| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| XP_008457020.1 PREDICTED: THO complex subunit 4D [Cucumis melo] | 4.0e-124 | 84.98 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLR-RGRANRGRGRGAGGSFSDGRGVGIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQLRHDLFEDSLRASGISGIEVGTK
M TPLDMSLEDVIKKNNREKLR RGRA RGRGAGGSF+ GRGV IGSVRRGPL INAR SAYSI KPP RMKNVQ +HDLFEDSLRASGISGI++GTK
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLR-RGRANRGRGRGAGGSFSDGRGVGIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQLRHDLFEDSLRASGISGIEVGTK
Query: LYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDNSGRPSGTAEVIYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGNPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVV
LYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYD +GRPSG+AEV+YTRRSDAFAALKRYNNVLLDG PMKIEMLGDNAEMPVSARINVTG NGR+RRTVV
Subjt: LYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDNSGRPSGTAEVIYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGNPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVV
Query: LTSESGR-TRFNAVNPFPGPSYRGGLRNSRGRGRGGWSHGLGSLSRGGRSQGRGRGGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
LT ESGR FN VNPFPGPS+RGGLRN+RGRGRG W+ G+G GG GR GRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
Subjt: LTSESGR-TRFNAVNPFPGPSYRGGLRNSRGRGRGGWSHGLGSLSRGGRSQGRGRGGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| XP_022935328.1 THO complex subunit 4D-like [Cucurbita moschata] | 2.0e-123 | 84.39 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLR-RGRANRGRGRGAGGSFSDGRGVGIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQLRHDLFEDSLRASGISGIEVGTK
MATPLDMSLEDVIKKNNREKLR RGRA RGRGAGGS++ GR V IGSVRRGPL INARPSA+SISKPPRRMKNVQ +HDLFEDSLRASGISGIE+GTK
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLR-RGRANRGRGRGAGGSFSDGRGVGIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQLRHDLFEDSLRASGISGIEVGTK
Query: LYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDNSGRPSGTAEVIYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGNPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVV
LYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYD +GRPSG+AEV+YTRRSDAFAALKRYNNVLLDG PMKIEMLGDNA+ PVSARINVTGVNGRSRRTVV
Subjt: LYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDNSGRPSGTAEVIYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGNPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVV
Query: LTSESGRT-RFNAVNPFPGPSYRGGLRN--SRGRGRGGWSHGLGSLSRGGRSQGRGRGGRGR------GRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQ
LTSESGRT +AVNPFPGPS+RGGLR+ RGRGRGGWS GLG GG +G G GGRGR GRGRGQGRKKPVEKSS ELDKELENYHAEAMQ
Subjt: LTSESGRT-RFNAVNPFPGPSYRGGLRN--SRGRGRGGWSHGLGSLSRGGRSQGRGRGGRGR------GRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQ
Query: T
T
Subjt: T
|
|
| XP_022982649.1 THO complex subunit 4D-like [Cucurbita maxima] | 1.2e-125 | 83.39 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLR-RGRANRGRGRGAGGSFSDGRGVGIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQLRHDLFEDSLRASGISGIEVGTK
MATPLDMSLEDVIKKNNREKLR RGRA RGRGAGGS++ GR V IGSVRRGPL INARPSA+SISKPPRRMKNVQ +HDLFEDSLRASGISGIE+GTK
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLR-RGRANRGRGRGAGGSFSDGRGVGIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQLRHDLFEDSLRASGISGIEVGTK
Query: LYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDNSGRPSGTAEVIYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGNPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVV
LYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYD +GRPSG+AEV+YTRRSDAFAALKRYNNVLLDG PMKIEMLGDNA+ PVSARINVTGVNGRSRRTVV
Subjt: LYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDNSGRPSGTAEVIYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGNPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVV
Query: LTSESGRT-RFNAVNPFPGPSYRGGLRNSRGRGRGGWSHGL-----------GSLSRGGRSQGRGRG---GRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENY
LTSESGRT NAVNPFPGPS+RGGLR+ RGRGRGGWS GL G GGR +GRGRG G G GRGRGQGRKKPVEKSS ELDKELENY
Subjt: LTSESGRT-RFNAVNPFPGPSYRGGLRNSRGRGRGGWSHGL-----------GSLSRGGRSQGRGRG---GRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENY
Query: HAEAMQT
HAEAMQT
Subjt: HAEAMQT
|
|
| XP_023527122.1 THO complex subunit 4D [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 5.2e-124 | 84.72 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLR-RGRANRGRGRGAGGSFSDGRGVGIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQLRHDLFEDSLRASGISGIEVGTK
MATPLDMSLEDVIKKNNREKLR RGRA RGRGAGGS++ GR V IGSVRRGPL INARPSA+SISKPPRRMKNVQ +HDLFEDSLRASGISGIE+GTK
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLR-RGRANRGRGRGAGGSFSDGRGVGIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQLRHDLFEDSLRASGISGIEVGTK
Query: LYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDNSGRPSGTAEVIYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGNPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVV
LYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYD +GRPSG+AEV+YTRRSDAFAALKRYNNVLLDG PMKIEMLGDNA+ PVSARINVTGVNGRSRRTVV
Subjt: LYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDNSGRPSGTAEVIYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGNPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVV
Query: LTSESGRT-RFNAVNPFPGPSYRGGLRN--SRGRGRGGWSHGLGSLSRGGRSQGRGRGGRGR------GRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQ
LTSESGRT NAVNPFPGPS+RGGLR+ RGRGRGGWS GLG GG +G G GGRGR GRGRGQGRKKPVEKSS ELDKELENYHAEAMQ
Subjt: LTSESGRT-RFNAVNPFPGPSYRGGLRN--SRGRGRGGWSHGLGSLSRGGRSQGRGRGGRGR------GRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQ
Query: T
T
Subjt: T
|
|
| XP_038896761.1 THO complex subunit 4D-like [Benincasa hispida] | 4.7e-125 | 86.01 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLR-RGRANRGRGRGAGGSFSDGRGVGIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQLRHDLFEDSLRASGISGIEVGTK
MATPLDMSLEDVIKK+NREKLR RGRA RGRGAGGSF+ GRGV +GSVRRGPL INAR SAYSI KPPRRMKNVQ +HDLFEDSLRASGISGIE+GTK
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLR-RGRANRGRGRGAGGSFSDGRGVGIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQLRHDLFEDSLRASGISGIEVGTK
Query: LYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDNSGRPSGTAEVIYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGNPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVV
LYVSNLDYGV+KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYD +GRPSG+AEV+YTRRSDAFAALKRYNNVLLDG PMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVV
Subjt: LYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDNSGRPSGTAEVIYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGNPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVV
Query: LTSESGRT-RFNAVNPFPGPSYRGGLRNSRGRGRGGWSHGLGSLSRGGRSQGRGRGGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
LT ESGRT N VNPFPGPS+RGGLRN RGRGRGGW+ G G GG GR GRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
Subjt: LTSESGRT-RFNAVNPFPGPSYRGGLRNSRGRGRGGWSHGLGSLSRGGRSQGRGRGGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A1S3C452 THO complex subunit 4D | 1.9e-124 | 84.98 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLR-RGRANRGRGRGAGGSFSDGRGVGIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQLRHDLFEDSLRASGISGIEVGTK
M TPLDMSLEDVIKKNNREKLR RGRA RGRGAGGSF+ GRGV IGSVRRGPL INAR SAYSI KPP RMKNVQ +HDLFEDSLRASGISGI++GTK
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLR-RGRANRGRGRGAGGSFSDGRGVGIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQLRHDLFEDSLRASGISGIEVGTK
Query: LYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDNSGRPSGTAEVIYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGNPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVV
LYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYD +GRPSG+AEV+YTRRSDAFAALKRYNNVLLDG PMKIEMLGDNAEMPVSARINVTG NGR+RRTVV
Subjt: LYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDNSGRPSGTAEVIYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGNPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVV
Query: LTSESGR-TRFNAVNPFPGPSYRGGLRNSRGRGRGGWSHGLGSLSRGGRSQGRGRGGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
LT ESGR FN VNPFPGPS+RGGLRN+RGRGRG W+ G+G GG GR GRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
Subjt: LTSESGR-TRFNAVNPFPGPSYRGGLRNSRGRGRGGWSHGLGSLSRGGRSQGRGRGGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| A0A2C9WC96 RRM domain-containing protein | 1.8e-90 | 64.04 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRRGRANRGRGRGAGGSFSDGRGVGIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQLRHDLFEDSLRASGISGIEVGTKL
MAT +DMSL+D+IKK NRE+ RGR RGRG GG F+ GR V G+VR+GPLS+N+RP+ Y+I+KPPRR++++ +HDL EDS+RA+GI+G+E+GTKL
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRRGRANRGRGRGAGGSFSDGRGVGIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQLRHDLFEDSLRASGISGIEVGTKL
Query: YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDNSGRPSGTAEVIYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGNPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVL
YVSNLDYGV+ EDIRELFSEIGDLKR+A+HYD +GRPSG+AEV+YTRRSDAFAALK+YNNVLLDG PMKIE++G +AEMP SAR+NVTGV+GR +RTVV+
Subjt: YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDNSGRPSGTAEVIYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGNPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVL
Query: TSESGRTRFNA-VNPFPGPSYRGGLRNSRGRGRGGWSHGLGSLSRGGRSQGRGRGGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
T GR R A N G + RGGLRN RGRG+G G+GRGRGRG+G+K+P KS+D+LDKELENYHAEAMQT
Subjt: TSESGRTRFNA-VNPFPGPSYRGGLRNSRGRGRGGWSHGLGSLSRGGRSQGRGRGGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| A0A6J1CP51 THO complex subunit 4D-like | 9.2e-119 | 83.62 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLR-RGRANRGRGRGAGGSFSDGRGVGIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQLRHDLFEDSLRASGISGIEVGTK
MATPLDMSLED+IKKNNREKLR RGRA RGRGAGGSF+ GR V IGS+RRGPLSIN RPSA+SISKPPRRMKNVQ +HDLFEDSLRASGISGIE+GTK
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLR-RGRANRGRGRGAGGSFSDGRGVGIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQLRHDLFEDSLRASGISGIEVGTK
Query: LYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDNSGRPSGTAEVIYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGNPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVV
LYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYD +GRPSG+AEV+YTRRSDAFAALKRYNNVLLDG PMKIE+LGDNAEMPVSARINVTG+NGRSRRTVV
Subjt: LYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDNSGRPSGTAEVIYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGNPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVV
Query: LTSESGRT-RFNAVNPFPGPSYRGGLRNSRGRGRGGWSHGLGSLSRGGRSQGRGRGGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
LTSESGRT VN FPGPS RG LR RGRGRGGWS G G + GGR GRGRGRGRG GRKK VEKSSDELDK+LENYHAEAMQT
Subjt: LTSESGRT-RFNAVNPFPGPSYRGGLRNSRGRGRGGWSHGLGSLSRGGRSQGRGRGGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| A0A6J1FAB9 THO complex subunit 4D-like | 9.5e-124 | 84.39 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLR-RGRANRGRGRGAGGSFSDGRGVGIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQLRHDLFEDSLRASGISGIEVGTK
MATPLDMSLEDVIKKNNREKLR RGRA RGRGAGGS++ GR V IGSVRRGPL INARPSA+SISKPPRRMKNVQ +HDLFEDSLRASGISGIE+GTK
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLR-RGRANRGRGRGAGGSFSDGRGVGIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQLRHDLFEDSLRASGISGIEVGTK
Query: LYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDNSGRPSGTAEVIYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGNPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVV
LYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYD +GRPSG+AEV+YTRRSDAFAALKRYNNVLLDG PMKIEMLGDNA+ PVSARINVTGVNGRSRRTVV
Subjt: LYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDNSGRPSGTAEVIYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGNPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVV
Query: LTSESGRT-RFNAVNPFPGPSYRGGLRN--SRGRGRGGWSHGLGSLSRGGRSQGRGRGGRGR------GRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQ
LTSESGRT +AVNPFPGPS+RGGLR+ RGRGRGGWS GLG GG +G G GGRGR GRGRGQGRKKPVEKSS ELDKELENYHAEAMQ
Subjt: LTSESGRT-RFNAVNPFPGPSYRGGLRN--SRGRGRGGWSHGLGSLSRGGRSQGRGRGGRGR------GRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQ
Query: T
T
Subjt: T
|
|
| A0A6J1J564 THO complex subunit 4D-like | 6.0e-126 | 83.39 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLR-RGRANRGRGRGAGGSFSDGRGVGIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQLRHDLFEDSLRASGISGIEVGTK
MATPLDMSLEDVIKKNNREKLR RGRA RGRGAGGS++ GR V IGSVRRGPL INARPSA+SISKPPRRMKNVQ +HDLFEDSLRASGISGIE+GTK
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLR-RGRANRGRGRGAGGSFSDGRGVGIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQLRHDLFEDSLRASGISGIEVGTK
Query: LYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDNSGRPSGTAEVIYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGNPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVV
LYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYD +GRPSG+AEV+YTRRSDAFAALKRYNNVLLDG PMKIEMLGDNA+ PVSARINVTGVNGRSRRTVV
Subjt: LYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDNSGRPSGTAEVIYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGNPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVV
Query: LTSESGRT-RFNAVNPFPGPSYRGGLRNSRGRGRGGWSHGL-----------GSLSRGGRSQGRGRG---GRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENY
LTSESGRT NAVNPFPGPS+RGGLR+ RGRGRGGWS GL G GGR +GRGRG G G GRGRGQGRKKPVEKSS ELDKELENY
Subjt: LTSESGRT-RFNAVNPFPGPSYRGGLRNSRGRGRGGWSHGL-----------GSLSRGGRSQGRGRG---GRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENY
Query: HAEAMQT
HAEAMQT
Subjt: HAEAMQT
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| B5FXN8 THO complex subunit 4 | 1.4e-31 | 38.57 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREK--LRRGRANRGRGRGAGGSFSDGRGVGIGSVRRGPL---SINARPSAYSISKPPRRMKNV--QLRHDLFEDSLRASGISG
MA +DMSL+D+IK N ++ R GR RGRG A G GVG G GP+ + AR + P R K + + +HDLF+ A +G
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREK--LRRGRANRGRGRGAGGSFSDGRGVGIGSVRRGPL---SINARPSAYSISKPPRRMKNV--QLRHDLFEDSLRASGISG
Query: IEVGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDNSGRPSGTAEVIYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGNPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGR
+E G KL VSNLD+GV+ DI+ELF+E G LK+ A+HYD SGR GTA+V + R++DA A+K+YN V LDG PM I++ V+++I
Subjt: IEVGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDNSGRPSGTAEVIYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGNPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGR
Query: SRRTVVLTSESGRTRFNAVNPFPGPSYRGGLRNSRGRGRGGWSHGLGSLSRGGRSQGRGRGGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHA
++ R +VN RGG+ +RG GG+ GG RG G RGRGRG GR + S++ELD +L+ Y+A
Subjt: SRRTVVLTSESGRTRFNAVNPFPGPSYRGGLRNSRGRGRGGWSHGLGSLSRGGRSQGRGRGGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHA
|
|
| Q6NQ72 THO complex subunit 4D | 5.7e-73 | 54.64 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRRGRANRGRGRGAGGSFSDGRGVGIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQLRHDLFEDSLRASGISGIEVGTKL
M+ L+M+L++++K+ + +RGRGRG GG G G G RRGPL++NARPS+++I+KP RR++++ + LFED LRA+G SG+EVGT+L
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRRGRANRGRGRGAGGSFSDGRGVGIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQLRHDLFEDSLRASGISGIEVGTKL
Query: YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDNSGRPSGTAEVIYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGNPMKIEMLGDN--AEMPVSAR--INVTGVNGRSRR
+V+NLD GVT EDIRELFSEIG+++R+AIHYD +GRPSGTAEV+Y RRSDAF ALK+YNNVLLDG PM++E+LG N +E P+S R +NVTG+NGR +R
Subjt: YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDNSGRPSGTAEVIYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGNPMKIEMLGDN--AEMPVSAR--INVTGVNGRSRR
Query: TVVLTSESG-----RTRFNAVNPFPGPSYRGGLRNSRGRG-RGGWSHGLGSLSRGG-RSQGRGRGGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAM
TVV+ G R P P S R + N +G G RGG RGG R++GRG GGRGRG GRG G KKPVEKS+ +LDK+LE+YHA+AM
Subjt: TVVLTSESG-----RTRFNAVNPFPGPSYRGGLRNSRGRG-RGGWSHGLGSLSRGG-RSQGRGRGGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAM
Query: QT
T
Subjt: QT
|
|
| Q8L719 THO complex subunit 4B | 2.5e-44 | 43.46 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRRGRANRGRGRGAGGSFSDGRGVGIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQLRHDLF--EDSLRAS---------
M+ LDMSL+D+IK N + RGR G G GG G G G RR + AR + YS ++ + ++D+F + S+ A+
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRRGRANRGRGRGAGGSFSDGRGVGIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQLRHDLF--EDSLRAS---------
Query: -GISGIEVGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDNSGRPSGTAEVIYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGNPMKIEMLGDNAEMPVSARINVT
G S IE GTKLY+SNLDYGV+ EDI+ELFSE+GDLKR+ IHYD SGR GTAEV+++RR DA AA+KRYNNV LDG MKIE++G N P +
Subjt: -GISGIEVGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDNSGRPSGTAEVIYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGNPMKIEMLGDNAEMPVSARINVT
Query: GVNGRSRRTVVLTSESGRTRFNAVNPFPGPSYRGGLRNSRGRGRGGWSHGLGSLSRGGRSQGRGRGGRG-RGR-GRGQ-GRKKPVEKSSDELDKELENYH
+ + + +E+ FN ++ G N RGRGRGG+ +G GG G RGGRG RGR GRG GR + S+++LD EL+ YH
Subjt: GVNGRSRRTVVLTSESGRTRFNAVNPFPGPSYRGGLRNSRGRGRGGWSHGLGSLSRGGRSQGRGRGGRG-RGR-GRGQ-GRKKPVEKSSDELDKELENYH
Query: AEAMQT
EAM+T
Subjt: AEAMQT
|
|
| Q8L773 THO complex subunit 4A | 2.3e-42 | 42.66 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRRGRANRGRGRGAGGSFSDGRGVGIGSVRR-GPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQLRHDLFEDSLRASGISGIEVGTK
M+T LDMSL+D+I KN R +RG GAG + G G G G RR P + R + Y +K P + D ED +GIE GTK
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRRGRANRGRGRGAGGSFSDGRGVGIGSVRR-GPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQLRHDLFEDSLRASGISGIEVGTK
Query: LYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDNSGRPSGTAEVIYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGNPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVV
LY+SNLDYGV EDI+ELF+E+G+LKR+ +H+D SGR GTAEV+Y+RR DA AA+K+YN+V LDG PMKIE++G N + +A + NG S
Subjt: LYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDNSGRPSGTAEVIYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGNPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVV
Query: LTSESGRTRFNAVNPFPGPSYRGGLRNSRGRGRGGWSHGLGSLSRGGRSQGRGRGGRGRGRGRGQGRKKPVEK-SSDELDKELENYHAEAMQT
G +RG G+GRGG RGG G GRGG GRGR G+G P EK S+++LD +L+ YH+ M+T
Subjt: LTSESGRTRFNAVNPFPGPSYRGGLRNSRGRGRGGWSHGLGSLSRGGRSQGRGRGGRGRGRGRGQGRKKPVEK-SSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| Q94EH8 THO complex subunit 4C | 3.3e-65 | 51.94 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRRGRA-----NRGRGRGAGG-SFSDGRGVGIGSVRRGPLSINARP-SAYSISKPPRRMKNV--QLRHDLFEDSLRASGI
M+ L+M+L++++KK+ E+ R+ +R GRG GG + G G G G VRRGPL++N RP S++SI+K RR +++ Q ++DL+E++LRA G+
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRRGRA-----NRGRGRGAGG-SFSDGRGVGIGSVRRGPLSINARP-SAYSISKPPRRMKNV--QLRHDLFEDSLRASGI
Query: SGIEVGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDNSGRPSGTAEVIYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGNPMKIEMLGDNAE-MPVSARINVTGV
SG+EVGT +Y++NLD GVT EDIREL++EIG+LKR+AIHYD +GRPSG+AEV+Y RRSDA A+++YNNVLLDG PMK+E+LG N E PV+AR+NVTG+
Subjt: SGIEVGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDNSGRPSGTAEVIYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGNPMKIEMLGDNAE-MPVSARINVTGV
Query: NGRSRRTVVLTSESGRTRFNAVNPFPGPSYRGGLRNSRGRGRG--GWSHGLGSLSRGGRSQGRGRGGRGRGRGRGQGR---------KKPVEKSSDELDK
NGR +R+V F G RGG R RGRG G G L +GG + GRG G RGRGRG G GR KKPVEKS+ +LDK
Subjt: NGRSRRTVVLTSESGRTRFNAVNPFPGPSYRGGLRNSRGRGRG--GWSHGLGSLSRGGRSQGRGRGGRGRGRGRGQGR---------KKPVEKSSDELDK
Query: ELENYHAEAM
+LE+YHAEAM
Subjt: ELENYHAEAM
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G66260.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 2.4e-66 | 51.94 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRRGRA-----NRGRGRGAGG-SFSDGRGVGIGSVRRGPLSINARP-SAYSISKPPRRMKNV--QLRHDLFEDSLRASGI
M+ L+M+L++++KK+ E+ R+ +R GRG GG + G G G G VRRGPL++N RP S++SI+K RR +++ Q ++DL+E++LRA G+
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRRGRA-----NRGRGRGAGG-SFSDGRGVGIGSVRRGPLSINARP-SAYSISKPPRRMKNV--QLRHDLFEDSLRASGI
Query: SGIEVGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDNSGRPSGTAEVIYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGNPMKIEMLGDNAE-MPVSARINVTGV
SG+EVGT +Y++NLD GVT EDIREL++EIG+LKR+AIHYD +GRPSG+AEV+Y RRSDA A+++YNNVLLDG PMK+E+LG N E PV+AR+NVTG+
Subjt: SGIEVGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDNSGRPSGTAEVIYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGNPMKIEMLGDNAE-MPVSARINVTGV
Query: NGRSRRTVVLTSESGRTRFNAVNPFPGPSYRGGLRNSRGRGRG--GWSHGLGSLSRGGRSQGRGRGGRGRGRGRGQGR---------KKPVEKSSDELDK
NGR +R+V F G RGG R RGRG G G L +GG + GRG G RGRGRG G GR KKPVEKS+ +LDK
Subjt: NGRSRRTVVLTSESGRTRFNAVNPFPGPSYRGGLRNSRGRGRG--GWSHGLGSLSRGGRSQGRGRGGRGRGRGRGQGR---------KKPVEKSSDELDK
Query: ELENYHAEAM
+LE+YHAEAM
Subjt: ELENYHAEAM
|
|
| AT1G66260.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 2.4e-66 | 51.94 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRRGRA-----NRGRGRGAGG-SFSDGRGVGIGSVRRGPLSINARP-SAYSISKPPRRMKNV--QLRHDLFEDSLRASGI
M+ L+M+L++++KK+ E+ R+ +R GRG GG + G G G G VRRGPL++N RP S++SI+K RR +++ Q ++DL+E++LRA G+
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRRGRA-----NRGRGRGAGG-SFSDGRGVGIGSVRRGPLSINARP-SAYSISKPPRRMKNV--QLRHDLFEDSLRASGI
Query: SGIEVGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDNSGRPSGTAEVIYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGNPMKIEMLGDNAE-MPVSARINVTGV
SG+EVGT +Y++NLD GVT EDIREL++EIG+LKR+AIHYD +GRPSG+AEV+Y RRSDA A+++YNNVLLDG PMK+E+LG N E PV+AR+NVTG+
Subjt: SGIEVGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDNSGRPSGTAEVIYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGNPMKIEMLGDNAE-MPVSARINVTGV
Query: NGRSRRTVVLTSESGRTRFNAVNPFPGPSYRGGLRNSRGRGRG--GWSHGLGSLSRGGRSQGRGRGGRGRGRGRGQGR---------KKPVEKSSDELDK
NGR +R+V F G RGG R RGRG G G L +GG + GRG G RGRGRG G GR KKPVEKS+ +LDK
Subjt: NGRSRRTVVLTSESGRTRFNAVNPFPGPSYRGGLRNSRGRGRG--GWSHGLGSLSRGGRSQGRGRGGRGRGRGRGQGR---------KKPVEKSSDELDK
Query: ELENYHAEAM
+LE+YHAEAM
Subjt: ELENYHAEAM
|
|
| AT5G02530.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.8e-45 | 43.46 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRRGRANRGRGRGAGGSFSDGRGVGIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQLRHDLF--EDSLRAS---------
M+ LDMSL+D+IK N + RGR G G GG G G G RR + AR + YS ++ + ++D+F + S+ A+
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRRGRANRGRGRGAGGSFSDGRGVGIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQLRHDLF--EDSLRAS---------
Query: -GISGIEVGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDNSGRPSGTAEVIYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGNPMKIEMLGDNAEMPVSARINVT
G S IE GTKLY+SNLDYGV+ EDI+ELFSE+GDLKR+ IHYD SGR GTAEV+++RR DA AA+KRYNNV LDG MKIE++G N P +
Subjt: -GISGIEVGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDNSGRPSGTAEVIYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGNPMKIEMLGDNAEMPVSARINVT
Query: GVNGRSRRTVVLTSESGRTRFNAVNPFPGPSYRGGLRNSRGRGRGGWSHGLGSLSRGGRSQGRGRGGRG-RGR-GRGQ-GRKKPVEKSSDELDKELENYH
+ + + +E+ FN ++ G N RGRGRGG+ +G GG G RGGRG RGR GRG GR + S+++LD EL+ YH
Subjt: GVNGRSRRTVVLTSESGRTRFNAVNPFPGPSYRGGLRNSRGRGRGGWSHGLGSLSRGGRSQGRGRGGRG-RGR-GRGQ-GRKKPVEKSSDELDKELENYH
Query: AEAMQT
EAM+T
Subjt: AEAMQT
|
|
| AT5G37720.1 ALWAYS EARLY 4 | 4.0e-74 | 54.64 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRRGRANRGRGRGAGGSFSDGRGVGIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQLRHDLFEDSLRASGISGIEVGTKL
M+ L+M+L++++K+ + +RGRGRG GG G G G RRGPL++NARPS+++I+KP RR++++ + LFED LRA+G SG+EVGT+L
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRRGRANRGRGRGAGGSFSDGRGVGIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQLRHDLFEDSLRASGISGIEVGTKL
Query: YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDNSGRPSGTAEVIYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGNPMKIEMLGDN--AEMPVSAR--INVTGVNGRSRR
+V+NLD GVT EDIRELFSEIG+++R+AIHYD +GRPSGTAEV+Y RRSDAF ALK+YNNVLLDG PM++E+LG N +E P+S R +NVTG+NGR +R
Subjt: YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDNSGRPSGTAEVIYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGNPMKIEMLGDN--AEMPVSAR--INVTGVNGRSRR
Query: TVVLTSESG-----RTRFNAVNPFPGPSYRGGLRNSRGRG-RGGWSHGLGSLSRGG-RSQGRGRGGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAM
TVV+ G R P P S R + N +G G RGG RGG R++GRG GGRGRG GRG G KKPVEKS+ +LDK+LE+YHA+AM
Subjt: TVVLTSESG-----RTRFNAVNPFPGPSYRGGLRNSRGRG-RGGWSHGLGSLSRGG-RSQGRGRGGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAM
Query: QT
T
Subjt: QT
|
|
| AT5G37720.2 ALWAYS EARLY 4 | 3.6e-75 | 55.56 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRRGRANRGRGRGAGGSFSDGRGVGIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQLRHDLFEDSLRASGISGIEVGTKL
M+ L+M+L++++K+ + +RGRGRG GG G G G RRGPL++NARPS+++I+KP RR++++ + LFED LRA+G SG+EVGT+L
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRRGRANRGRGRGAGGSFSDGRGVGIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQLRHDLFEDSLRASGISGIEVGTKL
Query: YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDNSGRPSGTAEVIYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGNPMKIEMLGDN--AEMPVSAR--INVTGVNGRSRR
+V+NLD GVT EDIRELFSEIG+++R+AIHYD +GRPSGTAEV+Y RRSDAF ALK+YNNVLLDG PM++E+LG N +E P+S R +NVTG+NGR +R
Subjt: YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDNSGRPSGTAEVIYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGNPMKIEMLGDN--AEMPVSAR--INVTGVNGRSRR
Query: TVVLTSESGRTRFNAVNPFPGPSYRGGLRNSRGRG-RGGWSHGLGSLSRGG-RSQGRGRGGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
TVV+ GR P P S R + N +G G RGG RGG R++GRG GGRGRG GRG G KKPVEKS+ +LDK+LE+YHA+AM T
Subjt: TVVLTSESGRTRFNAVNPFPGPSYRGGLRNSRGRG-RGGWSHGLGSLSRGG-RSQGRGRGGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
