; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0001996 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0001996
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionPlant protein 1589 of unknown function
Genome locationLG03:15988078..16004733
RNA-Seq ExpressionSed0001996
SyntenySed0001996
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR006476 - Conserved hypothetical protein CHP01589, plant


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_023518640.1 uncharacterized protein LOC111782088 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.6e-15388.61Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3C1F9 uncharacterized protein LOC103495809 isoform X12.0e-15187.03Show/hide
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A0A6J1DI93 uncharacterized protein LOC111021330 isoform X17.9e-14884.81Show/hide
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A0A6J1EH54 uncharacterized protein LOC111432488 isoform X12.5e-15488.61Show/hide
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A0A6J1F3A3 uncharacterized protein LOC111439400 isoform X17.4e-14684.49Show/hide
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A0A6J1HRZ6 uncharacterized protein LOC111466056 isoform X16.7e-15588.92Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G10250.1 Plant protein 1589 of unknown function4.2e-8551.88Show/hide
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AT3G10250.2 Plant protein 1589 of unknown function4.2e-8551.88Show/hide
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AT3G61700.1 Plant protein 1589 of unknown function1.6e-2833.44Show/hide
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        S+   R++SR D++LV+ LIERCLQL MNR EVV+TLL   +IDP FT  VWQKLEEEN +FF AYY+RL +K QI+ FN LLE Q  +M+    P  V 
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             NG H  +                    N P+G  +     +   HV    H   ++ +SS    +     +N    +      + ++T  ++++P
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         +     G    ++ +  S+ +S    FA+ D +    + S+LD        P   G  N         QI  NFS SDLTAD S+  D+  L +Y   P
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Query:  FLPTETDNILDTCENGD
        FLP++++  LD+ E  D
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AT5G04090.1 Plant protein 1589 of unknown function1.4e-5145.96Show/hide
Query:  VWQKLEEENREFFNAYYLRLMVKSQIMEFNRLLEQQARMMQQIHPCAVTALSSSNGSHVQSIHQSCYAPENTGPALKQDDTNNPVGVSLGNAYSNGTQHV
        VWQKLEEENREFF AYYLRLMVK QIME+N LLEQQ   M+Q+HP A  ++ + NGSHV  ++Q     E      K+ D ++P   +L + Y NG   +
Subjt:  VWQKLEEENREFFNAYYLRLMVKSQIMEFNRLLEQQARMMQQIHPCAVTALSSSNGSHVQSIHQSCYAPENTGPALKQDDTNNPVGVSLGNAYSNGTQHV

Query:  HSTMHTSVDMSSHAR------TDAALQSSNVGLFQGMNGGMIKVETGYSNSSPYIFGTEGNVLDARQSIGNSSVASFASVDSNTPSFNQSLLDQDPSSYG
        ++ + + VD SSH+R         +LQ++N+ L Q    GMIK ET Y N +PY++G E     A+ ++G+ ++ASF++ DS+  S N  L+D D  ++G
Subjt:  HSTMHTSVDMSSHAR------TDAALQSSNVGLFQGMNGGMIKVETGYSNSSPYIFGTEGNVLDARQSIGNSSVASFASVDSNTPSFNQSLLDQDPSSYG

Query:  FINQITSNFSFSDLTADFSHSSDILESYGRCPFLPTETDNILDTCENGDRL-DSKRLDNVSEAMSYEGFRHN
         + QI  NFS SDLTADFS SSDILESY   PFL  + +N LD+ E  +   D +RL  +S   SYE FR N
Subjt:  FINQITSNFSFSDLTADFSHSSDILESYGRCPFLPTETDNILDTCENGDRL-DSKRLDNVSEAMSYEGFRHN

AT5G04090.2 Plant protein 1589 of unknown function7.7e-7149.54Show/hide
Query:  MSTGTVRRISRHDMQLVRGLIERCLQLDMNRKEVVETLLNHEKIDPSFTEHVWQKLEEENREFFNAYYLRLMVKSQIMEFNRLLEQQARMMQQIHPCAVT
        MS+ TVRR+SR D+QLV+ LIERCLQL MN+KEVV+TLL   KI+P FTE VWQKLEEENREFF AYYLRLMVK QIME+N LLEQQ   M+Q+HP A  
Subjt:  MSTGTVRRISRHDMQLVRGLIERCLQLDMNRKEVVETLLNHEKIDPSFTEHVWQKLEEENREFFNAYYLRLMVKSQIMEFNRLLEQQARMMQQIHPCAVT

Query:  ALSSSNGSHVQSIHQSCYAPENTGPALKQDDTNNPVGVSLGNAYSNGTQHVHSTMHTSVDMSSHAR------TDAALQSSNVGLFQGMNGGMIKVETGYS
        ++ + NGSHV  ++Q     E      K+ D ++P   +L + Y NG   +++ + + VD SSH+R         +LQ++N+ L Q    GMIK ET Y 
Subjt:  ALSSSNGSHVQSIHQSCYAPENTGPALKQDDTNNPVGVSLGNAYSNGTQHVHSTMHTSVDMSSHAR------TDAALQSSNVGLFQGMNGGMIKVETGYS

Query:  NSSPYIFGTEGNVLDARQSIGNSSVASFASVDSNTPSFNQSLLDQDPSSYGFINQITSNFSFSDLTADFSHSSDILESYGRCPFLPTETDNILDTCENGD
        N +PY++G E     A+ ++G+ ++ASF++ DS+  S N  L+D D  ++G + QI  NFS SDLTADFS SSDILESY   PFL  + +N LD+ E  +
Subjt:  NSSPYIFGTEGNVLDARQSIGNSSVASFASVDSNTPSFNQSLLDQDPSSYGFINQITSNFSFSDLTADFSHSSDILESYGRCPFLPTETDNILDTCENGD

Query:  RL-DSKRLDNVSEAMSYEGFRHN
           D +RL  +S   SYE FR N
Subjt:  RL-DSKRLDNVSEAMSYEGFRHN


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCAACCGGAACTGTGAGAAGGATCTCACGGCATGATATGCAACTGGTGCGAGGTCTTATAGAAAGATGCCTTCAGCTTGATATGAACAGAAAAGAAGTTGTGGAAAC
ACTTTTGAATCATGAAAAAATCGACCCCAGTTTCACAGAACATGTTTGGCAGAAGCTTGAAGAGGAGAACCGGGAATTCTTCAATGCATATTATCTGAGACTGATGGTGA
AAAGCCAGATTATGGAATTCAATCGCTTGCTTGAACAGCAAGCAAGGATGATGCAACAGATACATCCATGTGCTGTGACTGCGCTTTCTAGTTCTAATGGGTCCCATGTC
CAATCTATACATCAGAGCTGCTACGCGCCCGAGAATACCGGACCTGCTTTGAAACAAGATGATACAAACAACCCTGTGGGTGTCAGCTTGGGCAATGCTTATTCTAATGG
TACTCAACATGTACACTCAACTATGCACACTTCTGTAGACATGTCTTCTCATGCCAGGACTGATGCTGCACTTCAGAGCTCAAACGTGGGTCTGTTTCAAGGAATGAATG
GAGGGATGATAAAAGTAGAAACTGGTTATTCGAACAGTTCGCCCTACATATTTGGAACAGAGGGTAATGTCCTTGATGCGCGTCAATCAATTGGGAATTCATCAGTTGCA
TCTTTTGCTAGTGTTGATTCCAACACACCATCTTTCAATCAATCACTACTTGATCAGGATCCCTCTTCATATGGGTTCATTAATCAAATTACCAGCAATTTTAGTTTCTC
AGATCTGACTGCAGACTTTTCTCACAGTTCAGATATACTAGAGAGCTACGGCAGATGTCCATTTTTACCAACAGAGACTGATAACATCCTTGATACCTGTGAGAACGGAG
ACCGTCTCGATAGTAAAAGGTTGGACAATGTGTCAGAAGCCATGAGTTACGAAGGCTTCAGACATAATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTTGATCGCACAGTGCTTTCTCTTCCATTCCACAATCTAAAGCGAAAATTCCTGCTTTTCACCCCCCATTTCCCTCTCTCAATATTCACAAATATTCTCATTTTGTTTTT
TCGCTGTACAAAATCTCTTCTTCTCTTGGAATCGACCCTTCTCACTGTTTTCTAGATGCTGGGGTGGAATATTTGAGGAGCAACAGTTCCCCAGTTGGTTGTACAATTCA
ATTCCTATGCTCTGGACCGGGAAATATGTCAACCGGAACTGTGAGAAGGATCTCACGGCATGATATGCAACTGGTGCGAGGTCTTATAGAAAGATGCCTTCAGCTTGATA
TGAACAGAAAAGAAGTTGTGGAAACACTTTTGAATCATGAAAAAATCGACCCCAGTTTCACAGAACATGTTTGGCAGAAGCTTGAAGAGGAGAACCGGGAATTCTTCAAT
GCATATTATCTGAGACTGATGGTGAAAAGCCAGATTATGGAATTCAATCGCTTGCTTGAACAGCAAGCAAGGATGATGCAACAGATACATCCATGTGCTGTGACTGCGCT
TTCTAGTTCTAATGGGTCCCATGTCCAATCTATACATCAGAGCTGCTACGCGCCCGAGAATACCGGACCTGCTTTGAAACAAGATGATACAAACAACCCTGTGGGTGTCA
GCTTGGGCAATGCTTATTCTAATGGTACTCAACATGTACACTCAACTATGCACACTTCTGTAGACATGTCTTCTCATGCCAGGACTGATGCTGCACTTCAGAGCTCAAAC
GTGGGTCTGTTTCAAGGAATGAATGGAGGGATGATAAAAGTAGAAACTGGTTATTCGAACAGTTCGCCCTACATATTTGGAACAGAGGGTAATGTCCTTGATGCGCGTCA
ATCAATTGGGAATTCATCAGTTGCATCTTTTGCTAGTGTTGATTCCAACACACCATCTTTCAATCAATCACTACTTGATCAGGATCCCTCTTCATATGGGTTCATTAATC
AAATTACCAGCAATTTTAGTTTCTCAGATCTGACTGCAGACTTTTCTCACAGTTCAGATATACTAGAGAGCTACGGCAGATGTCCATTTTTACCAACAGAGACTGATAAC
ATCCTTGATACCTGTGAGAACGGAGACCGTCTCGATAGTAAAAGGTTGGACAATGTGTCAGAAGCCATGAGTTACGAAGGCTTCAGACATAATTAGCTGCAGAAATGTAC
ATTATGTAATGCATTTTTACAGACATTTGGAGGAGCATGAAAGCTGCTTATTGATGGACTTTTAAGCAGTTGTATATCAGTATATGACAAAGGCACATGGTTTTCTGATC
ATTGATGCAACATATATCACCATTTTGTTGCTATACTTGTGCAGATGTTTGTACATAGTGTTGTAGGGCTGGAGAGGCTACTTCAGATTAGTACCTAAACCTAAACTTAC
TGATCATATATGCGCGAGTTTCACCGACATCGGCGAGTAAGGAATCTTTCTATAGAACATGGCTCCAGATTACTTGAGCGGTCTAACACGGAGAATGGAAATAATGTACC
ACTGTGCTTCTGAAAACAATTTTAGCTTTCAAGTGATTGAAGTCTCTGAGACTAACCCTTATTGCTTGATGATTGGGATATTGACATGATTGTAATGATCTGATTATTGT
GTTGAGTGTAGATTGTAAGAGTGAAATACTAAGTGTTGGTTGGTTTAACTTTTGCCATCGACTGCCATTGAAGGTGGCTTCACTTGTGTTTGATTAAAGAAGCCTCTTGA
GGAGGTAGGTTTTATACCTGATGATTGTGAAGTTCTGATTGAGGAGAGATTTTATGTGAAGGAAATTATAATTCTTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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SFASVDSNTPSFNQSLLDQDPSSYGFINQITSNFSFSDLTADFSHSSDILESYGRCPFLPTETDNILDTCENGDRLDSKRLDNVSEAMSYEGFRHN