO:0005730 - nucleolus (cellular component)
GO:0019843 - rRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR007109 - Brix domain
IPR039770 - Ribosome biogenesis protein Rpf2


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6580669.1 Ribosome production factor 2-like protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.3e-16292.24Show/hide
Query:  MLKVRTPKNAKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESSVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLKVRTPKN KV+RELEKRAPK+VETGKKTLILHGTKTSGVLN VLTE+YHLKKESSVKYSRKN+GIKPFESGGD+SLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNAKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESSVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  NNLVIGRTYDHHVYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFESVAELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLSGLDRVYVCTAISPDKVFLT
        +NLVIGRTYDH +YDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFE+V ELKHLKEVLLDLFRGEVVEN+NL+GLDRVYVCTAISP+KVFLT
Subjt:  NNLVIGRTYDHHVYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFESVAELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLSGLDRVYVCTAISPDKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSEGIRKEAMKTVKDQAKKKEKNVSQDAIEGKIGRIYIPDQKIGDMAILDKSKGVKRERREAKMKN
        HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPS+G+RKEAMKT KDQAKKKEKNVSQDAI+GKIGRIYIPDQK+GDMAI DKSKGVKRERREAKMKN
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSEGIRKEAMKTVKDQAKKKEKNVSQDAIEGKIGRIYIPDQKIGDMAILDKSKGVKRERREAKMKN

Query:  REDQPASKKPKEDSEKPKEDSE
        ++D PASKKPKEDSEKPKE+SE
Subjt:  REDQPASKKPKEDSEKPKEDSE

KAG7028079.1 Ribosome production factor 2-like protein [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]5.3e-16291.61Show/hide
Query:  MLKVRTPKNAKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESSVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLKVRTPKN KVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKES+VKYSR+NEGIKPFE+GGD+SLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNAKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESSVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  NNLVIGRTYDHHVYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFESVAELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLSGLDRVYVCTAISPDKVFLT
        +NLVI RTYDHH+YDL+EVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFE+V ELKH KEVLLD+FRGEVVENINL+GLDRVYVCTAISP+KVFLT
Subjt:  NNLVIGRTYDHHVYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFESVAELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLSGLDRVYVCTAISPDKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSEGIRKEAMKTVKDQAKKKEKNVSQDAIEGKIGRIYIPDQKIGDMAILDKSKGVKRERREAKMKN
        HCALR+KKSGSVVPRMELVEVGPSMD+VVRRHRLPS+G+RKEAMKT KDQAKKKEKNVSQDAI GKIGRIYIPDQK+GD+A+ DKSKGVKRERREAKMKN
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSEGIRKEAMKTVKDQAKKKEKNVSQDAIEGKIGRIYIPDQKIGDMAILDKSKGVKRERREAKMKN

Query:  REDQPASKKPKEDSEKPKEDSE
        R+D PASKKPKEDSEKPKEDSE
Subjt:  REDQPASKKPKEDSEKPKEDSE

XP_022934916.1 ribosome production factor 2 homolog [Cucurbita moschata]6.9e-16291.93Show/hide
Query:  MLKVRTPKNAKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESSVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLK+RTPKN KV+RELEKRAPK+VETGKKTLILHGTKTSGVLN VLTE+YHLKKESSVKYSRKN+GIKPFESGGD+SLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNAKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESSVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  NNLVIGRTYDHHVYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFESVAELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLSGLDRVYVCTAISPDKVFLT
        +NLVIGRTYDH +YDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFE+V ELKHLKEVLLDLFRGEVVEN+NL+GLDRVYVCTAISP+KVFLT
Subjt:  NNLVIGRTYDHHVYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFESVAELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLSGLDRVYVCTAISPDKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSEGIRKEAMKTVKDQAKKKEKNVSQDAIEGKIGRIYIPDQKIGDMAILDKSKGVKRERREAKMKN
        HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPS+G+RKEAMKT KDQAKKKEKNVSQDAI+GKIGRIYIPDQK+GDMAI DKSKGVKRERREAKMKN
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSEGIRKEAMKTVKDQAKKKEKNVSQDAIEGKIGRIYIPDQKIGDMAILDKSKGVKRERREAKMKN

Query:  REDQPASKKPKEDSEKPKEDSE
        ++D PASKKPKEDSEKPKE+SE
Subjt:  REDQPASKKPKEDSEKPKEDSE

XP_023005644.1 ribosome production factor 2 homolog [Cucurbita maxima]1.8e-16291.9Show/hide
Query:  MLKVRTPKNAKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESSVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLKVRTPKN KVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKES+VKYSR+NEGIKPFE+GGD+SLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNAKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESSVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  NNLVIGRTYDHHVYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFESVAELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLSGLDRVYVCTAISPDKVFLT
        +NLVI RTYDHH+YDL+EVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFE+V ELKHLKEVLLD+FRGEVVENINL+GLDRVYVCTAISP+KVFLT
Subjt:  NNLVIGRTYDHHVYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFESVAELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLSGLDRVYVCTAISPDKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSEGIRKEAMKTVKDQAKKKEKNVSQDAIEGKIGRIYIPDQKIGDMAILDKSKGVKRERREAKMKN
        HCALR+KKSGSVVPRMELVEVGPSMD+VVRRHRLPS+G+RKEAMKT KDQAKKKEKNVSQDAI GKIGRIYIPDQK+GD+A+ DKSKGVKRERREAKMKN
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSEGIRKEAMKTVKDQAKKKEKNVSQDAIEGKIGRIYIPDQKIGDMAILDKSKGVKRERREAKMKN

Query:  REDQPASKKPKEDSEKPKEDS
        R+D PASKKPKEDSEKPKEDS
Subjt:  REDQPASKKPKEDSEKPKEDS

XP_023540188.1 ribosome production factor 2 homolog [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.8e-16291.93Show/hide
Query:  MLKVRTPKNAKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESSVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLKVRTPKN KVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKES+VKYSR+NEGIKPFE+GGD+SLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNAKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESSVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  NNLVIGRTYDHHVYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFESVAELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLSGLDRVYVCTAISPDKVFLT
        +NLVI RTYDHH+YDL+EVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFE+V ELKHLKEVLLD+FRGEVVENINL+GLDRVYVCTAISP+KVFLT
Subjt:  NNLVIGRTYDHHVYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFESVAELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLSGLDRVYVCTAISPDKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSEGIRKEAMKTVKDQAKKKEKNVSQDAIEGKIGRIYIPDQKIGDMAILDKSKGVKRERREAKMKN
        HCALR+KKSGSVVPRMELVEVGPSMD+VVRRHRLPS+G+RKEAMKT KDQAKKKEKNVSQDAI GKIGRIYIPDQK+GD+A+ DKSKGVKRERREAKMKN
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSEGIRKEAMKTVKDQAKKKEKNVSQDAIEGKIGRIYIPDQKIGDMAILDKSKGVKRERREAKMKN

Query:  REDQPASKKPKEDSEKPKEDSE
        R+D PASKKPKEDSEKPKEDSE
Subjt:  REDQPASKKPKEDSEKPKEDSE

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LAR1 Ribosome production factor 2 homolog1.8e-16090.37Show/hide
Query:  MLKVRTPKNAKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESSVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        ML++RTPKN KVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTE+YHLKKES+VKYSRKN+GIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSII+YGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNAKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESSVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  NNLVIGRTYDHHVYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFESVAELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLSGLDRVYVCTAISPDKVFLT
        NNLVI RTY+ H+YD+VEVGIENFKSMHSF YDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFE+V ELKHLKEVLLD FRGEVVEN+NLSGLDRVYVCTAISP+KVFLT
Subjt:  NNLVIGRTYDHHVYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFESVAELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLSGLDRVYVCTAISPDKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSEGIRKEAMKTVKDQAKKKEKNVSQDAIEGKIGRIYIPDQKIGDMAILDKSKGVKRERREAKMKN
        HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMV+RRHRLP++G+RKEAMKT KD+AKKKEKNVS+D I+GKIGRIYIPDQK+GDMAI+DKSKGVKRERREAKMKN
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSEGIRKEAMKTVKDQAKKKEKNVSQDAIEGKIGRIYIPDQKIGDMAILDKSKGVKRERREAKMKN

Query:  REDQPASKKPKEDSEKPKEDSE
        R+D PASKKPKEDSEKPKEDSE
Subjt:  REDQPASKKPKEDSEKPKEDSE

A0A6J1F357 Ribosome production factor 2 homolog3.4e-16291.93Show/hide
Query:  MLKVRTPKNAKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESSVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLK+RTPKN KV+RELEKRAPK+VETGKKTLILHGTKTSGVLN VLTE+YHLKKESSVKYSRKN+GIKPFESGGD+SLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNAKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESSVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  NNLVIGRTYDHHVYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFESVAELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLSGLDRVYVCTAISPDKVFLT
        +NLVIGRTYDH +YDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFE+V ELKHLKEVLLDLFRGEVVEN+NL+GLDRVYVCTAISP+KVFLT
Subjt:  NNLVIGRTYDHHVYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFESVAELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLSGLDRVYVCTAISPDKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSEGIRKEAMKTVKDQAKKKEKNVSQDAIEGKIGRIYIPDQKIGDMAILDKSKGVKRERREAKMKN
        HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPS+G+RKEAMKT KDQAKKKEKNVSQDAI+GKIGRIYIPDQK+GDMAI DKSKGVKRERREAKMKN
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSEGIRKEAMKTVKDQAKKKEKNVSQDAIEGKIGRIYIPDQKIGDMAILDKSKGVKRERREAKMKN

Query:  REDQPASKKPKEDSEKPKEDSE
        ++D PASKKPKEDSEKPKE+SE
Subjt:  REDQPASKKPKEDSEKPKEDSE

A0A6J1FZZ6 Ribosome production factor 2 homolog1.8e-16091.3Show/hide
Query:  MLKVRTPKNAKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESSVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLKVRTPKN KVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKES+VKYSR+NEGIKPFE+GGD+SLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNAKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESSVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  NNLVIGRTYDHHVYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFESVAELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLSGLDRVYVCTAISPDKVFLT
        +NLVI RTYDHH+YDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFE+V ELKHLKEVLLD+FRGEVVENINL+GLDRVYVCTAISP+KVFLT
Subjt:  NNLVIGRTYDHHVYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFESVAELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLSGLDRVYVCTAISPDKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSEGIRKEAMKTVKDQAKKKEKNVSQDAIEGKIGRIYIPDQKIGDMAILDKSKGVKRERREAKMKN
        HCALR+KKSGSVVPRMELVEVGPSMD+VVRRHRLPS+G+RKEAMKT KDQAKKKEKNVSQDAI GKIGRIYIPDQK+GD+A+ DKSKGVKRER EAKMKN
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSEGIRKEAMKTVKDQAKKKEKNVSQDAIEGKIGRIYIPDQKIGDMAILDKSKGVKRERREAKMKN

Query:  REDQPASKKPKEDSEKPKEDSE
        R++ PASKK KEDSEKPKEDSE
Subjt:  REDQPASKKPKEDSEKPKEDSE

A0A6J1J655 Ribosome production factor 2 homolog1.3e-16191.61Show/hide
Query:  MLKVRTPKNAKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESSVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLKVRTPKN KV+RELEKRAPK+VETGKKTLILHGTKTSGVLN VLTE+YHLKKESSVKYSRKN+GIKPFESGGD+SLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNAKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESSVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  NNLVIGRTYDHHVYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFESVAELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLSGLDRVYVCTAISPDKVFLT
        +NLVIGRTYDH +YDL+EVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFE+V ELKHLKEVLLDLFRGEVVEN+NL+GLDRVYVCTAISP+KVFLT
Subjt:  NNLVIGRTYDHHVYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFESVAELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLSGLDRVYVCTAISPDKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSEGIRKEAMKTVKDQAKKKEKNVSQDAIEGKIGRIYIPDQKIGDMAILDKSKGVKRERREAKMKN
        HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPS+G+RKEAMKT KDQAKKKEKNVSQDAI+GKIGRIYIPDQK+GDMAI DKSKGVKRERREAKMK+
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSEGIRKEAMKTVKDQAKKKEKNVSQDAIEGKIGRIYIPDQKIGDMAILDKSKGVKRERREAKMKN

Query:  REDQPASKKPKEDSEKPKEDSE
        ++D PASKKPKEDSEKPKE+SE
Subjt:  REDQPASKKPKEDSEKPKEDSE

A0A6J1KZU6 Ribosome production factor 2 homolog8.8e-16391.9Show/hide
Query:  MLKVRTPKNAKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESSVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLKVRTPKN KVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKES+VKYSR+NEGIKPFE+GGD+SLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNAKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESSVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  NNLVIGRTYDHHVYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFESVAELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLSGLDRVYVCTAISPDKVFLT
        +NLVI RTYDHH+YDL+EVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFE+V ELKHLKEVLLD+FRGEVVENINL+GLDRVYVCTAISP+KVFLT
Subjt:  NNLVIGRTYDHHVYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFESVAELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLSGLDRVYVCTAISPDKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSEGIRKEAMKTVKDQAKKKEKNVSQDAIEGKIGRIYIPDQKIGDMAILDKSKGVKRERREAKMKN
        HCALR+KKSGSVVPRMELVEVGPSMD+VVRRHRLPS+G+RKEAMKT KDQAKKKEKNVSQDAI GKIGRIYIPDQK+GD+A+ DKSKGVKRERREAKMKN
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSEGIRKEAMKTVKDQAKKKEKNVSQDAIEGKIGRIYIPDQKIGDMAILDKSKGVKRERREAKMKN

Query:  REDQPASKKPKEDSEKPKEDS
        R+D PASKKPKEDSEKPKEDS
Subjt:  REDQPASKKPKEDSEKPKEDS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q2YDN6 Ribosome production factor 2 homolog4.5e-5542.12Show/hide
Query:  KVRTPKNAKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESSVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPNN
        +V  PK  + KR LEKR PKL E  K  +++ G   +  + +VL ++Y LKK   + Y +KN   +PFE     SLEFFS K+DCS+ ++GSH+KKRPNN
Subjt:  KVRTPKNAKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESSVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPNN

Query:  LVIGRTYDHHVYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFESVAELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLSGLDRVYVCTAISPDKVFLTHC
        LVIGR YD+HV D++E+GIE F S+      K   P  G+KP + F G+ F+   + + LK +L+D FRG  V NI L+GL+ V   TA++  K++    
Subjt:  LVIGRTYDHHVYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFESVAELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLSGLDRVYVCTAISPDKVFLTHC

Query:  ALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSEGIRKEAMKTVKDQAKKKEKNVSQDAIEGKIGRIYIPDQKIGDMAILDKSKGVKRERREAKMKNRE
         L LKKSG   PR+EL E+GPS+D+V+RR  L S+ + K +MK  K    KK+KN+S D      GRI++  Q +  +    K KG+K  +R A+ K  +
Subjt:  ALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSEGIRKEAMKTVKDQAKKKEKNVSQDAIEGKIGRIYIPDQKIGDMAILDKSKGVKRERREAKMKNRE

Query:  DQPASKKPKED
        ++  SK+ K++
Subjt:  DQPASKKPKED

Q9AWM9 Ribosome production factor 2 homolog8.9e-12069.23Show/hide
Query:  VRTPKNAKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESSVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPNNL
        +R P++ + KREL K APKLVETGKKTLILHGTKTS VLN VL +++HLK++++VKYS+KN+ I+PFESGG+ SLEFFSLKTDCS+IVYGSHSKKRPNNL
Subjt:  VRTPKNAKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESSVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPNNL

Query:  VIGRTYDHHVYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFESVAELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLSGLDRVYVCTAISPDKVFLTHCA
        V+GRTYDHH+YDLVEVG+EN+KS+ S+ YDKKL+P++GSKPF  FIGE FESV ELKHLKEVLLDLF+GEVVEN+NL+G+DRV+VCTAISP  V++ HCA
Subjt:  VIGRTYDHHVYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFESVAELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLSGLDRVYVCTAISPDKVFLTHCA

Query:  LRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSEGIRKEAMKTVKDQAKKKEKNVSQDAIEGKIGRIYIPDQKIGDMAILDKSKGVKRERREAKMKNRED
        LRLK+SG+ +PR+ELVEVGPSMD+VVRRHR P E ++KEAMKT  D AKK  KNV++D + GK+G++YIPDQ+I  M++ +  KG+KRERREAK KN++ 
Subjt:  LRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSEGIRKEAMKTVKDQAKKKEKNVSQDAIEGKIGRIYIPDQKIGDMAILDKSKGVKRERREAKMKNRED

Query:  QPASKKPKEDSE
           SKK K + E
Subjt:  QPASKKPKEDSE

Q9H7B2 Ribosome production factor 2 homolog1.0e-5442.44Show/hide
Query:  KVRTPKNAKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESSVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPNN
        +V  PK  + KR LEKR PKL E  K  +++ G   +  + +VL ++Y LKK   V Y +KN   +PFE     SLEFFS K+DCS+ ++GSH+KKRPNN
Subjt:  KVRTPKNAKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESSVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPNN

Query:  LVIGRTYDHHVYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFESVAELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLSGLDRVYVCTAISPDKVFLTHC
        LVIGR YD+HV D++E+GIENF S+      K   P  G+KP + F G+ F+   + + LK +L+D FRG  V NI L+GL+ V   TA++  K++    
Subjt:  LVIGRTYDHHVYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFESVAELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLSGLDRVYVCTAISPDKVFLTHC

Query:  ALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSEGIRKEAMKTVKDQAKKKEKNVSQDAIEGKIGRIYIPDQKIGDMAILDKSKGVKRERREAKMKNRE
         L LKKSG   PR+EL E+GPS+D+V+RR  L S+ + K +MK  K    KK+KN+S D      GRI++  Q +  +    K KG+K  +R A+    +
Subjt:  ALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSEGIRKEAMKTVKDQAKKKEKNVSQDAIEGKIGRIYIPDQKIGDMAILDKSKGVKRERREAKMKNRE

Query:  DQPASKKPKED
         +  SK+ K++
Subjt:  DQPASKKPKED

Q9JJ80 Ribosome production factor 2 homolog1.1e-5644.03Show/hide
Query:  KVRTPKNAKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESSVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPNN
        KV  PK  + KR LEKR PKL E  K  +++ G   +  + +VL ++Y LKK   V Y +KN   +PFE     SLEFFS K+DCS+ ++GSH+KKRPNN
Subjt:  KVRTPKNAKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESSVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPNN

Query:  LVIGRTYDHHVYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFESVAELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLSGLDRVYVCTAISPDKVFLTHC
        LVIGR YD+HV D++E+GIE F S+      K   P  G+KP + F G+ F+   + + LK +L+D FRG  V N+ L+GL+ V   TA++  KV+    
Subjt:  LVIGRTYDHHVYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFESVAELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLSGLDRVYVCTAISPDKVFLTHC

Query:  ALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSEGIRKEAMKTVKDQAKKKEKNVSQDAIEGKIGRIYIPDQKIGDMAILDKSKGVKRERRE
         L LKKSG   PR+EL E+GPS+D+V+RR  L S+ + K +MK  K    KK KN+SQD      GRI++  Q +  +    K KG+K+   E
Subjt:  ALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSEGIRKEAMKTVKDQAKKKEKNVSQDAIEGKIGRIYIPDQKIGDMAILDKSKGVKRERRE

Q9LUG5 Ribosome production factor 2 homolog1.7e-12671.11Show/hide
Query:  MLKVRTPKNAKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESSVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        M+++RTPK  K KR LE RAPKLVETGKKTLILHGTKTS  L+ V+TE+Y LKK  +++YSR+NE I+PFESGG+ SLEFFS KTDCSI VYGSH+KKRP
Subjt:  MLKVRTPKNAKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESSVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  NNLVIGRTYDHHVYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFESVAELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLSGLDRVYVCTAISPDKVFLT
        +NLV+GR YDH VYDL+EVGIENFKS+ +F+YDKK +P  G+KPFI FIGEGFE+V+ELKHLKEVL DLFRGEVV+N+NL+GLDR YVC+AISP KVFLT
Subjt:  NNLVIGRTYDHHVYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFESVAELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLSGLDRVYVCTAISPDKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSEGIRKEAMKTVKDQAKKKEKNVSQDAIEGKIGRIYIPDQKIGDMAILDKSKGVKRERREAKMKN
        HCAL+LKKSGS+VPRMELVEVGPSMD+V+RR+RLP++ + KEAM+T KD+ KKKEKNV QDA+ GK G+IY+PDQK+ +M + DKSKG KRER++AK+K+
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSEGIRKEAMKTVKDQAKKKEKNVSQDAIEGKIGRIYIPDQKIGDMAILDKSKGVKRERREAKMKN

Query:  REDQPASKKPKEDSE
        +E+  A KK K  SE
Subjt:  REDQPASKKPKEDSE

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G23620.1 Ribosomal RNA processing Brix domain protein1.2e-12771.11Show/hide
Query:  MLKVRTPKNAKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESSVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        M+++RTPK  K KR LE RAPKLVETGKKTLILHGTKTS  L+ V+TE+Y LKK  +++YSR+NE I+PFESGG+ SLEFFS KTDCSI VYGSH+KKRP
Subjt:  MLKVRTPKNAKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESSVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  NNLVIGRTYDHHVYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFESVAELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLSGLDRVYVCTAISPDKVFLT
        +NLV+GR YDH VYDL+EVGIENFKS+ +F+YDKK +P  G+KPFI FIGEGFE+V+ELKHLKEVL DLFRGEVV+N+NL+GLDR YVC+AISP KVFLT
Subjt:  NNLVIGRTYDHHVYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFESVAELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLSGLDRVYVCTAISPDKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSEGIRKEAMKTVKDQAKKKEKNVSQDAIEGKIGRIYIPDQKIGDMAILDKSKGVKRERREAKMKN
        HCAL+LKKSGS+VPRMELVEVGPSMD+V+RR+RLP++ + KEAM+T KD+ KKKEKNV QDA+ GK G+IY+PDQK+ +M + DKSKG KRER++AK+K+
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSEGIRKEAMKTVKDQAKKKEKNVSQDAIEGKIGRIYIPDQKIGDMAILDKSKGVKRERREAKMKN

Query:  REDQPASKKPKEDSE
        +E+  A KK K  SE
Subjt:  REDQPASKKPKEDSE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTGAAGGTCAGAACACCCAAGAACGCCAAAGTTAAACGAGAGCTCGAGAAACGCGCTCCCAAACTCGTTGAGACTGGGAAGAAGACGCTGATACTTCATGGCACCAA
AACGAGCGGCGTGTTGAATGAAGTACTGACGGAGATTTATCACCTGAAGAAGGAAAGTTCTGTTAAGTATTCTCGTAAGAATGAAGGAATTAAGCCGTTTGAAAGTGGCG
GCGATGCGTCTTTGGAATTTTTCTCTCTCAAAACTGATTGCAGCATTATCGTGTATGGTTCTCACTCAAAGAAACGACCCAATAACCTTGTCATAGGGAGAACCTATGAT
CACCATGTCTATGACCTAGTTGAGGTTGGGATTGAAAATTTCAAGTCAATGCATTCTTTCACATATGATAAGAAACTATCTCCACGGGTGGGATCAAAACCTTTCATTAC
CTTTATCGGTGAAGGATTTGAGAGTGTGGCTGAGCTAAAGCATTTAAAGGAAGTTCTGCTTGATTTATTCCGAGGAGAGGTTGTAGAGAATATAAATCTTTCTGGGTTGG
ACCGTGTATATGTATGTACAGCCATCTCACCAGATAAAGTATTTCTCACTCATTGTGCATTGCGATTAAAAAAGTCGGGTTCAGTAGTTCCAAGAATGGAACTTGTTGAG
GTTGGTCCTTCAATGGATATGGTGGTCCGCCGGCACCGACTTCCTAGTGAGGGCATAAGGAAGGAAGCCATGAAAACAGTCAAGGATCAGGCTAAGAAGAAGGAGAAAAA
TGTTAGCCAGGATGCAATTGAAGGCAAGATTGGAAGGATATACATTCCTGATCAAAAGATTGGAGATATGGCTATACTAGACAAATCAAAGGGAGTGAAAAGAGAACGAC
GCGAAGCGAAAATGAAAAACAGAGAGGATCAGCCTGCCTCTAAAAAACCAAAAGAAGATTCAGAAAAACCGAAAGAAGACTCGGAGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GCCAAACCCCATTTGCCCCAAAACCCTAAAATCGGCGGCAGAGCTCGCAGTCGCCGGAACTGTCGACACTTCTCTGCGATTAGGGCGACAAAACCCTAAATCCCATCTCT
GCAATCTCGTCGCCGGCGACCATGTTGAAGGTCAGAACACCCAAGAACGCCAAAGTTAAACGAGAGCTCGAGAAACGCGCTCCCAAACTCGTTGAGACTGGGAAGAAGAC
GCTGATACTTCATGGCACCAAAACGAGCGGCGTGTTGAATGAAGTACTGACGGAGATTTATCACCTGAAGAAGGAAAGTTCTGTTAAGTATTCTCGTAAGAATGAAGGAA
TTAAGCCGTTTGAAAGTGGCGGCGATGCGTCTTTGGAATTTTTCTCTCTCAAAACTGATTGCAGCATTATCGTGTATGGTTCTCACTCAAAGAAACGACCCAATAACCTT
GTCATAGGGAGAACCTATGATCACCATGTCTATGACCTAGTTGAGGTTGGGATTGAAAATTTCAAGTCAATGCATTCTTTCACATATGATAAGAAACTATCTCCACGGGT
GGGATCAAAACCTTTCATTACCTTTATCGGTGAAGGATTTGAGAGTGTGGCTGAGCTAAAGCATTTAAAGGAAGTTCTGCTTGATTTATTCCGAGGAGAGGTTGTAGAGA
ATATAAATCTTTCTGGGTTGGACCGTGTATATGTATGTACAGCCATCTCACCAGATAAAGTATTTCTCACTCATTGTGCATTGCGATTAAAAAAGTCGGGTTCAGTAGTT
CCAAGAATGGAACTTGTTGAGGTTGGTCCTTCAATGGATATGGTGGTCCGCCGGCACCGACTTCCTAGTGAGGGCATAAGGAAGGAAGCCATGAAAACAGTCAAGGATCA
GGCTAAGAAGAAGGAGAAAAATGTTAGCCAGGATGCAATTGAAGGCAAGATTGGAAGGATATACATTCCTGATCAAAAGATTGGAGATATGGCTATACTAGACAAATCAA
AGGGAGTGAAAAGAGAACGACGCGAAGCGAAAATGAAAAACAGAGAGGATCAGCCTGCCTCTAAAAAACCAAAAGAAGATTCAGAAAAACCGAAAGAAGACTCGGAGTAG
TTCAGTTGGTGTAATACTGGTTGATCCAATTCTCCTCTTGCTAACTTGAGTAGCTGTTGTGAAATGCAATTATATGGAGAGAGCAGACAGTATTTATTTGCTTGTATGCA
GTTTTGTCTTTTATCTTCAATTTTTGTCTTTACAAGCCTACCTTTTATGGTATCATTCAGGTTTTTGCAGAGTTTGACCGTGACACAATGCTGTTGTAGCAAACATAATG
TTCCTTTAAGATTACTTGTGGCAGAGATATCCAAGTATGCATGCATTGTTTCTGTTATATATCTATTACCCTTACCTTCCTAGGTGGTTTCTGTAGGGCTGAACCCATCC
TTAGTGCATGACTGTGAAGATGCTTCAGAATTTTTAGAGGCATGGGTTGAAGAAAATTACTGGAACCAGAAATTTCTTTAGGTTTAATTATAGCCCCTACGAAGAAATTT
GTTTTCATTTTGTAGGAAACAAGAGATTTGTTTCCAAGGGACGGCGTAGTGGTCGAAGACTTGGACTTTGAGAGTATGCTCCTCTCAAGGTTGGTTTTGGGTTCGAAGCT
ATGTAACCAGCA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLKVRTPKNAKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESSVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPNNLVIGRTYD
HHVYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFESVAELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLSGLDRVYVCTAISPDKVFLTHCALRLKKSGSVVPRMELVE
VGPSMDMVVRRHRLPSEGIRKEAMKTVKDQAKKKEKNVSQDAIEGKIGRIYIPDQKIGDMAILDKSKGVKRERREAKMKNREDQPASKKPKEDSEKPKEDSE