; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0001581 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0001581
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionNEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like
Genome locationLG04:45187050..45191502
RNA-Seq ExpressionSed0001581
SyntenySed0001581
Gene Ontology termsGO:0045116 - protein neddylation (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
GO:0019788 - NEDD8 transferase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000608 - Ubiquitin-conjugating enzyme E2
IPR016135 - Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like
IPR023313 - Ubiquitin-conjugating enzyme, active site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0036519.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like [Cucumis melo var. makuwa]4.7e-9995.08Show/hide
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KAG7022419.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.6e-9994.54Show/hide
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XP_022931623.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like [Cucurbita moschata]3.6e-9994.54Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BHD5 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like2.3e-9995.08Show/hide
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A0A5D3CPZ9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like2.3e-9995.08Show/hide
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A0A6J1C2V1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like2.1e-10095.08Show/hide
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A0A6J1EZ82 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like1.8e-9994.54Show/hide
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A0A6J1JMG9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like1.8e-9994.54Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A3KN22 NEDD8-conjugating enzyme Ubc126.7e-6461.75Show/hide
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Q6DCZ9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc122.3e-6462.3Show/hide
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Q6P8D9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc122.3e-6462.3Show/hide
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Q9SDY5 NEDD8-conjugating enzyme Ubc127.9e-8983.7Show/hide
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Q9ZU75 Probable NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like4.1e-8581.08Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G16740.1 ubiquitin-conjugating enzyme 294.8e-2540.15Show/hide
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        +  +  L T PN +DPL  + A + + +   +E   R
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AT2G18600.1 Ubiquitin-conjugating enzyme family protein2.9e-8681.08Show/hide
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AT3G08690.1 ubiquitin-conjugating enzyme 116.3e-2540.88Show/hide
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AT4G36800.1 RUB1 conjugating enzyme 15.6e-9083.7Show/hide
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AT4G36800.2 RUB1 conjugating enzyme 15.6e-9083.7Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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AG
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TTAAAAAAAAGTAATGTCATTGGTATAAATTAATTTAATTAACACAAAAAGATAGGTTCCTTTTATCTGGTCCCTCCTTTGGCGGAGTGCAGCAGTAAGTCTACCGAGCT
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CACTTTCTACGCGCTTTTCTGTCTTCTCCGCTCATCTGCTTCGGCGTTATCGTTTCGATTGTTGGTTTCGTTCGAATCCAGTACCCTGCAGGAACGATGATTAAGCTTTT
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