; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0002102 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0002102
OrganismSechium edule (Chayote v1)
Descriptionmucin-1
Genome locationLG08:29119759..29120331
RNA-Seq ExpressionSed0002102
SyntenySed0002102
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0066977.1 mucin-1 [Cucumis melo var. makuwa]2.5e-1853.55Show/hide
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        MASQS+LV +L+ V A+AGVF EAP+ SPS   +PKASPSDS S S                S SPAASPKA+   SE+ SPS AAS+PS+SSS AP+S+
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        SP +S    SSP+ SPSPA DSP     ADSP        TA+SPDSD+SSPPSPDAAD P AADGP  A GP AD+PA      D +S + L+ T+A V
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        G  V+  G +A
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XP_008450043.1 PREDICTED: mucin-1 [Cucumis melo]2.5e-1853.55Show/hide
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        MASQS+LV +L+ V A+AGVF EAP+ SPS   +PKASPSDS S S                S SPAASPKA+   SE+ SPS AAS+PS+SSS AP+S+
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Query:  SPAASTPESSSPATSPSPAADSPT---GADSPT-------TASSPDSDLSSPPSPDAADGP-AADGP--ASGPAADTPA------DPASASALEFTAATV
        SP +S    SSP+ SPSPA DSP     ADSP        TA+SPDSD+SSPPSPDAAD P AADGP  A GP AD+PA      D +S + L+ T+A V
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Query:  GVAVVIVGMFA
        G  V+  G +A
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XP_022934589.1 mucin-1-like [Cucurbita moschata]1.4e-0842.98Show/hide
Query:  MASQS-LLVLSLVLVVAIAGVFGEAPSTSPS---APKASPSDSNS---TSSPAASPKANSSKSESESP--SPAASPKANSSKSESESPS-SAASAPSNSS
        MASQS +LV +L+ V A+AG F EAP+ +PS   APK++PSDS +   +SSPA+SP    + + +++P  +PA +P    + + +++P+ + A AP+ SS
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Query:  SKAPS---------SESPAASTPES---SSPATSPSPAADSPTG--ADSPTTASSPDSDLSSPPS--PDAADGPAADGP--------------ASGPAAD
          +PS         SE+PA+++P+S   SSP+ SPSPA DSP    ADS + A+SPDSD SSPPS  PDAAD P ADGP              A G  +D
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Query:  TPAD------PASASALEFTAATVGVAVVIVGMFA
        +PAD       +  SAL+ T+A V  AV + G+FA
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XP_022983389.1 mucin-1-like [Cucurbita maxima]1.4e-0842.11Show/hide
Query:  MASQSLLVLSLVLVVAIAGVFGEAPSTSPS---APKASPSDSNS---TSSPAASPKANSSKSESESP---------------------------------
        MASQS+LV +L+ V A+AG F EAP+ SPS   APK++PSDS +   +SSPA +P    + + +E+P                                 
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Query:  -----SPAASPKANSSKSESESPSSAASAPSNSSSKAPSSESPAASTPESSSPATSPSPAADSPTG--ADSPTTASSPDSDLSSPPS--PDAADGPAADG
             +PA +P    + S   SPS AASAP+ S S+AP+S SP +S    SSP+ SPSP  DSP    ADS + A+SPDSD SSPPS  PDAAD P ADG
Subjt:  -----SPAASPKANSSKSESESPSSAASAPSNSSSKAPSSESPAASTPESSSPATSPSPAADSPTG--ADSPTTASSPDSDLSSPPS--PDAADGPAADG

Query:  PA--SGPAADTPAD------PASASALEFTAATV--GVAVVIVGMFA
        P+   GP +D+PAD       +  S+L+ T+A V   VAV + G+FA
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XP_031737954.1 classical arabinogalactan protein 11 [Cucumis sativus]6.4e-1449.33Show/hide
Query:  MASQSLLVLSLVLVVAIAGVFGEAPSTSPS---APKASPSDSN----STSSPAASPKANSSKSESESPSPAASPKANSSKSESESPSSAASAP-SNSSSK
        MASQ++LV +L+ + A+AGVF EAP+ SPS   +PKASPSDS     S+SSPA SPKA+    E+ SPSPAAS           SPSS++ AP SNS + 
Subjt:  MASQSLLVLSLVLVVAIAGVFGEAPSTSPS---APKASPSDSN----STSSPAASPKANSSKSESESPSPAASPKANSSKSESESPSSAASAP-SNSSSK

Query:  APSSESPAASTPESSSPATSP---SPAADSPTGADSPT---TASSPDSDLSSPPSPDAADGPAADGPAS--------------GP-AADTPA-----DPA
        +P+S    + +P + SP+ SP   SP ADSP  ADSP    TA+SPDSD+SSPPSPDAAD P ADGPA+              GP AAD+PA     D +
Subjt:  APSSESPAASTPESSSPATSP---SPAADSPTGADSPT---TASSPDSDLSSPPSPDAADGPAADGPAS--------------GP-AADTPA-----DPA

Query:  SASALEFTAATVGVAVVIVGMFA
        S + L+ T+A V   V  VG FA
Subjt:  SASALEFTAATVGVAVVIVGMFA

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LDP4 Uncharacterized protein9.9e-1351.53Show/hide
Query:  MASQSLLVLSLVLVVAIAGVFGEAPSTSPS---APKASPSDSN----STSSPAASPKANSSKSESESPSPAASPKANSSKSESESPSSAASAP-SNSSSK
        MASQ++LV +L+ + A+AGVF EAP+ SPS   +PKASPSDS     S+SSPA SPKA+    E+ SPSPAAS           SPSS++ AP SNS + 
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Query:  APSSESPAASTPESSSPATSP---SPAADSPTGADSPT---TASSPDSDLSSPPSPDAADGPAADGPAS--GP-AADTPADPASASALEFTAATVG
        +P+S    + +P + SP+ SP   SP ADSP  ADSP    TA+SPDSD+SSPPSPDAAD P ADGPA+  GP AAD P      +A +   A  G
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A0A1S3BND1 mucin-11.2e-1853.55Show/hide
Query:  MASQSLLVLSLVLVVAIAGVFGEAPSTSPS---APKASPSDSNSTSSPAASPKANSSKSESESPSPAASPKANSSKSESESPSSAASAPSNSSSKAPSSE
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Query:  SPAASTPESSSPATSPSPAADSPT---GADSPT-------TASSPDSDLSSPPSPDAADGP-AADGP--ASGPAADTPA------DPASASALEFTAATV
        SP +S    SSP+ SPSPA DSP     ADSP        TA+SPDSD+SSPPSPDAAD P AADGP  A GP AD+PA      D +S + L+ T+A V
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Query:  GVAVVIVGMFA
        G  V+  G +A
Subjt:  GVAVVIVGMFA

A0A5A7VIK3 Mucin-11.2e-1853.55Show/hide
Query:  MASQSLLVLSLVLVVAIAGVFGEAPSTSPS---APKASPSDSNSTSSPAASPKANSSKSESESPSPAASPKANSSKSESESPSSAASAPSNSSSKAPSSE
        MASQS+LV +L+ V A+AGVF EAP+ SPS   +PKASPSDS S S                S SPAASPKA+   SE+ SPS AAS+PS+SSS AP+S+
Subjt:  MASQSLLVLSLVLVVAIAGVFGEAPSTSPS---APKASPSDSNSTSSPAASPKANSSKSESESPSPAASPKANSSKSESESPSSAASAPSNSSSKAPSSE

Query:  SPAASTPESSSPATSPSPAADSPT---GADSPT-------TASSPDSDLSSPPSPDAADGP-AADGP--ASGPAADTPA------DPASASALEFTAATV
        SP +S    SSP+ SPSPA DSP     ADSP        TA+SPDSD+SSPPSPDAAD P AADGP  A GP AD+PA      D +S + L+ T+A V
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Query:  GVAVVIVGMFA
        G  V+  G +A
Subjt:  GVAVVIVGMFA

A0A6J1F318 mucin-1-like6.7e-0942.98Show/hide
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        MASQS +LV +L+ V A+AG F EAP+ +PS   APK++PSDS +   +SSPA+SP    + + +++P  +PA +P    + + +++P+ + A AP+ SS
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Query:  SKAPS---------SESPAASTPES---SSPATSPSPAADSPTG--ADSPTTASSPDSDLSSPPS--PDAADGPAADGP--------------ASGPAAD
          +PS         SE+PA+++P+S   SSP+ SPSPA DSP    ADS + A+SPDSD SSPPS  PDAAD P ADGP              A G  +D
Subjt:  SKAPS---------SESPAASTPES---SSPATSPSPAADSPTG--ADSPTTASSPDSDLSSPPS--PDAADGPAADGP--------------ASGPAAD

Query:  TPAD------PASASALEFTAATVGVAVVIVGMFA
        +PAD       +  SAL+ T+A V  AV + G+FA
Subjt:  TPAD------PASASALEFTAATVGVAVVIVGMFA

A0A6J1J779 mucin-1-like6.7e-0942.11Show/hide
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        MASQS+LV +L+ V A+AG F EAP+ SPS   APK++PSDS +   +SSPA +P    + + +E+P                                 
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Query:  -----SPAASPKANSSKSESESPSSAASAPSNSSSKAPSSESPAASTPESSSPATSPSPAADSPTG--ADSPTTASSPDSDLSSPPS--PDAADGPAADG
             +PA +P    + S   SPS AASAP+ S S+AP+S SP +S    SSP+ SPSP  DSP    ADS + A+SPDSD SSPPS  PDAAD P ADG
Subjt:  -----SPAASPKANSSKSESESPSSAASAPSNSSSKAPSSESPAASTPESSSPATSPSPAADSPTG--ADSPTTASSPDSDLSSPPS--PDAADGPAADG

Query:  PA--SGPAADTPAD------PASASALEFTAATV--GVAVVIVGMFA
        P+   GP +D+PAD       +  S+L+ T+A V   VAV + G+FA
Subjt:  PA--SGPAADTPAD------PASASALEFTAATV--GVAVVIVGMFA

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTCTCAATCTCTTCTTGTTCTTTCTCTAGTCTTGGTGGTAGCCATTGCTGGAGTTTTTGGTGAGGCTCCAAGCACCTCCCCTTCGGCGCCGAAAGCCTCTCCATC
CGACTCCAATTCTACTTCTTCTCCAGCAGCCTCTCCAAAGGCTAATTCGTCGAAGTCGGAGTCGGAGTCTCCATCCCCAGCAGCCTCTCCAAAGGCTAACTCGTCGAAGT
CGGAGTCGGAGTCTCCATCCTCAGCTGCCTCCGCTCCATCTAATTCGTCGTCCAAGGCTCCATCCAGCGAGTCGCCAGCTGCTAGCACCCCGGAGTCGTCTTCCCCTGCC
ACTTCTCCTTCTCCGGCAGCCGACTCTCCTACTGGAGCTGACTCCCCAACAACGGCTTCATCGCCCGATTCCGACCTCTCTTCTCCCCCATCTCCCGATGCTGCCGATGG
ACCCGCTGCCGATGGTCCTGCCTCTGGACCTGCGGCTGATACTCCAGCTGATCCCGCCAGTGCTTCTGCTCTGGAATTCACTGCCGCCACCGTCGGAGTTGCCGTCGTAA
TTGTCGGAATGTTTGCTCTCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTTCTCAATCTCTTCTTGTTCTTTCTCTAGTCTTGGTGGTAGCCATTGCTGGAGTTTTTGGTGAGGCTCCAAGCACCTCCCCTTCGGCGCCGAAAGCCTCTCCATC
CGACTCCAATTCTACTTCTTCTCCAGCAGCCTCTCCAAAGGCTAATTCGTCGAAGTCGGAGTCGGAGTCTCCATCCCCAGCAGCCTCTCCAAAGGCTAACTCGTCGAAGT
CGGAGTCGGAGTCTCCATCCTCAGCTGCCTCCGCTCCATCTAATTCGTCGTCCAAGGCTCCATCCAGCGAGTCGCCAGCTGCTAGCACCCCGGAGTCGTCTTCCCCTGCC
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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TSPSPAADSPTGADSPTTASSPDSDLSSPPSPDAADGPAADGPASGPAADTPADPASASALEFTAATVGVAVVIVGMFAL