; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0001716 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0001716
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionChalcone synthase
Genome locationLG11:2915072..2916113
RNA-Seq ExpressionSed0001716
SyntenySed0001716
Gene Ontology termsGO:0009813 - flavonoid biosynthetic process (biological process)
GO:0030639 - polyketide biosynthetic process (biological process)
GO:0016210 - naringenin-chalcone synthase activity (molecular function)
GO:0102128 - chalcone synthase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001099 - Chalcone/stilbene synthase, N-terminal
IPR011141 - Polyketide synthase, type III
IPR016039 - Thiolase-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
CDU44814.1 chalcone synthase, partial [Capsella rubella]2.2e-2971.29Show/hide
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XP_022934336.1 chalcone synthase 2 isoform X2 [Cucurbita moschata]3.8e-2975Show/hide
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XP_022983281.1 chalcone synthase 2 [Cucurbita maxima]3.8e-2975Show/hide
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XP_023528253.1 chalcone synthase 2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.8e-2975Show/hide
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XP_038892343.1 chalcone synthase 2 [Benincasa hispida]2.2e-2975Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LDT8 Uncharacterized protein1.8e-2975Show/hide
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A0A173QN93 Chalcone synthase (Fragment)1.1e-2971.29Show/hide
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A0A5A7TZX5 Chalcone synthase 21.8e-2975Show/hide
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A0A6J1F1I9 chalcone synthase 2 isoform X21.8e-2975Show/hide
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A0A6J1J1P2 chalcone synthase 21.8e-2975Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O04220 Chalcone synthase4.2e-3173.96Show/hide
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P17957 Chalcone synthase 22.7e-3070.83Show/hide
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P19168 Chalcone synthase 32.7e-3070.83Show/hide
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P24826 Chalcone synthase 12.7e-3070.83Show/hide
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P48406 Chalcone synthase 52.7e-3070.83Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02050.1 Chalcone and stilbene synthase family protein1.2e-0938.3Show/hide
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AT4G00040.1 Chalcone and stilbene synthase family protein9.3e-1039.36Show/hide
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AT4G34850.1 Chalcone and stilbene synthase family protein2.5e-1038.3Show/hide
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        G + S+ITH+V+     +  P  D  L K L L P   R ++Y    +     LR+AKD+AENN G+RVL+  SE T + F+ PS      +VG
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AT5G13930.1 Chalcone and stilbene synthase family protein9.6e-3170.83Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGTGTAAGTTGGCGCACGTTGGGATTGCTGGTTGCACGTGTCTGCAGTGAGGACATGCGAGGCGTGGCCGAAACGGCGCTGAGCTACGCGGCCGTGGTGCAGGCGAA
CACGAACTCGACCGGATCGTGCGAGGATGACGGCACCGGCGTTGGTGGCAAGGCGGCGTCGCCGCGGCTTGCGTGTCTGCTGCTTATGCGAGAGGGGATGTCGCGCGTGG
GAGCTGCGGTGTGCAATGGTGTTGGCGCAAATGGCTCGGCCTCGAGCGGCGGGCGGTGCGACGCAGATTCTTTATCTTTGCGTCGGGGACATCGTGGGTGGTGGAGGTGC
CGGCCGGGAAGGAGGCGGCGCGGCGGCCATCAAGGAGTGGGGGCCGCCAAGTCCGAGATCACGCACCTCGTCTTCGCACCACCTCCGGCGTCGACATGCCCGCGCGCCGA
CTACCAGCTCATGAAGCTCCTCGCCCTCCGCCCCTCCGTCAAGCGCTACATGATGTACCAAAGGGCTGCCACGCCGCGCACCGTCGTCCTCCGCCTCGCCAAGGACCTCG
CCGAGAACAACCGCGGCGCTCGCGTCCTCGTTGTGTGCTCCGAGATCACCGCCGTCACCTTCCGCGGCCCCTCTGAGACTCACTTGGATTCTATGGTCGGACAGTCTTCT
CTTTTAAAATTTAAAACCAAAAGATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGTGTAAGTTGGCGCACGTTGGGATTGCTGGTTGCACGTGTCTGCAGTGAGGACATGCGAGGCGTGGCCGAAACGGCGCTGAGCTACGCGGCCGTGGTGCAGGCGAA
CACGAACTCGACCGGATCGTGCGAGGATGACGGCACCGGCGTTGGTGGCAAGGCGGCGTCGCCGCGGCTTGCGTGTCTGCTGCTTATGCGAGAGGGGATGTCGCGCGTGG
GAGCTGCGGTGTGCAATGGTGTTGGCGCAAATGGCTCGGCCTCGAGCGGCGGGCGGTGCGACGCAGATTCTTTATCTTTGCGTCGGGGACATCGTGGGTGGTGGAGGTGC
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSVSWRTLGLLVARVCSEDMRGVAETALSYAAVVQANTNSTGSCEDDGTGVGGKAASPRLACLLLMREGMSRVGAAVCNGVGANGSASSGGRCDADSLSLRRGHRGWWRC
RPGRRRRGGHQGVGAAKSEITHLVFAPPPASTCPRADYQLMKLLALRPSVKRYMMYQRAATPRTVVLRLAKDLAENNRGARVLVVCSEITAVTFRGPSETHLDSMVGQSS
LLKFKTKR